Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1gd5_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 9.A N LYS 33.A O ARG 9.A H 3.104 2.188 ARG 9.A NH2 ARG 9.A O ARG 9.A HH21 2.864 2.053 HIS 10.A N LYS 33.A O HIS 10.A H 3.360 2.380 ALA 12.A N LEU 31.A O ALA 12.A H 2.995 2.041 LEU 14.A N MET 29.A O LEU 14.A H 3.022 2.120 GLY 15.A N MET 29.A O GLY 15.A H 3.073 2.070 LYS 18.A N GLU 17.A OE1 LYS 18.A H 2.752 1.810 ARG 19.A NH1 GLU 17.A OE2 ARG 19.A HH12 2.995 2.207 ARG 19.A NH1 ASP 125.A OD2 ARG 19.A HH11 3.033 2.013 ARG 19.A NH2 GLU 17.A OE2 ARG 19.A HH22 2.709 1.819 ARG 19.A NH2 LYS 18.A O ARG 19.A HH21 2.821 1.953 GLN 24.A NE2 PHE 20.A O GLN 24.A HE22 2.725 1.955 HIS 25.A N ARG 19.A O HIS 25.A H 3.412 2.478 HIS 25.A ND1 HIS 25.A O HIS 25.A HD1 2.654 1.847 VAL 27.A N GLU 17.A O VAL 27.A H 3.059 2.107 TYR 28.A N ARG 44.A O TYR 28.A H 2.850 1.890 MET 29.A N GLY 15.A O MET 29.A H 3.089 2.359 MET 29.A N PHE 16.A O MET 29.A H 3.094 2.306 PHE 30.A N VAL 42.A O PHE 30.A H 2.916 1.988 LEU 31.A N ALA 12.A O LEU 31.A H 2.812 1.886 VAL 32.A N LYS 40.A O VAL 32.A H 2.944 2.004 LYS 33.A N HIS 10.A O LYS 33.A H 3.038 2.070 TRP 34.A N SER 38.A O TRP 34.A H 2.974 1.977 GLN 35.A NE2 PHE 7.A O GLN 35.A HE22 2.755 1.912 LYS 40.A N VAL 32.A O LYS 40.A H 3.029 2.126 LYS 40.A NZ LEU 37.A O LYS 40.A HZ3 2.723 1.772 LYS 40.A NZ GLU 39.A O LYS 40.A HZ2 2.730 1.851 VAL 42.A N PHE 30.A O VAL 42.A H 2.991 1.999 ARG 44.A N TYR 28.A O ARG 44.A H 3.025 2.036 ARG 44.A NH2 GLU 48.A OE1 ARG 44.A HH22 2.814 1.959 ARG 45.A NE GLU 48.A OE2 ARG 45.A HE 2.733 1.873 ARG 45.A NH1 ASP 125.A OD1 ARG 45.A HH12 2.669 1.762 ARG 45.A NH2 GLU 48.A OE2 ARG 45.A HH21 2.785 1.933 ARG 45.A NH2 PRO 124.A O ARG 45.A HH22 2.891 2.182 ILE 49.A N ARG 45.A O ILE 49.A H 3.025 2.065 TYR 50.A N PHE 46.A O TYR 50.A H 2.928 1.945 GLU 51.A N THR 47.A O GLU 51.A H 2.858 1.939 PHE 52.A N GLU 48.A O PHE 52.A H 2.817 1.850 HIS 53.A N ILE 49.A O HIS 53.A H 3.006 1.999 LYS 54.A N TYR 50.A O LYS 54.A H 2.744 1.810 THR 55.A N GLU 51.A O THR 55.A H 2.791 1.911 THR 55.A OG1 GLU 51.A O THR 55.A HG1 2.788 1.883 LEU 56.A N PHE 52.A O LEU 56.A H 2.831 1.880 LYS 57.A N HIS 53.A O LYS 57.A H 2.948 1.941 LYS 57.A NZ HIS 53.A NE2 LYS 57.A HZ1 2.805 1.803 LYS 57.A NZ HIS 76.A NE2 LYS 57.A HZ3 2.888 1.954 GLU 58.A N LYS 54.A O GLU 58.A H 2.841 2.054 MET 59.A N THR 55.A O MET 59.A H 2.823 1.817 PHE 60.A N LEU 56.A O PHE 60.A H 2.785 1.844 ALA 64.A N PRO 61.A O ALA 64.A H 3.062 2.207 GLY 65.A N ILE 62.A O GLY 65.A H 2.928 1.995 ALA 66.A N ILE 62.A O ALA 66.A H 2.700 1.858 ILE 67.A N ILE 62.A O ILE 67.A H 2.959 2.049 ARG 72.A N PRO 69.A O ARG 72.A H 3.277 2.440 ARG 72.A NH1 PRO 69.A O ARG 72.A HH11 2.763 1.765 ILE 73.A N ASN 71.A O ILE 73.A H 2.700 1.778 LYS 81.A N ALA 79.A O LYS 81.A H 2.817 1.936 ARG 87.A NH1 ARG 87.A O ARG 87.A HH11 2.820 1.817 ARG 87.A NH1 ASN 91.A OD1 ARG 87.A HH12 2.815 1.842 ALA 88.A N GLY 85.A O ALA 88.A H 2.889 1.977 ALA 89.A N GLY 85.A O ALA 89.A H 3.051 2.127 GLU 90.A N GLN 86.A O GLU 90.A H 2.972 1.971 ASN 91.A N ALA 88.A O ASN 91.A H 3.312 2.410 ASN 91.A ND2 PRO 78.A O ASN 91.A HD22 2.799 1.950 ARG 92.A N ALA 88.A O ARG 92.A H 3.405 2.402 GLN 93.A N ALA 89.A O GLN 93.A H 2.860 1.900 GLY 94.A N ASN 91.A O GLY 94.A H 3.134 2.179 THR 95.A N ASN 91.A O THR 95.A H 2.757 1.767 LEU 96.A N ARG 92.A O LEU 96.A H 3.012 2.048 THR 97.A OG1 GLN 93.A O THR 97.A HG1 2.717 1.890 GLU 98.A N GLY 94.A O GLU 98.A H 2.729 1.923 TYR 99.A N THR 95.A O TYR 99.A H 2.764 1.825 CYS 100.A N LEU 96.A O CYS 100.A H 2.782 1.794 THR 102.A N GLU 98.A O THR 102.A H 2.730 1.854 LEU 103.A N TYR 99.A O LEU 103.A H 2.672 1.710 MET 104.A N CYS 100.A O MET 104.A H 3.435 2.556 SER 105.A N THR 102.A O SER 105.A H 2.898 2.160 SER 105.A OG THR 102.A O SER 105.A HG 2.885 1.924 LEU 106.A N THR 102.A O LEU 106.A H 2.832 1.838 ARG 112.A N THR 108.A O ARG 112.A H 2.682 1.717 ARG 112.A NE LEU 103.A O ARG 112.A HE 2.650 1.861 ARG 112.A NH1 LEU 106.A O ARG 112.A HH12 2.764 1.957 ARG 112.A NH1 THR 108.A OG1 ARG 112.A HH11 2.805 1.950 ARG 112.A NH2 LEU 103.A O ARG 112.A HH21 2.769 1.995 ARG 112.A NH2 LEU 106.A O ARG 112.A HH22 3.180 2.545 HIS 115.A NE2 PHE 52.A O no hydrogen 3.138 N/A LEU 116.A N ARG 112.A O LEU 116.A H 2.805 1.810 LEU 117.A N CYS 113.A O LEU 117.A H 3.027 2.024 ASP 118.A N PRO 114.A O ASP 118.A H 2.776 1.838 PHE 119.A N LEU 116.A O PHE 119.A H 2.717 1.808 PHE 120.A N LEU 116.A O PHE 120.A H 3.066 2.135 PHE 120.A N LEU 117.A O PHE 120.A H 3.292 2.577 LYS 121.A N LEU 117.A O LYS 121.A H 2.709 1.755 LYS 121.A NZ ASP 5.A OD1 LYS 121.A HZ1 2.744 1.810 ARG 123.A NE TYR 43.A O ARG 123.A HE 2.609 1.858 ARG 123.A NH1 GLU 48.A OE1 ARG 123.A HH12 2.678 1.711 ARG 123.A NH2 TYR 43.A O ARG 123.A HH21 2.799 2.112 ARG 123.A NH2 GLU 48.A OE2 ARG 123.A HH22 2.806 1.791 ASP 125.A N ARG 123.A O ASP 125.A H 2.763 1.810 ASP 126.A N ARG 123.A O ASP 126.A H 3.021 2.040 LEU 127.A N ARG 123.A O LEU 127.A H 3.546 2.566