Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1hdo_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 4.A N ASP 69.A OD2 LYS 4.A H 2.886 2.041 LYS 5.A N ASP 69.A OD2 LYS 5.A H 2.891 2.011 LYS 5.A NZ.A GLU 29.A OE2 LYS 5.A HZ2.A 3.421 2.587 ILE 6.A N GLU 29.A O ILE 6.A H 3.026 2.197 ALA 7.A N ALA 70.A O ALA 7.A H 3.148 2.315 ILE 8.A N THR 31.A O ILE 8.A H 2.882 2.035 PHE 9.A N ILE 72.A O PHE 9.A H 2.899 2.025 GLY 13.A N GLY 10.A O GLY 13.A H 3.171 2.315 LEU 17.A N GLY 13.A O LEU 17.A H 2.878 2.052 THR 19.A N THR 15.A O THR 19.A H 2.930 2.069 THR 19.A OG1 THR 15.A O no hydrogen 2.795 N/A LEU 20.A N GLY 16.A O LEU 20.A H 2.778 1.918 ALA 21.A N LEU 17.A O ALA 21.A H 2.951 2.093 GLN 22.A N THR 18.A O GLN 22.A H 2.882 2.018 GLN 22.A NE2 THR 18.A O GLN 22.A HE21 3.458 2.860 GLN 22.A NE2 THR 18.A OG1 GLN 22.A HE21 3.024 2.182 GLN 22.A NE2 HIS 179.A O GLN 22.A HE22 2.956 2.083 ALA 23.A N THR 19.A O ALA 23.A H 2.816 2.002 VAL 24.A N LEU 20.A O VAL 24.A H 2.974 2.103 GLN 25.A N ALA 21.A O GLN 25.A H 2.934 2.079 GLN 25.A NE2 GLN 25.A O GLN 25.A HE21 3.192 2.667 ALA 26.A N GLN 22.A O ALA 26.A H 2.874 2.106 GLY 27.A N VAL 24.A O GLY 27.A H 3.037 2.230 TYR 28.A N ALA 23.A O TYR 28.A H 3.037 2.240 GLU 29.A N LYS 4.A O GLU 29.A H 2.876 2.020 THR 31.A N ILE 6.A O THR 31.A H 2.861 1.985 VAL 32.A N HIS 49.A O VAL 32.A H 2.973 2.134 VAL 34.A N VAL 51.A O VAL 34.A H 2.891 2.030 SER 38.A N ASP 36.A OD1 SER 38.A H 2.909 2.167 SER 38.A OG ASP 36.A OD1 no hydrogen 2.627 N/A SER 38.A OG ASP 36.A OD2 no hydrogen 3.490 N/A ARG 39.A N ASP 36.A O ARG 39.A H 3.090 2.231 LEU 40.A N SER 37.A O LEU 40.A H 3.107 2.256 ARG 46.A NH1 SER 42.A O ARG 46.A HH11 2.784 2.016 HIS 49.A N VAL 30.A O HIS 49.A H 3.054 2.254 HIS 49.A NE2 GLU 29.A OE2 no hydrogen 2.659 N/A VAL 51.A N VAL 32.A O VAL 51.A H 2.784 1.907 GLY 53.A N VAL 34.A O GLY 53.A H 2.907 2.057 ASP 54.A N ASP 60.A OD2 ASP 54.A H 2.865 2.027 LEU 56.A N ASP 54.A OD1 LEU 56.A H 2.848 1.987 GLN 57.A N ASP 54.A O GLN 57.A H 2.995 2.150 VAL 61.A N GLN 57.A O VAL 61.A H 3.125 2.258 ASP 62.A N ALA 58.A O ASP 62.A H 2.757 1.917 LYS 63.A N ALA 59.A O LYS 63.A H 3.080 2.242 THR 64.A N ASP 60.A O THR 64.A H 3.234 2.504 THR 64.A N VAL 61.A O THR 64.A H 3.014 2.398 THR 64.A OG1 ASP 60.A O no hydrogen 2.829 N/A VAL 65.A N VAL 61.A O VAL 65.A H 2.925 2.122 ALA 66.A N ASP 62.A O ALA 66.A H 2.994 2.183 GLN 68.A N VAL 65.A O GLN 68.A H 3.114 2.264 GLN 68.A NE2 THR 31.A OG1 GLN 68.A HE22 3.117 2.320 GLN 68.A NE2 THR 64.A O GLN 68.A HE21 2.912 2.113 ASP 69.A N LYS 5.A O ASP 69.A H 2.763 1.952 VAL 71.A N LYS 105.A O VAL 71.A H 2.937 2.127 ILE 72.A N ALA 7.A O ILE 72.A H 2.868 1.992 VAL 73.A N VAL 107.A O VAL 73.A H 2.880 2.024 LEU 74.A N PHE 9.A O LEU 74.A H 2.804 2.008 THR 77.A OG1 ASP 80.A O no hydrogen 2.702 N/A ARG 78.A NH2 THR 12.A O ARG 78.A HH22 3.037 2.307 ASP 80.A N THR 77.A O ASP 80.A H 2.957 2.136 SER 82.A N ASP 80.A OD1 SER 82.A H 3.009 2.156 SER 82.A OG ASP 80.A OD1 no hydrogen 2.820 N/A SER 82.A OG ASP 80.A OD2 no hydrogen 3.522 N/A VAL 86.A N THR 84.A OG1 VAL 86.A H 3.213 2.345 SER 88.A N ASP 131.A OD2 SER 88.A H 3.026 2.179 SER 88.A OG THR 85.A O no hydrogen 3.371 N/A SER 88.A OG ASP 131.A OD1 no hydrogen 2.547 N/A SER 88.A OG ASP 131.A OD2 no hydrogen 3.534 N/A GLU 89.A N THR 85.A O GLU 89.A H 2.859 1.999 GLY 90.A N VAL 86.A O GLY 90.A H 2.825 1.988 ALA 91.A N MET 87.A O ALA 91.A H 2.824 1.989 ARG 92.A N SER 88.A O ARG 92.A H 2.884 2.043 ARG 92.A NE GLU 89.A OE2 ARG 92.A HE 3.104 2.336 ASN 93.A N GLU 89.A O ASN 93.A H 3.106 2.254 ASN 93.A ND2 VAL 55.A O ASN 93.A HD21 2.923 2.048 ILE 94.A N GLY 90.A O ILE 94.A H 2.849 2.014 VAL 95.A N ALA 91.A O VAL 95.A H 2.863 1.996 ALA 96.A N ARG 92.A O ALA 96.A H 3.084 2.229 ALA 97.A N ASN 93.A O ALA 97.A H 2.928 2.096 MET 98.A N ILE 94.A O MET 98.A H 2.833 1.991 LYS 99.A N VAL 95.A O LYS 99.A H 2.932 2.078 LYS 99.A NZ SER 142.A O LYS 99.A HZ2 2.907 2.170 ALA 100.A N ALA 96.A O ALA 100.A H 2.904 2.084 HIS 101.A N ALA 97.A O HIS 101.A H 3.022 2.379 HIS 101.A N MET 98.A O HIS 101.A H 3.157 2.430 HIS 101.A NE2 ASP 62.A OD1 no hydrogen 2.658 N/A VAL 103.A N MET 98.A O VAL 103.A H 2.924 2.133 LYS 105.A NZ CYS 188.A O LYS 105.A HZ3 2.843 2.134 LYS 105.A NZ THR 191.A O LYS 105.A HZ3 2.983 2.417 LYS 105.A NZ ASP 195.A OD1 LYS 105.A HZ1 3.045 2.366 VAL 106.A N LYS 145.A O VAL 106.A H 2.837 1.975 VAL 107.A N VAL 71.A O VAL 107.A H 2.875 2.009 ALA 108.A N VAL 147.A O ALA 108.A H 3.042 2.176 CYS 109.A N VAL 73.A O CYS 109.A H 2.939 2.084 CYS 109.A SG THR 110.A O no hydrogen 3.674 N/A THR 110.A N VAL 149.A O THR 110.A H 2.819 1.955 ALA 112.A N PRO 151.A O ALA 112.A H 2.811 1.956 PHE 113.A N SER 111.A OG.A PHE 113.A H 3.081 2.379 PHE 113.A N SER 111.A OG.B PHE 113.A H 2.962 2.131 LEU 114.A N SER 111.A O LEU 114.A H 3.016 2.153 LEU 115.A N ALA 112.A O LEU 115.A H 2.853 2.019 TRP 116.A N ALA 112.A O TRP 116.A H 2.940 2.085 TRP 116.A NE1 GLY 169.A O TRP 116.A HE1 2.809 1.961 THR 119.A N ASP 117.A OD1 THR 119.A H 2.879 2.031 THR 119.A OG1 ASP 117.A OD1 no hydrogen 2.833 N/A LYS 120.A N ASP 117.A O LYS 120.A H 3.067 2.269 LEU 125.A N PRO 122.A O LEU 125.A H 2.914 2.128 GLN 126.A N PRO 123.A O GLN 126.A H 3.105 2.246 GLN 126.A NE2 GLN 126.A O GLN 126.A HE21 3.417 2.921 GLN 126.A NE2 ASP 130.A OD1 GLN 126.A HE21 2.867 2.036 THR 129.A N LEU 125.A O THR 129.A H 2.978 2.128 THR 129.A OG1 LEU 125.A O THR 129.A HG1 2.777 2.055 ASP 130.A N GLN 126.A O ASP 130.A H 2.787 1.971 ASP 131.A N ALA 127.A O ASP 131.A H 3.235 2.448 HIS 132.A N VAL 128.A O HIS 132.A H 2.870 2.021 ILE 133.A N THR 129.A O ILE 133.A H 2.866 2.038 ARG 134.A N ASP 130.A O ARG 134.A H 3.023 2.177 ARG 134.A NE ASP 131.A OD1 ARG 134.A HE 2.832 1.994 ARG 134.A NH2 THR 84.A O ARG 134.A HH21 2.913 2.154 ARG 134.A NH2 ASP 131.A OD1 ARG 134.A HH21 3.370 2.714 MET 135.A N ASP 131.A O MET 135.A H 2.844 1.991 HIS 136.A N HIS 132.A O HIS 136.A H 2.832 1.975 HIS 136.A ND1 TYR 146.A OH HIS 136.A HD1 2.669 1.792 LYS 137.A N ILE 133.A O LYS 137.A H 2.971 2.124 LYS 137.A NZ GLU 141.A OE2 LYS 137.A HZ1 2.679 1.865 VAL 138.A N ARG 134.A O VAL 138.A H 3.018 2.168 LEU 139.A N MET 135.A O LEU 139.A H 3.004 2.160 ARG 140.A N HIS 136.A O ARG 140.A H 2.831 1.986 GLU 141.A N LYS 137.A O GLU 141.A H 2.931 2.115 SER 142.A N LEU 139.A O SER 142.A H 3.294 2.482 SER 142.A OG LEU 139.A O no hydrogen 2.712 N/A LEU 144.A N SER 142.A OG LEU 144.A H 3.082 2.268 LYS 145.A N ASP 104.A O LYS 145.A H 2.857 2.080 LYS 145.A N ASP 104.A OD1.B LYS 145.A H 3.257 2.453 VAL 147.A N VAL 106.A O VAL 147.A H 2.938 2.082 ALA 148.A N HIS 197.A O ALA 148.A H 3.141 2.303 VAL 149.A N ALA 108.A O VAL 149.A H 2.926 2.058 MET 150.A N THR 199.A O MET 150.A H 2.797 1.996 GLY 155.A N ILE 176.A O GLY 155.A H 2.840 1.969 GLN 157.A N GLN 157.A OE1 GLN 157.A H 2.810 1.999 THR 160.A N ASP 180.A OD1 THR 160.A H 2.810 1.944 THR 160.A OG1 ASP 180.A OD1 no hydrogen 3.377 N/A THR 160.A OG1 ASP 180.A OD2 no hydrogen 2.779 N/A GLY 161.A N ASP 180.A OD1 GLY 161.A H 2.884 2.020 ALA 162.A N THR 160.A OG1 ALA 162.A H 2.985 2.150 THR 164.A N SER 202.A O THR 164.A H 2.933 2.061 THR 166.A N TYR 200.A O THR 166.A H 3.006 2.136 THR 166.A OG1 ASP 168.A OD1 no hydrogen 3.477 N/A THR 166.A OG1 ARG 170.A O no hydrogen 2.606 N/A ARG 170.A N ASP 168.A OD1 ARG 170.A H 2.982 2.137 ARG 170.A NH1 ASP 168.A OD2 ARG 170.A HH11 3.109 2.256 SER 173.A N SER 202.A OG SER 173.A H 3.362 2.541 SER 173.A OG HIS 203.A O no hydrogen 2.698 N/A VAL 175.A N SER 173.A OG VAL 175.A H 2.988 2.146 ILE 176.A N HIS 153.A O ILE 176.A H 2.906 2.042 SER 177.A N TYR 205.A OH SER 177.A H 2.831 1.955 SER 177.A OG.A GLN 157.A O no hydrogen 2.513 N/A SER 177.A OG.B TYR 205.A OH no hydrogen 3.371 N/A LYS 178.A N GLY 155.A O LYS 178.A H 2.828 1.959 HIS 179.A N SER 177.A OG.A HIS 179.A H 2.986 2.252 HIS 179.A ND1 THR 18.A OG1 HIS 179.A HD1 2.691 1.831 ASP 180.A N SER 177.A OG.B ASP 180.A H 2.955 2.100 LEU 181.A N SER 177.A O LEU 181.A H 2.785 1.922 GLY 182.A N LYS 178.A O GLY 182.A H 2.983 2.131 HIS 183.A N HIS 179.A O HIS 183.A H 2.952 2.106 HIS 183.A ND1 TYR 163.A OH HIS 183.A HD1 2.682 1.821 PHE 184.A N ASP 180.A O PHE 184.A H 2.874 2.063 MET 185.A N LEU 181.A O MET 185.A H 2.912 2.057 LEU 186.A N GLY 182.A O LEU 186.A H 3.028 2.176 ARG 187.A N HIS 183.A O ARG 187.A H 2.899 2.096 ARG 187.A NH1 ARG 187.A O ARG 187.A HH11 3.077 2.245 CYS 188.A N PHE 184.A O CYS 188.A H 3.056 2.255 CYS 188.A SG PHE 184.A O no hydrogen 3.398 N/A LEU 189.A N LEU 186.A O LEU 189.A H 2.941 2.144 THR 190.A N ARG 187.A O THR 190.A H 3.007 2.141 THR 190.A OG1 ARG 187.A O no hydrogen 3.146 N/A THR 191.A OG1 GLU 193.A OE1 no hydrogen 2.970 N/A GLU 193.A N THR 191.A OG1 GLU 193.A H 2.957 2.109 ASP 195.A N ASP 192.A O ASP 195.A H 3.026 2.183 GLY 196.A N TYR 146.A O GLY 196.A H 2.884 2.050 HIS 197.A N TYR 194.A O HIS 197.A H 2.946 2.153 THR 199.A N ALA 148.A O THR 199.A H 2.870 2.180 THR 199.A OG1 ALA 148.A O no hydrogen 2.888 N/A TYR 200.A N THR 166.A O TYR 200.A H 2.788 2.005 TYR 200.A OH SER 173.A O no hydrogen 2.659 N/A SER 202.A N THR 164.A O SER 202.A H 3.004 2.158 SER 202.A OG SER 173.A O no hydrogen 3.282 N/A HIS 203.A N SER 173.A OG HIS 203.A H 3.236 2.567 HIS 203.A N VAL 175.A O HIS 203.A H 3.065 2.266 GLN 204.A NE2 PRO 172.A O GLN 204.A HE21 2.928 2.276 TYR 205.A OH SER 177.A OG.B no hydrogen 3.371 N/A TYR 205.A OH ASP 180.A OD2 no hydrogen 2.609 N/A