Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1e9l_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 2.A N GLY 334.A O GLN 2.A H 2.372 1.551 MET 4.A N ALA 336.A O MET 4.A H 2.839 1.900 CYS 5.A N HIS 32.A O CYS 5.A H 2.863 2.023 CYS 5.A SG LEU 3.A O no hydrogen 3.794 N/A TYR 6.A N VAL 338.A O TYR 6.A H 3.026 2.075 TYR 7.A N ILE 34.A O TYR 7.A H 2.891 1.943 THR 8.A N ASP 342.A OD2 THR 8.A H 2.866 1.989 ARG 14.A N ALA 11.A O ARG 14.A H 3.347 2.419 ARG 14.A NH1 ASP 342.A OD1 ARG 14.A HH12 2.805 1.811 GLU 17.A N GLU 17.A OE1 GLU 17.A H 2.806 1.869 GLY 18.A N PRO 15.A O GLY 18.A H 2.584 1.745 SER 19.A N ILE 16.A O SER 19.A H 2.962 2.021 SER 19.A OG ALA 11.A O SER 19.A HG 3.372 2.416 PHE 20.A N ALA 11.A O PHE 20.A H 3.396 2.462 ASN 24.A N LYS 21.A O ASN 24.A H 2.871 1.949 CYS 28.A N ASP 26.A OD1 CYS 28.A H 3.266 2.305 LEU 29.A N ASP 26.A O LEU 29.A H 3.379 2.439 THR 31.A N LEU 3.A O THR 31.A H 2.795 1.840 THR 31.A OG1 LEU 3.A O THR 31.A HG1 3.115 2.219 HIS 32.A N LEU 3.A O HIS 32.A H 3.457 2.483 HIS 32.A ND1 THR 31.A OG1 HIS 32.A HD1 3.036 2.090 LEU 33.A N LYS 70.A O LEU 33.A H 2.892 1.964 ILE 34.A N CYS 5.A O ILE 34.A H 2.905 1.938 TYR 35.A N LEU 72.A O TYR 35.A H 2.874 1.953 ALA 36.A N TYR 7.A O ALA 36.A H 2.685 1.820 ALA 38.A N ALA 74.A O ALA 38.A H 2.834 1.963 GLY 39.A N THR 46.A O GLY 39.A H 2.514 1.673 GLN 41.A N GLU 44.A O GLN 41.A H 2.892 1.939 GLU 44.A N GLN 41.A O GLU 44.A H 3.161 2.453 ILE 45.A N SER 101.A OG ILE 45.A H 2.823 1.875 THR 46.A N GLY 39.A O THR 46.A H 2.957 2.013 THR 48.A N ASP 52.A OD2 THR 48.A H 3.330 2.515 HIS 49.A N ASP 52.A OD2 HIS 49.A H 3.389 2.567 ASP 52.A N HIS 49.A O ASP 52.A H 2.933 2.072 ARG 54.A N GLN 51.A O ARG 54.A H 3.101 2.297 ASP 55.A N ASP 52.A O ASP 55.A H 2.602 1.833 TYR 56.A N ASP 52.A O TYR 56.A H 3.004 2.107 GLU 57.A N LEU 53.A O GLU 57.A H 3.334 2.390 ALA 58.A N ARG 54.A O ALA 58.A H 3.363 2.503 LEU 59.A N ASP 55.A O LEU 59.A H 2.706 1.829 ASN 60.A N TYR 56.A O ASN 60.A H 2.917 1.959 ASN 60.A ND2 TYR 56.A O ASN 60.A HD21 2.784 1.985 LEU 62.A N LEU 59.A O LEU 62.A H 3.423 2.496 LYS 63.A N ASN 60.A O LYS 63.A H 3.022 2.147 LYS 63.A NZ ASN 110.A O LYS 63.A HZ2 2.746 1.910 LYS 63.A NZ ASP 112.A OD2 LYS 63.A HZ1 2.554 1.739 ASP 64.A N GLY 61.A O ASP 64.A H 3.482 2.615 LYS 65.A N LEU 62.A O LYS 65.A H 2.875 2.132 ASN 66.A N LEU 62.A O ASN 66.A H 3.058 2.105 GLU 68.A N ASN 66.A OD1 GLU 68.A H 3.023 2.207 LEU 69.A N ASN 66.A O LEU 69.A H 3.091 2.206 LEU 69.A N ASN 66.A OD1 LEU 69.A H 3.295 2.578 LYS 70.A N THR 31.A O LYS 70.A H 2.963 2.010 THR 71.A N ASP 112.A OD2 THR 71.A H 2.921 1.951 THR 71.A OG1 ASN 60.A OD1 THR 71.A HG1 2.681 1.992 LEU 72.A N LEU 33.A O LEU 72.A H 2.837 1.896 LEU 73.A N GLY 113.A O LEU 73.A H 3.101 2.158 ALA 74.A N TYR 35.A O ALA 74.A H 3.407 2.493 ILE 75.A N ASN 115.A O ILE 75.A H 2.916 1.996 GLY 77.A N ASP 117.A O GLY 77.A H 2.911 1.943 PHE 85.A N PRO 82.A O PHE 85.A H 2.837 2.057 SER 86.A N PRO 82.A O SER 86.A H 3.218 2.249 ALA 87.A N ALA 83.A O ALA 87.A H 3.271 2.373 MET 88.A N PRO 84.A O MET 88.A H 3.081 2.320 VAL 89.A N PHE 85.A O VAL 89.A H 2.844 1.913 ASN 94.A N THR 91.A OG1 ASN 94.A H 3.012 2.045 ARG 95.A N THR 91.A O ARG 95.A H 3.009 2.059 ARG 95.A NE VAL 89.A O ARG 95.A HE 3.487 2.648 ARG 95.A NH1 GLU 140.A OE2 ARG 95.A HH12 2.669 1.923 GLN 96.A N PRO 92.A O GLN 96.A H 3.011 2.051 ILE 97.A N GLN 93.A O ILE 97.A H 3.154 2.298 PHE 98.A N ASN 94.A O PHE 98.A H 3.080 2.138 ILE 99.A N ARG 95.A O ILE 99.A H 3.008 2.031 GLN 100.A N GLN 96.A O GLN 100.A H 3.180 2.249 SER 101.A N ILE 97.A O SER 101.A H 3.113 2.164 VAL 102.A N PHE 98.A O VAL 102.A H 2.780 1.869 ILE 103.A N ILE 99.A O ILE 103.A H 3.092 2.221 ARG 104.A N GLN 100.A O ARG 104.A H 2.891 1.917 PHE 105.A N SER 101.A O PHE 105.A H 2.763 1.854 LEU 106.A N VAL 102.A O LEU 106.A H 2.907 1.984 ARG 107.A N ILE 103.A O ARG 107.A H 2.959 2.025 ARG 107.A NH2 PRO 155.A O ARG 107.A HH22 3.241 2.248 GLN 108.A N ARG 104.A O GLN 108.A H 3.043 2.248 TYR 109.A N PHE 105.A O TYR 109.A H 3.236 2.402 PHE 111.A N LEU 106.A O PHE 111.A H 2.962 2.069 ASP 112.A N THR 71.A O ASP 112.A H 2.827 1.985 LEU 114.A N LEU 158.A O LEU 114.A H 2.956 2.014 ASN 115.A N LEU 73.A O ASN 115.A H 2.655 1.690 ASN 115.A ND2 LEU 116.A O ASN 115.A HD21 3.634 2.841 ASN 115.A ND2 GLN 187.A OE1 ASN 115.A HD22 3.275 2.313 LEU 116.A N THR 160.A O LEU 116.A H 3.231 2.255 ASP 117.A N ILE 75.A O ASP 117.A H 2.809 1.942 ARG 124.A NH2 TRP 78.A O ARG 124.A HH22 3.309 2.445 SER 126.A N SER 123.A O SER 126.A H 3.182 2.308 ASP 130.A N PRO 127.A O ASP 130.A H 2.895 1.980 LYS 131.A N PRO 128.A O LYS 131.A H 2.925 1.978 LEU 133.A N LYS 129.A O LEU 133.A H 2.851 1.918 PHE 134.A N ASP 130.A O PHE 134.A H 2.807 1.894 VAL 136.A N HIS 132.A O VAL 136.A H 3.111 2.250 LEU 137.A N LEU 133.A O LEU 137.A H 2.877 1.922 VAL 138.A N PHE 134.A O VAL 138.A H 3.223 2.314 LYS 139.A N SER 135.A O LYS 139.A H 3.149 2.177 GLU 140.A N VAL 136.A O GLU 140.A H 2.887 1.943 MET 141.A N LEU 137.A O MET 141.A H 2.741 1.819 ARG 142.A N VAL 138.A O ARG 142.A H 2.757 1.824 ARG 142.A NE GLU 146.A OE2 ARG 142.A HE 3.460 2.509 LYS 143.A N LYS 139.A O LYS 143.A H 3.181 2.314 ALA 144.A N GLU 140.A O ALA 144.A H 3.267 2.380 PHE 145.A N MET 141.A O PHE 145.A H 3.188 2.238 GLU 146.A N ARG 142.A O GLU 146.A H 3.136 2.277 GLU 147.A N LYS 143.A O GLU 147.A H 2.920 2.052 GLU 148.A N ALA 144.A O GLU 148.A H 2.751 1.793 SER 149.A N PHE 145.A O SER 149.A H 3.003 2.129 SER 149.A OG ILE 154.A O SER 149.A HG 3.064 2.345 VAL 150.A N GLU 146.A O VAL 150.A H 3.209 2.445 VAL 150.A N GLU 147.A O VAL 150.A H 2.788 2.075 GLU 151.A N GLU 147.A O GLU 151.A H 2.902 1.943 LYS 152.A N GLU 148.A O LYS 152.A H 2.985 2.165 ILE 154.A N SER 149.A O ILE 154.A H 3.294 2.444 ARG 156.A NH1 ASP 184.A OD1 ARG 156.A HH12 2.881 1.928 LEU 158.A N ASP 112.A O LEU 158.A H 2.847 1.893 LEU 159.A N ASP 184.A OD1 LEU 159.A H 2.866 1.937 THR 160.A N LEU 114.A O THR 160.A H 3.032 2.054 THR 162.A N LEU 116.A O THR 162.A H 3.046 2.145 THR 162.A OG1 ASP 117.A OD1 THR 162.A HG1 3.360 2.558 GLY 163.A N GLN 187.A O GLY 163.A H 3.028 2.200 VAL 169.A N ILE 166.A O VAL 169.A H 2.800 1.969 ILE 170.A N ILE 166.A O ILE 170.A H 3.008 2.094 LYS 171.A N ILE 167.A O LYS 171.A H 2.937 1.999 GLY 173.A N VAL 169.A O GLY 173.A H 3.207 2.490 TYR 174.A N ILE 170.A O TYR 174.A H 3.021 2.138 LEU 179.A N LYS 175.A O LEU 179.A H 3.054 2.165 SER 180.A N ILE 176.A O SER 180.A H 2.824 1.890 GLN 181.A N GLU 178.A O GLN 181.A H 3.101 2.247 SER 182.A N GLU 178.A O SER 182.A H 3.349 2.520 SER 182.A N LEU 179.A O SER 182.A H 3.307 2.599 LEU 183.A N LEU 179.A O LEU 183.A H 3.015 2.084 ASP 184.A N LEU 159.A O ASP 184.A H 2.846 1.875 ILE 186.A N LYS 238.A O ILE 186.A H 2.964 2.082 GLN 187.A N SER 161.A O GLN 187.A H 2.927 2.113 GLN 187.A NE2 TYR 6.A OH GLN 187.A HE21 3.561 2.781 VAL 188.A N ILE 240.A O VAL 188.A H 2.890 1.976 MET 189.A N GLY 163.A O MET 189.A H 3.083 2.111 THR 190.A N VAL 188.A O THR 190.A H 2.790 2.024 THR 190.A OG1 GLY 242.A O THR 190.A HG1 2.781 2.251 ASP 192.A N ASN 204.A OD1 ASP 192.A H 2.956 2.153 LEU 193.A N ASN 204.A O LEU 193.A H 3.257 2.301 ASP 195.A N ASP 198.A OD2 ASP 195.A H 3.355 2.429 LYS 197.A N ASP 195.A OD1 LYS 197.A H 2.806 1.894 ASP 198.A N ASP 195.A O ASP 198.A H 2.697 1.807 GLY 199.A N PRO 196.A O GLY 199.A H 3.365 2.522 THR 201.A N ALA 262.A O THR 201.A H 2.749 1.883 THR 201.A OG1 ALA 262.A O THR 201.A HG1 3.375 2.502 ASN 204.A ND2 TYR 246.A O ASN 204.A HD21 3.072 2.470 LEU 207.A N GLN 301.A O LEU 207.A H 3.099 2.256 LYS 209.A NZ ASP 213.A O LYS 209.A HZ1 3.366 2.484 SER 210.A N ASP 213.A OD2 SER 210.A H 3.158 2.207 TYR 212.A N SER 210.A OG TYR 212.A H 3.354 2.430 ASP 213.A N SER 210.A O ASP 213.A H 2.747 1.899 SER 217.A N ILE 214.A O SER 217.A H 3.002 2.178 ALA 218.A N GLY 215.A O ALA 218.A H 3.324 2.388 ASP 219.A N LYS 216.A O ASP 219.A H 3.300 2.376 LEU 220.A N SER 217.A O LEU 220.A H 3.012 2.134 ASN 221.A N ASP 219.A O ASN 221.A H 2.656 1.796 VAL 222.A N PRO 206.A O VAL 222.A H 2.826 1.882 ASP 223.A N LEU 207.A O ASP 223.A H 3.174 2.239 SER 224.A OG ASN 221.A OD1 SER 224.A HG 3.134 2.285 ILE 225.A N ASN 221.A O ILE 225.A H 3.003 2.026 ILE 226.A N VAL 222.A O ILE 226.A H 3.021 2.055 SER 227.A N ASP 223.A O SER 227.A H 3.219 2.321 TYR 228.A N SER 224.A O TYR 228.A H 3.004 2.120 TRP 229.A N ILE 225.A O TRP 229.A H 3.130 2.174 TRP 229.A NE1 ALA 164.A O TRP 229.A HE1 2.992 2.087 LYS 230.A N ILE 226.A O LYS 230.A H 2.894 1.929 ASP 231.A N SER 227.A O ASP 231.A H 2.775 1.874 HIS 232.A N TRP 229.A O HIS 232.A H 3.198 2.332 HIS 232.A ND1 TYR 228.A O HIS 232.A HD1 2.705 1.862 ALA 234.A N TRP 229.A O ALA 234.A H 3.159 2.264 LYS 238.A N ALA 235.A O LYS 238.A H 3.046 2.275 LYS 238.A NZ LEU 183.A O LYS 238.A HZ1 2.733 2.053 LEU 239.A N SER 236.A O LEU 239.A H 2.956 2.095 ILE 240.A N ILE 186.A O ILE 240.A H 3.069 2.144 VAL 241.A N GLY 335.A O VAL 241.A H 2.861 1.927 PHE 243.A N VAL 337.A O PHE 243.A H 2.806 1.920 ALA 245.A N TRP 339.A O ALA 245.A H 3.112 2.178 TYR 246.A OH ASP 192.A OD1 TYR 246.A HH 2.937 2.041 GLY 247.A N LEU 280.A O GLY 247.A H 3.013 2.070 HIS 248.A N GLY 314.A O HIS 248.A H 3.128 2.223 HIS 248.A ND1 GLY 278.A O HIS 248.A HD1 2.812 1.907 HIS 248.A NE2 ASP 192.A OD1 HIS 248.A HE2 2.589 1.635 THR 249.A N GLY 278.A O THR 249.A H 2.942 2.038 PHE 250.A N TRP 312.A O PHE 250.A H 2.893 1.965 LEU 252.A N ASN 310.A O LEU 252.A H 3.119 2.349 SER 253.A N PRO 263.A O SER 253.A H 3.512 2.550 SER 256.A N ASP 254.A OD1 SER 256.A H 2.967 2.073 LYS 257.A N ASP 254.A O LYS 257.A H 2.907 2.004 GLY 261.A N THR 201.A O GLY 261.A H 2.978 2.090 ALA 262.A N GLY 259.A O ALA 262.A H 3.001 2.171 THR 264.A N GLY 199.A O THR 264.A H 2.946 1.989 ILE 265.A N ILE 251.A O ILE 265.A H 3.024 2.191 GLY 268.A N THR 249.A O GLY 268.A H 3.264 2.512 TYR 273.A N GLU 284.A OE1 TYR 273.A H 2.780 1.924 THR 274.A N GLU 284.A OE1 THR 274.A H 3.035 2.133 ASP 275.A N GLY 271.A O ASP 275.A H 3.389 2.539 GLY 278.A N GLY 268.A O GLY 278.A H 3.165 2.364 LEU 280.A N GLY 247.A O LEU 280.A H 3.365 2.582 ALA 281.A N GLU 284.A OE2 ALA 281.A H 2.968 1.983 TYR 282.A N ALA 245.A O TYR 282.A H 3.001 2.277 TYR 282.A N MET 343.A O TYR 282.A H 2.954 2.146 VAL 285.A N ALA 281.A O VAL 285.A H 3.103 2.346 VAL 285.A N TYR 282.A O VAL 285.A H 2.922 2.171 CYS 286.A N TYR 282.A O CYS 286.A H 3.165 2.325 CYS 286.A SG TYR 282.A O no hydrogen 3.678 N/A PHE 288.A N GLU 284.A O PHE 288.A H 3.416 2.511 LEU 289.A N VAL 285.A O LEU 289.A H 2.948 2.025 ASN 290.A N CYS 286.A O ASN 290.A H 2.901 2.004 GLU 291.A N PHE 288.A O GLU 291.A H 3.206 2.385 GLY 292.A N LEU 289.A O GLY 292.A H 3.190 2.380 ALA 293.A N PHE 288.A O ALA 293.A H 3.247 2.559 THR 294.A N TYR 307.A O THR 294.A H 2.954 2.247 VAL 296.A N TYR 305.A O VAL 296.A H 2.908 1.978 TRP 297.A NE1 GLU 302.A OE2 TRP 297.A HE1 3.263 2.425 ASP 298.A N VAL 303.A O ASP 298.A H 2.815 1.941 GLN 301.A NE2 ASP 298.A OD2 GLN 301.A HE21 2.749 2.035 GLU 302.A N ALA 299.A O GLU 302.A H 3.162 2.312 VAL 303.A N ASP 298.A O VAL 303.A H 3.256 2.421 TYR 305.A N VAL 296.A O TYR 305.A H 2.962 2.062 ALA 306.A N VAL 313.A O ALA 306.A H 2.965 2.080 TYR 307.A N THR 294.A O TYR 307.A H 3.080 2.215 GLN 308.A N GLU 311.A O GLN 308.A H 2.786 1.854 GLU 311.A N GLN 308.A O GLU 311.A H 2.774 1.921 TRP 312.A N PHE 250.A O TRP 312.A H 3.134 2.156 TRP 312.A NE1 THR 258.A O TRP 312.A HE1 2.978 2.127 VAL 313.A N ALA 306.A O VAL 313.A H 2.822 1.868 GLY 314.A N HIS 248.A O GLY 314.A H 3.187 2.213 TYR 315.A N PRO 304.A O TYR 315.A H 3.380 2.493 ASN 317.A N SER 320.A OG ASN 317.A H 2.816 1.989 ASN 317.A ND2 SER 320.A OG ASN 317.A HD21 3.227 2.336 PHE 321.A N ASN 317.A O PHE 321.A H 3.201 2.351 LYS 322.A N VAL 318.A O LYS 322.A H 2.927 1.970 LEU 323.A N ARG 319.A O LEU 323.A H 3.016 2.055 LYS 324.A N SER 320.A O LYS 324.A H 3.014 2.203 LYS 324.A NZ SER 205.A OG LYS 324.A HZ3 3.244 2.410 ALA 325.A N PHE 321.A O ALA 325.A H 2.642 1.841 GLN 326.A N LYS 322.A O GLN 326.A H 2.971 2.116 TRP 327.A N LEU 323.A O TRP 327.A H 3.288 2.366 LEU 328.A N LYS 324.A O LEU 328.A H 3.037 2.215 LYS 329.A N GLN 326.A O LYS 329.A H 3.131 2.190 LYS 329.A NZ ALA 325.A O LYS 329.A HZ1 3.511 2.553 LYS 329.A NZ ASP 365.A O LYS 329.A HZ3 3.433 2.452 ASN 332.A N LEU 328.A O ASN 332.A H 3.307 2.560 ALA 336.A N GLN 2.A O ALA 336.A H 3.117 2.151 VAL 337.A N VAL 241.A O VAL 337.A H 2.958 2.018 VAL 338.A N MET 4.A O VAL 338.A H 2.823 1.887 TRP 339.A N PHE 243.A O TRP 339.A H 2.823 1.865 LEU 341.A N TYR 6.A O LEU 341.A H 2.823 1.943 MET 343.A N PRO 340.A O MET 343.A H 3.085 2.168 ASP 344.A N LEU 341.A O ASP 344.A H 2.908 1.993 PHE 346.A N ASP 344.A O PHE 346.A H 2.511 1.801 GLY 348.A N ASP 345.A OD1 GLY 348.A H 2.942 2.176 SER 349.A N SER 347.A OG SER 349.A H 3.222 2.297 CYS 351.A N ASP 345.A OD2 CYS 351.A H 2.527 1.689 GLN 353.A N CYS 351.A O GLN 353.A H 2.570 1.700 PHE 356.A N ASP 345.A O PHE 356.A H 2.910 2.111 LEU 358.A N ASP 344.A OD1 LEU 358.A H 3.529 2.626 THR 359.A N ASP 344.A OD2 THR 359.A H 3.165 2.266 SER 360.A N PHE 356.A O SER 360.A H 2.841 2.010 THR 361.A N PRO 357.A O THR 361.A H 3.162 2.372 LEU 362.A N LEU 358.A O LEU 362.A H 3.412 2.453 LYS 363.A N THR 359.A O LYS 363.A H 2.890 1.973 LYS 363.A NZ CYS 28.A O LYS 363.A HZ1 3.150 2.485 GLY 364.A N SER 360.A O GLY 364.A H 3.085 2.162 ASP 365.A N THR 361.A O ASP 365.A H 2.951 2.000 LEU 366.A N LEU 362.A O LEU 366.A H 2.956 2.255 ASN 367.A N GLY 364.A O ASN 367.A H 3.223 2.342 ILE 368.A N LYS 363.A O ILE 368.A H 3.016 2.079 ALA 371.A N GLU 68.A OE2 ALA 371.A H 3.298 2.317 SER 372.A N SER 370.A O SER 372.A H 2.539 1.658