Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1gdn_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ILE 1.A N GLY 124.A O ILE 1.A H2 3.373 2.826 ILE 1.A N ALA 125.A O ILE 1.A H 2.882 2.182 VAL 2.A N ASP 174.A O VAL 2.A H 2.802 1.958 THR 5.A N LYS 139.A O THR 5.A H 2.883 2.044 ALA 7.A N LEU 137.A O ALA 7.A H 2.987 2.147 SER 8.A N ASP 11.A OD2.A SER 8.A H 2.957 2.118 SER 8.A N ASP 11.A OD2.B SER 8.A H 2.612 1.784 ASP 11.A N.A SER 8.A O ASP 11.A H.A 2.920 2.093 ASP 11.A N.B SER 8.A O ASP 11.A H.B 3.145 2.336 ILE 15.A N PHE 12.A O.A ILE 15.A H 2.988 2.133 ILE 15.A N PHE 12.A O.B ILE 15.A H 2.756 1.910 VAL 16.A N GLY 28.A O VAL 16.A H 2.940 2.083 SER 17.A N ARG 54A.A O SER 17.A H 2.971 2.197 ILE 18.A N CYS 26.A O.A ILE 18.A H 2.863 2.054 ILE 18.A N CYS 26.A O.B ILE 18.A H 2.849 2.041 SER 19.A N GLN 52.A O SER 19.A H 2.890 2.094 ARG 20.A N GLY 23.A O ARG 20.A H 2.854 2.022 ASN 21.A N GLY 50.A O ASN 21.A H 2.823 2.014 GLY 23.A N ARG 20.A O GLY 23.A H 3.022 2.175 TRP 25.A NE1 CYS 42.A O TRP 25.A HE1 2.809 1.979 CYS 26.A N.A ILE 18.A O CYS 26.A H.A 3.003 2.152 CYS 26.A N.B ILE 18.A O CYS 26.A H.B 2.946 2.097 CYS 26.A SG.A TRP 25.A O no hydrogen 3.274 N/A CYS 26.A SG.B GLY 27.A O no hydrogen 3.809 N/A GLY 27.A N SER 180.A O GLY 27.A H.A 2.838 1.985 GLY 28.A N VAL 16.A O GLY 28.A H 2.924 2.199 SER 29.A N LEU 37.A O SER 29.A H 2.875 2.084 LEU 30.A N PHE 14.A O LEU 30.A H 2.754 1.901 LEU 31.A N THR 35.A O LEU 31.A H 2.851 2.021 ASN 32.A ND2 ALA 224.A O ASN 32.A HD21 2.872 2.118 ASN 34.A N ASN 32.A OD1 ASN 34.A H 3.094 2.305 THR 35.A N ASN 32.A O THR 35.A H 3.307 2.455 THR 35.A OG1 ASN 32.A OD1 THR 35.A HG1 2.745 2.107 VAL 36.A N LEU 88.A O VAL 36.A H 2.916 2.070 LEU 37.A N SER 29.A O LEU 37.A H 2.810 1.960 THR 38.A N ALA 86.A O THR 38.A H 2.993 2.140 THR 38.A OG1 GLY 27.A O THR 38.A HG1 2.779 2.116 HIS 41.A N ASP 84.A OD1 HIS 41.A H 2.795 2.012 HIS 41.A ND1 ASP 84.A OD2 HIS 41.A HD1 2.757 1.923 CYS 42.A N ALA 39.A O CYS 42.A H 3.082 2.340 CYS 42.A SG.A THR 38.A OG1 no hydrogen 3.778 N/A CYS 42.A SG.A SER 180.A O no hydrogen 3.462 N/A VAL 43.A N ALA 40.A O VAL 43.A H 3.028 2.214 GLY 50.A N ALA 47D.A O GLY 50.A H 3.143 2.314 PHE 51.A N GLN 48.A O PHE 51.A H 3.180 2.329 GLN 52.A N SER 19.A O GLN 52.A H 3.094 2.269 ILE 53.A N SER 67.A O ILE 53.A H 2.864 2.006 ALA 55.A N ILE 65.A O ALA 55.A H 2.867 2.018 SER 57.A OG SER 62.A O SER 57.A HG 2.805 1.987 SER 59.A N SER 57.A OG SER 59.A H 3.092 2.348 ARG 60.A N VAL 135.A O ARG 60.A H 3.008 2.200 ARG 60.A NE PRO 134.A O ARG 60.A HE 2.843 2.055 ARG 60.A NH2 THR 133.A O ARG 60.A HH22 3.086 2.301 THR 61.A N SER 59.A OG THR 61.A H 2.935 2.141 THR 61.A OG1 SER 62.A OG THR 61.A HG1 3.052 2.245 ILE 65.A N ALA 55.A O ILE 65.A H 2.909 2.077 SER 67.A N ILE 53.A O SER 67.A H 2.955 2.151 SER 67.A OG SER 68.A O SER 67.A HG 2.720 1.921 SER 68.A OG.A SER 91.A OG SER 68.A HG.A 3.018 2.213 SER 70.A N LYS 89.A O SER 70.A H 2.779 1.956 ARG 73.A N ILE 87.A O ARG 73.A H 2.876 2.075 HIS 75.A N LEU 85.A O HIS 75.A H 2.958 2.147 SER 77.A N HIS 75.A ND1 SER 77.A H 2.917 2.082 TYR 78.A N HIS 75.A O TYR 78.A H 2.947 2.104 TYR 78.A OH GLY 80.A O.A TYR 78.A HH 3.334 2.707 SER 79.A N.A ASN 82.A O SER 79.A H.A 3.012 2.165 SER 79.A N.B ASN 82.A O SER 79.A H.B 3.186 2.351 ASN 82.A N SER 79.A O.A ASN 82.A H 2.871 2.070 ASN 82.A N SER 79.A O.B ASN 82.A H 3.072 2.330 ASN 83.A ND2 SER 77.A O ASN 83.A HD22 3.026 2.167 LEU 85.A N ASN 83.A O LEU 85.A H 2.999 2.233 ALA 86.A N THR 38.A O ALA 86.A H 2.872 2.047 ILE 87.A N ARG 73.A O ILE 87.A H 2.816 1.982 LEU 88.A N VAL 36.A O LEU 88.A H 2.800 1.944 LYS 89.A N SER 71.A O LYS 89.A H 2.946 2.097 LYS 89.A NZ THR 35.A OG1 LYS 89.A HZ2 2.866 1.983 LYS 89.A NZ TYR 223.A O LYS 89.A HZ1 2.795 2.020 LEU 90.A N ASN 34.A O LEU 90.A H 2.871 2.051 SER 91.A N SER 68.A O SER 91.A H 2.946 2.092 THR 92.A N SER 67.A OG THR 92.A H 2.934 2.136 ILE 94.A N ALA 33.A O ILE 94.A H 2.808 1.971 SER 96.A OG.B ILE 100.A O SER 96.A HG.B 3.149 2.440 GLY 97.A N ILE 100.A O GLY 97.A H 2.846 1.989 ILE 100.A N GLY 97.A O ILE 100.A H 3.069 2.244 GLY 101.A N PRO 13.A O GLY 101.A H 3.006 2.182 TYR 102.A OH ILE 94.A O TYR 102.A HH 2.734 1.937 ALA 103.A N LEU 30.A O ALA 103.A H 2.965 2.138 ARG 104.A NE.B THR 190.A OG1.A ARG 104.A HE.B 3.080 2.256 ARG 104.A NE.B THR 190.A OG1.B ARG 104.A HE.B 2.430 1.756 ARG 104.A NH1.A THR 190.A OG1.A ARG 104.A HH12.A 3.055 2.306 ARG 104.A NH1.A THR 190.A OG1.B ARG 104.A HH12.A 2.832 2.232 ARG 104.A NH1.B SER 188.A O.A ARG 104.A HH11.B 2.034 1.436 ARG 104.A NH1.B SER 188.A O.B ARG 104.A HH12.B 2.855 2.315 ARG 104.A NH1.B THR 190.A OG1.B ARG 104.A HH11.B 2.573 1.962 ARG 104.A NH2.A SER 188.A O.A ARG 104.A HH22.A 2.846 2.151 ARG 104.A NH2.A THR 190.A OG1.B ARG 104.A HH22.A 2.624 1.967 ALA 106.A N.A LEU 191.A O.A ALA 106.A H.A 3.022 2.220 ALA 106.A N.A LEU 191.A O.B ALA 106.A H.A 3.325 2.583 ALA 106.A N.B LEU 191.A O.A ALA 106.A H.B 2.662 1.827 ALA 106.A N.B LEU 191.A O.B ALA 106.A H.B 2.779 1.956 GLY 109.A N.B GLY 214.A O GLY 109.A H.B 3.390 2.535 SER 110.A N.A ALA 107.A O.A SER 110.A H.A 3.021 2.193 SER 110.A N.B ALA 107.A O.A SER 110.A H.B 2.994 2.177 SER 110.A N.B ALA 107.A O.B SER 110.A H.B 3.010 2.176 SER 110.A OG.A ALA 107.A O.A SER 110.A HG.A 2.737 1.954 SER 110.A OG.A ALA 107.A O.B SER 110.A HG.A 2.013 1.508 GLY 115.A N.A ILE 144.A O GLY 115.A H.A 2.883 2.043 GLY 115.A N.B ILE 144.A O GLY 115.A H.B 2.749 1.894 SER 116.A N VAL 113.A O.A SER 116.A H 3.148 2.306 SER 116.A N VAL 113.A O.B SER 116.A H 2.439 1.605 SER 116.A OG VAL 113.A O.A SER 116.A HG 2.816 2.081 SER 116.A OG VAL 113.A O.B SER 116.A HG 2.471 1.708 ALA 118.A N VAL 142.A O ALA 118.A H 2.894 2.098 THR 119.A N VAL 185.A O.A THR 119.A H 2.991 2.168 THR 119.A N VAL 185.A O.B THR 119.A H 2.514 1.671 VAL 120.A N VAL 140.A O VAL 120.A H 2.911 2.069 ALA 121.A N PRO 183.A O ALA 121.A H 3.269 2.500 GLY 122.A N LEU 138.A O GLY 122.A H 2.962 2.143 TRP 123.A NE1 LEU 58.A O TRP 123.A HE1 2.926 2.132 GLY 124.A N ASP 179.A OD1 GLY 124.A H 2.742 1.950 ALA 125.A N GLN 177.A O ALA 125.A H 2.924 2.092 SER 127.A OG.A GLU 128.A O.B SER 127.A HG.A 3.268 2.756 GLY 130.A N.A SER 127.A O.A GLY 130.A H.A 3.024 2.279 GLY 130.A N.B SER 127.A O.A GLY 130.A H.B 2.616 1.841 GLY 130.A N.B SER 127.A O.B GLY 130.A H.B 2.927 2.247 LEU 137.A N LEU 58.A O LEU 137.A H 2.915 2.176 LEU 138.A N GLY 122.A O LEU 138.A H 3.091 2.245 LYS 139.A N THR 5.A O LYS 139.A H 2.890 2.073 LYS 139.A NZ ASP 11.A OD2.A LYS 139.A HZ2 2.728 1.851 LYS 139.A NZ ASP 11.A OD2.B LYS 139.A HZ2 2.879 1.997 VAL 140.A N VAL 120.A O VAL 140.A H 2.919 2.103 VAL 142.A N ALA 118.A O VAL 142.A H 2.865 2.045 ILE 144.A N SER 116.A O ILE 144.A H 2.848 2.005 VAL 145.A N CYS 165.A O VAL 145.A H 2.896 2.044 ARG 147.A NE THR 160.A O ARG 147.A HE 3.239 2.615 ARG 147.A NE MET 163.A O ARG 147.A HE 3.071 2.348 ARG 147.A NH1 ASP 111.A OD2.A ARG 147.A HH11 2.863 2.009 ARG 147.A NH1 ASP 111.A OD2.B ARG 147.A HH11 3.063 2.238 ARG 147.A NH2 ASP 111.A OD1.A ARG 147.A HH21 2.796 1.951 ARG 147.A NH2 ASP 111.A OD1.B ARG 147.A HH21 3.173 2.398 ARG 147.A NH2 ASP 111.A OD2.A ARG 147.A HH21 3.530 2.876 ARG 147.A NH2 ASP 111.A OD2.B ARG 147.A HH21 3.533 2.844 ARG 147.A NH2 MET 163.A O ARG 147.A HH22 2.782 1.981 THR 149.A N SER 146.A OG THR 149.A H 3.003 2.166 CYS 150.A N SER 146.A O CYS 150.A H 2.879 2.032 CYS 150.A SG.B VAL 145.A O no hydrogen 3.952 N/A CYS 150.A SG.B SER 146.A O no hydrogen 3.461 N/A CYS 150.A SG.B SER 207.A OG no hydrogen 3.327 N/A ARG 151.A N ARG 147.A O ARG 151.A H 2.846 2.025 ARG 151.A NE ILE 159.A O ARG 151.A HE 2.849 2.061 ARG 151.A NH2 ILE 159.A O ARG 151.A HH22 2.875 2.142 ARG 151.A NH2 ASN 161.A OD1 ARG 151.A HH21 3.133 2.345 ALA 152.A N ALA 148.A O ALA 152.A H 3.004 2.227 GLN 153.A N THR 149.A O GLN 153.A H 3.025 2.267 TYR 154.A N CYS 150.A O TYR 154.A H 2.927 2.146 TYR 154.A OH SER 207.A O TYR 154.A HH 2.623 1.875 GLY 155.A N ARG 151.A O GLY 155.A H 2.773 2.042 ALA 158.A N GLY 155.A O ALA 158.A H 3.229 2.545 GLN 162.A NE2 ASN 82.A OD1 GLN 162.A HE22 3.171 2.525 GLN 162.A NE2 ASN 83.A OD1 GLN 162.A HE22 3.008 2.329 MET 163.A N THR 160.A O MET 163.A H 3.154 2.352 PHE 164.A N TYR 210.A O PHE 164.A H 2.934 2.118 ALA 166.A N GLY 208.A O ALA 166.A H 2.944 2.129 GLY 167.A N PRO 143.A O GLY 167.A H 3.007 2.184 GLY 171.A N VAL 168A.A O GLY 171.A H 2.810 2.007 GLY 172.A N ALA 202.A O GLY 172.A H 2.889 2.103 ASP 174.A N VAL 2.A O ASP 174.A H 3.081 2.263 SER 175.A N ASP 174.A OD1 SER 175.A H 2.849 2.241 SER 175.A OG TYR 210.A OH SER 175.A HG 2.908 2.156 CYS 176.A N.A ASP 179.A OD2 CYS 176.A H.A 2.803 2.015 CYS 176.A N.B ASP 179.A OD2 CYS 176.A H.B 2.792 2.018 CYS 176.A SG.A SER 127.A O.A no hydrogen 3.955 N/A CYS 176.A SG.A GLN 177.A OE1 no hydrogen 3.211 N/A CYS 176.A SG.B SER 127.A O.A no hydrogen 3.390 N/A CYS 176.A SG.B SER 127.A O.B no hydrogen 3.572 N/A ASP 179.A N CYS 176.A O.A ASP 179.A H 2.798 1.982 ASP 179.A N CYS 176.A O.B ASP 179.A H 2.964 2.145 SER 180.A OG HIS 41.A NE2 no hydrogen 2.943 N/A GLY 181.A N VAL 195.A O GLY 181.A H 2.858 2.002 GLY 182.A N ASP 179.A O GLY 182.A H 3.076 2.255 ILE 184.A N GLY 193.A O ILE 184.A H 3.103 2.250 VAL 185.A N.A THR 119.A O VAL 185.A H.A 2.956 2.120 VAL 185.A N.B THR 119.A O VAL 185.A H.B 2.641 1.788 ASP 186.A N.A THR 190.A O.A ASP 186.A H.A 2.954 2.131 ASP 186.A N.A THR 190.A O.B ASP 186.A H.A 2.754 2.025 ASP 186.A N.B THR 190.A O.A ASP 186.A H.B 3.258 2.415 ASP 186.A N.B THR 190.A O.B ASP 186.A H.B 2.903 2.089 SER 188.A N.A ASP 186.A OD1.A SER 188.A H.A 2.918 2.172 SER 188.A N.B ASP 186.A OD1.B SER 188.A H.B 2.907 2.229 SER 188.A OG.A ASP 186.A OD1.A SER 188.A HG.A 2.731 2.043 SER 188.A OG.A ASP 186.A OD2.A SER 188.A HG.A 3.458 2.705 SER 188.A OG.A ASP 186.A OD2.B SER 188.A HG.A 2.559 1.758 ASN 189.A N.A ASP 186.A O.A ASN 189.A H.A 2.900 2.098 ASN 189.A N.B ASP 186.A O.A ASN 189.A H.B 2.973 2.232 ASN 189.A N.B ASP 186.A O.B ASN 189.A H.B 2.965 2.142 ASN 189.A ND2.A SER 187A.A O.B ASN 189.A HD21.A 3.404 2.889 THR 190.A N.A ASP 186.A OD1.A THR 190.A H.A 3.013 2.207 THR 190.A N.A ASP 186.A OD1.B THR 190.A H.A 2.788 2.039 THR 190.A N.B ASP 186.A OD1.B THR 190.A H.B 3.039 2.272 THR 190.A OG1.B SER 188.A O.A THR 190.A HG1.B 2.765 1.991 LEU 191.A N.A ARG 104.A O.A LEU 191.A H.A 2.802 1.975 LEU 191.A N.A ARG 104.A O.B LEU 191.A H.A 2.647 1.792 LEU 191.A N.B ARG 104.A O.A LEU 191.A H.B 3.137 2.389 LEU 191.A N.B ARG 104.A O.B LEU 191.A H.B 2.799 1.962 ILE 192.A N ILE 184.A O ILE 192.A H 3.011 2.215 GLY 193.A N ILE 184.A O GLY 193.A H 3.203 2.450 ALA 194.A N ALA 211.A O ALA 194.A H 3.106 2.304 VAL 195.A N GLY 182.A O VAL 195.A H 2.914 2.080 SER 196.A N VAL 209.A O SER 196.A H 3.164 2.480 SER 196.A OG ASP 84.A OD2 SER 196.A HG 2.684 1.873 TRP 197.A N VAL 209.A O TRP 197.A H 3.036 2.196 ASN 199.A N TYR 154.A OH ASN 199.A H 2.935 2.089 CYS 201.A N GLU 128.A OE1.B CYS 201.A H 2.984 2.126 CYS 201.A SG.A SER 175.A O no hydrogen 3.961 N/A CYS 201.A SG.A GLN 177.A OE1 no hydrogen 2.978 N/A CYS 201.A SG.B SER 175.A O no hydrogen 2.762 N/A ALA 202.A N ASP 174.A OD2 ALA 202.A H 2.798 1.963 ASN 205.A N SER 169.A O ASN 205.A H 2.935 2.198 TYR 206.A N ARG 203A.A O TYR 206.A H 3.340 2.514 SER 207.A N GLN 153.A OE1 SER 207.A H 2.981 2.144 SER 207.A OG GLN 153.A OE1 SER 207.A HG 2.809 2.017 GLY 208.A N ALA 166.A O GLY 208.A H 2.916 2.253 VAL 209.A N TRP 197.A O VAL 209.A H 2.832 2.057 TYR 210.A N PHE 164.A O TYR 210.A H 2.804 2.005 ALA 211.A N ALA 194.A O ALA 211.A H 2.956 2.174 SER 212.A N GLN 162.A O SER 212.A H 2.945 2.104 VAL 213.A N ILE 192.A O VAL 213.A H 2.956 2.133 ALA 215.A N SER 212.A OG ALA 215.A H 3.282 2.441 LEU 216.A N SER 212.A O LEU 216.A H 3.153 2.547 LEU 216.A N VAL 213.A O LEU 216.A H 3.140 2.420 ARG 217.A NE.A ASP 221.A OD1 ARG 217.A HE.A 2.542 1.720 ARG 217.A NE.B ASP 221.A OD1 ARG 217.A HE.B 3.224 2.403 ARG 217.A NH1.A ALA 106.A O.A ARG 217.A HH11.A 2.814 2.041 ARG 217.A NH1.A ALA 106.A O.B ARG 217.A HH11.A 3.354 2.784 ARG 217.A NH1.B ALA 106.A O.A ARG 217.A HH11.B 2.447 1.591 ARG 217.A NH1.B ALA 106.A O.B ARG 217.A HH11.B 2.973 2.211 ARG 217.A NH2.B ASP 221.A OD1 ARG 217.A HH21.B 3.384 2.626 ARG 217.A NH2.B ASP 221.A OD2 ARG 217.A HH21.B 3.394 2.690 ILE 220.A N LEU 216.A O ILE 220.A H 3.177 2.335 ASP 221.A N ARG 217.A O ASP 221.A H 2.855 2.014 THR 222.A N SER 218.A O THR 222.A H 3.044 2.275 TYR 223.A N PHE 219.A O TYR 223.A H 3.352 2.605 TYR 223.A N ILE 220.A O TYR 223.A H 3.247 2.561 ALA 224.A N ILE 220.A O ALA 224.A H 2.821 2.066 SER 44A.A N.A ALA 40.A O SER 44A.A H.A 2.851 2.041 SER 44A.A N.B ALA 40.A O SER 44A.A H.B 2.786 1.983 ARG 54A.A N SER 17.A O ARG 54A.A H 2.900 2.088 ARG 54A.A NE ARG 60.A O ARG 54A.A HE 3.250 2.507 ARG 54A.A NH1 GLY 63.A O ARG 54A.A HH12 2.900 2.071 ARG 203A.A NE GLU 128.A OE1.A ARG 203A.A HE 2.902 2.179 ARG 203A.A NE GLU 128.A OE1.B ARG 203A.A HE 2.884 2.064 ARG 203A.A NH2 GLU 128.A OE1.A ARG 203A.A HH21 2.716 1.940 ARG 203A.A NH2 GLU 128.A OE1.B ARG 203A.A HH21 3.449 2.787 ARG 203A.A NH2 GLU 128.A OE2.A ARG 203A.A HH21 2.283 1.665 ARG 203A.A NH2 GLU 128.A OE2.B ARG 203A.A HH21 3.009 2.188 TYR 46C.A N.A VAL 43.A O TYR 46C.A H.A 3.191 2.404 TYR 46C.A N.B VAL 43.A O TYR 46C.A H.B 3.280 2.445