Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1lyb_B.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLU 6.A N GLN 52.A OE1 GLU 6.A H 2.997 2.056 GLN 8.A NE2 VAL 9.A O GLN 8.A HE22 2.943 1.986 GLN 8.A NE2 LEU 43.A O GLN 8.A HE21 3.093 2.137 ILE 22.A N ILE 19.A O ILE 22.A H 2.862 2.056 ALA 23.A N ILE 19.A O ALA 23.A H 3.263 2.301 TYR 34.A N ALA 99.A O TYR 34.A H 3.115 2.319 TYR 34.A OH ASN 233.A OD1 TYR 34.A HH 2.678 1.796 SER 38.A N PRO 35.A O SER 38.A H 3.009 2.109 SER 38.A OG VAL 42.A O SER 38.A HG 2.862 1.916 VAL 42.A N VAL 39.A O VAL 42.A H 3.343 2.402 ASN 48.A N PRO 44.A O ASN 48.A H 2.838 1.905 ASN 48.A ND2 GLU 6.A O ASN 48.A HD21 3.194 2.376 ASN 48.A ND2 GLN 8.A OE1 ASN 48.A HD22 3.160 2.224 LEU 49.A N VAL 45.A O LEU 49.A H 2.824 1.974 MET 50.A N PHE 46.A O MET 50.A H 2.912 1.949 GLN 51.A N ASP 47.A O GLN 51.A H 3.031 2.127 GLN 52.A N ASN 48.A O GLN 52.A H 3.033 2.232 GLN 52.A NE2 LYS 4.A O GLN 52.A HE21 3.350 2.655 LYS 53.A N MET 50.A O LYS 53.A H 3.008 2.169 LEU 54.A N LEU 49.A O LEU 54.A H 3.025 2.055 GLN 57.A NE2 GLY 79.A O GLN 57.A HE22 3.113 2.449 ASN 58.A N ASP 231.A OD2 ASN 58.A H 3.158 2.223 ASN 58.A ND2 ASP 231.A OD1 ASN 58.A HD22 3.215 2.341 PHE 60.A N PHE 228.A O PHE 60.A H 3.087 2.172 SER 61.A N MET 77.A O SER 61.A H 2.956 2.065 SER 61.A OG GLY 80.A O SER 61.A HG 2.863 2.055 PHE 62.A N THR 226.A O PHE 62.A H 3.031 2.078 TYR 63.A N GLU 75.A O TYR 63.A H 3.000 2.042 SER 65.A N GLY 73.A O SER 65.A H 2.735 1.815 ASP 67.A N SER 65.A OG ASP 67.A H 3.409 2.455 ASP 69.A N ASP 67.A OD1 ASP 69.A H 2.990 2.084 GLU 75.A N TYR 63.A O GLU 75.A H 2.765 1.872 MET 77.A N SER 61.A O MET 77.A H 2.813 1.865 GLY 79.A N ILE 59.A O GLY 79.A H 2.935 2.127 ASP 82.A N TYR 225.A OH ASP 82.A H 2.782 1.845 LYS 84.A N ASP 82.A OD1 LYS 84.A H 3.055 2.171 LYS 84.A NZ ASP 82.A OD1 LYS 84.A HZ1 3.250 2.220 LYS 84.A NZ ASP 82.A OD2 LYS 84.A HZ1 2.994 2.245 TYR 85.A N ASP 82.A O TYR 85.A H 3.140 2.169 TYR 86.A N SER 83.A O TYR 86.A H 3.306 2.333 LYS 87.A N GLU 239.A O LYS 87.A H 2.826 1.885 SER 91.A N PHE 237.A O SER 91.A H 3.041 2.067 LEU 93.A N VAL 235.A O LEU 93.A H 2.881 1.915 VAL 95.A N ASN 233.A O VAL 95.A H 2.736 1.849 THR 96.A N GLN 102.A O THR 96.A H 3.109 2.212 THR 96.A OG1 GLU 122.A OE1 THR 96.A HG1 3.048 2.096 ALA 99.A N ARG 97.A O ALA 99.A H 2.873 2.056 ALA 99.A N TYR 100.A O ALA 99.A H 3.320 2.549 TRP 101.A NE1 MET 32.A O TRP 101.A HE1 3.073 2.109 VAL 103.A N ALA 123.A O VAL 103.A H 2.758 1.888 HIS 104.A ND1 CYS 121.A O HIS 104.A HD1 2.713 2.012 HIS 104.A ND1 GLU 122.A OE2 HIS 104.A HD1 2.894 2.190 LEU 105.A N CYS 121.A O LEU 105.A H 3.043 2.139 ASP 106.A N LYS 172.A O ASP 106.A H 2.788 1.881 VAL 108.A N LEU 116.A O VAL 108.A H 3.210 2.230 GLU 109.A N THR 170.A O GLU 109.A H 2.739 1.797 VAL 110.A N LEU 114.A O VAL 110.A H 2.832 1.857 ALA 111.A N ALA 168.A O ALA 111.A H 3.137 2.202 GLY 113.A N VAL 110.A O GLY 113.A H 2.813 1.878 LEU 116.A N VAL 108.A O LEU 116.A H 2.837 1.876 CYS 117.A SG CYS 117.A O no hydrogen 2.614 N/A CYS 121.A N LEU 105.A O CYS 121.A H 3.055 2.116 ALA 123.A N VAL 103.A O ALA 123.A H 2.859 1.932 ILE 124.A N TRP 214.A O ILE 124.A H 3.067 2.140 VAL 125.A N TRP 101.A O VAL 125.A H 2.824 1.886 ASP 126.A N LEU 216.A O ASP 126.A H 3.088 2.106 GLY 128.A N ASP 126.A OD1 GLY 128.A H 2.940 2.139 MET 132.A N GLY 200.A O MET 132.A H 2.896 1.934 VAL 133.A N ILE 215.A O VAL 133.A H 3.084 2.181 GLY 134.A N MET 202.A O GLY 134.A H 3.113 2.242 VAL 136.A N ASP 205.A OD1 VAL 136.A H 3.218 2.365 GLU 138.A N PRO 135.A O GLU 138.A H 3.202 2.426 VAL 139.A N PRO 135.A O VAL 139.A H 3.180 2.213 ARG 140.A N VAL 136.A O ARG 140.A H 2.868 1.921 GLU 141.A N ASP 137.A O GLU 141.A H 2.986 2.087 LEU 142.A N GLU 138.A O LEU 142.A H 3.072 2.119 GLN 143.A N VAL 139.A O GLN 143.A H 2.828 1.913 GLN 143.A NE2 SER 199.A OG GLN 143.A HE21 3.077 2.236 GLN 143.A NE2 PHE 201.A O GLN 143.A HE22 2.805 2.156 LYS 144.A N ARG 140.A O LYS 144.A H 3.106 2.170 ALA 145.A N GLU 141.A O ALA 145.A H 3.091 2.132 ILE 146.A N LEU 142.A O ILE 146.A H 3.014 2.104 GLY 147.A N LYS 144.A O GLY 147.A H 3.073 2.369 ALA 148.A N GLN 143.A O ALA 148.A H 3.032 2.105 VAL 149.A N MET 157.A O VAL 149.A H 2.899 1.951 LEU 151.A N GLU 155.A O LEU 151.A H 2.797 1.930 GLU 155.A N ILE 152.A O GLU 155.A H 3.218 2.328 MET 157.A N VAL 149.A O MET 157.A H 2.888 1.993 ILE 158.A N CYS 197.A O ILE 158.A H 2.900 1.953 CYS 160.A N THR 195.A O CYS 160.A H 2.881 1.914 LYS 162.A N PRO 159.A O LYS 162.A H 2.980 2.178 VAL 163.A N CYS 160.A O VAL 163.A H 3.267 2.324 THR 165.A N LYS 162.A O THR 165.A H 2.966 2.019 LEU 166.A N VAL 163.A O LEU 166.A H 3.056 2.103 ILE 169.A N LEU 180.A O ILE 169.A H 2.933 2.003 THR 170.A N GLU 109.A O THR 170.A H 2.812 1.933 LEU 171.A N TYR 178.A O LEU 171.A H 2.997 2.059 LYS 172.A N GLN 107.A O LYS 172.A H 2.761 1.877 LYS 172.A NZ ASP 106.A OD2 LYS 172.A HZ3 3.410 2.514 LEU 173.A N LYS 176.A O LEU 173.A H 2.886 2.083 GLY 175.A N ASP 106.A OD2 GLY 175.A H 3.158 2.187 LYS 176.A N LEU 173.A O LYS 176.A H 2.982 2.064 TYR 178.A N LEU 171.A O TYR 178.A H 2.866 1.898 LEU 180.A N ILE 169.A O LEU 180.A H 2.778 1.811 SER 181.A N ASP 184.A OD2 SER 181.A H 2.912 1.970 ASP 184.A N SER 181.A O ASP 184.A H 2.814 1.952 TYR 185.A N SER 181.A O TYR 185.A H 3.083 2.161 THR 186.A OG1 PRO 182.A O THR 186.A HG1 2.754 1.902 LEU 187.A N LEU 198.A O LEU 187.A H 2.930 2.045 VAL 189.A N LEU 196.A O VAL 189.A H 3.139 2.184 SER 190.A OG ALA 192.A O SER 190.A HG 3.184 2.560 CYS 197.A N ILE 158.A O CYS 197.A H 3.422 2.608 LEU 198.A N LEU 187.A O LEU 198.A H 2.775 1.846 SER 199.A N TYR 156.A O SER 199.A H 2.821 1.898 SER 199.A OG GLN 143.A OE1 SER 199.A HG 2.763 1.891 GLY 200.A N TYR 185.A O GLY 200.A H 2.663 1.869 PHE 201.A N SER 199.A O PHE 201.A H 2.875 2.141 MET 202.A N MET 132.A O MET 202.A H 2.751 1.810 GLY 203.A N GLY 154.A O GLY 203.A H 2.873 1.943 MET 204.A N GLY 134.A O MET 204.A H 2.837 1.964 GLY 211.A N PRO 207.A O GLY 211.A H 2.930 2.062 TRP 214.A N GLU 122.A O TRP 214.A H 3.156 2.172 ILE 215.A N VAL 133.A O ILE 215.A H 2.855 1.909 LEU 216.A N ILE 124.A O LEU 216.A H 3.012 2.049 ASP 218.A N THR 129.A O ASP 218.A H 2.827 1.877 VAL 219.A N SER 130.A O VAL 219.A H 3.122 2.171 PHE 220.A N GLY 217.A O PHE 220.A H 2.814 2.076 ILE 221.A N GLY 217.A O ILE 221.A H 3.038 2.079 GLY 222.A N ASP 218.A O GLY 222.A H 2.602 1.865 ARG 223.A N PHE 220.A O ARG 223.A H 3.006 2.149 ARG 223.A NE LYS 179.A O ARG 223.A HE 3.132 2.560 TYR 224.A N PHE 220.A O TYR 224.A H 2.890 2.052 TYR 224.A OH LYS 179.A O TYR 224.A HH 2.814 1.883 TYR 225.A N ALA 238.A O TYR 225.A H 2.761 1.908 THR 226.A N PHE 62.A O THR 226.A H 3.400 2.476 VAL 227.A N GLY 236.A O VAL 227.A H 2.869 1.937 PHE 228.A N PHE 60.A O PHE 228.A H 2.920 1.945 ASP 229.A N ARG 234.A O ASP 229.A H 2.997 2.055 ARG 230.A N ASN 58.A O ARG 230.A H 2.965 2.129 ARG 230.A NH1 ASP 47.A OD1 ARG 230.A HH12 3.406 2.682 ARG 230.A NH1 ASP 47.A OD2 ARG 230.A HH12 2.949 1.978 ARG 230.A NH2 ASP 47.A OD1 ARG 230.A HH22 3.025 2.176 ASN 232.A N ASP 229.A O ASN 232.A H 3.398 2.534 ASN 232.A N ASP 229.A OD1 ASN 232.A H 2.919 2.225 ARG 234.A NE ASP 229.A OD2 ARG 234.A HE 3.076 2.131 ARG 234.A NH2 ASP 229.A OD2 ARG 234.A HH21 3.318 2.462 VAL 235.A N LEU 93.A O VAL 235.A H 2.856 1.925 GLY 236.A N VAL 227.A O GLY 236.A H 2.795 1.900 PHE 237.A N SER 91.A O PHE 237.A H 2.906 1.979 ALA 238.A N TYR 225.A O ALA 238.A H 3.141 2.224 ALA 240.A N ARG 223.A O ALA 240.A H 2.872 1.895 ALA 241.A N TYR 85.A O ALA 241.A H 2.736 1.888