Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1gvk_B.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 1.A N LEU 134.A O VAL 1.A H1 2.890 2.145 VAL 1.A N ASP 187.A OD1 VAL 1.A H3 3.541 2.642 VAL 1.A N ASP 187.A OD2 VAL 1.A H3 2.695 2.011 VAL 2.A N SER 182.A O.A VAL 2.A H 2.893 2.106 VAL 2.A N SER 182.A O.B VAL 2.A H 2.805 1.956 THR 5.A N GLN 147.A O THR 5.A H 2.821 1.967 ALA 7.A N LEU 145.A O ALA 7.A H 2.885 2.016 GLN 8.A NE2.B ASN 10.A OD1 GLN 8.A HE21.B 2.675 1.955 SER 11.A N GLN 8.A O.A SER 11.A H 3.016 2.144 SER 11.A N GLN 8.A O.B SER 11.A H 3.344 2.471 TRP 12.A NE1 GLN 147.A OE1 TRP 12.A HE1 2.828 1.975 GLN 15.A N TRP 12.A O GLN 15.A H 3.046 2.190 GLN 15.A NE2 ILE 16.A O GLN 15.A HE21 2.946 2.085 ILE 16.A N GLY 32.A O ILE 16.A H 2.947 2.101 SER 17.A N VAL 56.A O SER 17.A H 3.014 2.146 SER 17.A OG HIS 28.A ND1 no hydrogen 2.765 N/A LEU 18.A N CYS 30.A O LEU 18.A H 2.841 1.994 GLN 19.A N ARG 54A.A O GLN 19.A H 2.915 2.045 GLN 19.A NE2 SER 17.A OG GLN 19.A HE21 2.912 2.079 TYR 20.A N ALA 27.A O TYR 20.A H 2.914 2.079 ARG 21.A N THR 52.A O ARG 21.A H 2.948 2.137 SER 25.A N SER 22A.A O SER 25.A H 3.131 2.363 ALA 27.A N TYR 20.A O ALA 27.A H 2.865 2.016 HIS 28.A ND1 SER 17.A OG no hydrogen 2.765 N/A HIS 28.A NE2 GLY 186.A O no hydrogen 2.894 N/A THR 29.A N LEU 18.A O THR 29.A H 2.890 2.015 CYS 30.A N LEU 18.A O CYS 30.A H 3.252 2.407 CYS 30.A SG THR 29.A O no hydrogen 3.136 N/A GLY 31.A N SER 188.A O GLY 31.A H 2.810 2.032 THR 33.A N MET 41.A O THR 33.A H 2.822 1.969 LEU 34.A N SER 14.A O LEU 34.A H 2.855 1.989 ILE 35.A N TRP 39.A O ILE 35.A H 2.903 2.040 ARG 36.A N TRP 39.A O ARG 36.A H 3.184 2.313 ARG 36.A NH1 ILE 35.A O ARG 36.A HH11 2.986 2.156 GLN 37.A NE2 VAL 103.A O GLN 37.A HE21 2.742 1.864 TRP 39.A N ARG 36.A O TRP 39.A H 3.150 2.271 VAL 40.A N LEU 97.A O VAL 40.A H 2.875 2.014 MET 41.A N THR 33.A O MET 41.A H 2.819 1.954 THR 42.A N ALA 95.A O THR 42.A H 2.916 2.038 THR 42.A OG1 GLY 31.A O no hydrogen 2.818 N/A ALA 43.A N THR 42.A OG1 ALA 43.A H 2.817 2.167 HIS 45.A N ASP 93.A OD1 no hydrogen 2.833 N/A HIS 45.A ND1 ASP 93.A OD2 no hydrogen 2.673 N/A CYS 46.A N ALA 43.A O CYS 46.A H 3.088 2.343 CYS 46.A SG SER 188.A O no hydrogen 3.580 N/A VAL 47.A N.A ALA 44.A O VAL 47.A H.A 3.031 2.200 VAL 47.A N.B ALA 44.A O VAL 47.A H.B 2.905 2.085 ASP 48.A N.A HIS 45.A O ASP 48.A H.A 3.454 2.583 ARG 49.A N.B VAL 47.A O.A ARG 49.A H.B 2.047 1.365 VAL 55.A N VAL 72.A O.A VAL 55.A H 2.839 1.966 VAL 55.A N VAL 72.A O.B VAL 55.A H 2.843 1.976 VAL 56.A N SER 17.A O VAL 56.A H 2.880 2.026 VAL 57.A N GLN 70.A O VAL 57.A H 2.991 2.165 HIS 60.A N GLU 59.A OE1 HIS 60.A H 2.826 2.119 HIS 60.A N ASN 66.A OD1 HIS 60.A H 3.379 2.591 HIS 60.A NE2 GLU 6.A OE2.A no hydrogen 2.759 N/A ASN 61.A N ASN 66.A OD1 ASN 61.A H 2.854 1.989 LEU 62.A N GLN 143.A O LEU 62.A H 2.859 2.014 ASN 63.A N ASN 61.A OD1 ASN 63.A H 2.815 1.985 GLN 64.A N.A ASN 61.A O GLN 64.A H.A 3.439 2.562 GLN 64.A N.B ASN 61.A O GLN 64.A H.B 3.411 2.538 ASN 66.A N GLU 69.A OE2 ASN 66.A H 2.810 1.942 GLY 67.A N ASN 65.A OD1 GLY 67.A H 3.043 2.258 THR 68.A N GLU 69.A OE1 THR 68.A H 3.137 2.385 THR 68.A OG1 GLY 58.A O no hydrogen 2.654 N/A GLU 69.A N GLU 69.A OE1 GLU 69.A H 2.749 1.956 GLN 70.A N VAL 57.A O GLN 70.A H 2.931 2.072 GLN 70.A NE2 THR 104.A O GLN 70.A HE22 2.919 2.049 VAL 72.A N.A VAL 55.A O VAL 72.A H.A 2.922 2.108 VAL 72.A N.B VAL 55.A O VAL 72.A H.B 2.900 2.063 VAL 74.A N PHE 53.A O VAL 74.A H 3.278 2.432 GLN 75.A N ARG 98.A O GLN 75.A H 2.801 1.989 LYS 76.A N ARG 98.A O LYS 76.A H 3.296 2.484 VAL 78.A N LEU 96.A O VAL 78.A H 2.801 1.932 HIS 80.A N ILE 94.A O HIS 80.A H 3.055 2.202 TYR 82.A N.A HIS 80.A ND1 TYR 82.A H.A 2.922 2.050 TYR 82.A N.B HIS 80.A ND1 TYR 82.A H.B 2.832 1.975 TRP 83.A N HIS 80.A O TRP 83.A H 3.008 2.151 TRP 83.A NE1 ASP 48.A OD1.A TRP 83.A HE1 3.084 2.233 TRP 83.A NE1 ASP 48.A OD2.B TRP 83.A HE1 2.590 1.752 THR 85.A OG1 ASP 48.A OD2.A no hydrogen 2.682 N/A THR 85.A OG1 ASP 48.A OD2.B no hydrogen 3.059 N/A ASP 86.A N ASN 84.A OD1 ASP 86.A H 2.970 2.175 ASP 87.A N ASN 84.A O ASP 87.A H 2.863 2.040 GLY 91.A N VAL 88.A O GLY 91.A H 3.025 2.195 ILE 94.A N TYR 92.A O ILE 94.A H 2.891 2.226 ALA 95.A N THR 42.A O ALA 95.A H 2.908 2.109 LEU 96.A N VAL 78.A O LEU 96.A H 2.859 1.988 LEU 97.A N VAL 40.A O LEU 97.A H 2.797 1.938 ARG 98.A N LYS 76.A O ARG 98.A H 2.843 2.019 ARG 98.A NE GLN 75.A OE1 ARG 98.A HE 2.928 2.149 ARG 98.A NH1 ASN 240.A OXT ARG 98.A HH11 2.941 2.132 ARG 98.A NH2 GLN 75.A OE1 ARG 98.A HH21 3.167 2.461 LEU 99.A N ASN 38.A O LEU 99.A H 2.846 1.973 ALA 100.A N GLY 73.A O ALA 100.A H 2.878 2.042 VAL 103.A N GLN 37.A O VAL 103.A H 2.895 2.034 THR 104.A N GLN 70.A OE1 THR 104.A H 2.951 2.078 ASN 106.A N VAL 109.A O ASN 106.A H 2.914 2.068 TYR 108.A N ASN 106.A OD1 TYR 108.A H 2.795 1.999 VAL 109.A N ASN 106.A O VAL 109.A H 3.099 2.247 GLN 110.A N PRO 13.A O GLN 110.A H 3.095 2.238 GLN 110.A NE2 ASN 106.A O GLN 110.A HE21 2.845 1.975 GLY 112.A N LEU 34.A O GLY 112.A H 2.756 1.881 GLY 118.A N SER 227.A O GLY 118.A H 2.997 2.124 THR 119.A N ARG 116.A O THR 119.A H 3.143 2.308 THR 119.A OG1 ARG 116.A O no hydrogen 2.708 N/A ASN 124.A N THR 152.A O ASN 124.A H 2.831 2.079 SER 125.A N THR 152.A OG1 SER 125.A H 2.993 2.173 SER 125.A OG ALA 122.A O no hydrogen 2.657 N/A CYS 127.A SG SER 125.A O no hydrogen 3.735 N/A TYR 128.A N HIS 193.A O TYR 128.A H 2.798 1.949 ILE 129.A N ALA 148.A O ILE 129.A H 2.946 2.162 THR 130.A OG1 GLN 15.A OE1 no hydrogen 2.663 N/A THR 130.A OG1 HIS 193.A NE2 no hydrogen 2.864 N/A GLY 131.A N GLN 146.A O GLY 131.A H 2.976 2.152 TRP 132.A NE1 HIS 60.A O TRP 132.A HE1 2.905 2.047 GLY 133.A N ASP 187.A OD1 GLY 133.A H 2.775 1.998 LEU 134.A N GLN 185.A O LEU 134.A H 2.795 1.945 THR 135.A N GLN 140.A O THR 135.A H 3.076 2.275 THR 137.A OG1 ASN 215.A OD1 no hydrogen 3.372 N/A GLY 139.A N ARG 136.A O GLY 139.A H 2.850 2.167 ALA 142.A N TRP 132.A O ALA 142.A H 2.971 2.250 THR 144.A OG1 GLU 6.A OE1.B no hydrogen 2.953 N/A LEU 145.A N HIS 60.A O LEU 145.A H 2.984 2.241 GLN 146.A N GLY 131.A O GLN 146.A H 3.003 2.152 GLN 146.A NE2 THR 144.A O GLN 146.A HE21 3.074 2.208 GLN 147.A N THR 5.A O GLN 147.A H 2.856 1.993 ALA 148.A N ILE 129.A O ALA 148.A H 2.941 2.115 LEU 150.A N CYS 127.A O LEU 150.A H 2.881 2.040 THR 152.A N SER 125.A O THR 152.A H 2.980 2.156 THR 152.A OG1 ALA 122.A O no hydrogen 2.950 N/A VAL 153.A N CYS 174.A O VAL 153.A H 2.883 2.011 ASP 154.A N ASN 123.A OD1 ASP 154.A H 2.900 2.054 ILE 157.A N ASP 154.A OD1 ILE 157.A H 2.980 2.129 CYS 158.A N ASP 154.A O CYS 158.A H 2.729 1.862 SER 159.A N TYR 155.A O SER 159.A H 2.841 2.000 SER 159.A OG TYR 155.A O no hydrogen 2.682 N/A SER 160.A N ILE 157.A O SER 160.A H 2.998 2.187 SER 160.A OG ILE 157.A O no hydrogen 2.635 N/A TYR 163.A N SER 160.A O TYR 163.A H 3.044 2.310 TRP 164.A N CYS 158.A O TRP 164.A H 2.827 1.994 TRP 164.A NE1 PRO 220.A O TRP 164.A HE1 2.863 2.062 GLY 165.A N SER 160.A O GLY 165.A H 2.926 2.160 THR 167.A N TRP 164.A O THR 167.A H 3.145 2.342 LYS 169.A NZ SER 166.A O.A LYS 169.A HZ3 2.883 2.018 LYS 169.A NZ SER 166.A O.B LYS 169.A HZ3 2.772 1.882 LYS 169.A NZ ALA 89A.A O LYS 169.A HZ1 2.804 2.054 MET 172.A N LYS 169.A O MET 172.A H 3.007 2.259 VAL 173.A N PHE 223.A O VAL 173.A H 2.787 1.944 ALA 175.A N THR 221.A O ALA 175.A H 2.936 2.084 GLY 176.A N PRO 151.A O.A GLY 176.A H 2.931 2.068 GLY 176.A N PRO 151.A O.B GLY 176.A H 2.829 1.985 VAL 180.A N ASP 178.A OD1 VAL 180.A H 2.716 1.880 SER 182.A N.A VAL 2.A O SER 182.A H.A 3.064 2.245 SER 182.A N.B VAL 2.A O SER 182.A H.B 3.046 2.232 SER 182.A OG.A GLY 183.A O no hydrogen 2.821 N/A SER 182.A OG.B GLY 183.A O no hydrogen 2.655 N/A SER 182.A OG.B CYS 214.A O no hydrogen 2.610 N/A SER 182.A OG.B THR 221.A OG1 no hydrogen 3.186 N/A GLY 183.A N THR 221.A OG1 GLY 183.A H 2.956 2.109 CYS 184.A N ASP 187.A OD2 CYS 184.A H 2.835 2.046 CYS 184.A SG ARG 136.A O no hydrogen 3.889 N/A CYS 184.A SG GLN 185.A OE1 no hydrogen 3.319 N/A GLN 185.A N GLN 185.A OE1 GLN 185.A H 2.842 2.120 ASP 187.A N CYS 184.A O ASP 187.A H 2.907 2.068 SER 188.A OG HIS 45.A NE2 no hydrogen 3.022 N/A GLY 189.A N THR 206.A O GLY 189.A H 2.779 1.903 GLY 190.A N ASP 187.A O GLY 190.A H 3.036 2.199 LEU 192.A N GLY 204.A O LEU 192.A H 2.950 2.123 HIS 193.A N TYR 128.A O HIS 193.A H 2.857 1.993 HIS 193.A NE2 THR 130.A OG1 no hydrogen 2.864 N/A CYS 194.A N ALA 201.A O CYS 194.A H 2.835 1.964 LEU 195.A N PRO 126.A O LEU 195.A H 3.214 2.365 VAL 196.A N GLN 199.A O.A VAL 196.A H 3.044 2.169 VAL 196.A N GLN 199.A O.B VAL 196.A H 2.852 1.973 GLN 199.A N.A VAL 196.A O GLN 199.A H.A 3.011 2.163 GLN 199.A N.B VAL 196.A O GLN 199.A H.B 3.057 2.189 ALA 201.A N CYS 194.A O ALA 201.A H 2.979 2.129 VAL 202.A N VAL 113.A O VAL 202.A H 2.789 1.920 HIS 203.A N LEU 192.A O HIS 203.A H 2.913 2.197 GLY 204.A N LEU 192.A O GLY 204.A H 3.431 2.624 VAL 205.A N THR 224.A O VAL 205.A H 3.023 2.205 THR 206.A N GLY 190.A O THR 206.A H 2.862 2.006 THR 206.A OG1 GLY 190.A O no hydrogen 3.265 N/A SER 207.A N VAL 222.A O SER 207.A H 2.826 2.029 SER 207.A OG ASP 93.A OD2 no hydrogen 2.677 N/A PHE 208.A N VAL 222.A O PHE 208.A H 3.047 2.202 LEU 212.A N.A SER 210.A OG LEU 212.A H.A 2.860 2.021 LEU 212.A N.B SER 210.A OG LEU 212.A H.B 3.226 2.384 GLY 213.A N SER 210.A O GLY 213.A H 3.169 2.330 CYS 214.A N THR 137.A OG1 CYS 214.A H 2.967 2.124 CYS 214.A SG GLN 185.A OE1 no hydrogen 3.266 N/A ASN 215.A ND2 GLY 179.A O ASN 215.A HD21 2.947 2.133 ARG 218.A N GLY 177.A O ARG 218.A H 2.976 2.118 LYS 219.A N VAL 216A.A O LYS 219.A H 2.978 2.165 LYS 219.A NZ TYR 163.A O LYS 219.A HZ3 2.759 1.993 LYS 219.A NZ SER 162B.A O LYS 219.A HZ3 3.385 2.825 THR 221.A OG1 SER 182.A OG.B no hydrogen 3.186 N/A VAL 222.A N PHE 208.A O VAL 222.A H 2.914 2.064 PHE 223.A N VAL 173.A O PHE 223.A H 2.785 1.973 THR 224.A N VAL 205.A O THR 224.A H 2.793 1.994 THR 224.A OG1 ASP 93.A O no hydrogen 2.730 N/A ARG 225.A N SER 171.A O ARG 225.A H 2.878 2.026 ARG 225.A NE ASN 170.A O ARG 225.A HE 2.958 2.138 ARG 225.A NH1 SER 227.A OG ARG 225.A HH11 2.916 2.083 ARG 225.A NH2 ASN 170.A O ARG 225.A HH21 2.962 2.176 VAL 226.A N HIS 203.A O VAL 226.A H 2.999 2.163 SER 227.A OG THR 119.A O no hydrogen 2.704 N/A ALA 228.A N ARG 225.A O ALA 228.A H 2.978 2.150 TYR 229.A N VAL 226.A O TYR 229.A H 2.869 2.021 ILE 233.A N TYR 229.A O ILE 233.A H 2.871 2.000 ASN 234.A N ILE 230.A O ASN 234.A H 2.942 2.070 ASN 235.A N SER 231.A O ASN 235.A H 2.797 1.957 VAL 236.A N TRP 232.A O VAL 236.A H 2.927 2.064 ILE 237.A N ILE 233.A O ILE 237.A H 3.031 2.159 ALA 238.A N ASN 234.A O ALA 238.A H 2.927 2.095 SER 239.A N.A ASN 235.A O SER 239.A H.A 3.162 2.496 SER 239.A N.A VAL 236.A O SER 239.A H.A 3.220 2.489 SER 239.A N.B ASN 235.A O SER 239.A H.B 3.008 2.309 SER 239.A N.B VAL 236.A O SER 239.A H.B 3.174 2.544 SER 239.A OG.A ASN 235.A O no hydrogen 2.922 N/A SER 239.A OG.A VAL 236.A O no hydrogen 3.093 N/A SER 239.A OG.B ASN 235.A O no hydrogen 3.060 N/A ASN 240.A N.A ILE 237.A O ASN 240.A H.A 3.337 2.509 ASN 240.A N.B VAL 236.A O ASN 240.A H.B 3.009 2.160 ASN 240.A ND2 VAL 236.A O ASN 240.A HD21 2.923 2.071 SER 22A.A N SER 25.A O SER 22A.A H 2.799 1.922 ARG 54A.A N GLN 19.A O ARG 54A.A H 2.903 2.049 ARG 54A.A NE GLN 19.A OE1 ARG 54A.A HE 2.854 2.065 ARG 54A.A NH2 GLN 19.A OE1 ARG 54A.A HH21 2.861 2.074 ARG 181A.A N ASP 178.A OD1 ARG 181A.A H 2.834 1.961 ARG 181A.A NE.A ASP 178.A OD2 ARG 181A.A HE.A 3.151 2.298 ARG 181A.A NE.B GLY 3.A O ARG 181A.A HE.B 2.548 1.756 ARG 181A.A NH2.B GLY 3.A O ARG 181A.A HH21.B 2.769 2.081 ALA 90B.A N ASP 87.A O ALA 90B.A H 3.035 2.218