Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1cmq_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): HIS 3.A ND1 GLY 270.A O HIS 3.A HD1 2.996 2.078 ALA 5.A N THR 272.A O ALA 5.A H 2.863 1.892 SER 6.A N GLY 126.A O SER 6.A H 2.993 2.103 GLU 8.A N GLU 8.A OE1 GLU 8.A H 2.953 2.125 ARG 11.A N GLU 8.A O ARG 11.A H 2.973 2.017 SER 12.A N ASP 15.A OD2 SER 12.A H 2.971 2.029 ASP 15.A N SER 12.A O ASP 15.A H 2.803 2.059 PHE 16.A N SER 12.A O PHE 16.A H 3.450 2.500 GLN 17.A N TYR 13.A O GLN 17.A H 2.880 1.907 GLN 17.A NE2 TYR 13.A OH GLN 17.A HE22 2.767 1.974 GLN 17.A NE2 LYS 284.A O GLN 17.A HE21 3.581 2.711 LYS 18.A N GLU 14.A O LYS 18.A H 3.368 2.609 LYS 18.A N ASP 15.A O LYS 18.A H 2.934 2.154 VAL 19.A N ASP 15.A O VAL 19.A H 3.276 2.406 TYR 20.A N PHE 16.A O TYR 20.A H 2.925 1.950 ASN 21.A N GLN 17.A O ASN 21.A H 3.016 2.058 ASN 21.A ND2 GLN 289.A OE1 ASN 21.A HD21 2.575 1.827 ALA 22.A N LYS 18.A O ALA 22.A H 2.991 2.092 ILE 23.A N VAL 19.A O ILE 23.A H 2.900 1.932 ALA 24.A N TYR 20.A O ALA 24.A H 2.878 1.901 LEU 25.A N ASN 21.A O LEU 25.A H 3.052 2.111 LYS 26.A N ALA 22.A O LYS 26.A H 3.115 2.173 LEU 27.A N ILE 23.A O LEU 27.A H 2.897 2.037 ARG 28.A N ALA 24.A O ARG 28.A H 2.991 2.020 ARG 28.A NH1 LEU 291.A O ARG 28.A HH12 2.965 1.996 ARG 28.A NH2 LEU 291.A OXT ARG 28.A HH22 2.653 1.888 GLU 29.A N LEU 25.A O GLU 29.A H 3.202 2.296 ASP 30.A N LYS 26.A O ASP 30.A H 2.969 1.993 TYR 33.A N ASP 30.A O TYR 33.A H 3.422 2.447 TYR 36.A N GLU 32.A O TYR 36.A H 3.073 2.140 ILE 37.A N ASP 34.A O ILE 37.A H 2.995 2.070 GLY 38.A N TYR 33.A O GLY 38.A H 2.798 1.870 LEU 43.A N TYR 39.A O LEU 43.A H 3.156 2.257 VAL 44.A N GLY 40.A O VAL 44.A H 3.072 2.119 ARG 45.A N PRO 41.A O ARG 45.A H 3.073 2.092 ARG 45.A NE HIS 49.A NE2 ARG 45.A HE 3.638 2.853 ARG 45.A NH1 ALA 80.A O ARG 45.A HH12 2.963 1.971 LEU 46.A N VAL 42.A O LEU 46.A H 2.858 1.959 ALA 47.A N LEU 43.A O ALA 47.A H 3.041 2.064 TRP 48.A N VAL 44.A O TRP 48.A H 3.083 2.131 HIS 49.A N ARG 45.A O HIS 49.A H 2.911 1.936 HIS 49.A ND1 ASN 79.A OD1 HIS 49.A HD1 2.769 1.834 ILE 50.A N LEU 46.A O ILE 50.A H 3.104 2.138 SER 51.A N ALA 47.A O SER 51.A H 3.457 2.551 GLY 52.A N TRP 48.A O GLY 52.A H 2.922 2.137 TRP 54.A N SER 51.A O TRP 54.A H 3.383 2.478 TRP 54.A NE1 ASN 59.A OD1 TRP 54.A HE1 3.012 2.031 ASP 55.A N THR 60.A O ASP 55.A H 2.963 1.988 LYS 56.A N ARG 157.A O LYS 56.A H 3.188 2.208 LYS 56.A NZ GLN 156.A O LYS 56.A HZ2 3.079 2.203 HIS 57.A N ASP 55.A OD1 HIS 57.A H 2.956 2.018 ASN 59.A ND2 LEU 1.A O ASN 59.A HD22 2.825 1.872 ASN 59.A ND2 GLY 270.A O ASN 59.A HD21 3.526 2.651 THR 60.A N ASP 58.A OD1 THR 60.A H 3.161 2.208 GLY 62.A N THR 53.A OG1 GLY 62.A H 3.056 2.108 TYR 64.A OH VAL 4.A O TYR 64.A HH 2.630 1.812 GLY 66.A N SER 63.A O GLY 66.A H 3.400 2.451 THR 67.A OG1 GLU 73.A OE1 THR 67.A HG1 2.872 2.073 ARG 69.A N GLY 66.A O ARG 69.A H 3.381 2.422 ARG 69.A NH1 THR 130.A O ARG 69.A HH12 3.367 2.485 ARG 69.A NH2 THR 130.A O ARG 69.A HH22 3.493 2.656 PHE 70.A N THR 67.A O PHE 70.A H 2.942 2.035 LYS 72.A NZ THR 135.A O LYS 72.A HZ3 2.709 1.793 LYS 72.A NZ ASP 137.A OD1 LYS 72.A HZ1 3.175 2.152 PHE 74.A N PHE 70.A O PHE 74.A H 2.937 1.992 ASN 75.A N LYS 71.A O ASN 75.A H 2.858 1.902 ASP 76.A N GLU 73.A O ASP 76.A H 3.447 2.597 ASN 79.A N ASP 76.A O ASN 79.A H 2.735 1.816 ASN 79.A ND2 GLU 73.A O ASN 79.A HD22 2.717 1.810 ALA 80.A N PRO 77.A O ALA 80.A H 3.117 2.153 GLY 81.A N GLN 83.A OE1 GLY 81.A H 2.794 2.063 LEU 82.A N ASN 79.A O LEU 82.A H 3.001 2.067 GLN 83.A N GLN 83.A OE1 GLN 83.A H 2.834 1.971 ASN 84.A N GLY 81.A O ASN 84.A H 3.406 2.505 GLY 85.A N LEU 82.A O GLY 85.A H 2.679 1.948 PHE 86.A N LEU 82.A O PHE 86.A H 3.082 2.121 LYS 87.A N GLN 83.A O LYS 87.A H 2.885 1.914 PHE 88.A N ASN 84.A O PHE 88.A H 3.279 2.395 LEU 89.A N GLY 85.A O LEU 89.A H 3.246 2.372 GLU 90.A N PHE 86.A O GLU 90.A H 2.976 2.104 HIS 93.A N LEU 89.A O HIS 93.A H 3.037 2.147 HIS 93.A NE2 ILE 99.A O HIS 93.A HE2 2.644 1.751 LYS 94.A N GLU 90.A O LYS 94.A H 3.144 2.177 GLU 95.A N PRO 91.A O GLU 95.A H 3.132 2.250 PHE 96.A N ILE 92.A O PHE 96.A H 3.069 2.287 ILE 99.A N PHE 96.A O ILE 99.A H 3.216 2.257 SER 100.A N GLU 8.A OE2 SER 100.A H 2.891 1.928 SER 100.A OG ARG 127.A O SER 100.A HG 2.797 1.861 SER 101.A N ASP 129.A OD1 SER 101.A H 2.770 2.073 SER 101.A OG ASP 129.A OD2 SER 101.A HG 3.023 2.274 ASP 103.A N SER 100.A OG ASP 103.A H 3.335 2.454 LEU 104.A N SER 100.A O LEU 104.A H 2.959 2.031 PHE 105.A N SER 101.A O PHE 105.A H 2.851 1.884 SER 106.A N GLY 102.A O SER 106.A H 3.008 2.064 SER 106.A OG GLY 102.A O SER 106.A HG 3.045 2.239 SER 106.A OG ASP 103.A O SER 106.A HG 3.317 2.662 LEU 107.A N ASP 103.A O LEU 107.A H 2.973 2.057 GLY 108.A N LEU 104.A O GLY 108.A H 2.882 1.934 VAL 110.A N SER 106.A O VAL 110.A H 3.375 2.400 THR 111.A N LEU 107.A O THR 111.A H 2.892 1.942 THR 111.A OG1 LEU 107.A O THR 111.A HG1 2.756 1.798 ALA 112.A N GLY 108.A O ALA 112.A H 2.942 1.972 VAL 113.A N GLY 109.A O VAL 113.A H 3.098 2.126 GLN 114.A N VAL 110.A O GLN 114.A H 3.081 2.111 GLN 114.A NE2 TYR 20.A OH GLN 114.A HE22 3.225 2.406 GLN 114.A NE2 PHE 283.A O GLN 114.A HE21 2.895 2.035 GLU 115.A N THR 111.A O GLU 115.A H 2.827 1.894 MET 116.A N ALA 112.A O MET 116.A H 2.936 2.021 GLN 117.A NE2 GLU 115.A O GLN 117.A HE22 3.581 2.703 GLY 118.A N VAL 113.A O GLY 118.A H 2.850 2.015 LYS 120.A NZ PHE 283.A O LYS 120.A HZ1 3.027 2.155 LYS 120.A NZ GLU 288.A OE1 LYS 120.A HZ2 3.002 2.000 ILE 121.A N GLN 114.A OE1 ILE 121.A H 3.141 2.293 TRP 123.A N PHE 281.A O TRP 123.A H 3.086 2.113 TRP 123.A NE1 SER 106.A OG TRP 123.A HE1 2.957 1.975 GLY 126.A N ASP 103.A OD2 GLY 126.A H 3.090 2.158 ARG 127.A N ASP 103.A OD1 ARG 127.A H 2.964 2.081 THR 130.A N GLY 65.A O THR 130.A H 3.177 2.217 THR 130.A OG1 THR 134.A OG1 THR 130.A HG1 2.702 1.939 THR 134.A N PRO 131.A O THR 134.A H 2.835 1.902 THR 134.A OG1 PRO 131.A O THR 134.A HG1 2.750 1.823 THR 135.A N GLU 132.A O THR 135.A H 3.300 2.396 THR 135.A OG1 GLU 132.A O THR 135.A HG1 2.850 2.322 ARG 140.A NH1 THR 53.A O ARG 140.A HH11 2.735 1.776 ARG 140.A NH1 THR 60.A OG1 ARG 140.A HH12 2.986 2.136 ARG 140.A NH2 THR 60.A OG1 ARG 140.A HH22 2.945 2.067 LYS 146.A NZ ASP 145.A OD1 LYS 146.A HZ2 2.952 2.143 GLY 149.A N ASP 147.A OD2 GLY 149.A H 3.292 2.390 VAL 151.A N ASP 147.A O VAL 151.A H 3.284 2.301 ARG 152.A N ALA 148.A O ARG 152.A H 3.219 2.270 ARG 152.A NE ASP 162.A OD1 ARG 152.A HE 2.951 2.116 ARG 152.A NH1 ASP 238.A OD2 ARG 152.A HH12 3.001 2.020 ARG 152.A NH2 ASP 162.A OD1 ARG 152.A HH21 3.182 2.406 ARG 152.A NH2 ASP 162.A OD2 ARG 152.A HH21 3.478 2.498 ARG 152.A NH2 ASP 238.A OD1 ARG 152.A HH22 3.162 2.167 THR 153.A N GLY 149.A O THR 153.A H 3.033 2.084 PHE 154.A N TYR 150.A O PHE 154.A H 2.799 1.866 PHE 155.A N VAL 151.A O PHE 155.A H 2.978 2.005 GLN 156.A N ARG 152.A O GLN 156.A H 3.310 2.513 GLN 156.A NE2 THR 153.A O GLN 156.A HE22 2.685 1.864 ARG 157.A N PHE 154.A O ARG 157.A H 2.937 2.141 ARG 157.A NE TRP 54.A O ARG 157.A HE 2.952 2.077 ARG 157.A NH1 ARG 140.A O ARG 157.A HH12 2.746 1.802 ARG 157.A NH2 TRP 54.A O ARG 157.A HH21 3.008 2.159 ARG 157.A NH2 ARG 140.A O ARG 157.A HH22 3.153 2.371 LEU 158.A N PHE 155.A O LEU 158.A H 3.384 2.524 ASN 159.A N GLN 156.A O ASN 159.A H 3.159 2.449 ASN 159.A ND2 ASN 159.A O ASN 159.A HD22 2.866 2.106 MET 160.A N PHE 155.A O MET 160.A H 2.822 1.874 ASN 161.A N GLU 164.A OE1 ASN 161.A H 2.966 2.041 ARG 163.A NE ASP 258.A OD2 ARG 163.A HE 2.903 2.095 ARG 163.A NH2 GLU 247.A OE1 ARG 163.A HH22 2.952 1.978 GLU 164.A N ASN 161.A OD1 GLU 164.A H 3.314 2.342 VAL 165.A N ASN 161.A O VAL 165.A H 3.009 2.068 VAL 166.A N ASP 162.A O VAL 166.A H 2.880 1.977 ALA 167.A N ARG 163.A O ALA 167.A H 2.859 1.884 LEU 168.A N GLU 164.A O LEU 168.A H 2.910 1.944 MET 169.A N VAL 165.A O MET 169.A H 3.138 2.359 MET 169.A N VAL 166.A O MET 169.A H 3.208 2.468 GLY 170.A N VAL 166.A O GLY 170.A H 3.290 2.510 GLY 170.A N ALA 167.A O GLY 170.A H 2.903 2.114 ALA 171.A N LEU 168.A O ALA 171.A H 3.413 2.475 HIS 172.A N MET 169.A O HIS 172.A H 2.849 1.898 HIS 172.A ND1 ASP 232.A OD1 HIS 172.A HD1 3.107 2.153 ALA 173.A N GLY 170.A O ALA 173.A H 3.321 2.354 LEU 174.A N ALA 171.A O LEU 174.A H 3.021 2.094 GLY 175.A N ASN 192.A O GLY 175.A H 2.855 1.885 LYS 176.A NZ THR 177.A O LYS 176.A HZ2 3.140 2.277 LYS 176.A NZ GLU 185.A OE2 LYS 176.A HZ3 2.872 1.883 THR 177.A N GLY 186.A O THR 177.A H 2.988 2.060 THR 177.A OG1 GLY 186.A O THR 177.A HG1 3.041 2.093 HIS 178.A NE2 ASP 34.A OD1 HIS 178.A HE2 3.191 2.453 HIS 178.A NE2 ASP 34.A OD2 HIS 178.A HE2 2.841 1.971 LEU 179.A N GLU 185.A OE1 LEU 179.A H 3.156 2.225 ASN 181.A N HIS 178.A O ASN 181.A H 3.193 2.425 SER 182.A N HIS 178.A O SER 182.A H 3.211 2.288 GLY 183.A N LEU 179.A O GLY 183.A H 2.967 2.133 GLU 185.A N GLN 219.A OE1 GLU 185.A H 3.361 2.433 GLY 186.A N THR 177.A O GLY 186.A H 3.276 2.311 ALA 190.A N GLU 198.A OE2 ALA 190.A H 2.851 1.974 ALA 191.A N GLU 198.A OE1 ALA 191.A H 3.003 2.177 ASN 192.A ND2 ALA 190.A O ASN 192.A HD22 3.442 2.889 ASN 193.A ND2 ILE 37.A O ASN 193.A HD22 2.948 2.005 PHE 195.A N MET 116.A O PHE 195.A H 2.836 1.945 ASN 197.A ND2 TYR 248.A O ASN 197.A HD22 3.000 2.034 TYR 200.A N ASN 197.A O TYR 200.A H 2.894 2.068 TYR 200.A OH VAL 166.A O TYR 200.A HH 2.726 1.832 LEU 201.A N ASN 197.A O LEU 201.A H 3.480 2.536 ASN 202.A N GLU 198.A O ASN 202.A H 2.905 1.931 ASN 202.A ND2 GLY 188.A O ASN 202.A HD22 2.868 1.985 ASN 202.A ND2 GLU 198.A OE2 ASN 202.A HD21 3.319 2.585 LEU 203.A N PHE 199.A O LEU 203.A H 3.073 2.210 LEU 204.A N TYR 200.A O LEU 204.A H 2.910 1.988 ASN 205.A N LEU 201.A O ASN 205.A H 2.782 1.934 GLU 206.A N ASN 202.A O GLU 206.A H 3.179 2.288 TRP 208.A NE1 ASN 202.A O TRP 208.A HE1 2.907 2.155 LYS 209.A N ASP 221.A O LYS 209.A H 2.733 1.813 GLU 211.A N GLN 219.A O GLU 211.A H 2.886 1.911 ASN 213.A N ASN 217.A O ASN 213.A H 2.911 1.976 ASN 213.A ND2 GLY 183.A O ASN 213.A HD21 2.956 2.090 ASN 213.A ND2 GLN 219.A OE1 ASN 213.A HD22 2.788 1.821 ALA 215.A N ASN 213.A OD1 ALA 215.A H 2.710 1.961 ASN 216.A N ASN 213.A O ASN 216.A H 3.000 2.059 ASN 217.A N ASN 213.A OD1 ASN 217.A H 3.143 2.184 GLN 219.A N GLU 211.A O GLN 219.A H 2.938 1.960 GLN 219.A NE2 GLU 185.A O GLN 219.A HE21 3.027 2.056 GLN 219.A NE2 ASP 221.A OD1 GLN 219.A HE22 2.929 2.025 TRP 220.A N MET 228.A O TRP 220.A H 3.027 2.084 ASP 221.A N LYS 209.A O ASP 221.A H 2.926 2.006 SER 222.A N TYR 226.A O SER 222.A H 2.993 2.084 SER 224.A OG GLU 206.A OE2 SER 224.A HG 3.162 2.504 GLY 225.A N SER 222.A O GLY 225.A H 3.087 2.117 MET 227.A N PRO 187.A O MET 227.A H 2.835 1.895 MET 228.A N TRP 220.A O MET 228.A H 2.879 1.997 LEU 229.A N ASP 232.A OD2 LEU 229.A H 2.985 2.088 THR 231.A N ALA 144.A O THR 231.A H 2.964 2.056 TYR 233.A N LEU 229.A O TYR 233.A H 2.856 1.914 SER 234.A N PRO 230.A O SER 234.A H 2.856 1.912 SER 234.A OG PRO 230.A O SER 234.A HG 3.116 2.163 LEU 235.A N ASP 232.A O LEU 235.A H 3.259 2.316 ILE 236.A N TYR 233.A O ILE 236.A H 2.933 1.988 GLN 237.A N SER 234.A O GLN 237.A H 3.076 2.361 ASP 238.A N SER 234.A O ASP 238.A H 3.146 2.385 TYR 241.A N ASP 238.A OD1 TYR 241.A H 3.110 2.159 LEU 242.A N ASP 238.A O LEU 242.A H 2.912 1.952 SER 243.A N PRO 239.A O SER 243.A H 3.394 2.467 ILE 244.A N TYR 241.A O ILE 244.A H 2.830 2.121 VAL 245.A N TYR 241.A O VAL 245.A H 2.900 1.926 LYS 246.A N LEU 242.A O LYS 246.A H 3.250 2.301 GLU 247.A N SER 243.A O GLU 247.A H 3.348 2.478 TYR 248.A N ILE 244.A O TYR 248.A H 3.139 2.175 ALA 249.A N VAL 245.A O ALA 249.A H 3.011 2.055 ASN 250.A N LYS 246.A O ASN 250.A H 2.948 2.087 ASN 250.A ND2 LYS 246.A O ASN 250.A HD22 2.788 1.954 ASP 251.A N TYR 248.A O ASP 251.A H 3.024 2.193 GLN 252.A NE2 ASN 197.A OD1 GLN 252.A HE22 3.424 2.565 LYS 254.A N ASP 251.A OD1 LYS 254.A H 3.369 2.397 LYS 254.A NZ ASP 258.A OD1 LYS 254.A HZ2 3.377 2.344 LYS 254.A NZ ASP 258.A OD2 LYS 254.A HZ2 2.724 1.962 PHE 255.A N ASP 251.A O PHE 255.A H 3.056 2.082 PHE 256.A N GLN 252.A O PHE 256.A H 2.824 1.875 LYS 257.A N ASP 253.A O no hydrogen 2.911 N/A ASP 258.A N LYS 254.A O ASP 258.A H 2.988 2.029 PHE 259.A N PHE 255.A O PHE 259.A H 2.812 1.854 SER 260.A N PHE 256.A O SER 260.A H 2.941 2.000 SER 260.A OG LYS 120.A O SER 260.A HG 2.849 2.200 LYS 261.A N LYS 257.A O LYS 261.A H 3.324 2.379 LYS 261.A NZ ASP 258.A OD1 LYS 261.A HZ3 3.237 2.281 ALA 262.A N ASP 258.A O ALA 262.A H 2.954 2.022 PHE 263.A N PHE 259.A O PHE 263.A H 2.782 1.900 GLU 264.A N SER 260.A O GLU 264.A H 3.166 2.186 LYS 265.A N LYS 261.A O LYS 265.A H 3.147 2.174 LYS 265.A NZ ASN 159.A O LYS 265.A HZ3 2.855 2.034 LYS 265.A NZ GLU 164.A OE1 LYS 265.A HZ2 3.213 2.260 LEU 266.A N ALA 262.A O LEU 266.A H 2.923 2.014 LEU 267.A N PHE 263.A O LEU 267.A H 2.872 1.959 GLU 268.A N GLU 264.A O GLU 268.A H 2.962 2.052 ILE 271.A N GLU 268.A O ILE 271.A H 3.424 2.528 THR 272.A N HIS 3.A O THR 272.A H 2.902 1.950 LYS 275.A NZ LYS 275.A O LYS 275.A HZ1 2.635 1.826 ALA 277.A N PRO 274.A O ALA 277.A H 3.048 2.139 PHE 281.A N TRP 123.A O PHE 281.A H 2.783 1.907 THR 285.A N GLU 288.A OE1 THR 285.A H 2.927 1.960 LEU 286.A N GLU 115.A OE2 LEU 286.A H 3.436 2.574 GLU 288.A N THR 285.A OG1 GLU 288.A H 3.314 2.455 GLN 289.A N THR 285.A O GLN 289.A H 3.109 2.229 GLN 289.A NE2 ASN 21.A OD1 GLN 289.A HE21 2.643 1.843 GLY 290.A N GLU 287.A O GLY 290.A H 3.322 2.404 LEU 291.A N LEU 286.A O LEU 291.A H 2.950 1.981