Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1fnf_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 3.A N THR 28.A OG1 SER 3.A H 2.751 1.808 THR 6.A N GLU 24.A O THR 6.A H 3.197 2.261 HIS 9.A N SER 22.A O HIS 9.A H 2.708 1.800 GLU 11.A N THR 20.A O GLU 11.A H 2.943 2.018 ASN 13.A N VAL 18.A O ASN 13.A H 2.893 1.941 ASN 13.A ND2 ASP 15.A O ASN 13.A HD22 3.097 2.397 ASN 13.A ND2 ASP 15.A OD2 ASN 13.A HD21 2.736 2.032 THR 16.A OG1 ALA 94.A O THR 16.A HG1 2.463 1.844 THR 20.A N GLU 11.A O THR 20.A H 2.743 1.877 VAL 21.A N CYS 60.A O VAL 21.A H 2.744 1.801 SER 22.A N HIS 9.A O SER 22.A H 2.974 2.006 TRP 23.A N SER 58.A O TRP 23.A H 3.190 2.268 GLU 24.A N THR 6.A O GLU 24.A H 2.663 1.751 ARG 25.A N GLU 24.A OE2 ARG 25.A H 3.366 2.622 SER 26.A N TYR 34.A OH SER 26.A H 2.765 1.837 SER 26.A OG SER 3.A O SER 26.A HG 2.589 1.855 THR 28.A N SER 26.A OG THR 28.A H 3.038 2.082 THR 32.A N VAL 78.A O THR 32.A H 2.791 1.951 GLY 33.A N VAL 78.A O GLY 33.A H 3.081 2.293 TYR 34.A N VAL 53.A O TYR 34.A H 3.293 2.347 ARG 35.A N TYR 76.A O ARG 35.A H 3.050 2.117 ARG 35.A NE GLU 83.A OE2 ARG 35.A HE 2.758 1.840 ARG 35.A NH1 GLU 50.A OE2 ARG 35.A HH11 2.734 1.906 ARG 35.A NH2 GLU 83.A OE1 ARG 35.A HH21 3.001 2.002 ARG 35.A NH2 GLU 83.A OE2 ARG 35.A HH21 3.206 2.391 ILE 36.A N GLU 51.A O ILE 36.A H 2.776 1.805 THR 37.A N SER 74.A O THR 37.A H 2.924 2.062 THR 37.A OG1 SER 74.A O THR 37.A HG1 3.539 2.658 THR 38.A N LEU 49.A O THR 38.A H 3.033 2.073 THR 39.A N ASN 72.A O THR 39.A H 3.143 2.252 THR 41.A N GLU 70.A O THR 41.A H 2.944 2.017 THR 41.A OG1 GLU 70.A OE1 THR 41.A HG1 3.244 2.437 GLY 43.A N PRO 40.A O GLY 43.A H 3.284 2.375 GLN 44.A NE2 GLY 43.A O GLN 44.A HE22 2.800 1.923 GLN 45.A NE2 GLY 46.A O GLN 45.A HE21 3.449 2.847 ASN 47.A N TYR 71.A OH ASN 47.A H 2.969 2.035 ASN 47.A ND2 ASN 64.A O ASN 47.A HD22 2.776 1.921 SER 48.A OG THR 39.A OG1 SER 48.A HG 2.772 2.034 LEU 49.A N THR 38.A O LEU 49.A H 2.793 1.942 GLU 51.A N ILE 36.A O GLU 51.A H 2.824 1.959 VAL 53.A N TYR 34.A O VAL 53.A H 2.867 1.905 HIS 54.A N GLN 57.A OE1 HIS 54.A H 3.029 2.154 GLN 57.A N HIS 54.A O GLN 57.A H 3.110 2.272 CYS 60.A N VAL 21.A O CYS 60.A H 2.910 1.982 PHE 62.A N LEU 19.A O PHE 62.A H 2.844 1.938 GLY 68.A N PRO 93.A O GLY 68.A H 2.945 2.130 TYR 71.A N ILE 91.A O TYR 71.A H 2.852 1.914 ASN 72.A N THR 39.A O ASN 72.A H 2.712 1.782 VAL 73.A N ASP 89.A O VAL 73.A H 2.777 1.817 SER 74.A N THR 37.A O SER 74.A H 3.074 2.138 SER 74.A OG ASN 72.A OD1 SER 74.A HG 3.471 2.759 VAL 75.A N ILE 87.A O VAL 75.A H 2.948 2.010 TYR 76.A N ARG 35.A O TYR 76.A H 2.824 1.892 THR 77.A N SER 84.A OG THR 77.A H 3.052 2.089 VAL 78.A N GLY 33.A O VAL 78.A H 2.966 2.018 LYS 79.A N LYS 82.A O LYS 79.A H 2.913 1.934 LYS 79.A NZ ASP 30.A O LYS 79.A HZ3 3.023 2.166 ASP 80.A N THR 32.A OG1 ASP 80.A H 2.888 1.930 LYS 82.A N LYS 79.A O LYS 82.A H 2.936 1.986 LYS 82.A NZ ASP 81.A OD1 LYS 82.A HZ2 2.667 1.818 SER 84.A N THR 77.A O SER 84.A H 3.002 2.095 SER 84.A OG VAL 85.A O SER 84.A HG 2.788 1.824 ILE 87.A N VAL 75.A O ILE 87.A H 3.056 2.126 SER 88.A OG SER 74.A OG SER 88.A HG 2.711 1.843 ASP 89.A N VAL 73.A O ASP 89.A H 2.911 2.060 THR 90.A N ASP 89.A OD1 THR 90.A H 2.833 2.073 THR 90.A OG1 TYR 71.A O THR 90.A HG1 2.625 1.907 ILE 91.A N TYR 71.A O ILE 91.A H 2.824 1.888 THR 99.A N ALA 116.A O THR 99.A H 2.763 1.842 ARG 102.A N THR 114.A O ARG 102.A H 2.805 1.850 THR 104.A N ARG 112.A O THR 104.A H 2.902 1.932 GLY 107.A N THR 110.A O GLY 107.A H 2.779 1.833 THR 110.A OG1 LEU 153.A O THR 110.A HG1 2.559 1.809 MET 111.A N LEU 153.A O MET 111.A H 3.238 2.315 ARG 112.A N THR 104.A O ARG 112.A H 2.892 1.956 VAL 113.A N VAL 151.A O VAL 113.A H 2.813 1.844 THR 114.A N ARG 102.A O THR 114.A H 2.837 1.882 TRP 115.A N ASN 149.A O TRP 115.A H 2.883 1.963 ALA 116.A N THR 99.A O ALA 116.A H 2.683 1.734 THR 124.A N VAL 169.A O THR 124.A H 2.757 1.813 ASN 125.A ND2 PHE 126.A O ASN 125.A HD22 3.086 2.455 PHE 126.A N ILE 144.A O PHE 126.A H 2.880 1.960 LEU 127.A N SER 167.A O LEU 127.A H 2.684 1.845 VAL 128.A N LEU 142.A O VAL 128.A H 2.735 1.806 ARG 129.A N SER 165.A O ARG 129.A H 2.884 1.918 ARG 129.A NE GLU 141.A OE1 ARG 129.A HE 2.977 2.014 ARG 129.A NH1 GLU 174.A OE2 ARG 129.A HH12 2.725 1.722 ARG 129.A NH2 GLU 141.A OE1 ARG 129.A HH21 3.438 2.647 ARG 129.A NH2 GLU 174.A OE1 ARG 129.A HH22 2.839 1.837 ARG 129.A NH2 GLU 174.A OE2 ARG 129.A HH22 3.534 2.843 TYR 130.A N ALA 140.A O TYR 130.A H 3.189 2.282 SER 131.A N VAL 163.A O SER 131.A H 3.027 2.136 SER 131.A OG GLU 136.A O SER 131.A HG 3.518 2.644 VAL 133.A N GLU 161.A O VAL 133.A H 2.735 1.774 ASN 135.A N PRO 132.A O ASN 135.A H 2.829 1.906 ASP 138.A N ASN 135.A O ASP 138.A H 2.966 2.074 ALA 140.A N TYR 130.A O ALA 140.A H 2.969 2.017 LEU 142.A N VAL 128.A O LEU 142.A H 2.780 1.931 ILE 144.A N PHE 126.A O ILE 144.A H 2.908 1.941 SER 145.A OG SER 147.A OG SER 145.A HG 2.849 2.142 SER 147.A OG ASP 148.A OD1 SER 147.A HG 3.440 2.489 ASP 148.A N SER 145.A O ASP 148.A H 2.973 2.015 VAL 151.A N VAL 113.A O VAL 151.A H 2.990 2.104 LEU 153.A N MET 111.A O LEU 153.A H 2.764 1.878 LEU 156.A N ASP 109.A O LEU 156.A H 2.865 1.931 LEU 157.A N TYR 162.A OH LEU 157.A H 2.757 1.790 GLY 159.A N GLY 185.A O GLY 159.A H 2.638 1.822 THR 160.A N THR 184.A OG1 THR 160.A H 2.843 1.867 THR 160.A OG1 LEU 157.A O THR 160.A HG1 3.311 2.831 THR 160.A OG1 PRO 158.A O THR 160.A HG1 3.069 2.142 TYR 162.A N GLN 182.A O TYR 162.A H 2.860 1.890 VAL 163.A N SER 131.A O VAL 163.A H 2.723 1.776 VAL 164.A N GLY 180.A O VAL 164.A H 2.766 1.803 SER 165.A N ARG 129.A O SER 165.A H 2.837 1.868 VAL 166.A N LEU 178.A O VAL 166.A H 2.809 1.886 SER 167.A N LEU 127.A O SER 167.A H 2.856 1.938 SER 167.A OG GLU 174.A OE2 SER 167.A HG 3.547 2.687 SER 168.A N SER 175.A OG SER 168.A H 3.101 2.191 SER 168.A OG PRO 96.A O SER 168.A HG 2.921 2.008 VAL 169.A N ASN 125.A O VAL 169.A H 3.110 2.372 TYR 170.A N HIS 173.A O TYR 170.A H 2.770 1.879 GLU 171.A N THR 124.A OG1 GLU 171.A H 2.842 1.889 HIS 173.A N TYR 170.A O HIS 173.A H 2.819 2.115 SER 175.A N SER 168.A O SER 175.A H 3.019 2.085 SER 175.A OG THR 176.A O SER 175.A HG 3.158 2.188 LEU 178.A N VAL 166.A O LEU 178.A H 2.783 1.823 GLY 180.A N VAL 164.A O GLY 180.A H 2.860 2.014 GLN 182.A N TYR 162.A O GLN 182.A H 2.959 2.031 THR 184.A N THR 160.A O THR 184.A H 2.846 1.905 THR 184.A OG1 LEU 157.A O THR 184.A HG1 2.588 1.736 GLY 185.A N GLY 107.A O GLY 185.A H 2.957 1.991 ASP 187.A N ASP 187.A OD1 ASP 187.A H 2.638 1.923 THR 190.A N ILE 207.A O THR 190.A H 2.998 2.106 ASP 193.A N HIS 205.A O ASP 193.A H 2.850 1.955 SER 195.A N THR 203.A O SER 195.A H 2.779 1.857 THR 198.A N SER 201.A O THR 198.A H 2.817 1.852 THR 198.A OG1 SER 201.A O THR 198.A HG1 3.340 2.875 THR 198.A OG1 SER 201.A OG THR 198.A HG1 2.781 1.935 ASN 200.A N THR 198.A OG1 ASN 200.A H 3.220 2.320 PHE 202.A N LEU 243.A O PHE 202.A H 3.209 2.306 THR 203.A N SER 195.A O THR 203.A H 2.758 1.815 THR 203.A OG1 ASP 196.A OD2 THR 203.A HG1 2.918 1.944 VAL 204.A N ILE 241.A O VAL 204.A H 2.650 1.706 HIS 205.A N ASP 193.A O HIS 205.A H 2.686 1.874 HIS 205.A ND1 ASP 193.A O HIS 205.A HD1 2.784 1.870 TRP 206.A N ASN 239.A O TRP 206.A H 2.990 2.094 ILE 207.A N THR 190.A O ILE 207.A H 2.702 1.797 ARG 210.A N ASP 187.A OD2 ARG 210.A H 2.640 1.786 ARG 210.A NH2 PRO 158.A O ARG 210.A HH21 2.562 1.738 ALA 211.A N ASP 187.A OD1 ALA 211.A H 2.955 2.000 THR 214.A N LEU 259.A O THR 214.A H 2.822 1.873 TYR 216.A N VAL 234.A O TYR 216.A H 3.143 2.244 ARG 217.A N VAL 257.A O ARG 217.A H 2.993 2.054 ARG 217.A NH1 GLU 264.A OE1 ARG 217.A HH12 2.951 1.966 ARG 217.A NH1 GLU 264.A OE2 ARG 217.A HH12 2.999 2.270 ARG 217.A NH2 GLU 264.A OE2 ARG 217.A HH22 2.660 1.770 ILE 218.A N ASP 232.A O ILE 218.A H 2.935 2.011 ARG 219.A N SER 255.A O ARG 219.A H 2.738 1.879 ARG 219.A NE GLU 231.A OE2 ARG 219.A HE 3.073 2.301 ARG 219.A NH2 GLU 231.A OE2 ARG 219.A HH21 2.729 1.788 HIS 220.A N ARG 230.A O HIS 220.A H 3.235 2.274 HIS 221.A N VAL 253.A O HIS 221.A H 3.106 2.260 ARG 230.A NE HIS 220.A O ARG 230.A HE 3.043 2.105 ARG 230.A NH2 HIS 220.A O ARG 230.A HH21 3.437 2.576 ASP 232.A N ILE 218.A O ASP 232.A H 2.884 1.963 VAL 234.A N TYR 216.A O VAL 234.A H 3.045 2.100 ARG 238.A N PRO 235.A O ARG 238.A H 3.020 2.051 ARG 238.A NH1 SER 240.A O ARG 238.A HH11 2.686 1.943 ILE 241.A N VAL 204.A O ILE 241.A H 2.764 1.902 THR 242.A OG1 THR 203.A OG1 THR 242.A HG1 2.881 1.915 LEU 243.A N PHE 202.A O LEU 243.A H 2.795 1.913 LEU 246.A N ASN 200.A O LEU 246.A H 2.864 1.904 THR 247.A OG1 THR 250.A OG1 THR 247.A HG1 2.808 1.864 GLY 249.A N VAL 275.A O GLY 249.A H 3.024 2.062 THR 250.A N THR 274.A OG1 THR 250.A H 2.806 1.841 THR 250.A OG1 PRO 248.A O THR 250.A HG1 2.812 1.901 TYR 252.A N GLN 272.A O TYR 252.A H 2.738 1.881 VAL 253.A N HIS 221.A O VAL 253.A H 2.789 1.826 VAL 254.A N GLY 270.A O VAL 254.A H 2.810 1.864 SER 255.A N ARG 219.A O SER 255.A H 2.773 1.820 SER 255.A OG ARG 219.A O SER 255.A HG 3.521 2.783 ILE 256.A N LEU 268.A O ILE 256.A H 2.929 2.003 VAL 257.A N ARG 217.A O VAL 257.A H 3.137 2.217 ALA 258.A N SER 265.A OG ALA 258.A H 2.949 1.987 LEU 259.A N GLY 215.A O LEU 259.A H 2.954 2.030 ASN 260.A N GLU 263.A O ASN 260.A H 2.766 1.872 ASN 260.A ND2 THR 212.A O ASN 260.A HD22 2.752 1.932 ARG 262.A NE GLU 263.A OE2 ARG 262.A HE 3.025 2.208 ARG 262.A NH2 GLU 263.A OE2 ARG 262.A HH21 2.702 1.748 GLU 263.A N ASN 260.A O GLU 263.A H 2.913 2.024 SER 265.A N ALA 258.A O SER 265.A H 2.965 2.156 SER 265.A OG PRO 266.A O SER 265.A HG 2.844 1.910 LEU 268.A N ILE 256.A O LEU 268.A H 2.904 2.003 GLY 270.A N VAL 254.A O GLY 270.A H 2.912 2.079 GLN 272.A N TYR 252.A O GLN 272.A H 2.757 1.873 GLN 272.A NE2 SER 273.A O GLN 272.A HE22 2.806 1.848 SER 273.A OG GLU 251.A OE1 SER 273.A HG 2.778 1.893 THR 274.A N THR 250.A O THR 274.A H 2.803 1.903 THR 274.A OG1 THR 247.A O THR 274.A HG1 2.664 1.823 VAL 275.A N THR 198.A O VAL 275.A H 2.711 1.820 VAL 278.A N SER 276.A OG VAL 278.A H 3.259 2.328 ARG 280.A N ASP 297.A O ARG 280.A H 3.006 2.095 ARG 280.A NH2 SER 276.A OG ARG 280.A HH22 3.371 2.467 GLU 283.A N SER 295.A O GLU 283.A H 2.752 1.830 VAL 284.A N GLU 283.A OE1 VAL 284.A H 3.240 2.322 VAL 285.A N LEU 293.A O VAL 285.A H 2.689 1.846 ALA 286.A N LEU 293.A O ALA 286.A H 3.370 2.415 THR 288.A N SER 291.A O THR 288.A H 3.071 2.122 THR 290.A N THR 288.A OG1 THR 290.A H 3.392 2.440 SER 291.A N THR 288.A O SER 291.A H 3.340 2.362 LEU 292.A N ILE 333.A O LEU 292.A H 3.232 2.425 LEU 293.A N ALA 286.A O LEU 293.A H 2.972 1.993 ILE 294.A N ALA 331.A O ILE 294.A H 2.740 1.874 SER 295.A N GLU 283.A O SER 295.A H 2.775 1.853 SER 295.A OG SER 329.A O SER 295.A HG 3.469 2.683 TRP 296.A N SER 329.A O TRP 296.A H 3.225 2.336 ASP 297.A N ARG 280.A O ASP 297.A H 2.677 1.725 VAL 301.A N PRO 299.A O VAL 301.A H 2.752 1.881 ARG 304.A N VAL 349.A O ARG 304.A H 2.682 1.903 ARG 304.A NE GLY 351.A O ARG 304.A HE 2.971 2.001 TYR 305.A N VAL 349.A O TYR 305.A H 3.273 2.331 TYR 306.A N VAL 324.A O TYR 306.A H 2.761 1.830 ARG 307.A N TYR 347.A O ARG 307.A H 2.887 1.949 ARG 307.A NE GLU 321.A OE1 ARG 307.A HE 2.884 2.004 ARG 307.A NE GLU 321.A OE2 ARG 307.A HE 2.939 2.202 ARG 307.A NH2 GLU 321.A OE1 ARG 307.A HH21 3.044 2.171 ILE 308.A N PHE 322.A O ILE 308.A H 2.980 2.002 THR 309.A N THR 345.A O THR 309.A H 2.919 1.992 TYR 310.A N GLN 320.A O TYR 310.A H 2.851 1.935 GLY 311.A N THR 343.A O GLY 311.A H 3.266 2.401 THR 313.A N ASP 341.A O THR 313.A H 2.681 1.763 THR 313.A OG1 ASP 341.A OD2 THR 313.A HG1 2.841 1.887 GLY 315.A N GLU 312.A O GLY 315.A H 2.757 1.898 GLN 320.A N TYR 310.A O GLN 320.A H 2.947 1.971 PHE 322.A N ILE 308.A O PHE 322.A H 3.154 2.250 VAL 324.A N TYR 306.A O VAL 324.A H 2.900 2.055 GLY 326.A N ARG 304.A O GLY 326.A H 3.060 2.270 LYS 328.A N PRO 325.A O LYS 328.A H 3.011 2.042 ALA 331.A N ILE 294.A O ALA 331.A H 2.969 2.064 ILE 333.A N LEU 292.A O ILE 333.A H 2.838 1.881 LEU 336.A N THR 290.A O LEU 336.A H 2.644 1.864 LYS 337.A NZ GLY 335.A O LYS 337.A HZ1 2.605 1.864 LYS 337.A NZ LEU 336.A O LYS 337.A HZ1 3.563 2.785 GLY 339.A N THR 368.A O GLY 339.A H 3.219 2.274 THR 343.A N GLY 311.A O THR 343.A H 2.758 1.832 THR 343.A OG1 THR 313.A OG1 THR 343.A HG1 2.795 1.914 ILE 344.A N ILE 364.A O ILE 344.A H 2.890 1.986 THR 345.A N THR 309.A O THR 345.A H 2.817 1.865 VAL 346.A N ILE 362.A O VAL 346.A H 2.895 1.972 TYR 347.A N ARG 307.A O TYR 347.A H 2.821 1.945 ALA 348.A N SER 359.A OG ALA 348.A H 2.980 2.009 VAL 349.A N TYR 305.A O VAL 349.A H 2.827 1.970 THR 350.A N ALA 357.A O THR 350.A H 2.774 1.942 GLY 351.A N ALA 357.A O GLY 351.A H 2.866 1.910 SER 358.A OG SER 359.A O SER 358.A HG 3.164 2.198 SER 359.A N ALA 348.A O SER 359.A H 2.954 2.031 SER 359.A OG LYS 360.A O SER 359.A HG 2.878 1.926 ILE 362.A N VAL 346.A O ILE 362.A H 3.244 2.328 ILE 364.A N ILE 344.A O ILE 364.A H 2.963 2.081 TYR 366.A N TYR 342.A O TYR 366.A H 2.847 1.912