Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1bnw_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N ASN 8.A O GLY 3.A H 2.970 2.082 GLY 5.A N ASN 8.A OD1 GLY 5.A H 2.800 1.956 ASN 8.A N GLY 5.A O ASN 8.A H 3.053 2.150 ASN 8.A ND2 HIS 1.A O ASN 8.A HD22 3.271 2.341 HIS 12.A N GLY 9.A O HIS 12.A H 2.789 1.855 HIS 12.A NE2 LYS 6.A O HIS 12.A HE2 2.956 2.090 TRP 13.A N PRO 10.A O TRP 13.A H 3.030 2.073 TRP 13.A NE1 GLY 3.A O TRP 13.A HE1 3.219 2.358 LYS 15.A N HIS 12.A O LYS 15.A H 3.055 2.074 ASP 16.A N TRP 13.A O ASP 16.A H 3.058 2.207 PHE 17.A N TRP 13.A O PHE 17.A H 2.858 1.977 ALA 20.A N PHE 17.A O ALA 20.A H 2.969 2.012 LYS 21.A N PRO 18.A O LYS 21.A H 3.056 2.092 GLY 22.A N ILE 19.A O GLY 22.A H 2.830 1.969 ARG 24.A N GLU 201.A OE2 ARG 24.A H 3.166 2.369 ARG 24.A NE GLY 192.A O ARG 24.A HE 3.014 2.240 ARG 24.A NH1 PRO 134.A O ARG 24.A HH12 3.326 2.526 ARG 24.A NH2 PRO 134.A O ARG 24.A HH22 2.934 1.995 ARG 24.A NH2 GLY 192.A O ARG 24.A HH21 3.496 2.836 ARG 24.A NH2 VAL 203.A O ARG 24.A HH21 3.115 2.169 GLN 25.A NE2 LEU 199.A O GLN 25.A HE21 3.073 2.146 GLN 25.A NE2 GLU 201.A OE2 GLN 25.A HE22 2.984 2.090 ILE 30.A N THR 105.A O ILE 30.A H 2.907 1.943 THR 32.A N ASP 107.A OD1 THR 32.A H 2.975 2.042 THR 34.A N ASP 31.A O THR 34.A H 3.178 2.363 LYS 36.A N ILE 252.A O LYS 36.A H 2.888 1.977 ASP 38.A N ALA 254.A O ASP 38.A H 2.981 2.024 SER 40.A N ASP 38.A OD1 SER 40.A H 3.029 2.110 LEU 41.A N ASP 38.A O LEU 41.A H 3.238 2.274 SER 45.A N LYS 77.A O SER 45.A H 2.768 1.887 SER 47.A N VAL 75.A O SER 47.A H 2.842 1.897 THR 52.A OG1 GLN 50.A O THR 52.A HG1 3.385 2.497 SER 53.A OG PHE 172.A O SER 53.A HG 2.801 1.885 LEU 54.A N GLU 66.A O LEU 54.A H 2.903 1.959 ARG 55.A NH1 GLU 66.A OE2 ARG 55.A HH11 3.106 2.324 ILE 56.A N ALA 170.A O ILE 56.A H 3.107 2.173 LEU 57.A N ASN 64.A O LEU 57.A H 2.909 2.004 ASN 58.A N LYS 168.A O ASN 58.A H 3.000 2.027 ASN 58.A ND2 ILE 163.A O ASN 58.A HD22 3.371 2.441 ASN 58.A ND2 ASN 226.A O ASN 58.A HD21 2.987 2.011 ASN 59.A N ALA 62.A O ASN 59.A H 3.033 2.054 GLY 60.A N ASN 58.A OD1 GLY 60.A H 2.750 1.879 HIS 61.A N ASN 59.A OD1 HIS 61.A H 2.884 2.007 ALA 62.A N ASN 59.A OD1 ALA 62.A H 2.928 2.067 ASN 64.A N LEU 57.A O ASN 64.A H 2.924 2.005 VAL 65.A N PHE 90.A O VAL 65.A H 2.974 2.017 GLU 66.A N ARG 55.A O GLU 66.A H 2.878 1.926 PHE 67.A N ILE 88.A O PHE 67.A H 2.947 2.039 ASP 68.A N THR 52.A O ASP 68.A H 2.945 1.998 SER 70.A N ASP 68.A OD1 SER 70.A H 3.430 2.557 GLN 71.A NE2 SER 70.A O GLN 71.A HE22 3.019 2.099 LYS 73.A N GLN 71.A O LYS 73.A H 2.807 2.045 LYS 73.A NZ THR 52.A OG1 LYS 73.A HZ2 3.290 2.470 LYS 73.A NZ ASP 68.A OD2 LYS 73.A HZ1 2.934 2.047 VAL 75.A N SER 47.A O VAL 75.A H 3.162 2.231 LEU 76.A N TYR 85.A O LEU 76.A H 2.875 1.958 LYS 77.A N SER 45.A O LYS 77.A H 2.818 1.890 LYS 77.A NZ THR 84.A OG1 LYS 77.A HZ1 3.095 2.177 GLY 79.A N PRO 43.A O GLY 79.A H 2.893 2.057 LEU 81.A N GLY 78.A O LEU 81.A H 2.929 1.995 TYR 85.A N LEU 76.A O TYR 85.A H 2.994 2.026 ARG 86.A N TRP 120.A O ARG 86.A H 2.905 2.006 ARG 86.A NE ASP 72.A OD1 ARG 86.A HE 2.767 2.017 ARG 86.A NH2 ASP 72.A OD1 ARG 86.A HH21 2.854 2.040 LEU 87.A N ALA 74.A O LEU 87.A H 2.958 1.991 ILE 88.A N VAL 118.A O ILE 88.A H 2.991 2.015 PHE 90.A N VAL 65.A O PHE 90.A H 3.222 2.368 HIS 91.A N HIS 116.A O HIS 91.A H 3.168 2.271 HIS 91.A ND1 GLN 89.A OE1 HIS 91.A HD1 2.927 1.958 HIS 93.A N GLU 114.A O HIS 93.A H 3.019 2.101 HIS 93.A ND1 ASN 240.A O HIS 93.A HD1 2.850 1.877 TRP 94.A N ASN 240.A OD1 TRP 94.A H 2.936 1.967 TRP 94.A NE1 MET 237.A O TRP 94.A HE1 2.967 2.136 GLY 95.A N ALA 112.A O GLY 95.A H 3.402 2.599 SER 96.A N ASP 239.A OD1 SER 96.A H 3.006 2.261 GLN 100.A N LEU 97.A O GLN 100.A H 3.462 2.614 GLN 100.A NE2 ASP 239.A OD1 GLN 100.A HE22 2.983 2.058 SER 102.A N TYR 111.A O SER 102.A H 2.925 2.083 SER 102.A OG HIS 104.A O SER 102.A HG 2.881 1.937 GLU 103.A N GLU 114.A OE1 GLU 103.A H 2.929 2.213 HIS 104.A N GLU 114.A OE1 HIS 104.A H 2.955 1.995 HIS 104.A ND1 GLU 114.A OE2 HIS 104.A HD1 3.060 2.150 HIS 104.A NE2 TYR 190.A OH HIS 104.A HE2 2.639 1.772 THR 105.A N VAL 28.A O THR 105.A H 3.526 2.615 VAL 106.A N LYS 109.A O VAL 106.A H 2.988 2.099 ASP 107.A N ILE 30.A O ASP 107.A H 2.800 1.832 LYS 108.A N ASP 29.A OD1 LYS 108.A H 2.791 2.016 LYS 109.A N VAL 106.A O LYS 109.A H 2.800 1.915 TYR 111.A N SER 102.A OG TYR 111.A H 2.961 1.980 ALA 112.A N LEU 144.A O ALA 112.A H 3.154 2.389 GLU 114.A N HIS 93.A O GLU 114.A H 2.877 1.983 LEU 115.A N ILE 142.A O LEU 115.A H 2.865 1.897 HIS 116.A N HIS 91.A O HIS 116.A H 2.919 1.955 HIS 116.A NE2 GLU 114.A OE2 HIS 116.A HE2 2.810 2.032 LEU 117.A N LEU 140.A O LEU 117.A H 2.995 2.015 VAL 118.A N GLN 89.A O VAL 118.A H 2.867 1.902 HIS 119.A N ALA 138.A O HIS 119.A H 2.938 2.225 HIS 119.A ND1 ALA 138.A O HIS 119.A HD1 3.075 2.318 HIS 119.A NE2 TYR 48.A OH HIS 119.A HE2 2.664 1.888 TRP 120.A N ARG 86.A O TRP 120.A H 3.073 2.206 ASN 121.A N GLY 136.A O ASN 121.A H 2.788 1.875 ASN 121.A ND2 ASP 135.A O ASN 121.A HD22 3.099 2.112 THR 122.A N THR 84.A O THR 122.A H 3.140 2.166 THR 122.A OG1 THR 84.A O THR 122.A HG1 3.002 2.039 LYS 123.A N ASN 121.A OD1 LYS 123.A H 3.358 2.475 LYS 123.A NZ TYR 124.A OH LYS 123.A HZ3 3.185 2.300 TYR 124.A N ASN 121.A O TYR 124.A H 3.011 2.044 GLY 125.A N THR 122.A O GLY 125.A H 2.988 2.028 ASP 126.A N TYR 124.A O ASP 126.A H 2.763 1.961 LYS 129.A N ASP 126.A O LYS 129.A H 3.085 2.309 LYS 129.A N ASP 126.A OD1 LYS 129.A H 2.926 2.188 LYS 129.A NZ ASP 126.A OD1 LYS 129.A HZ1 3.551 2.777 ALA 130.A N ASP 126.A O ALA 130.A H 3.020 2.052 VAL 131.A N PHE 127.A O VAL 131.A H 2.998 2.086 GLN 132.A N LYS 129.A O GLN 132.A H 2.896 2.005 GLN 132.A NE2 GLY 128.A O GLN 132.A HE22 3.028 2.073 GLN 133.A N ALA 130.A O GLN 133.A H 3.037 2.229 GLN 133.A NE2 TYR 124.A OH GLN 133.A HE22 3.552 2.684 GLY 136.A N GLN 133.A O GLY 136.A H 2.982 2.133 LEU 137.A N CYS 202.A O LEU 137.A H 2.850 1.934 ALA 138.A N HIS 119.A O ALA 138.A H 2.965 2.013 VAL 139.A N THR 204.A O VAL 139.A H 3.190 2.263 LEU 140.A N LEU 117.A O LEU 140.A H 3.093 2.155 GLY 141.A N ILE 206.A O GLY 141.A H 2.759 1.872 ILE 142.A N LEU 115.A O ILE 142.A H 2.939 2.050 LEU 144.A N ALA 113.A O LEU 144.A H 2.920 2.008 LYS 145.A N ILE 212.A O LYS 145.A H 2.912 1.952 GLY 147.A N VAL 214.A O GLY 147.A H 2.721 1.849 LYS 150.A N GLN 218.A OE1 LYS 150.A H 2.896 1.955 LYS 150.A NZ GLY 179.A O LYS 150.A HZ3 3.061 2.311 LEU 153.A N LYS 150.A O LEU 153.A H 3.136 2.242 GLN 154.A N PRO 151.A O GLN 154.A H 2.940 1.984 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD1 GLN 154.A HE22 3.207 2.278 LYS 155.A NZ GLY 152.A O LYS 155.A HZ2 3.093 2.399 VAL 156.A N LEU 153.A O VAL 156.A H 3.054 2.258 VAL 157.A N LEU 153.A O VAL 157.A H 3.318 2.406 ASP 158.A N GLN 154.A O ASP 158.A H 2.917 2.034 VAL 159.A N LYS 155.A O VAL 159.A H 3.521 2.609 LEU 160.A N VAL 157.A O LEU 160.A H 3.341 2.388 SER 162.A N VAL 159.A O SER 162.A H 2.889 2.056 SER 162.A OG VAL 159.A O SER 162.A HG 3.092 2.352 ILE 163.A N LEU 160.A O ILE 163.A H 3.253 2.324 LYS 164.A NZ LYS 224.A O LYS 164.A HZ3 2.899 2.065 LYS 164.A NZ GLU 234.A OE2 LYS 164.A HZ2 3.007 2.053 LYS 166.A N ASN 228.A O LYS 166.A H 2.925 1.963 GLY 167.A N ASN 58.A O GLY 167.A H 2.926 1.997 LYS 168.A N THR 165.A O LYS 168.A H 3.277 2.312 ALA 170.A N ILE 56.A O ALA 170.A H 2.935 2.039 PHE 172.A N LEU 54.A O PHE 172.A H 2.937 1.974 THR 173.A OG1 ASN 174.A OD1 THR 173.A HG1 3.124 2.214 PHE 175.A N SER 53.A OG PHE 175.A H 2.854 1.918 ARG 178.A N ASP 176.A OD1 ARG 178.A H 3.265 2.357 ARG 178.A NE ASP 176.A OD1 ARG 178.A HE 3.176 2.337 ARG 178.A NE ASP 176.A OD2 ARG 178.A HE 3.150 2.251 ARG 178.A NH2 ASP 176.A OD2 ARG 178.A HH21 3.130 2.221 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.420 2.448 LEU 180.A N PRO 177.A O LEU 180.A H 2.923 1.978 LEU 181.A N ARG 178.A O LEU 181.A H 3.267 2.309 GLU 183.A N GLU 210.A OE2 GLU 183.A H 2.905 2.119 SER 184.A N GLU 210.A OE1 SER 184.A H 3.243 2.567 ASP 186.A N SER 184.A OG ASP 186.A H 3.341 2.438 TYR 187.A N SER 255.A OG TYR 187.A H 3.091 2.133 TYR 187.A OH LYS 42.A O TYR 187.A HH 2.776 1.888 TRP 188.A N VAL 207.A O TRP 188.A H 2.945 1.987 THR 189.A N LYS 253.A O THR 189.A H 3.058 2.151 THR 189.A OG1 TRP 205.A O THR 189.A HG1 3.053 2.135 TYR 190.A N TRP 205.A O TYR 190.A H 3.350 2.453 TYR 190.A OH SER 26.A OG TYR 190.A HH 2.808 1.870 GLY 192.A N VAL 203.A O GLY 192.A H 2.788 1.849 SER 193.A N SER 26.A OG SER 193.A H 2.998 2.060 LEU 194.A N LEU 200.A O LEU 194.A H 3.145 2.298 LEU 199.A N THR 196.A O LEU 199.A H 2.921 2.056 CYS 202.A SG VAL 131.A O no hydrogen 3.197 N/A VAL 203.A N GLY 192.A O VAL 203.A H 3.294 2.392 THR 204.A N LEU 137.A O THR 204.A H 2.882 1.926 TRP 205.A N TYR 190.A O TRP 205.A H 2.965 2.019 TRP 205.A NE1 SER 193.A O TRP 205.A HE1 2.981 2.032 ILE 206.A N VAL 139.A O ILE 206.A H 2.950 2.009 VAL 207.A N TRP 188.A O VAL 207.A H 3.029 2.053 LEU 208.A N GLY 141.A O LEU 208.A H 3.091 2.116 LYS 209.A N ASP 186.A O LYS 209.A H 2.901 1.925 ILE 212.A N PHE 143.A O ILE 212.A H 3.105 2.150 VAL 214.A N LYS 145.A O VAL 214.A H 2.857 1.942 SER 215.A N GLN 218.A OE1 SER 215.A H 3.319 2.381 GLN 218.A NE2 LYS 150.A O GLN 218.A HE21 2.924 1.948 GLN 218.A NE2 GLN 154.A OE1 GLN 218.A HE22 3.039 2.105 VAL 219.A N SER 215.A O VAL 219.A H 3.286 2.328 LEU 220.A N SER 216.A O LEU 220.A H 2.826 1.947 LYS 221.A N GLU 217.A O LYS 221.A H 3.379 2.548 LYS 221.A N GLN 218.A O LYS 221.A H 3.112 2.329 LYS 221.A NZ GLU 217.A O LYS 221.A HZ1 2.858 1.976 PHE 222.A N VAL 219.A O PHE 222.A H 3.078 2.372 ARG 223.A N VAL 219.A O ARG 223.A H 3.533 2.611 ARG 223.A NE GLY 95.A O ARG 223.A HE 3.013 2.056 ARG 223.A NH1 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH12 3.461 2.667 ARG 223.A NH2 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH22 2.924 1.941 LYS 224.A N LYS 221.A O LYS 224.A H 2.990 2.067 LEU 225.A N PHE 222.A O LEU 225.A H 3.262 2.322 ASN 226.A N LYS 164.A O ASN 226.A H 2.790 1.967 ASN 226.A ND2 GLU 234.A OE2 ASN 226.A HD21 3.035 2.178 PHE 227.A N GLU 235.A O PHE 227.A H 2.873 1.898 ASN 228.A ND2 ASN 226.A OD1 ASN 228.A HD21 3.683 2.841 ASN 228.A ND2 GLY 229.A O ASN 228.A HD22 2.825 1.941 GLY 229.A N GLU 232.A OE1 GLY 229.A H 2.969 2.042 GLU 232.A N GLY 229.A O GLU 232.A H 2.991 2.052 GLU 235.A N ASN 228.A OD1 GLU 235.A H 2.844 1.920 MET 237.A N LEU 225.A O MET 237.A H 2.907 1.961 ASN 240.A N TRP 94.A O ASN 240.A H 3.446 2.569 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O ASN 240.A HD22 2.932 1.953 ASN 240.A ND2 PHE 92.A O ASN 240.A HD21 3.666 2.919 TRP 241.A NE1 ASP 239.A OD1 TRP 241.A HE1 3.113 2.146 ARG 242.A N GLU 103.A OE2 ARG 242.A H 2.882 2.015 ARG 242.A NH1 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH12 2.992 2.126 ARG 242.A NH1 SER 26.A O ARG 242.A HH11 2.662 1.883 ARG 242.A NH2 ALA 20.A O ARG 242.A HH22 3.460 2.782 ARG 242.A NH2 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH22 3.034 2.180 GLN 245.A N PRO 27.A O GLN 245.A H 2.758 1.844 GLN 245.A NE2 PRO 243.A O GLN 245.A HE22 2.566 1.816 LYS 248.A NZ GLY 22.A O LYS 248.A HZ3 3.204 2.257 ARG 250.A NE LEU 247.A O ARG 250.A HE 2.888 1.923 ARG 250.A NH1 GLN 25.A O ARG 250.A HH12 3.103 2.237 ARG 250.A NH1 PRO 191.A O ARG 250.A HH11 2.863 1.894 ARG 250.A NH2 GLN 25.A O ARG 250.A HH22 3.008 2.101 ARG 250.A NH2 PRO 246.A O ARG 250.A HH21 2.971 2.199 LYS 253.A N THR 189.A O LYS 253.A H 3.057 2.188 LYS 253.A NZ GLN 251.A OE1 LYS 253.A HZ1 2.749 2.000 ALA 254.A N LYS 36.A O ALA 254.A H 2.753 1.904 SER 255.A N TYR 187.A O SER 255.A H 2.872 1.898