Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1mir_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): PHE 58.A N TRP 259.A O PHE 58.A H 3.139 2.180 ALA 60.A N LEU 257.A O ALA 60.A H 3.039 2.126 ARG 61.A N ASP 59.A OD1 ARG 61.A H 2.972 2.191 ARG 61.A NE ASP 59.A OD1 ARG 61.A HE 2.959 2.032 ARG 61.A NE ASP 59.A OD2 ARG 61.A HE 3.323 2.491 ARG 61.A NH2 ASP 59.A OD2 ARG 61.A HH21 2.992 2.039 GLU 62.A N ASP 59.A O GLU 62.A H 2.796 2.075 GLN 63.A N ASP 59.A O GLN 63.A H 3.215 2.242 GLN 63.A NE2 GLN 63.A O GLN 63.A HE22 3.271 2.627 TRP 64.A N ALA 60.A O TRP 64.A H 2.878 1.960 CYS 67.A N TRP 64.A O CYS 67.A H 2.801 1.893 ILE 70.A N CYS 67.A O ILE 70.A H 3.248 2.422 ALA 71.A N PRO 68.A O ALA 71.A H 2.968 2.090 GLN 72.A N THR 69.A O GLN 72.A H 2.783 1.929 ARG 74.A NH1 VAL 107.A O ARG 74.A HH12 2.931 2.033 ARG 74.A NH2 VAL 107.A O ARG 74.A HH22 3.520 2.814 GLN 76.A N SER 273.A O GLN 76.A H 3.381 2.498 GLN 76.A NE2 CYS 79.A O GLN 76.A HE22 3.016 2.145 GLN 76.A NE2 LEU 32P.A O GLN 76.A HE21 2.767 1.979 GLY 77.A N ASP 75.A OD1 GLY 77.A H 3.018 2.074 CYS 79.A N GLN 76.A O CYS 79.A H 3.388 2.573 GLY 80.A N CYS 124.A O GLY 80.A H 2.657 1.880 TRP 83.A N GLY 34P.A O TRP 83.A H 2.972 2.127 TRP 83.A NE1 GLY 123.A O TRP 83.A HE1 2.968 2.039 ALA 84.A N SER 81.A O ALA 84.A H 2.598 1.832 PHE 85.A N SER 81.A O PHE 85.A H 2.992 2.057 GLY 86.A N SER 82.A O GLY 86.A H 2.899 1.922 VAL 88.A N ALA 84.A O VAL 88.A H 3.074 2.135 GLU 89.A N PHE 85.A O GLU 89.A H 2.885 1.986 ALA 90.A N GLY 86.A O ALA 90.A H 3.355 2.413 MET 91.A N ALA 87.A O MET 91.A H 2.897 1.927 SER 92.A N VAL 88.A O SER 92.A H 2.975 2.010 ASP 93.A N GLU 89.A O ASP 93.A H 3.202 2.228 ARG 94.A N ALA 90.A O ARG 94.A H 3.034 2.074 ARG 94.A NE GLY 302.A O ARG 94.A HE 2.926 2.091 ARG 94.A NH1 GLU 216.A OE2 ARG 94.A HH12 3.219 2.449 ARG 94.A NH2 GLU 216.A OE2 ARG 94.A HH22 2.886 1.994 ARG 94.A NH2 GLY 302.A O ARG 94.A HH21 2.800 1.913 ILE 95.A N MET 91.A O ILE 95.A H 2.991 2.018 CYS 96.A N SER 92.A O CYS 96.A H 3.374 2.439 CYS 96.A SG ASN 66.A O no hydrogen 3.773 N/A ILE 97.A N ASP 93.A O ILE 97.A H 3.045 2.070 HIS 98.A N ARG 94.A O HIS 98.A H 2.701 1.729 HIS 98.A NE2 ASN 220.A O HIS 98.A HE2 2.680 1.843 THR 99.A N CYS 96.A O THR 99.A H 2.854 1.917 THR 99.A OG1 VAL 103.A O THR 99.A HG1 3.356 2.750 ASN 100.A N ILE 97.A O ASN 100.A H 3.174 2.297 GLY 101.A N CYS 96.A O GLY 101.A H 2.998 2.025 ARG 102.A N THR 99.A O ARG 102.A H 2.831 1.925 VAL 107.A N SER 92.A OG VAL 107.A H 3.038 2.094 SER 108.A N VAL 142.A O SER 108.A H 2.857 1.913 ASP 111.A N SER 108.A OG ASP 111.A H 2.857 1.879 LEU 113.A N ALA 109.A O LEU 113.A H 2.973 2.032 THR 114.A N GLU 110.A O THR 114.A H 2.892 2.033 CYS 115.A N ASP 111.A O CYS 115.A H 2.839 1.927 CYS 115.A SG ASP 111.A OD1 no hydrogen 3.188 N/A CYS 115.A SG THR 114.A OG1 no hydrogen 3.184 N/A CYS 115.A SG TYR 193.A OH no hydrogen 3.650 N/A CYS 116.A N LEU 112.A O CYS 116.A H 3.472 2.562 ASP 122.A N GLY 126.A O ASP 122.A H 3.127 2.198 ASN 125.A N ASP 122.A O ASN 125.A H 2.640 1.727 ASN 125.A ND2 ASP 122.A OD2 ASN 125.A HD22 2.995 2.098 GLY 126.A N GLY 123.A O GLY 126.A H 3.201 2.295 TYR 128.A N CYS 120.A O TYR 128.A H 2.679 1.756 SER 130.A OG PRO 40P.A O SER 130.A HG 3.426 2.540 ALA 132.A N TYR 128.A O ALA 132.A H 3.433 2.484 TRP 133.A N PRO 129.A O TRP 133.A H 3.325 2.360 TRP 133.A NE1 GLU 224.A OE1 TRP 133.A HE1 2.868 2.055 ASN 134.A N SER 130.A O ASN 134.A H 2.995 2.041 PHE 135.A N GLY 131.A O PHE 135.A H 2.741 2.002 PHE 135.A N ALA 132.A O PHE 135.A H 3.085 2.350 TRP 136.A N ALA 132.A O TRP 136.A H 3.009 2.064 THR 137.A N TRP 133.A O THR 137.A H 3.323 2.484 THR 137.A OG1 TRP 133.A O THR 137.A HG1 3.135 2.239 ARG 138.A N ASN 134.A O ARG 138.A H 3.369 2.408 LYS 139.A N PHE 135.A O LYS 139.A H 2.845 1.932 GLY 140.A N PHE 135.A O GLY 140.A H 3.185 2.280 LEU 141.A N HIS 198.A O LEU 141.A H 3.124 2.171 VAL 142.A N ASP 111.A OD2 VAL 142.A H 3.027 2.058 SER 143.A N ASP 196.A OD2 SER 143.A H 3.413 2.475 SER 143.A OG ASP 196.A OD2 SER 143.A HG 2.900 1.981 GLY 144.A N GLU 106.A O GLY 144.A H 2.802 1.972 GLY 145.A N ILE 151.A O GLY 145.A H 2.718 1.806 SER 149.A N VAL 146.A O SER 149.A H 2.933 2.050 SER 149.A OG VAL 146.A O SER 149.A HG 2.596 1.819 HIS 150.A ND1 GLU 186.A OE2 HIS 150.A HD1 3.131 2.248 ILE 151.A N SER 149.A OG ILE 151.A H 3.189 2.282 CYS 153.A N SER 143.A OG CYS 153.A H 3.102 2.124 LEU 154.A N SER 143.A O LEU 154.A H 3.108 2.261 TYR 156.A N GLY 145.A O TYR 156.A H 3.089 2.187 THR 157.A N GLU 110.A OE1 THR 157.A H 2.841 1.961 HIS 163.A N CYS 161.A O HIS 163.A H 2.649 1.783 HIS 163.A NE2 ASN 275.A OD1 HIS 163.A HE2 3.063 2.350 VAL 165.A N GLU 162.A O VAL 165.A H 3.142 2.181 CYS 172.A N ASN 23P.A O CYS 172.A H 2.963 2.121 THR 173.A OG1 ASP 25P.A OD2 THR 173.A HG1 3.182 2.429 THR 173.A OG1 SER 27P.A OG THR 173.A HG1 2.855 2.027 ASN 182.A ND2 MET 184.A O ASN 182.A HD22 3.689 3.163 CYS 185.A SG THR 191.A O no hydrogen 3.438 N/A GLU 186.A N CYS 153.A O GLU 186.A H 2.870 1.899 TYR 189.A N GLU 186.A O TYR 189.A H 3.013 2.068 TYR 189.A OH ASP 196.A OD1 TYR 189.A HH 3.353 2.513 TYR 189.A OH ASP 196.A OD2 TYR 189.A HH 3.131 2.472 THR 191.A N TYR 189.A O THR 191.A H 3.005 2.169 ASP 196.A N TYR 193.A O ASP 196.A H 2.810 1.895 LYS 197.A NZ ASP 111.A OD2 LYS 197.A HZ1 2.839 1.813 LYS 197.A NZ GLY 140.A O LYS 197.A HZ3 3.067 2.118 HIS 198.A N LEU 141.A O HIS 198.A H 2.716 1.752 TYR 201.A N ILE 303.A O TYR 201.A H 2.809 1.908 TYR 204.A N ALA 301.A O TYR 204.A H 2.843 1.893 TYR 204.A OH GLU 216.A OE1 TYR 204.A HH 3.289 2.507 TYR 204.A OH GLU 216.A OE2 TYR 204.A HH 2.771 1.868 SER 205.A N PRO 43P.A O SER 205.A H 3.083 2.103 VAL 206.A N ILE 299.A O VAL 206.A H 2.954 2.131 ILE 213.A N SER 209.A O ILE 213.A H 2.996 2.035 MET 214.A N GLU 210.A O MET 214.A H 3.158 2.228 ALA 215.A N LYS 211.A O ALA 215.A H 3.020 2.096 GLU 216.A N GLU 212.A O GLU 216.A H 2.982 2.022 ILE 217.A N ILE 213.A O ILE 217.A H 3.007 2.087 TYR 218.A N MET 214.A O TYR 218.A H 3.048 2.098 LYS 219.A N ALA 215.A O LYS 219.A H 2.804 1.915 ASN 220.A N GLU 216.A O ASN 220.A H 2.815 1.947 ASN 220.A ND2 GLU 216.A OE1 ASN 220.A HD22 3.079 2.196 ASN 220.A ND2 GLU 216.A OE2 ASN 220.A HD22 3.245 2.353 GLY 221.A N GLU 216.A O GLY 221.A H 3.233 2.507 GLY 221.A N ILE 217.A O GLY 221.A H 2.845 2.153 VAL 223.A N ILE 256.A O VAL 223.A H 3.031 2.118 GLU 224.A N VAL 300.A O GLU 224.A H 3.023 2.226 GLY 225.A N ILE 254.A O GLY 225.A H 2.851 1.958 PHE 227.A N HIS 252.A O PHE 227.A H 2.715 1.808 THR 228.A N CYS 293.A O THR 228.A H 3.026 2.068 VAL 229.A N GLY 250.A O VAL 229.A H 2.746 1.818 SER 231.A N ASP 247.A O SER 231.A H 2.886 1.942 SER 231.A OG ASP 247.A O SER 231.A HG 3.100 2.243 PHE 233.A N PHE 230.A O PHE 233.A H 2.836 1.990 LEU 234.A N SER 231.A O LEU 234.A H 2.855 2.038 THR 235.A N ASP 232.A O THR 235.A H 2.882 1.966 TYR 236.A N PHE 233.A O TYR 236.A H 2.818 1.866 TYR 236.A OH GLY 239.A O TYR 236.A HH 2.703 1.749 LYS 237.A N GLN 16P.A O LYS 237.A H 2.925 2.164 LYS 237.A NZ ASN 20P.A OD1 LYS 237.A HZ1 3.011 2.224 SER 238.A N GLN 16P.A O SER 238.A H 3.168 2.303 VAL 240.A N THR 14P.A O VAL 240.A H 2.800 1.828 TYR 241.A N LYS 285.A O TYR 241.A H 2.783 1.859 HIS 243.A ND1 ASP 232.A OD1 HIS 243.A HD1 3.355 2.446 GLU 244.A N ASP 232.A OD2 GLU 244.A H 2.920 2.006 ALA 245.A N ASP 232.A OD2 ALA 245.A H 2.969 2.008 VAL 248.A N ASP 247.A OD1 VAL 248.A H 2.819 1.938 MET 249.A N VAL 229.A O MET 249.A H 2.748 1.783 HIS 252.A ND1 SER 82.A OG HIS 252.A HD1 3.089 2.274 HIS 252.A NE2 ASN 272.A OD1 HIS 252.A HE2 2.948 1.984 ILE 254.A N GLY 225.A O ILE 254.A H 2.645 1.825 ARG 255.A N ALA 271.A O ARG 255.A H 3.476 2.498 ILE 256.A N VAL 223.A O ILE 256.A H 2.795 1.888 LEU 257.A N LEU 269.A O LEU 257.A H 3.048 2.072 TRP 259.A N PHE 58.A O TRP 259.A H 3.078 2.186 TRP 259.A NE1 PRO 55.A O TRP 259.A HE1 3.195 2.278 GLY 260.A N TYR 267.A O GLY 260.A H 3.101 2.408 GLU 262.A N VAL 265.A O GLU 262.A H 2.869 1.907 ASN 263.A ND2 GLU 262.A O ASN 263.A HD22 3.620 2.883 VAL 265.A N GLU 262.A O VAL 265.A H 3.075 2.355 TYR 267.A N GLY 260.A O TYR 267.A H 2.928 1.976 TRP 268.A N ILE 286.A O TRP 268.A H 2.817 1.875 TRP 268.A NE1 GLU 296.A OE2 TRP 268.A HE1 2.956 1.991 LEU 269.A N GLY 258.A O LEU 269.A H 2.793 1.828 VAL 270.A N PHE 284.A O VAL 270.A H 2.854 1.953 ALA 271.A N ARG 255.A O ALA 271.A H 3.006 2.034 ASN 272.A N GLY 282.A O ASN 272.A H 3.005 2.102 SER 273.A N ASN 272.A OD1 SER 273.A H 2.692 1.980 ASN 275.A N ARG 74.A O ASN 275.A H 3.348 2.494 ASN 275.A ND2 ASP 277.A OD2 ASN 275.A HD21 3.304 2.448 TRP 278.A N ASN 275.A O TRP 278.A H 2.981 2.009 GLY 279.A N ASN 20P.A OD1 GLY 279.A H 3.073 2.104 ASP 280.A N PHE 283.A O ASP 280.A H 3.082 2.380 ASN 281.A N GLY 279.A O ASN 281.A H 2.952 2.246 GLY 282.A N TRP 278.A O GLY 282.A H 2.807 2.100 PHE 283.A N ASP 280.A O PHE 283.A H 2.864 1.982 PHE 284.A N VAL 270.A O PHE 284.A H 2.802 1.890 LYS 285.A N TYR 236.A OH LYS 285.A H 3.245 2.312 ILE 286.A N TRP 268.A O ILE 286.A H 3.176 2.261 LEU 287.A N TYR 241.A O LEU 287.A H 3.052 2.154 ARG 288.A N PRO 266.A O ARG 288.A H 2.870 1.917 ARG 288.A NH2 GLY 260.A O ARG 288.A HH21 3.409 2.455 GLY 289.A N GLU 296.A OE2 GLY 289.A H 2.943 2.116 ASN 291.A N GLY 289.A O ASN 291.A H 2.829 1.985 ASN 291.A N GLU 296.A OE1 ASN 291.A H 3.119 2.359 ASN 291.A ND2 SER 297.A OG ASN 291.A HD21 3.283 2.405 GLY 294.A N ASN 291.A O GLY 294.A H 3.416 2.475 ILE 295.A N HIS 292.A O ILE 295.A H 2.899 1.926 GLU 296.A N ASN 291.A OD1 GLU 296.A H 3.120 2.285 SER 297.A N GLY 294.A O SER 297.A H 2.826 1.880 VAL 300.A N GLU 224.A O VAL 300.A H 2.927 1.974 ALA 301.A N TYR 204.A O ALA 301.A H 3.088 2.277 ILE 303.A N THR 202.A O ILE 303.A H 3.409 2.505 ARG 305.A N TYR 199.A O ARG 305.A H 3.087 2.199 ARG 305.A NE GLN 307.A OE1 ARG 305.A HE 3.378 2.511 ARG 305.A NH2 GLN 307.A OE1 ARG 305.A HH21 3.465 2.611 TYR 309.A N THR 306.A O TYR 309.A H 3.030 2.073 TRP 310.A N GLN 307.A O TRP 310.A H 3.197 2.330 ARG 312.A N TYR 309.A O ARG 312.A H 3.005 2.211 PHE 313.A N TYR 309.A O PHE 313.A H 2.704 1.877 PHE 313.A N TRP 310.A O PHE 313.A H 3.173 2.441 MET 4P.A N SER 1P.A O MET 4P.A H 3.037 2.154 ASN 6P.A N ASP 2P.A O ASN 6P.A H 3.109 2.167 ASN 6P.A ND2 ASP 2P.A O ASN 6P.A HD22 3.223 2.673 TYR 7P.A N ASP 3P.A O TYR 7P.A H 3.031 2.073 ILE 8P.A N MET 4P.A O ILE 8P.A H 2.836 1.870 ASN 9P.A N ILE 5P.A O ASN 9P.A H 3.129 2.167 ASN 9P.A ND2 ALA 17P.A O ASN 9P.A HD21 3.130 2.219 LYS 10P.A N ASN 6P.A O LYS 10P.A H 2.756 1.797 GLN 11P.A N TYR 7P.A O GLN 11P.A H 3.080 2.399 GLN 11P.A N ILE 8P.A O GLN 11P.A H 3.012 2.207 GLN 11P.A NE2 TYR 7P.A O GLN 11P.A HE22 3.282 2.435 ASN 12P.A N ASN 9P.A O ASN 12P.A H 3.087 2.205 ASN 12P.A ND2 ASN 12P.A O ASN 12P.A HD22 2.734 2.062 THR 14P.A OG1 VAL 240.A O THR 14P.A HG1 2.869 2.156 TRP 15P.A NE1 LYS 242.A O TRP 15P.A HE1 3.230 2.438 GLN 16P.A N SER 238.A O GLN 16P.A H 2.846 1.886 ALA 17P.A N ASN 9P.A OD1 ALA 17P.A H 3.013 2.095 GLY 18P.A N THR 235.A O GLY 18P.A H 2.811 1.853 ASN 20P.A ND2 LEU 234.A O ASN 20P.A HD22 3.061 2.145 ASN 20P.A ND2 TYR 236.A O ASN 20P.A HD21 2.773 1.855 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