Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1ak5_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 2.A NZ TYR 4.A OH LYS 2.A HZ2 2.823 1.865 HIS 9.A N THR 198.A OG1 HIS 9.A H 2.792 1.832 HIS 9.A ND1 GLU 13.A OE1 HIS 9.A HD1 2.783 1.899 HIS 9.A NE2 GLU 6.A OE1 HIS 9.A HE2 2.879 1.993 HIS 9.A NE2 GLU 6.A OE2 HIS 9.A HE2 3.150 2.294 THR 10.A N GLU 13.A OE2 THR 10.A H 2.864 1.952 GLU 13.A N THR 10.A O GLU 13.A H 3.208 2.249 LEU 15.A N THR 322.A O LEU 15.A H 2.880 1.998 LEU 16.A N TYR 230.A OH LEU 16.A H 2.770 1.811 ILE 17.A N LYS 320.A O ILE 17.A H 2.874 1.901 GLY 19.A N ASN 306.A O GLY 19.A H 2.920 1.965 SER 21.A OG CYS 305.A O SER 21.A HG 2.856 1.902 CYS 25.A N THR 22.A O CYS 25.A H 3.145 2.186 CYS 25.A SG ALA 309.A O no hydrogen 3.624 N/A ASN 29.A N ILE 26.A O ASN 29.A H 2.687 1.825 ASN 29.A ND2 ASP 24.A O ASN 29.A HD22 2.953 2.042 VAL 30.A N PRO 27.A O VAL 30.A H 3.033 2.088 ASN 31.A N LEU 310.A O ASN 31.A H 2.842 1.862 THR 34.A N LEU 49.A O THR 34.A H 3.049 2.173 THR 34.A OG1 ASP 241.A O THR 34.A HG1 3.320 2.572 LEU 36.A N ILE 47.A O LEU 36.A H 2.886 1.917 VAL 37.A N SER 45.A OG VAL 37.A H 3.302 2.435 LYS 38.A N ASP 186.A O LYS 38.A H 2.776 1.984 PHE 39.A N TYR 217.A O PHE 39.A H 3.319 2.404 LYS 41.A N GLY 215.A O LYS 41.A H 2.745 1.862 GLN 43.A N GLN 40.A O GLN 43.A H 2.978 2.094 GLN 43.A NE2 GLN 40.A OE1 GLN 43.A HE22 3.538 2.916 SER 45.A OG VAL 37.A O SER 45.A HG 2.582 1.820 ILE 47.A N SER 45.A OG ILE 47.A H 3.423 2.519 ASN 48.A ND2 SER 45.A O ASN 48.A HD21 2.895 2.334 LEU 49.A N THR 34.A O LEU 49.A H 2.664 1.778 LYS 50.A N GLY 74.A O LYS 50.A H 2.902 2.028 LYS 50.A NZ GLU 103.A O LYS 50.A HZ3 2.963 1.991 ILE 51.A N GLY 74.A O ILE 51.A H 3.310 2.425 VAL 54.A N ILE 243.A O VAL 54.A H 2.917 2.015 SER 55.A N ILE 76.A O SER 55.A H 3.229 2.339 SER 55.A OG SER 62.A OG SER 55.A HG 2.737 1.866 ALA 56.A N LEU 245.A O ALA 56.A H 2.911 2.001 MET 58.A N ALA 56.A O MET 58.A H 2.838 2.056 GLN 59.A N GLU 273.A OE2 GLN 59.A H 2.816 1.904 GLN 59.A NE2 SER 82.A O GLN 59.A HE22 3.059 2.175 VAL 61.A N MET 58.A O VAL 61.A H 3.311 2.376 SER 62.A N MET 58.A O SER 62.A H 2.968 2.040 SER 62.A OG ALA 56.A O SER 62.A HG 2.519 1.877 GLY 63.A N VAL 61.A O GLY 63.A H 3.320 2.587 ALA 67.A N GLY 63.A O ALA 67.A H 2.958 2.018 ILE 68.A N GLU 64.A O ILE 68.A H 3.083 2.142 ALA 69.A N LYS 65.A O ALA 69.A H 3.067 2.105 LEU 70.A N MET 66.A O LEU 70.A H 2.849 1.916 ALA 71.A N ALA 67.A O ALA 71.A H 3.009 2.070 ARG 72.A N ILE 68.A O ARG 72.A H 3.055 2.147 ARG 72.A NE TYR 111.A OH ARG 72.A HE 2.858 1.998 GLU 73.A N LEU 70.A O GLU 73.A H 3.010 2.178 GLY 74.A N ALA 71.A O GLY 74.A H 3.069 2.192 GLY 75.A N LEU 70.A O GLY 75.A H 3.024 2.115 ILE 79.A N GLY 114.A O ILE 79.A H 2.940 2.080 PHE 80.A N SER 62.A O PHE 80.A H 3.508 2.573 GLN 83.A NE2 PHE 80.A O GLN 83.A HE22 2.689 1.847 SER 84.A OG SER 87.A OG SER 84.A HG 2.586 1.827 SER 87.A N SER 84.A OG SER 87.A H 2.969 2.041 GLN 88.A N SER 84.A O GLN 88.A H 3.059 2.079 GLN 88.A NE2 ILE 79.A O GLN 88.A HE22 3.297 2.453 GLN 88.A NE2 GLY 116.A O GLN 88.A HE21 2.742 1.795 ALA 89.A N ILE 85.A O ALA 89.A H 3.067 2.122 ALA 90.A N GLU 86.A O ALA 90.A H 3.067 2.190 MET 91.A N SER 87.A O MET 91.A H 2.941 2.003 VAL 92.A N GLN 88.A O VAL 92.A H 2.941 2.014 HIS 93.A N ALA 89.A O HIS 93.A H 2.855 1.910 ALA 94.A N ALA 90.A O ALA 94.A H 2.817 1.927 VAL 95.A N MET 91.A O VAL 95.A H 3.164 2.230 LYS 96.A N VAL 92.A O LYS 96.A H 3.069 2.091 LYS 96.A NZ ASP 106.A OD2 LYS 96.A HZ3 2.936 1.912 LYS 96.A NZ TYR 111.A O LYS 96.A HZ1 2.850 1.888 LYS 96.A NZ ASP 135.A OD1 LYS 96.A HZ2 3.318 2.509 LYS 96.A NZ ASP 135.A OD2 LYS 96.A HZ2 2.892 1.875 ASN 97.A N HIS 93.A O ASN 97.A H 2.982 2.042 PHE 98.A N VAL 95.A O PHE 98.A H 3.268 2.317 LYS 99.A NZ GLU 103.A OE1 LYS 99.A HZ2 2.977 1.955 LYS 99.A NZ GLU 103.A OE2 LYS 99.A HZ2 3.454 2.695 LYS 99.A NZ LYS 109.A O LYS 99.A HZ3 2.972 2.100 HIS 101.A ND1 ARG 72.A O HIS 101.A HD1 2.839 2.073 LEU 104.A N ALA 71.A O LEU 104.A H 2.767 1.819 ASP 106.A N ARG 110.A O ASP 106.A H 2.777 1.867 LYS 109.A N ASP 106.A O LYS 109.A H 2.786 1.934 ARG 110.A N ASP 106.A OD1 ARG 110.A H 2.911 1.968 ARG 110.A NH1 GLN 108.A OE1 ARG 110.A HH12 3.100 2.309 LEU 112.A N LEU 104.A O LEU 112.A H 3.133 2.213 VAL 113.A N ASP 135.A OD2 VAL 113.A H 2.864 1.946 GLY 114.A N SER 77.A O GLY 114.A H 2.889 1.987 ALA 115.A N VAL 136.A O ALA 115.A H 2.914 2.110 GLY 116.A N ILE 79.A O GLY 116.A H 2.878 1.926 ILE 117.A N CYS 138.A O ILE 117.A H 2.860 1.940 ASN 118.A ND2 ASP 121.A OD1 ASN 118.A HD21 2.977 2.258 ARG 120.A N ASN 118.A OD1 ARG 120.A H 2.798 1.917 ASP 121.A N ASN 118.A OD1 ASP 121.A H 2.913 2.014 GLU 124.A N ASP 121.A O GLU 124.A H 3.034 2.249 ARG 125.A N ASP 121.A O ARG 125.A H 2.815 1.867 ARG 125.A NE GLN 88.A OE1 ARG 125.A HE 2.848 1.880 ARG 125.A NH1 ASP 121.A OD1 ARG 125.A HH11 3.016 2.047 ARG 125.A NH2 GLN 83.A O ARG 125.A HH22 2.593 1.755 ARG 125.A NH2 GLN 88.A OE1 ARG 125.A HH21 3.493 2.755 VAL 126.A N PHE 122.A O VAL 126.A H 2.797 1.863 LEU 129.A N ARG 125.A O LEU 129.A H 3.041 2.100 VAL 130.A N VAL 126.A O VAL 130.A H 2.858 1.897 GLU 131.A N PRO 127.A O GLU 131.A H 2.844 1.879 ALA 132.A N ALA 128.A O ALA 132.A H 2.904 2.022 GLY 133.A N VAL 130.A O GLY 133.A H 2.956 2.105 ALA 134.A N LEU 129.A O ALA 134.A H 3.003 2.053 ASP 135.A N VAL 113.A O ASP 135.A H 2.743 1.878 VAL 136.A N VAL 113.A O VAL 136.A H 3.334 2.471 LEU 137.A N LYS 165.A O LEU 137.A H 2.826 1.918 CYS 138.A N ALA 115.A O CYS 138.A H 2.966 2.117 CYS 138.A SG ILE 139.A O no hydrogen 3.818 N/A ILE 139.A N GLY 167.A O ILE 139.A H 2.930 1.962 ASP 140.A N ILE 117.A O ASP 140.A H 2.855 1.883 GLY 144.A N ASN 170.A O GLY 144.A H 2.959 1.977 PHE 145.A N ASP 143.A OD1 PHE 145.A H 3.124 2.185 GLN 149.A N SER 146.A O GLN 149.A H 3.150 2.299 ILE 151.A N GLU 147.A O ILE 151.A H 2.901 1.933 THR 152.A N TRP 148.A O THR 152.A H 3.110 2.161 THR 152.A OG1 TRP 148.A O THR 152.A HG1 2.832 1.883 ILE 153.A N GLN 149.A O ILE 153.A H 2.985 2.016 GLY 154.A N LYS 150.A O GLY 154.A H 2.847 1.931 TRP 155.A N ILE 151.A O TRP 155.A H 2.943 2.004 ILE 156.A N THR 152.A O ILE 156.A H 3.187 2.237 ARG 157.A N ILE 153.A O ARG 157.A H 2.887 1.951 ARG 157.A NH1 GLY 161.A O ARG 157.A HH11 2.968 2.156 ARG 157.A NH1 VAL 164.A O ARG 157.A HH12 2.813 1.853 ARG 157.A NH2 GLY 184.A O ARG 157.A HH21 2.889 1.906 ARG 157.A NH2 ASP 186.A OD2 ARG 157.A HH22 2.627 1.819 GLU 158.A N GLY 154.A O GLU 158.A H 2.929 2.018 LYS 159.A N TRP 155.A O LYS 159.A H 2.891 1.970 TYR 160.A N ILE 156.A O TYR 160.A H 2.711 1.807 GLY 161.A N ARG 157.A O GLY 161.A H 2.678 1.926 LYS 163.A N TYR 160.A O LYS 163.A H 3.216 2.294 LYS 165.A NZ GLU 46.A OE2 LYS 165.A HZ3 3.081 2.283 LYS 165.A NZ ASP 162.A O LYS 165.A HZ2 2.944 2.079 VAL 166.A N ASP 186.A OD2 VAL 166.A H 2.773 1.914 GLY 167.A N LEU 137.A O GLY 167.A H 2.683 1.780 ALA 168.A N PHE 187.A O ALA 168.A H 3.068 2.162 GLY 169.A N GLN 149.A OE1 GLY 169.A H 2.770 1.897 ASN 170.A ND2 GLY 169.A O ASN 170.A HD22 3.374 2.582 ILE 171.A N LYS 189.A O ILE 171.A H 3.101 2.184 GLY 176.A N ASP 173.A O GLY 176.A H 3.085 2.400 GLY 176.A N ASP 173.A OD1 GLY 176.A H 3.126 2.261 PHE 177.A N ASP 173.A O PHE 177.A H 3.135 2.210 ARG 178.A N GLY 174.A O ARG 178.A H 2.837 1.874 ARG 178.A NE GLU 206.A OE2 ARG 178.A HE 3.158 2.302 ARG 178.A NH1 GLU 213.A OE1 ARG 178.A HH12 2.844 1.968 ARG 178.A NH2 GLU 206.A OE2 ARG 178.A HH21 2.977 2.055 ARG 178.A NH2 GLU 213.A OE1 ARG 178.A HH22 3.130 2.348 ARG 178.A NH2 GLU 213.A OE2 ARG 178.A HH22 3.397 2.409 TYR 179.A N GLU 175.A O TYR 179.A H 3.156 2.205 LEU 180.A N GLY 176.A O LEU 180.A H 3.234 2.269 ALA 181.A N PHE 177.A O ALA 181.A H 2.812 1.923 ASP 182.A N ARG 178.A O ASP 182.A H 2.974 2.004 ALA 183.A N TYR 179.A O ALA 183.A H 3.052 2.208 GLY 184.A N LEU 180.A O GLY 184.A H 3.290 2.602 GLY 184.A N ALA 181.A O GLY 184.A H 3.162 2.304 ALA 185.A N LEU 180.A O ALA 185.A H 3.205 2.257 ASP 186.A N VAL 166.A O ASP 186.A H 2.875 1.920 ILE 188.A N PRO 219.A O ILE 188.A H 3.059 2.121 LYS 189.A N ALA 168.A O LYS 189.A H 2.956 1.986 LYS 189.A NZ ASP 223.A OD2 LYS 189.A HZ1 3.352 2.549 ILE 190.A N CYS 221.A O ILE 190.A H 2.733 1.801 GLY 191.A N ILE 171.A O GLY 191.A H 3.063 2.114 ARG 194.A N ILE 192.A O ARG 194.A H 3.039 2.105 ARG 194.A NH1 VAL 172.A O ARG 194.A HH11 2.578 1.830 ALA 197.A N HIS 9.A O ALA 197.A H 3.299 2.595 THR 198.A N HIS 9.A O THR 198.A H 3.507 2.599 ALA 199.A N GLY 195.A O ALA 199.A H 3.098 2.148 VAL 200.A N GLN 196.A O VAL 200.A H 3.091 2.125 ILE 201.A N ALA 197.A O ILE 201.A H 3.013 2.038 ASP 202.A N THR 198.A O ASP 202.A H 2.882 1.941 VAL 203.A N ALA 199.A O VAL 203.A H 2.953 1.991 VAL 204.A N VAL 200.A O VAL 204.A H 2.887 1.933 ALA 205.A N ILE 201.A O ALA 205.A H 3.168 2.286 GLU 206.A N ASP 202.A O GLU 206.A H 3.225 2.333 ARG 207.A N VAL 203.A O ARG 207.A H 2.751 1.837 ARG 207.A NE ASN 208.A OD1 ARG 207.A HE 3.089 2.140 ARG 207.A NH1 ILE 218.A O ARG 207.A HH11 3.077 2.108 ARG 207.A NH1 ASP 241.A OD2 ARG 207.A HH12 2.824 1.927 ARG 207.A NH2 GLY 239.A O ARG 207.A HH22 2.799 1.931 ASN 208.A N VAL 204.A O ASN 208.A H 2.879 1.984 LYS 209.A N ALA 205.A O LYS 209.A H 3.058 2.151 TYR 210.A N GLU 206.A O TYR 210.A H 2.792 1.850 TYR 210.A OH ASP 182.A OD1 TYR 210.A HH 3.068 2.139 PHE 211.A N ARG 207.A O PHE 211.A H 2.998 2.110 GLU 212.A N ASN 208.A O GLU 212.A H 3.113 2.173 GLU 213.A N LYS 209.A O GLU 213.A H 2.980 2.104 THR 214.A N TYR 210.A O THR 214.A H 2.831 1.916 THR 214.A OG1 TYR 210.A O THR 214.A HG1 2.806 1.881 GLY 215.A N PHE 211.A O GLY 215.A H 2.686 1.870 ILE 216.A N THR 214.A OG1 ILE 216.A H 3.296 2.368 TYR 217.A N PHE 39.A O TYR 217.A H 2.901 1.932 VAL 220.A N ASP 241.A OD2 VAL 220.A H 2.876 1.956 CYS 221.A N ILE 188.A O CYS 221.A H 2.883 1.955 CYS 221.A SG SER 222.A O no hydrogen 3.848 N/A CYS 221.A SG PHE 242.A O no hydrogen 3.949 N/A SER 222.A N PHE 242.A O SER 222.A H 3.150 2.229 SER 222.A OG GLN 196.A OE1 SER 222.A HG 2.938 2.057 ASP 223.A N ILE 190.A O ASP 223.A H 2.896 1.943 GLY 224.A N MET 244.A O GLY 224.A H 3.180 2.239 HIS 231.A N TYR 228.A O HIS 231.A H 2.986 2.212 HIS 231.A NE2 ASN 12.A OD1 HIS 231.A HE2 3.278 2.431 MET 232.A N ASP 229.A O MET 232.A H 2.884 2.158 THR 233.A N ASP 229.A O THR 233.A H 3.382 2.468 LEU 234.A N TYR 230.A O LEU 234.A H 3.024 2.086 ALA 235.A N HIS 231.A O ALA 235.A H 2.881 1.948 LEU 236.A N MET 232.A O LEU 236.A H 3.174 2.201 ALA 237.A N THR 233.A O ALA 237.A H 2.922 1.974 MET 238.A N LEU 234.A O MET 238.A H 2.919 2.003 GLY 239.A N LEU 236.A O GLY 239.A H 2.894 1.991 ALA 240.A N ALA 235.A O ALA 240.A H 3.146 2.228 ASP 241.A N VAL 220.A O ASP 241.A H 3.033 2.158 ILE 243.A N PRO 52.A O ILE 243.A H 2.814 1.879 MET 244.A N SER 222.A O MET 244.A H 2.862 1.898 LEU 245.A N VAL 54.A O LEU 245.A H 3.042 2.106 PHE 249.A N GLY 246.A O PHE 249.A H 3.027 2.296 ALA 250.A N GLY 246.A O ALA 250.A H 3.169 2.294 ARG 251.A NE TYR 248.A O ARG 251.A HE 2.917 1.969 ARG 251.A NH2 TYR 248.A O ARG 251.A HH21 3.256 2.432 PHE 252.A N PHE 249.A O PHE 252.A H 3.204 2.277 GLU 253.A N GLY 287.A O GLU 253.A H 2.633 1.745 SER 255.A N PHE 252.A O SER 255.A H 3.144 2.178 SER 255.A OG ALA 250.A O SER 255.A HG 3.109 2.168 THR 257.A OG1 GLU 269.A O THR 257.A HG1 2.770 1.921 LYS 259.A NZ GLU 253.A OE1 LYS 259.A HZ2 3.010 2.170 VAL 260.A N MET 267.A O VAL 260.A H 2.723 1.787 ILE 262.A N SER 265.A O ILE 262.A H 2.751 1.801 ASN 263.A ND2 ASN 263.A O ASN 263.A HD22 2.640 1.915 SER 265.A N ILE 262.A O SER 265.A H 3.041 2.117 MET 267.A N VAL 260.A O MET 267.A H 2.687 1.768 LYS 268.A N VAL 283.A O LYS 268.A H 2.908 2.006 LYS 268.A NZ SER 255.A OG LYS 268.A HZ2 2.830 1.863 LYS 268.A NZ THR 257.A O LYS 268.A HZ3 3.017 2.065 GLU 269.A N ARG 258.A O GLU 269.A H 3.059 2.191 TYR 270.A N SER 281.A O TYR 270.A H 3.102 2.181 TRP 271.A NE1 GLN 59.A OE1 TRP 271.A HE1 2.880 1.936 GLY 272.A N VAL 279.A O GLY 272.A H 2.744 1.822 SER 275.A N GLY 272.A O SER 275.A H 2.985 2.171 SER 275.A OG GLY 272.A O SER 275.A HG 2.850 2.225 ARG 277.A NH1 GLU 269.A OE2 ARG 277.A HH12 3.548 2.667 ARG 277.A NH1 ASP 280.A OD1 ARG 277.A HH11 3.096 2.366 ARG 277.A NH1 ASP 280.A OD2 ARG 277.A HH11 3.183 2.239 ARG 277.A NH2 GLU 269.A OE1 ARG 277.A HH22 3.199 2.261 ARG 277.A NH2 GLU 269.A OE2 ARG 277.A HH22 3.474 2.569 SER 281.A N TYR 270.A O SER 281.A H 2.657 1.729 VAL 283.A N LYS 268.A O VAL 283.A H 2.979 2.041 TYR 285.A N VAL 266.A O TYR 285.A H 3.209 2.261 ALA 286.A N ARG 251.A O ALA 286.A H 2.982 2.018 LEU 289.A N GLU 254.A OE1 LEU 289.A H 2.959 2.124 LEU 289.A N GLU 254.A OE2 LEU 289.A H 3.385 2.449 LYS 290.A NZ ASP 291.A OD1 LYS 290.A HZ2 3.387 2.496 ASN 292.A ND2 ALA 286.A O ASN 292.A HD21 3.012 2.050 ASN 292.A ND2 LYS 288.A O ASN 292.A HD22 2.995 2.058 VAL 293.A N LEU 289.A O VAL 293.A H 2.957 1.975 GLU 294.A N LYS 290.A O GLU 294.A H 3.037 2.081 ALA 295.A N ASP 291.A O ALA 295.A H 3.241 2.367 SER 296.A N ASN 292.A O SER 296.A H 2.979 2.017 SER 296.A OG TYR 248.A OH SER 296.A HG 2.740 1.888 LEU 297.A N VAL 293.A O LEU 297.A H 2.812 1.841 ASN 298.A N GLU 294.A O ASN 298.A H 3.015 2.150 LYS 299.A N ALA 295.A O LYS 299.A H 3.401 2.503 LYS 299.A NZ ASP 229.A OD2 LYS 299.A HZ3 3.188 2.216 VAL 300.A N SER 296.A O VAL 300.A H 3.126 2.291 LYS 301.A N LEU 297.A O LYS 301.A H 2.941 2.002 SER 302.A N ASN 298.A O SER 302.A H 3.149 2.221 THR 303.A N LYS 299.A O THR 303.A H 3.157 2.194 MET 304.A N VAL 300.A O MET 304.A H 2.877 1.946 CYS 305.A N LYS 301.A O CYS 305.A H 3.081 2.142 CYS 305.A SG LYS 301.A O no hydrogen 3.825 N/A ASN 306.A N SER 302.A O ASN 306.A H 2.943 2.089 CYS 307.A N THR 303.A O CYS 307.A H 3.070 2.315 CYS 307.A N MET 304.A O CYS 307.A H 2.838 2.094 CYS 307.A SG THR 303.A O no hydrogen 3.492 N/A GLY 308.A N CYS 305.A O GLY 308.A H 2.861 1.991 ALA 309.A N MET 304.A O ALA 309.A H 3.064 2.172 LEU 310.A N GLN 314.A OE1 LEU 310.A H 2.751 1.785 GLN 314.A N THR 311.A OG1 GLN 314.A H 3.288 2.359 LEU 315.A N THR 311.A O LEU 315.A H 3.029 2.087 GLN 316.A N ILE 312.A O GLN 316.A H 2.885 1.939 GLN 316.A NE2 LEU 236.A O GLN 316.A HE22 3.077 2.171 SER 317.A N PRO 313.A O SER 317.A H 3.330 2.589 SER 317.A N GLN 314.A O SER 317.A H 3.103 2.314 LYS 318.A N GLN 314.A O LYS 318.A H 2.832 1.918 LYS 318.A NZ GLY 308.A O LYS 318.A HZ3 3.085 2.314 ALA 319.A N LEU 315.A O ALA 319.A H 2.800 1.909 LYS 320.A NZ PRO 18.A O LYS 320.A HZ3 2.946 2.147 THR 322.A N LEU 15.A O THR 322.A H 2.925 1.942 THR 322.A OG1 LEU 323.A O THR 322.A HG1 3.224 2.318 VAL 324.A N GLU 13.A O VAL 324.A H 2.664 1.824 SER 325.A OG SER 328.A OG SER 325.A HG 2.616 1.890 SER 328.A N SER 325.A OG SER 328.A H 3.396 2.555 ILE 329.A N SER 326.A O ILE 329.A H 3.105 2.205