Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1bq1_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A NZ GLU 5.A OE2 LYS 1.A HZ2 2.963 2.236 GLN 2.A N GLN 2.A OE1 GLN 2.A H 2.887 2.014 GLN 2.A NE2 ARG 34.A O GLN 2.A HE22 3.102 2.151 GLU 5.A N LYS 1.A O GLU 5.A H 2.962 2.001 LEU 6.A N GLN 2.A O LEU 6.A H 3.235 2.329 MET 7.A N TYR 3.A O MET 7.A H 3.121 2.161 GLN 8.A N LEU 4.A O GLN 8.A H 3.136 2.158 GLN 8.A NE2 GLN 8.A O GLN 8.A HE22 3.456 2.665 GLN 8.A NE2 ASP 12.A OD1 GLN 8.A HE22 2.932 2.177 LYS 9.A N GLU 5.A O LYS 9.A H 2.965 2.097 VAL 10.A N LEU 6.A O VAL 10.A H 2.949 1.997 LEU 11.A N MET 7.A O LEU 11.A H 3.050 2.069 ASP 12.A N GLN 8.A O ASP 12.A H 2.741 1.945 GLU 13.A N LYS 9.A O GLU 13.A H 2.812 1.857 THR 15.A N SER 27.A O THR 15.A H 2.921 1.973 LYS 17.A N THR 25.A O LYS 17.A H 2.867 1.893 LYS 17.A NZ ASP 204.A OD2 LYS 17.A HZ1 3.103 2.207 ARG 20.A NH1 ILE 263.A OXT ARG 20.A HH12 3.308 2.406 ARG 20.A NH2 ILE 263.A OXT ARG 20.A HH22 3.291 2.384 GLY 22.A N ASP 19.A O GLY 22.A H 2.946 2.088 THR 23.A OG1 THR 21.A O THR 23.A HG1 3.037 2.090 GLY 24.A N ASP 19.A OD1 GLY 24.A H 2.959 2.026 THR 25.A N LYS 17.A O THR 25.A H 2.713 1.784 THR 25.A OG1 LYS 17.A O THR 25.A HG1 3.368 2.540 LEU 26.A N LEU 207.A O LEU 26.A H 2.799 1.835 SER 27.A N THR 15.A O SER 27.A H 2.790 1.947 ILE 28.A N THR 205.A O ILE 28.A H 2.918 1.937 GLY 30.A N GLY 203.A O GLY 30.A H 3.049 2.096 HIS 31.A N GLY 202.A O HIS 31.A H 3.289 2.474 GLN 32.A NE2 THR 201.A OG1 GLN 32.A HE22 2.964 2.093 MET 33.A N TRP 200.A O MET 33.A H 2.897 2.016 ARG 34.A NH1 ASP 197.A OD2 ARG 34.A HH11 2.948 2.006 PHE 35.A N PHE 198.A O PHE 35.A H 2.805 1.880 LEU 37.A N GLY 196.A O LEU 37.A H 2.975 2.033 GLN 38.A N ASN 36.A OD1 GLN 38.A H 2.944 2.146 ASP 39.A N ASN 36.A O ASP 39.A H 2.996 2.037 GLY 40.A N LEU 37.A O GLY 40.A H 3.181 2.305 PHE 41.A N PRO 227.A O PHE 41.A H 2.856 1.897 LEU 43.A N PHE 41.A O LEU 43.A H 2.782 2.032 ARG 52.A NH2 ASN 74.A O ARG 52.A HH21 2.739 2.049 ARG 52.A NH2 ASN 75.A O ARG 52.A HH22 2.832 1.882 SER 53.A N HIS 50.A O SER 53.A H 3.414 2.561 ILE 55.A N LEU 51.A O ILE 55.A H 3.013 2.036 HIS 56.A N ARG 52.A O HIS 56.A H 3.178 2.219 HIS 56.A ND1 TYR 70.A OH HIS 56.A HD1 2.975 2.041 GLU 57.A N SER 53.A O GLU 57.A H 2.997 2.046 LEU 58.A N ILE 54.A O LEU 58.A H 3.130 2.167 LEU 59.A N ILE 55.A O LEU 59.A H 3.066 2.092 TRP 60.A N HIS 56.A O TRP 60.A H 2.997 2.037 TRP 60.A NE1 ASN 67.A O TRP 60.A HE1 3.154 2.207 PHE 61.A N GLU 57.A O PHE 61.A H 2.982 2.024 LEU 62.A N LEU 58.A O LEU 62.A H 3.096 2.158 GLN 63.A N LEU 59.A O GLN 63.A H 3.058 2.184 GLN 63.A NE2 LEU 59.A O GLN 63.A HE22 3.534 2.975 GLY 64.A N PHE 61.A O GLY 64.A H 3.093 2.193 ASP 65.A N TRP 60.A O ASP 65.A H 3.376 2.429 ASN 67.A N ASP 65.A OD1 ASN 67.A H 3.033 2.110 ASN 67.A ND2 ASN 86.A O ASN 67.A HD21 2.906 2.129 ASN 67.A ND2 ASP 88.A OD1 ASN 67.A HD22 3.014 2.153 ILE 68.A N GLY 87.A O ILE 68.A H 3.017 2.053 ALA 69.A N ASN 67.A OD1 ALA 69.A H 3.072 2.092 HIS 72.A N ILE 68.A O HIS 72.A H 2.934 2.010 HIS 72.A NE2 ASP 80.A OD2 HIS 72.A HE2 3.230 2.286 GLU 73.A N ALA 69.A O GLU 73.A H 2.890 1.953 ASN 74.A N TYR 70.A O ASN 74.A H 3.231 2.539 ASN 74.A N LEU 71.A O ASN 74.A H 2.905 2.144 ASN 75.A N HIS 72.A O ASN 75.A H 2.909 1.969 VAL 76.A N LEU 71.A O VAL 76.A H 2.887 1.926 TRP 79.A NE1 GLU 57.A OE2 TRP 79.A HE1 2.943 2.003 ASP 80.A N THR 77.A O ASP 80.A H 2.998 2.043 TRP 82.A N TRP 79.A O TRP 82.A H 3.326 2.391 ALA 83.A N ASP 80.A O ALA 83.A H 3.134 2.182 ASP 84.A N ASP 88.A O ASP 84.A H 3.049 2.069 GLY 87.A N ASP 84.A O GLY 87.A H 2.842 1.950 LEU 89.A N THR 66.A O LEU 89.A H 3.156 2.245 VAL 92.A N GLY 90.A O VAL 92.A H 2.700 1.875 LYS 95.A N VAL 92.A O LYS 95.A H 3.037 2.248 GLN 96.A N VAL 92.A O GLN 96.A H 3.299 2.373 GLN 96.A NE2 PRO 91.A O GLN 96.A HE22 2.747 1.835 GLN 96.A NE2 GLU 136.A OE1 GLN 96.A HE21 3.284 2.340 TRP 97.A N TYR 93.A O TRP 97.A H 2.839 1.874 ARG 98.A N GLY 94.A O ARG 98.A H 3.308 2.381 ARG 98.A NE ASP 109.A OD1 ARG 98.A HE 3.063 2.114 ARG 98.A NE ASP 109.A OD2 ARG 98.A HE 3.467 2.644 ARG 98.A NH1 LEU 62.A O ARG 98.A HH11 2.918 2.128 ARG 98.A NH2 ASP 109.A OD2 ARG 98.A HH21 3.044 2.083 ALA 99.A N LYS 95.A O ALA 99.A H 2.737 1.903 TRP 100.A N ILE 108.A O TRP 100.A H 2.958 2.124 THR 102.A N ARG 106.A O THR 102.A H 3.158 2.192 GLY 105.A N THR 102.A O GLY 105.A H 3.419 2.524 ARG 106.A N THR 102.A OG1 ARG 106.A H 2.885 2.121 HIS 107.A ND1 ALA 99.A O HIS 107.A HD1 2.996 2.018 ILE 108.A N TRP 100.A O ILE 108.A H 2.776 1.855 GLN 110.A NE2 GLN 96.A O GLN 110.A HE22 2.778 1.845 GLN 110.A NE2 SER 130.A O GLN 110.A HE21 2.827 1.877 ILE 111.A N TRP 97.A O ILE 111.A H 3.177 2.269 THR 112.A N ASP 109.A OD1 THR 112.A H 3.093 2.124 THR 113.A N ASP 109.A O THR 113.A H 3.044 2.096 THR 113.A OG1 ASP 109.A O THR 113.A HG1 3.115 2.154 VAL 114.A N GLN 110.A O VAL 114.A H 3.146 2.181 LEU 115.A N ILE 111.A O LEU 115.A H 3.139 2.182 ASN 116.A N THR 112.A O ASN 116.A H 2.988 2.020 GLN 117.A N THR 113.A O GLN 117.A H 2.933 1.992 GLN 117.A NE2 THR 113.A O GLN 117.A HE22 3.651 2.959 LEU 118.A N VAL 114.A O LEU 118.A H 2.899 1.968 LYS 119.A N LEU 115.A O LYS 119.A H 3.220 2.277 ASN 120.A N ASN 116.A O ASN 120.A H 2.923 1.998 ASP 121.A N GLN 117.A O ASP 121.A H 2.736 1.890 SER 124.A N ASP 121.A O SER 124.A H 2.917 1.984 ARG 126.A N SER 124.A OG ARG 126.A H 3.078 2.171 VAL 129.A N PHE 149.A O VAL 129.A H 3.033 2.092 SER 130.A N GLN 110.A OE1 SER 130.A H 2.897 1.935 ALA 131.A N ALA 147.A O ALA 131.A H 2.889 1.964 TRP 132.A N SER 130.A OG TRP 132.A H 3.192 2.422 TRP 132.A N ALA 147.A O TRP 132.A H 3.232 2.487 ASN 133.A N ALA 131.A O ASN 133.A H 2.848 2.104 ASN 133.A ND2 GLN 96.A OE1 ASN 133.A HD22 2.957 1.985 GLY 135.A N ASN 133.A OD1 GLY 135.A H 3.336 2.604 GLU 136.A N ASN 133.A O GLU 136.A H 2.935 1.981 LEU 137.A N VAL 134.A O LEU 137.A H 3.422 2.482 LYS 139.A N GLU 136.A O LYS 139.A H 2.865 1.943 LYS 139.A NZ GLU 136.A OE2 LYS 139.A HZ2 3.153 2.247 MET 140.A N LEU 137.A O MET 140.A H 3.085 2.149 ALA 141.A N LEU 89.A O ALA 141.A H 2.879 1.924 ALA 147.A N TYR 163.A O ALA 147.A H 3.112 2.304 PHE 149.A N VAL 129.A O PHE 149.A H 2.917 2.030 GLN 150.A N GLN 161.A O GLN 150.A H 2.913 2.028 PHE 151.A N ILE 127.A O PHE 151.A H 2.886 1.914 TYR 152.A N SER 159.A O TYR 152.A H 3.144 2.326 ALA 154.A N LYS 157.A O ALA 154.A H 3.050 2.134 LYS 157.A N ALA 154.A O LYS 157.A H 2.799 1.890 LEU 158.A N GLU 194.A O LEU 158.A H 2.841 1.913 SER 159.A N TYR 152.A O SER 159.A H 2.857 1.900 CYS 160.A N ASP 197.A O CYS 160.A H 2.912 1.978 CYS 160.A SG GLN 150.A O no hydrogen 3.927 N/A GLN 161.A N GLN 150.A O GLN 161.A H 2.807 1.902 LEU 162.A N VAL 199.A O LEU 162.A H 2.968 2.028 TYR 163.A N PHE 148.A O TYR 163.A H 3.166 2.207 GLN 164.A N THR 201.A O GLN 164.A H 2.915 1.941 GLN 164.A NE2 SER 166.A O GLN 164.A HE22 3.268 2.347 ARG 165.A N CYS 145.A O ARG 165.A H 2.833 2.004 ARG 165.A NE PRO 144.A O ARG 165.A HE 3.045 2.201 ARG 165.A NH2 ALA 143.A O ARG 165.A HH21 3.171 2.215 CYS 167.A N ASP 204.A O CYS 167.A H 2.857 2.059 VAL 169.A N HIS 206.A O VAL 169.A H 3.080 2.112 LEU 171.A N ASP 168.A OD1 LEU 171.A H 3.145 2.185 GLY 172.A N ASP 168.A O GLY 172.A H 2.833 2.067 LEU 173.A N ASP 168.A O LEU 173.A H 3.158 2.397 ALA 176.A N GLY 172.A O ALA 176.A H 3.198 2.228 ILE 177.A N LEU 173.A O ILE 177.A H 3.055 2.089 ALA 178.A N PRO 174.A O ALA 178.A H 3.286 2.340 SER 179.A N PHE 175.A O SER 179.A H 2.957 2.033 TYR 180.A N ALA 176.A O TYR 180.A H 3.163 2.186 ALA 181.A N ILE 177.A O ALA 181.A H 3.050 2.099 LEU 182.A N ALA 178.A O LEU 182.A H 2.933 1.998 LEU 183.A N SER 179.A O LEU 183.A H 2.976 2.038 VAL 184.A N TYR 180.A O VAL 184.A H 3.015 2.079 HIS 185.A N ALA 181.A O HIS 185.A H 3.205 2.280 MET 186.A N LEU 182.A O MET 186.A H 3.153 2.210 MET 187.A N LEU 183.A O MET 187.A H 2.969 1.992 ALA 188.A N VAL 184.A O ALA 188.A H 2.933 1.961 GLN 189.A N HIS 185.A O GLN 189.A H 3.101 2.186 GLN 189.A NE2 ARG 233.A O GLN 189.A HE21 3.079 2.144 GLN 190.A N MET 186.A O GLN 190.A H 3.113 2.162 GLN 190.A NE2 PRO 235.A O GLN 190.A HE21 3.243 2.284 GLN 190.A NE2 TYR 241.A OH GLN 190.A HE22 2.758 1.926 CYS 191.A N MET 187.A O CYS 191.A H 2.971 2.136 CYS 191.A SG MET 187.A O no hydrogen 3.579 N/A ASP 192.A N GLN 189.A O ASP 192.A H 3.309 2.370 LEU 193.A N ALA 188.A O LEU 193.A H 2.908 1.933 GLU 194.A N GLY 156.A O GLU 194.A H 2.899 1.944 GLY 196.A N LEU 158.A O GLY 196.A H 2.783 1.987 ASP 197.A N SER 159.A OG ASP 197.A H 2.849 1.875 PHE 198.A N PHE 35.A O PHE 198.A H 2.914 1.994 VAL 199.A N CYS 160.A O VAL 199.A H 2.802 1.885 TRP 200.A N MET 33.A O TRP 200.A H 2.834 1.872 TRP 200.A NE1 GLN 164.A OE1 TRP 200.A HE1 3.048 2.070 THR 201.A N LEU 162.A O THR 201.A H 2.933 2.011 THR 201.A OG1 GLN 161.A OE1 THR 201.A HG1 3.003 2.204 GLY 202.A N HIS 31.A O GLY 202.A H 2.867 1.924 GLY 203.A N GLN 164.A O GLY 203.A H 2.789 1.893 ASP 204.A N ARG 165.A O ASP 204.A H 2.860 1.922 THR 205.A N ILE 28.A O THR 205.A H 2.927 1.965 THR 205.A OG1 GLY 203.A O THR 205.A HG1 3.166 2.235 HIS 206.A N CYS 167.A O HIS 206.A H 3.026 2.135 HIS 206.A ND1 ASP 204.A OD1 HIS 206.A HD1 3.105 2.192 LEU 207.A N LEU 26.A O LEU 207.A H 2.915 1.979 SER 209.A N GLY 24.A O SER 209.A H 3.075 2.114 HIS 211.A N TYR 208.A O HIS 211.A H 2.915 2.027 HIS 211.A NE2 PRO 260.A O HIS 211.A HE2 2.774 1.917 GLN 214.A N GLN 214.A OE1 GLN 214.A H 2.763 1.972 GLN 214.A NE2 ASN 210.A O GLN 214.A HE21 3.531 2.777 GLN 214.A NE2 LYS 258.A O GLN 214.A HE22 3.546 2.598 THR 215.A N HIS 211.A O THR 215.A H 2.901 1.922 HIS 216.A N MET 212.A O HIS 216.A H 3.001 2.100 LEU 217.A N ASP 213.A O LEU 217.A H 2.993 2.096 GLN 218.A N GLN 214.A O GLN 218.A H 2.916 1.962 GLN 218.A NE2 THR 46.A OG1 GLN 218.A HE22 2.935 1.958 LEU 219.A N THR 215.A O LEU 219.A H 2.922 1.978 SER 220.A N LEU 217.A O SER 220.A H 3.202 2.306 ARG 221.A N GLN 218.A O ARG 221.A H 3.063 2.136 ARG 221.A NH1 THR 46.A O ARG 221.A HH11 2.850 1.875 ARG 221.A NH1 PRO 255.A O ARG 221.A HH12 2.952 2.123 ARG 224.A N THR 45.A OG1 ARG 224.A H 2.880 1.906 ARG 224.A NH1 ASP 252.A O ARG 224.A HH11 2.739 1.895 LYS 228.A N GLU 249.A O LYS 228.A H 2.848 1.927 LYS 228.A NZ ASP 39.A O LYS 228.A HZ3 3.379 2.585 LYS 228.A NZ LEU 226.A O LYS 228.A HZ1 2.898 2.008 ILE 230.A N GLU 247.A O ILE 230.A H 2.949 1.970 LYS 232.A N ASP 245.A O LYS 232.A H 2.923 1.958 ARG 233.A NE ASP 245.A OD1 ARG 233.A HE 3.035 2.083 ARG 233.A NH2 ASP 240.A O ARG 233.A HH22 3.211 2.337 ARG 233.A NH2 ASP 245.A OD1 ARG 233.A HH21 3.356 2.511 ARG 233.A NH2 ASP 245.A OD2 ARG 233.A HH21 2.849 2.097 SER 237.A OG ASP 240.A OD2 SER 237.A HG 2.922 2.185 PHE 239.A N SER 237.A OG PHE 239.A H 3.095 2.342 ASP 240.A N SER 237.A O ASP 240.A H 2.882 1.948 TYR 241.A OH GLN 189.A OE1 TYR 241.A HH 2.595 1.783 ARG 242.A N ASP 245.A OD2 ARG 242.A H 2.980 2.059 ASP 245.A N ARG 242.A O ASP 245.A H 2.971 2.019 PHE 246.A N PHE 243.A O PHE 246.A H 3.167 2.203 GLU 247.A N ILE 230.A O GLU 247.A H 3.029 2.147 GLU 249.A N LYS 228.A O GLU 249.A H 2.894 1.945 HIS 254.A N THR 45.A O HIS 254.A H 2.777 1.911 HIS 254.A NE2 GLU 222.A O HIS 254.A HE2 2.805 1.906