Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1lya_B.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLU 6.A N GLN 52.A OE1 GLU 6.A H 3.081 2.125 GLN 8.A NE2 VAL 9.A O GLN 8.A HE22 2.971 2.056 GLN 8.A NE2 LEU 43.A O GLN 8.A HE21 3.096 2.207 ILE 22.A N ILE 19.A O ILE 22.A H 2.765 1.965 ALA 23.A N ILE 19.A O ALA 23.A H 3.333 2.382 ALA 24.A N PHE 21.A O ALA 24.A H 3.367 2.420 TYR 34.A N ALA 99.A O TYR 34.A H 2.931 2.029 SER 38.A N PRO 35.A O SER 38.A H 3.010 2.214 SER 38.A OG VAL 42.A O SER 38.A HG 2.697 1.857 ASN 41.A N SER 38.A O ASN 41.A H 3.259 2.366 ASN 48.A N PRO 44.A O ASN 48.A H 2.979 2.024 ASN 48.A ND2 GLU 6.A O ASN 48.A HD21 3.244 2.436 ASN 48.A ND2 GLN 8.A OE1 ASN 48.A HD22 2.900 2.075 LEU 49.A N VAL 45.A O LEU 49.A H 2.892 1.943 MET 50.A N PHE 46.A O MET 50.A H 2.990 2.055 GLN 51.A N ASP 47.A O GLN 51.A H 2.933 1.980 GLN 52.A N ASN 48.A O GLN 52.A H 2.933 2.039 LYS 53.A N MET 50.A O LYS 53.A H 2.953 2.085 LEU 54.A N LEU 49.A O LEU 54.A H 3.133 2.152 ASN 58.A N ASP 231.A OD2 ASN 58.A H 3.154 2.215 ASN 58.A ND2 ASP 231.A OD1 ASN 58.A HD22 3.171 2.249 ILE 59.A N GLN 57.A O ILE 59.A H 2.941 2.176 PHE 60.A N PHE 228.A O PHE 60.A H 3.229 2.335 SER 61.A N MET 77.A O SER 61.A H 2.861 1.963 SER 61.A OG GLY 80.A O SER 61.A HG 2.798 1.941 PHE 62.A N THR 226.A O PHE 62.A H 2.786 1.864 TYR 63.A N GLU 75.A O TYR 63.A H 3.019 2.065 SER 65.A N GLY 73.A O SER 65.A H 2.786 1.898 ASP 67.A N SER 65.A OG ASP 67.A H 3.259 2.283 ASP 69.A N ASP 67.A OD1 ASP 69.A H 3.123 2.300 GLU 75.A N TYR 63.A O GLU 75.A H 2.751 1.831 MET 77.A N SER 61.A O MET 77.A H 2.901 1.956 GLY 79.A N ILE 59.A O GLY 79.A H 2.647 1.817 THR 81.A OG1 SER 61.A OG THR 81.A HG1 3.385 2.488 ASP 82.A N TYR 225.A OH ASP 82.A H 2.868 1.940 SER 83.A OG TYR 86.A OH SER 83.A HG 3.166 2.216 LYS 84.A N ASP 82.A OD1 LYS 84.A H 3.130 2.176 LYS 84.A NZ ASP 82.A OD1 LYS 84.A HZ3 3.234 2.206 LYS 84.A NZ ASP 82.A OD2 LYS 84.A HZ3 3.107 2.292 TYR 85.A N ASP 82.A O TYR 85.A H 3.040 2.081 LYS 87.A N GLU 239.A O LYS 87.A H 2.732 1.852 LYS 87.A NZ ALA 240.A O LYS 87.A HZ2 3.535 2.711 SER 91.A N PHE 237.A O SER 91.A H 3.074 2.141 LEU 93.A N VAL 235.A O LEU 93.A H 2.770 1.927 VAL 95.A N ASN 233.A O VAL 95.A H 2.883 1.925 THR 96.A N GLN 102.A O THR 96.A H 2.882 1.967 THR 96.A OG1 GLU 122.A OE1 THR 96.A HG1 2.867 2.089 ALA 99.A N ARG 97.A O ALA 99.A H 3.020 2.316 ALA 99.A N TYR 100.A O ALA 99.A H 3.231 2.360 TRP 101.A NE1 MET 32.A O TRP 101.A HE1 2.994 2.008 VAL 103.A N ALA 123.A O VAL 103.A H 2.840 1.882 HIS 104.A ND1 GLU 122.A OE2 HIS 104.A HD1 2.996 2.220 LEU 105.A N CYS 121.A O LEU 105.A H 2.820 1.921 ASP 106.A N LYS 172.A O ASP 106.A H 2.808 1.876 VAL 108.A N LEU 116.A O VAL 108.A H 2.985 2.004 GLU 109.A N THR 170.A O GLU 109.A H 2.862 1.890 VAL 110.A N LEU 114.A O VAL 110.A H 2.803 1.841 ALA 111.A N ALA 168.A O ALA 111.A H 3.213 2.253 GLY 113.A N VAL 110.A O GLY 113.A H 2.933 1.997 THR 115.A OG1 GLY 113.A O THR 115.A HG1 3.465 2.513 LEU 116.A N VAL 108.A O LEU 116.A H 2.770 1.809 CYS 117.A N GLU 138.A OE1 CYS 117.A H 3.058 2.096 CYS 117.A SG CYS 117.A O no hydrogen 2.688 N/A GLY 120.A N CYS 117.A O GLY 120.A H 2.870 1.961 CYS 121.A N LEU 105.A O CYS 121.A H 2.898 1.952 ALA 123.A N VAL 103.A O ALA 123.A H 2.922 1.992 ILE 124.A N TRP 214.A O ILE 124.A H 2.921 2.026 VAL 125.A N TRP 101.A O VAL 125.A H 2.976 2.071 ASP 126.A N LEU 216.A O ASP 126.A H 3.022 2.058 GLY 128.A N ASP 126.A OD1 GLY 128.A H 2.890 2.062 THR 129.A N ASP 126.A O THR 129.A H 3.359 2.382 MET 132.A N GLY 200.A O MET 132.A H 3.017 2.051 VAL 133.A N ILE 215.A O VAL 133.A H 3.137 2.199 GLY 134.A N MET 202.A O GLY 134.A H 3.086 2.172 VAL 136.A N ASP 205.A OD1 VAL 136.A H 3.031 2.174 GLU 138.A N PRO 135.A O GLU 138.A H 3.042 2.257 VAL 139.A N PRO 135.A O VAL 139.A H 2.971 1.999 ARG 140.A N VAL 136.A O ARG 140.A H 2.974 2.033 GLU 141.A N ASP 137.A O GLU 141.A H 3.298 2.343 LEU 142.A N GLU 138.A O LEU 142.A H 2.920 1.969 GLN 143.A N VAL 139.A O GLN 143.A H 2.938 2.042 GLN 143.A NE2 SER 199.A OG GLN 143.A HE21 2.971 2.137 GLN 143.A NE2 PHE 201.A O GLN 143.A HE22 3.007 2.430 LYS 144.A N ARG 140.A O LYS 144.A H 2.933 1.968 LYS 144.A NZ ALA 148.A O LYS 144.A HZ1 2.915 2.158 ALA 145.A N GLU 141.A O ALA 145.A H 2.901 1.930 ILE 146.A N LEU 142.A O ILE 146.A H 3.067 2.231 GLY 147.A N GLN 143.A O GLY 147.A H 2.725 2.027 GLY 147.A N LYS 144.A O GLY 147.A H 3.038 2.316 ALA 148.A N GLN 143.A O ALA 148.A H 3.062 2.115 VAL 149.A N MET 157.A O VAL 149.A H 2.879 1.910 LEU 151.A N GLU 155.A O LEU 151.A H 2.820 1.871 GLU 155.A N ILE 152.A O GLU 155.A H 3.056 2.097 MET 157.A N VAL 149.A O MET 157.A H 2.826 1.896 ILE 158.A N CYS 197.A O ILE 158.A H 2.869 1.905 CYS 160.A N THR 195.A O CYS 160.A H 3.036 2.074 GLU 161.A N GLU 161.A OE1 GLU 161.A H 2.862 2.075 LYS 162.A N PRO 159.A O LYS 162.A H 2.748 1.924 VAL 163.A N CYS 160.A O VAL 163.A H 3.302 2.358 THR 165.A N LYS 162.A O THR 165.A H 3.086 2.117 LEU 166.A N VAL 163.A O LEU 166.A H 3.282 2.346 ILE 169.A N LEU 180.A O ILE 169.A H 2.900 1.957 THR 170.A N GLU 109.A O THR 170.A H 2.855 1.892 LEU 171.A N TYR 178.A O LEU 171.A H 2.995 2.056 LYS 172.A N GLN 107.A O LYS 172.A H 2.974 2.007 LYS 172.A NZ ASP 106.A OD2 LYS 172.A HZ2 3.419 2.385 LEU 173.A N LYS 176.A O LEU 173.A H 2.787 1.939 GLY 175.A N ASP 106.A OD2 GLY 175.A H 3.015 2.101 LYS 176.A N LEU 173.A O LYS 176.A H 2.999 2.160 TYR 178.A N LEU 171.A O TYR 178.A H 2.805 1.847 LEU 180.A N ILE 169.A O LEU 180.A H 2.798 1.836 SER 181.A N ASP 184.A OD2 SER 181.A H 3.019 2.048 GLU 183.A N GLU 183.A OE1 GLU 183.A H 2.986 2.240 ASP 184.A N SER 181.A O ASP 184.A H 2.853 2.110 TYR 185.A N SER 181.A O TYR 185.A H 3.156 2.253 TYR 185.A OH PRO 167.A O TYR 185.A HH 2.660 1.778 THR 186.A OG1 PRO 182.A O THR 186.A HG1 2.720 1.844 LEU 187.A N LEU 198.A O LEU 187.A H 3.135 2.236 VAL 189.A N LEU 196.A O VAL 189.A H 2.992 2.037 SER 190.A OG VAL 189.A O SER 190.A HG 2.931 2.138 ALA 192.A N GLN 191.A OE1 ALA 192.A H 2.829 1.917 LYS 194.A N SER 190.A OG LYS 194.A H 3.055 2.159 CYS 197.A N ILE 158.A O CYS 197.A H 3.324 2.473 LEU 198.A N LEU 187.A O LEU 198.A H 2.856 1.901 SER 199.A N TYR 156.A O SER 199.A H 2.852 1.877 SER 199.A OG GLN 143.A OE1 SER 199.A HG 2.724 1.893 GLY 200.A N TYR 185.A O GLY 200.A H 2.626 1.872 MET 202.A N MET 132.A O MET 202.A H 2.823 1.908 GLY 203.A N GLY 154.A O GLY 203.A H 2.901 1.963 MET 204.A N GLY 134.A O MET 204.A H 2.814 1.891 GLY 211.A N PRO 207.A O GLY 211.A H 2.894 2.013 TRP 214.A N GLU 122.A O TRP 214.A H 3.123 2.165 ILE 215.A N VAL 133.A O ILE 215.A H 2.928 1.978 LEU 216.A N ILE 124.A O LEU 216.A H 2.879 1.935 ASP 218.A N THR 129.A O ASP 218.A H 2.809 1.853 VAL 219.A N SER 130.A O VAL 219.A H 2.998 2.151 PHE 220.A N GLY 217.A O PHE 220.A H 2.822 2.031 ILE 221.A N GLY 217.A O ILE 221.A H 3.080 2.111 GLY 222.A N ASP 218.A O GLY 222.A H 2.855 2.055 ARG 223.A N PHE 220.A O ARG 223.A H 2.970 2.111 ARG 223.A NE LYS 179.A O ARG 223.A HE 3.097 2.289 ARG 223.A NE TYR 224.A OH ARG 223.A HE 3.080 2.298 ARG 223.A NH2 LYS 179.A O ARG 223.A HH21 2.971 2.097 TYR 224.A N PHE 220.A O TYR 224.A H 2.939 1.994 TYR 224.A OH LYS 179.A O TYR 224.A HH 2.712 1.834 TYR 225.A N ALA 238.A O TYR 225.A H 2.794 2.101 THR 226.A N PHE 62.A O THR 226.A H 3.209 2.242 THR 226.A OG1 TYR 224.A O THR 226.A HG1 3.025 2.139 VAL 227.A N GLY 236.A O VAL 227.A H 2.743 1.892 PHE 228.A N PHE 60.A O PHE 228.A H 2.970 1.991 ASP 229.A N ARG 234.A O ASP 229.A H 2.879 1.954 ARG 230.A N ASN 58.A O ARG 230.A H 2.848 2.085 ARG 230.A NH1 ASP 47.A OD1 ARG 230.A HH12 2.864 1.908 ARG 230.A NH1 ASP 47.A OD2 ARG 230.A HH12 3.224 2.461 ARG 230.A NH2 ASP 47.A OD2 ARG 230.A HH22 2.930 2.064 ASP 231.A N ASN 58.A O ASP 231.A H 3.365 2.563 ASN 232.A N ASP 229.A O ASN 232.A H 3.495 2.629 ASN 232.A N ASP 229.A OD1 ASN 232.A H 2.891 2.160 ASN 232.A ND2 ASP 231.A O ASN 232.A HD22 2.909 2.311 ASN 233.A ND2 TYR 34.A OH ASN 233.A HD22 2.767 1.902 ARG 234.A N ASP 229.A O ARG 234.A H 3.447 2.548 ARG 234.A NE ASP 229.A OD2 ARG 234.A HE 3.037 2.082 ARG 234.A NH2 ASP 229.A OD2 ARG 234.A HH21 3.375 2.524 VAL 235.A N LEU 93.A O VAL 235.A H 2.776 1.848 GLY 236.A N VAL 227.A O GLY 236.A H 2.793 1.893 PHE 237.A N SER 91.A O PHE 237.A H 2.939 2.000 ALA 238.A N TYR 225.A O ALA 238.A H 3.065 2.168 ALA 240.A N ARG 223.A O ALA 240.A H 2.896 1.927 ALA 241.A N TYR 85.A O ALA 241.A H 3.008 2.134