Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1lsd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A N THR 40.A OG1 LYS 1.A H1 2.816 1.780 LYS 1.A NZ GLU 7.A OE2 LYS 1.A HZ2 3.151 2.196 PHE 3.A N PHE 38.A O PHE 3.A H 2.907 1.944 GLY 4.A N GLU 7.A OE1 GLY 4.A H 3.324 2.352 ARG 5.A NE TRP 123.A O ARG 5.A HE 3.049 2.363 ARG 5.A NH2 ALA 122.A O ARG 5.A HH21 3.378 2.703 LEU 8.A N GLY 4.A O LEU 8.A H 2.925 1.958 ALA 9.A N ARG 5.A O ALA 9.A H 2.989 2.006 ALA 10.A N CYS 6.A O ALA 10.A H 2.995 2.049 ALA 11.A N GLU 7.A O ALA 11.A H 3.105 2.161 MET 12.A N LEU 8.A O MET 12.A H 2.854 1.891 LYS 13.A N ALA 9.A O LYS 13.A H 2.982 2.044 ARG 14.A N ALA 10.A O ARG 14.A H 2.974 1.991 HIS 15.A N ALA 11.A O HIS 15.A H 3.164 2.319 HIS 15.A ND1 ALA 11.A O HIS 15.A HD1 2.746 1.821 HIS 15.A NE2 THR 89.A OG1 HIS 15.A HE2 2.818 1.983 GLY 16.A N LYS 13.A O GLY 16.A H 2.919 2.000 LEU 17.A N MET 12.A O LEU 17.A H 3.112 2.170 ASN 19.A N TYR 23.A O ASN 19.A H 2.795 2.101 TYR 20.A N LEU 17.A O TYR 20.A H 3.144 2.174 GLY 22.A N ASN 19.A O GLY 22.A H 2.904 2.076 TYR 23.A N TYR 20.A O TYR 23.A H 3.057 2.091 LEU 25.A N ASP 18.A OD1 LEU 25.A H 2.919 2.052 ASN 27.A N SER 24.A O ASN 27.A H 2.969 2.174 ASN 27.A ND2 SER 24.A O ASN 27.A HD22 3.492 2.616 CYS 30.A N GLY 26.A O CYS 30.A H 2.873 1.940 ALA 31.A N ASN 27.A O ALA 31.A H 2.941 1.990 ALA 32.A N TRP 28.A O ALA 32.A H 3.059 2.080 LYS 33.A N VAL 29.A O LYS 33.A H 2.979 2.024 PHE 34.A N CYS 30.A O PHE 34.A H 3.144 2.174 GLU 35.A N ALA 31.A O GLU 35.A H 2.814 1.904 SER 36.A N ALA 32.A O SER 36.A H 3.008 2.062 SER 36.A OG ILE 55.A O SER 36.A HG 2.909 2.022 ASN 37.A N LYS 33.A O ASN 37.A H 2.855 2.145 PHE 38.A N ALA 32.A O PHE 38.A H 3.456 2.483 ASN 39.A N SER 36.A O ASN 39.A H 3.180 2.278 THR 40.A N LYS 1.A O THR 40.A H 2.845 1.886 THR 40.A OG1 LEU 84.A O THR 40.A HG1 3.194 2.225 GLN 41.A N ASN 39.A OD1 GLN 41.A H 3.049 2.136 ALA 42.A N ASN 39.A O ALA 42.A H 3.280 2.344 ASN 44.A N ASP 52.A O ASN 44.A H 3.016 2.086 ASN 46.A N SER 50.A O ASN 46.A H 2.750 1.803 ASN 46.A ND2 ASP 52.A OD2 ASN 46.A HD21 3.250 2.286 GLY 49.A N ASN 46.A O GLY 49.A H 3.041 2.120 SER 50.A N ASP 48.A OD1 SER 50.A H 2.900 2.032 THR 51.A N SER 60.A OG THR 51.A H 2.950 1.992 ASP 52.A N ASN 44.A O ASP 52.A H 2.789 1.838 TYR 53.A N ILE 58.A O TYR 53.A H 2.977 2.046 GLY 54.A N ALA 42.A O GLY 54.A H 2.831 1.905 GLN 57.A N GLY 54.A O GLN 57.A H 2.963 2.039 ILE 58.A N TYR 53.A O ILE 58.A H 3.021 2.126 ASN 59.A ND2 SER 50.A OG ASN 59.A HD21 2.922 1.992 ASN 59.A ND2 THR 51.A O ASN 59.A HD22 3.602 2.947 ASN 59.A ND2 ASP 52.A OD1 ASN 59.A HD22 2.745 1.975 SER 60.A N THR 51.A O SER 60.A H 3.002 2.047 SER 60.A OG THR 69.A OG1 SER 60.A HG 2.841 1.887 ARG 61.A N ASN 59.A OD1 ARG 61.A H 2.977 2.119 TRP 63.A N ASN 59.A O TRP 63.A H 3.017 2.085 ASN 65.A N ILE 78.A O ASN 65.A H 2.910 1.953 GLY 67.A N ASN 65.A OD1 GLY 67.A H 3.103 2.161 ARG 68.A N ASP 66.A OD1 ARG 68.A H 3.054 2.190 ARG 68.A NH2 THR 51.A OG1 ARG 68.A HH21 3.057 2.059 SER 72.A N THR 69.A O SER 72.A H 3.082 2.121 SER 72.A OG SER 60.A O SER 72.A HG 2.600 1.872 SER 72.A OG CYS 64.A O SER 72.A HG 3.558 2.882 ARG 73.A N ARG 61.A O ARG 73.A H 2.806 1.864 LEU 75.A N TRP 62.A O LEU 75.A H 2.863 1.890 CYS 76.A N TRP 63.A O CYS 76.A H 2.928 2.052 ASN 77.A N ASN 74.A O ASN 77.A H 3.038 2.129 ILE 78.A N ASN 74.A OD1 ILE 78.A H 3.044 2.102 CYS 80.A N ASN 65.A O CYS 80.A H 2.819 1.874 ALA 82.A N PRO 79.A O ALA 82.A H 3.073 2.280 LEU 83.A N CYS 80.A O LEU 83.A H 3.006 2.173 LEU 84.A N SER 81.A O LEU 84.A H 2.894 1.949 ASP 87.A N SER 85.A OG ASP 87.A H 3.125 2.250 THR 89.A N ASP 87.A OD1 THR 89.A H 3.198 2.257 VAL 92.A N ILE 88.A O VAL 92.A H 2.864 1.892 ASN 93.A N THR 89.A O ASN 93.A H 2.835 1.863 CYS 94.A N ALA 90.A O CYS 94.A H 3.038 2.072 ALA 95.A N SER 91.A O ALA 95.A H 2.914 1.956 LYS 96.A N VAL 92.A O LYS 96.A H 3.034 2.074 LYS 96.A NZ HIS 15.A O LYS 96.A HZ2 2.842 2.139 LYS 97.A N ASN 93.A O LYS 97.A H 3.471 2.556 ILE 98.A N CYS 94.A O ILE 98.A H 3.062 2.085 VAL 99.A N ALA 95.A O VAL 99.A H 2.912 1.938 SER 100.A N LYS 96.A O SER 100.A H 3.311 2.537 SER 100.A OG LYS 96.A O SER 100.A HG 2.784 1.840 ASP 101.A N LYS 97.A O ASP 101.A H 3.298 2.512 ASP 101.A N ILE 98.A O ASP 101.A H 3.157 2.358 GLY 104.A N ASP 101.A O GLY 104.A H 3.288 2.346 MET 105.A N TYR 23.A OH MET 105.A H 3.030 2.069 TRP 108.A N MET 105.A O TRP 108.A H 3.137 2.189 TRP 108.A NE1 LEU 56.A O TRP 108.A HE1 2.765 1.948 ALA 110.A N GLU 35.A OE2 ALA 110.A H 3.379 2.544 TRP 111.A NE1 ASN 27.A OD1 TRP 111.A HE1 3.003 2.097 ARG 112.A N TRP 108.A O ARG 112.A H 3.083 2.108 ARG 112.A NH1 ASN 106.A O ARG 112.A HH11 3.076 2.175 ASN 113.A N VAL 109.A O ASN 113.A H 2.874 1.904 ARG 114.A N ALA 110.A O ARG 114.A H 2.896 1.978 CYS 115.A N TRP 111.A O CYS 115.A H 2.943 2.103 LYS 116.A N TRP 111.A O LYS 116.A H 2.728 1.789 THR 118.A N CYS 115.A O THR 118.A H 2.978 2.076 THR 118.A OG1 CYS 115.A O THR 118.A HG1 2.606 1.810 GLN 121.A N GLN 121.A OE1 GLN 121.A H 2.851 1.933 ALA 122.A N ASP 119.A O ALA 122.A H 3.091 2.138 TRP 123.A N VAL 120.A O TRP 123.A H 3.313 2.437 ILE 124.A N GLN 121.A O ILE 124.A H 3.152 2.267 ARG 125.A N ALA 122.A O ARG 125.A H 3.318 2.359 CYS 127.A N ILE 124.A O CYS 127.A H 3.400 2.457 CYS 127.A SG ILE 124.A O no hydrogen 3.566 N/A