Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1kqp_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N GLU 4.A OE2 SER 1.A H2 3.393 2.655 GLU 4.A N SER 1.A OG GLU 4.A H 3.055 2.208 LYS 5.A N SER 1.A O LYS 5.A H 3.144 2.329 ILE 6.A N MET 2.A O ILE 6.A H 2.893 2.041 MET 7.A N GLN 3.A O MET 7.A H 2.939 2.093 ARG 8.A N GLU 4.A O ARG 8.A H 2.979 2.167 GLU 9.A N LYS 5.A O GLU 9.A H 2.868 2.049 LEU 10.A N ILE 6.A O LEU 10.A H 2.895 2.091 HIS 11.A N ARG 8.A O HIS 11.A H 3.188 2.420 VAL 12.A N MET 7.A O VAL 12.A H 2.996 2.146 LYS 13.A NZ GLU 21.A OE2 LYS 13.A HZ3 3.209 2.331 GLN 20.A N ASP 17.A OD2 GLN 20.A H 2.974 2.150 GLN 20.A NE2 ASP 24.A OD1 GLN 20.A HE21 2.932 2.113 GLU 21.A N ASP 17.A O GLU 21.A H 2.944 2.103 ILE 22.A N PRO 18.A O ILE 22.A H 3.009 2.165 GLU 23.A N LYS 19.A O GLU 23.A H 3.048 2.206 ASP 24.A N GLN 20.A O ASP 24.A H 2.831 1.988 ARG 25.A N GLU 21.A O ARG 25.A H 2.960 2.172 ARG 25.A NE GLU 21.A OE1 ARG 25.A HE 2.865 2.094 ARG 25.A NH1 PRO 180.A O ARG 25.A HH12 2.874 2.036 ARG 25.A NH1 THR 182.A O ARG 25.A HH11 2.745 1.931 ARG 25.A NH2 GLU 21.A OE1 ARG 25.A HH22 2.960 2.223 ARG 25.A NH2 THR 182.A O ARG 25.A HH21 3.059 2.348 VAL 26.A N ILE 22.A O VAL 26.A H 2.911 2.057 ASN 27.A N GLU 23.A O ASN 27.A H 2.823 1.999 PHE 28.A N ASP 24.A O PHE 28.A H 2.928 2.144 LEU 29.A N ARG 25.A O LEU 29.A H 3.128 2.280 LYS 30.A N VAL 26.A O LYS 30.A H 2.939 2.097 LYS 30.A NZ SER 64.A OG LYS 30.A HZ1 2.974 2.158 LYS 30.A NZ GLU 68.A OE2 LYS 30.A HZ2 2.491 1.606 GLN 31.A N ASN 27.A O GLN 31.A H 2.837 2.000 TYR 32.A N PHE 28.A O TYR 32.A H 2.867 2.046 VAL 33.A N LEU 29.A O VAL 33.A H 3.102 2.247 LYS 34.A N LYS 30.A O LYS 34.A H 2.906 2.090 LYS 35.A N GLN 31.A O LYS 35.A H 2.887 2.052 THR 36.A N TYR 32.A O THR 36.A H 3.122 2.383 GLY 37.A N VAL 33.A O GLY 37.A H 2.968 2.255 PHE 41.A N GLN 73.A O PHE 41.A H 2.961 2.146 VAL 42.A N LEU 153.A O VAL 42.A H 2.851 2.045 LEU 43.A N ILE 75.A O LEU 43.A H 3.027 2.234 GLY 44.A N GLN 143.A OE1 GLY 44.A H 2.854 2.065 ILE 45.A N VAL 77.A O ILE 45.A H 2.843 1.999 SER 46.A N SER 51.A OG SER 46.A H 3.060 2.205 GLY 48.A N SER 46.A OG GLY 48.A H 2.914 2.109 GLN 49.A NE2 LYS 186.A O GLN 49.A HE22 2.999 2.229 THR 52.A N GLY 48.A O THR 52.A H 3.203 2.411 LEU 53.A N GLN 49.A O LEU 53.A H 2.996 2.165 ALA 54.A N ASP 50.A O ALA 54.A H 2.867 2.007 GLY 55.A N SER 51.A O GLY 55.A H 2.893 2.103 ARG 56.A N THR 52.A O ARG 56.A H 3.018 2.188 ARG 56.A NH1 ILE 97.A O ARG 56.A HH12 2.853 2.136 LEU 57.A N LEU 53.A O LEU 57.A H 2.985 2.131 ALA 58.A N ALA 54.A O ALA 58.A H 2.913 2.094 GLN 59.A N GLY 55.A O GLN 59.A H 2.987 2.157 LEU 60.A N ARG 56.A O LEU 60.A H 2.934 2.086 ALA 61.A N LEU 57.A O ALA 61.A H 2.913 2.112 VAL 62.A N ALA 58.A O VAL 62.A H 2.983 2.143 GLU 63.A N GLN 59.A O GLU 63.A H 3.005 2.172 SER 64.A N LEU 60.A O SER 64.A H 2.937 2.123 ILE 65.A N ALA 61.A O ILE 65.A H 2.947 2.104 ARG 66.A N VAL 62.A O ARG 66.A H 2.994 2.157 ARG 66.A NH1 ALA 72.A O ARG 66.A HH11 2.806 2.012 ARG 66.A NH1 ASP 100.A OD1 ARG 66.A HH12 3.363 2.759 ARG 66.A NH1 ASP 100.A OD2 ARG 66.A HH12 2.827 2.032 ARG 66.A NH2 ASP 100.A OD1 ARG 66.A HH21 2.906 2.195 GLU 67.A N GLU 63.A O GLU 67.A H 2.925 2.109 GLU 68.A N SER 64.A O GLU 68.A H 3.094 2.351 GLU 68.A N ILE 65.A O GLU 68.A H 3.138 2.532 GLY 69.A N ARG 66.A O GLY 69.A H 2.735 1.937 GLY 70.A N ILE 65.A O GLY 70.A H 2.847 2.063 GLN 73.A N LYS 39.A O GLN 73.A H 2.984 2.231 PHE 74.A N ASP 100.A OD2 PHE 74.A H 2.919 2.146 ILE 75.A N PHE 41.A O ILE 75.A H 2.908 2.060 ALA 76.A N LYS 101.A O ALA 76.A H 2.920 2.116 VAL 77.A N LEU 43.A O VAL 77.A H 2.912 2.095 ARG 78.A N TRP 103.A O ARG 78.A H 2.897 2.050 ARG 78.A NE GLU 87.A OE2 ARG 78.A HE 2.862 2.007 ARG 78.A NH1 ILE 45.A O ARG 78.A HH11 2.839 2.064 ARG 78.A NH1 GLN 84.A OE1 ARG 78.A HH12 3.414 2.800 ARG 78.A NH2 GLN 84.A OE1 ARG 78.A HH21 2.764 1.967 ARG 78.A NH2 GLU 87.A OE1 ARG 78.A HH22 2.731 1.880 ARG 78.A NH2 GLU 87.A OE2 ARG 78.A HH22 3.428 2.764 GLY 82.A N ASP 106.A OD1 GLY 82.A H 2.938 2.087 GLN 84.A NE2 SER 46.A O GLN 84.A HE22 2.899 2.181 GLN 84.A NE2 ASP 86.A OD1 GLN 84.A HE21 2.824 1.975 GLU 87.A N GLN 84.A O GLU 87.A H 3.078 2.283 ASP 89.A N ASP 88.A OD2 ASP 89.A H 2.893 2.223 ALA 90.A N ASP 86.A O ALA 90.A H 3.207 2.392 GLN 91.A N GLU 87.A O GLN 91.A H 2.877 2.050 LEU 92.A N ASP 88.A O LEU 92.A H 2.969 2.168 ALA 93.A N ASP 89.A O ALA 93.A H 2.870 2.056 LEU 94.A N ALA 90.A O LEU 94.A H 2.984 2.155 LYS 95.A N GLN 91.A O LYS 95.A H 2.935 2.130 PHE 96.A N LEU 92.A O PHE 96.A H 2.995 2.192 ILE 97.A N ALA 93.A O ILE 97.A H 2.807 1.959 LYS 98.A N LEU 94.A O LYS 98.A H 2.919 2.108 LYS 98.A NZ LYS 95.A O LYS 98.A HZ1 2.861 1.973 LYS 101.A N PHE 74.A O LYS 101.A H 3.081 2.342 LYS 101.A NZ GLN 73.A OE1 LYS 101.A HZ1 2.875 2.051 TRP 103.A N ALA 76.A O TRP 103.A H 2.853 1.998 PHE 105.A N ARG 78.A O PHE 105.A H 2.857 2.014 ILE 107.A N PRO 80.A O ILE 107.A H 2.961 2.155 LYS 108.A N ASP 106.A OD1 LYS 108.A H 2.911 2.067 VAL 111.A N ILE 107.A O VAL 111.A H 3.033 2.181 SER 112.A N LYS 108.A O SER 112.A H 2.799 1.957 ALA 113.A N SER 109.A O ALA 113.A H 2.967 2.146 PHE 114.A N THR 110.A O PHE 114.A H 2.958 2.123 SER 115.A N VAL 111.A O SER 115.A H 2.867 2.030 SER 115.A OG VAL 111.A O SER 115.A HG 2.848 2.113 ASP 116.A N SER 112.A O ASP 116.A H 2.838 2.006 GLN 117.A N ALA 113.A O GLN 117.A H 2.936 2.105 TYR 118.A N PHE 114.A O TYR 118.A H 2.803 2.015 GLN 119.A N SER 115.A O GLN 119.A H 3.148 2.302 GLN 120.A N ASP 116.A O GLN 120.A H 2.934 2.106 GLU 121.A N GLN 117.A O GLU 121.A H 2.859 2.077 THR 122.A N TYR 118.A O THR 122.A H 3.000 2.233 GLY 123.A N GLN 119.A O GLY 123.A H 2.761 2.000 ASN 130.A N THR 127.A OG1 ASN 130.A H 2.979 2.146 LYS 131.A N THR 127.A O LYS 131.A H 2.836 1.989 LYS 131.A NZ ASP 213.A OD2 LYS 131.A HZ3 2.855 1.982 GLY 132.A N ASP 128.A O GLY 132.A H 2.841 2.072 ASN 133.A N PHE 129.A O ASN 133.A H 3.209 2.420 VAL 134.A N ASN 130.A O VAL 134.A H 3.091 2.285 LYS 135.A N LYS 131.A O LYS 135.A H 2.967 2.151 LYS 135.A NZ LEU 211.A O LYS 135.A HZ1 2.882 2.029 LYS 135.A NZ ASP 213.A OD1 LYS 135.A HZ2 2.779 1.907 ALA 136.A N GLY 132.A O ALA 136.A H 3.054 2.235 ARG 137.A N ASN 133.A O ARG 137.A H 2.963 2.127 ARG 137.A NE LYS 170.A O ARG 137.A HE 3.019 2.306 ARG 137.A NH2 LYS 170.A O ARG 137.A HH21 2.829 2.045 THR 138.A N VAL 134.A O THR 138.A H 2.818 2.033 THR 138.A OG1 VAL 134.A O THR 138.A HG1 2.839 2.080 ARG 139.A N LYS 135.A O ARG 139.A H 2.953 2.130 ARG 139.A NE LEU 79.A O ARG 139.A HE 2.843 2.057 ARG 139.A NH2 LEU 79.A O ARG 139.A HH22 3.000 2.271 MET 140.A N ALA 136.A O MET 140.A H 3.218 2.413 ILE 141.A N ARG 137.A O ILE 141.A H 2.986 2.155 ALA 142.A N THR 138.A O ALA 142.A H 2.877 2.056 GLN 143.A N ARG 139.A O GLN 143.A H 3.023 2.181 GLN 143.A NE2 ARG 139.A O GLN 143.A HE21 2.949 2.112 TYR 144.A N MET 140.A O TYR 144.A H 2.901 2.046 TYR 144.A OH ASP 177.A OD1 TYR 144.A HH 2.704 1.916 ALA 145.A N ILE 141.A O ALA 145.A H 2.841 2.078 ILE 146.A N ALA 142.A O ILE 146.A H 3.020 2.168 GLY 147.A N GLN 143.A O GLY 147.A H 2.847 2.000 GLY 148.A N TYR 144.A O GLY 148.A H 2.774 1.998 GLN 149.A N ALA 145.A O GLN 149.A H 2.884 2.042 GLU 150.A N ILE 146.A O GLU 150.A H 2.900 2.160 GLY 151.A N GLY 147.A O GLY 151.A H 2.816 2.201 LEU 152.A N GLY 147.A O LEU 152.A H 2.908 2.078 LEU 153.A N GLY 40.A O LEU 153.A H 2.886 2.028 VAL 154.A N ASP 177.A OD2 VAL 154.A H 2.800 1.943 LEU 155.A N VAL 42.A O LEU 155.A H 2.986 2.143 GLY 156.A N LEU 178.A O GLY 156.A H 2.914 2.072 HIS 159.A NE2 ASP 50.A OD2 no hydrogen 2.836 N/A ALA 160.A N LEU 184.A O ALA 160.A H 2.886 2.200 GLU 162.A N HIS 159.A O GLU 162.A H 3.211 2.548 ALA 163.A N HIS 159.A O ALA 163.A H 2.834 2.026 VAL 164.A N ALA 160.A O VAL 164.A H 2.999 2.203 THR 165.A OG1 GLU 162.A O THR 165.A HG1 3.146 2.730 GLY 166.A N ALA 163.A O GLY 166.A H 3.145 2.351 PHE 167.A N GLU 162.A O PHE 167.A H 2.993 2.163 PHE 168.A N GLY 166.A O PHE 168.A H 2.993 2.248 THR 169.A N ASP 173.A OD2 THR 169.A H 2.826 1.988 GLY 172.A N THR 169.A O GLY 172.A H 2.868 2.066 GLY 174.A N THR 169.A O GLY 174.A H 3.087 2.286 GLY 175.A N GLY 172.A O GLY 175.A H 2.882 2.123 ASP 177.A N VAL 154.A O ASP 177.A H 2.778 1.972 LEU 178.A N VAL 154.A O LEU 178.A H 3.375 2.593 THR 182.A OG1 LEU 179.A O THR 182.A HG1 3.567 2.905 LEU 184.A N LEU 181.A O LEU 184.A H 3.092 2.246 THR 185.A N GLN 188.A OE1 THR 185.A H 3.062 2.207 LYS 186.A N ASP 232.A OD1 LYS 186.A H 2.810 2.007 LYS 186.A NZ ASP 50.A OD1 LYS 186.A HZ1 2.833 1.958 ARG 187.A N ASP 232.A OD2 ARG 187.A H 2.734 1.958 ARG 187.A NH1 ASP 233.A OD2 ARG 187.A HH11 2.824 2.063 ARG 187.A NH1 GLU 236.A OE2 ARG 187.A HH12 2.903 2.090 ARG 187.A NH2 ASP 229.A O ARG 187.A HH22 3.450 2.816 ARG 187.A NH2 ASP 229.A OD1 ARG 187.A HH21 3.288 2.486 ARG 187.A NH2 ASP 233.A OD2 ARG 187.A HH22 2.943 2.223 GLN 188.A NE2 LYS 13.A O GLN 188.A HE22 2.881 2.100 GLY 189.A N THR 185.A O GLY 189.A H 2.968 2.150 ARG 190.A N LYS 186.A O ARG 190.A H 3.125 2.312 THR 191.A N ARG 187.A O THR 191.A H 3.000 2.197 THR 191.A OG1 ARG 187.A O THR 191.A HG1 3.196 2.438 LEU 192.A N GLN 188.A O LEU 192.A H 2.986 2.163 LEU 193.A N GLY 189.A O LEU 193.A H 2.949 2.101 LYS 194.A N ARG 190.A O LYS 194.A H 2.897 2.069 GLU 195.A N THR 191.A O GLU 195.A H 3.031 2.204 LEU 196.A N LEU 192.A O LEU 196.A H 2.972 2.196 GLY 197.A N LYS 194.A O GLY 197.A H 2.999 2.191 ALA 198.A N LEU 193.A O ALA 198.A H 2.941 2.085 ARG 201.A NE ASP 89.A OD1 ARG 201.A HE 2.832 2.073 ARG 201.A NE ASP 89.A OD2 ARG 201.A HE 3.344 2.551 ARG 201.A NH2 ASP 89.A OD1 ARG 201.A HH22 2.811 2.057 LEU 202.A N PRO 199.A O LEU 202.A H 3.048 2.229 TYR 203.A N GLU 200.A O TYR 203.A H 3.008 2.244 LEU 204.A N GLU 200.A O LEU 204.A H 2.916 2.189 LYS 205.A N ARG 201.A O LYS 205.A H 3.348 2.572 LYS 205.A NZ GLY 47.A O LYS 205.A HZ3 2.907 2.079 LYS 205.A NZ ASP 86.A OD2 LYS 205.A HZ2 2.771 1.938 LYS 205.A NZ ASP 89.A OD1 LYS 205.A HZ1 2.797 1.949 THR 208.A OG1 GLN 218.A O THR 208.A HG1 2.706 1.938 ASP 210.A N THR 208.A OG1 ASP 210.A H 3.044 2.354 ASP 213.A N ASP 128.A OD1 ASP 213.A H 2.851 2.076 GLU 214.A N ASP 128.A OD2 GLU 214.A H 2.799 1.968 GLN 217.A N ASP 210.A OD1 GLN 217.A H 2.800 2.023 GLN 217.A NE2.A ASP 86.A OD1 GLN 217.A HE22.A 3.133 2.310 GLN 217.A NE2.A ASP 210.A OD2 GLN 217.A HE21.A 2.795 2.071 ASP 220.A N PRO 207.A O ASP 220.A H 3.020 2.173 THR 222.A N SER 219.A OG THR 222.A H 3.010 2.186 THR 222.A OG1 SER 219.A OG THR 222.A HG1 2.887 2.164 GLU 223.A N SER 219.A O GLU 223.A H 3.231 2.407 LEU 224.A N ASP 220.A O LEU 224.A H 2.827 2.001 GLY 225.A N GLU 221.A O GLY 225.A H 2.868 2.099 SER 227.A N GLU 230.A OE2 SER 227.A H 2.867 2.008 TYR 228.A OH ASP 220.A OD2 TYR 228.A HH 2.538 1.757 GLU 230.A N SER 227.A OG GLU 230.A H 3.080 2.252 ILE 231.A N SER 227.A O ILE 231.A H 2.968 2.116 ASP 232.A N TYR 228.A O ASP 232.A H 2.828 1.998 ASP 233.A N ASP 229.A O ASP 233.A H 2.950 2.132 TYR 234.A N GLU 230.A O TYR 234.A H 2.990 2.151 TYR 234.A OH GLU 249.A OE2 TYR 234.A HH 2.628 1.848 LEU 235.A N ILE 231.A O LEU 235.A H 2.901 2.053 GLU 236.A N ASP 232.A O GLU 236.A H 2.847 2.086 GLY 237.A N TYR 234.A O GLY 237.A H 3.140 2.320 LYS 238.A N ASP 233.A O LYS 238.A H 3.029 2.304 LYS 243.A NZ SER 241.A OG LYS 243.A HZ3 3.230 2.345 VAL 244.A N SER 241.A O VAL 244.A H 3.069 2.411 SER 245.A N SER 241.A O SER 245.A H 3.419 2.583 GLU 246.A N ALA 242.A O GLU 246.A H 2.922 2.090 ALA 247.A N LYS 243.A O ALA 247.A H 3.098 2.272 LEU 248.A N VAL 244.A O LEU 248.A H 2.953 2.107 GLU 249.A N SER 245.A O GLU 249.A H 2.907 2.081 LYS 250.A N GLU 246.A O LYS 250.A H 3.134 2.303 LYS 250.A NZ GLU 246.A OE1 LYS 250.A HZ1 2.597 1.968 ARG 251.A N ALA 247.A O ARG 251.A H 3.098 2.252 ARG 251.A NH2 LEU 224.A O ARG 251.A HH21 3.036 2.435 TYR 252.A N LEU 248.A O TYR 252.A H 2.812 1.982 TYR 252.A OH GLU 9.A OE2 TYR 252.A HH 2.607 1.814 SER 253.A N GLU 249.A O SER 253.A H 3.032 2.189 MET 254.A N LYS 250.A O MET 254.A H 2.992 2.155 THR 255.A N ARG 251.A O THR 255.A H 3.075 2.407 THR 255.A OG1 TYR 252.A O THR 255.A HG1 3.506 3.131 GLU 256.A N SER 253.A O GLU 256.A H 3.407 2.557 LYS 258.A N THR 255.A O LYS 258.A H 2.858 2.068 LYS 258.A NZ GLY 166.A O LYS 258.A HZ1 2.870 2.006 LYS 258.A NZ PHE 168.A O LYS 258.A HZ3 2.765 2.005 ARG 259.A N GLU 256.A O ARG 259.A H 2.842 2.034 ARG 259.A NH1 ALA 163.A O ARG 259.A HH12 2.838 2.252 ARG 259.A NH1 THR 255.A OG1 ARG 259.A HH11 3.111 2.314 ARG 259.A NH2 TYR 252.A O ARG 259.A HH22 2.849 2.009 ARG 259.A NH2 GLU 256.A OE2.A ARG 259.A HH21 2.910 2.104 SER 264.A N ASP 267.A OD2 SER 264.A H 2.841 1.993 ASP 267.A N SER 264.A O ASP 267.A H 3.084 2.253 TRP 270.A NE1 SER 264.A O TRP 270.A HE1 3.139 2.352 LYS 271.A N ASP 268.A O LYS 271.A H 3.192 2.340