Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1mpb_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A N ASP 55.A OD1 LYS 1.A H3 2.999 2.187 GLY 5.A N ASN 272.A OD1 GLY 5.A H 2.834 1.966 LEU 7.A N LYS 34.A O LEU 7.A H 2.947 1.994 VAL 8.A N ASP 58.A OD2 VAL 8.A H 3.011 2.064 ILE 9.A N THR 36.A O ILE 9.A H 2.722 1.802 TRP 10.A N ILE 59.A O TRP 10.A H 2.935 1.967 ILE 11.A N GLU 38.A O ILE 11.A H 3.040 2.103 LYS 15.A N ASN 12.A O LYS 15.A H 3.015 2.122 TYR 17.A N LYS 15.A O TYR 17.A H 2.875 2.102 GLY 19.A N ASP 296.A OD2 GLY 19.A H 2.972 2.101 LEU 20.A N GLY 16.A O LEU 20.A H 2.974 2.061 ALA 21.A N TYR 17.A O ALA 21.A H 2.896 1.990 GLU 22.A N ASN 18.A O GLU 22.A H 3.208 2.351 VAL 23.A N GLY 19.A O VAL 23.A H 3.220 2.349 GLY 24.A N LEU 20.A O GLY 24.A H 2.975 2.072 LYS 25.A N ALA 21.A O LYS 25.A H 2.921 2.146 LYS 25.A NZ GLU 22.A OE2 LYS 25.A HZ2 2.997 2.154 LYS 26.A N GLU 22.A O LYS 26.A H 3.307 2.437 LYS 26.A NZ ASP 30.A OD2 LYS 26.A HZ1 3.399 2.505 PHE 27.A N VAL 23.A O PHE 27.A H 3.131 2.224 GLU 28.A N GLY 24.A O GLU 28.A H 2.965 2.031 LYS 29.A N LYS 25.A O LYS 29.A H 2.907 2.068 ASP 30.A N LYS 26.A O ASP 30.A H 3.088 2.284 THR 31.A N PHE 27.A O THR 31.A H 2.812 2.022 GLY 32.A N GLU 28.A O GLY 32.A H 2.703 1.822 ILE 33.A N THR 31.A OG1 ILE 33.A H 3.081 2.153 THR 36.A N LEU 7.A O THR 36.A H 2.747 1.785 GLU 38.A N ILE 9.A O GLU 38.A H 2.776 1.826 LEU 43.A N PRO 40.A O LEU 43.A H 3.314 2.624 GLU 44.A N GLU 44.A OE1 GLU 44.A H 2.753 1.925 GLU 45.A N LYS 42.A O GLU 45.A H 2.979 2.086 LYS 46.A N LYS 42.A O LYS 46.A H 3.056 2.124 LYS 46.A NZ ASP 41.A O LYS 46.A HZ3 3.238 2.389 PHE 47.A N LEU 43.A O PHE 47.A H 2.890 1.948 VAL 50.A N LYS 46.A O VAL 50.A H 3.061 2.096 ALA 51.A N PHE 47.A O ALA 51.A H 2.801 1.880 ALA 52.A N PRO 48.A O ALA 52.A H 3.245 2.480 ALA 52.A N GLN 49.A O ALA 52.A H 3.281 2.561 THR 53.A N VAL 50.A O THR 53.A H 3.292 2.520 GLY 54.A N ALA 51.A O GLY 54.A H 3.144 2.271 ASP 55.A N VAL 50.A O ASP 55.A H 2.813 1.973 ASP 58.A N VAL 8.A O ASP 58.A H 2.908 2.196 ILE 59.A N VAL 8.A O ILE 59.A H 3.158 2.201 ILE 60.A N GLY 265.A O ILE 60.A H 3.015 2.064 PHE 61.A N TRP 10.A O PHE 61.A H 2.854 1.928 TRP 62.A N SER 263.A O TRP 62.A H 3.014 2.083 HIS 64.A N VAL 261.A O HIS 64.A H 2.727 1.964 HIS 64.A NE2 MET 330.A O HIS 64.A HE2 2.630 1.775 ARG 66.A N ALA 63.A O ARG 66.A H 3.404 2.562 ARG 66.A NH1 GLU 45.A OE2 ARG 66.A HH12 2.848 1.891 PHE 67.A N HIS 64.A O PHE 67.A H 3.145 2.355 GLY 68.A N ASP 65.A O GLY 68.A H 3.533 2.598 TYR 70.A N ARG 66.A O TYR 70.A H 3.482 2.546 ALA 71.A N PHE 67.A O ALA 71.A H 2.977 2.045 GLN 72.A N GLY 68.A O GLN 72.A H 3.038 2.317 GLN 72.A N GLY 69.A O GLN 72.A H 3.252 2.560 SER 73.A N GLY 69.A O SER 73.A H 3.346 2.481 GLY 74.A N ALA 71.A O GLY 74.A H 3.149 2.264 LEU 75.A N TYR 70.A O LEU 75.A H 2.981 2.028 ALA 77.A N ILE 266.A O ALA 77.A H 2.871 1.900 ILE 79.A N LEU 103.A O ILE 79.A H 2.955 1.996 PHE 85.A N ASP 82.A OD1 PHE 85.A H 2.896 2.045 GLN 86.A N ASP 82.A O GLN 86.A H 3.026 2.070 GLN 86.A NE2 PRO 81.A O GLN 86.A HE22 3.225 2.382 ASP 87.A N LYS 83.A O ASP 87.A H 3.100 2.246 LYS 88.A N PHE 85.A O LYS 88.A H 3.062 2.148 LYS 88.A NZ ALA 84.A O LYS 88.A HZ3 3.358 2.632 LEU 89.A N GLN 86.A O LEU 89.A H 3.212 2.265 TYR 90.A N ALA 303.A O TYR 90.A H 3.075 2.161 THR 93.A N TYR 90.A O THR 93.A H 2.970 2.129 TRP 94.A N PRO 91.A O TRP 94.A H 3.098 2.228 TRP 94.A NE1 GLN 86.A O TRP 94.A HE1 3.009 2.092 ASP 95.A N PHE 92.A O ASP 95.A H 3.273 2.527 ALA 96.A N THR 93.A O ALA 96.A H 3.376 2.575 VAL 97.A N TRP 94.A O VAL 97.A H 3.147 2.251 ARG 98.A NE ASP 95.A OD1 ARG 98.A HE 3.166 2.263 ARG 98.A NH2 ASP 95.A OD1 ARG 98.A HH21 3.184 2.284 TYR 99.A N LYS 102.A O TYR 99.A H 2.685 1.744 GLY 101.A N GLY 174.A O GLY 101.A H 3.458 2.612 LYS 102.A N TYR 99.A O LYS 102.A H 2.976 2.048 ILE 104.A N VAL 97.A O ILE 104.A H 2.792 1.823 TYR 106.A N ALA 264.A O TYR 106.A H 2.864 1.895 ILE 108.A N LEU 262.A O ILE 108.A H 2.703 1.795 ALA 109.A N LEU 262.A O ALA 109.A H 3.365 2.448 VAL 110.A N ALA 301.A O VAL 110.A H 2.873 1.902 GLU 111.A N GLY 260.A O GLU 111.A H 2.761 1.848 SER 114.A N ASN 227.A O SER 114.A H 2.954 1.982 LEU 115.A N THR 245.A O LEU 115.A H 2.977 2.110 ILE 116.A N THR 225.A O ILE 116.A H 2.915 1.964 TYR 117.A N GLY 243.A O TYR 117.A H 2.969 2.017 ASN 118.A N ALA 223.A O ASN 118.A H 2.846 1.902 LYS 119.A N ASN 241.A O LYS 119.A H 2.731 1.888 LYS 119.A NZ TYR 242.A O LYS 119.A HZ3 2.999 2.171 ASP 120.A N ASN 118.A OD1 ASP 120.A H 2.990 2.232 LEU 121.A N ASN 118.A OD1 LEU 121.A H 3.425 2.515 LEU 122.A N ASN 118.A O LEU 122.A H 2.967 2.063 TRP 129.A N THR 249.A O TRP 129.A H 2.849 1.903 TRP 129.A NE1 SER 255.A OG TRP 129.A HE1 3.024 2.082 GLU 130.A N GLU 130.A OE1 GLU 130.A H 2.887 2.024 GLU 131.A N THR 128.A OG1 GLU 131.A H 3.403 2.594 ILE 132.A N TRP 129.A O ILE 132.A H 3.003 2.071 LEU 135.A N GLU 131.A O LEU 135.A H 3.202 2.258 ASP 136.A N ILE 132.A O ASP 136.A H 2.910 2.025 LYS 137.A N PRO 133.A O LYS 137.A H 3.236 2.336 GLU 138.A N ALA 134.A O GLU 138.A H 3.126 2.195 LEU 139.A N LEU 135.A O LEU 139.A H 3.091 2.180 LYS 140.A N ASP 136.A O LYS 140.A H 2.755 1.912 LYS 140.A NZ ASP 136.A OD2 LYS 140.A HZ1 2.759 1.944 ALA 141.A N LYS 137.A O ALA 141.A H 3.333 2.456 LYS 142.A N LEU 139.A O LYS 142.A H 3.108 2.200 GLY 143.A N LYS 140.A O GLY 143.A H 2.903 1.940 LYS 144.A N LEU 139.A O LYS 144.A H 2.868 1.963 LYS 144.A NZ GLY 220.A O LYS 144.A HZ1 3.208 2.405 SER 145.A N GLU 221.A O SER 145.A H 3.281 2.335 ALA 146.A N ASP 136.A OD1 ALA 146.A H 2.919 2.014 MET 148.A N MET 224.A O MET 148.A H 3.128 2.159 LEU 151.A N THR 208.A O LEU 151.A H 3.099 2.134 GLN 152.A N ASN 150.A OD1 GLN 152.A H 3.092 2.216 GLN 152.A NE2 ALA 206.A O GLN 152.A HE21 2.875 1.956 GLN 152.A NE2 THR 208.A O GLN 152.A HE22 3.041 2.063 PHE 156.A N GLU 153.A O PHE 156.A H 2.936 2.089 TRP 158.A N PRO 154.A O TRP 158.A H 2.864 2.030 TRP 158.A NE1 GLU 328.A OE1 TRP 158.A HE1 2.878 1.941 LEU 160.A N THR 157.A O LEU 160.A H 3.223 2.457 ILE 161.A N THR 157.A O ILE 161.A H 3.320 2.350 ALA 162.A N TRP 158.A O ALA 162.A H 2.831 1.900 ALA 163.A N PRO 159.A O ALA 163.A H 3.274 2.581 ALA 163.A N LEU 160.A O ALA 163.A H 3.353 2.591 GLY 165.A N ALA 162.A O GLY 165.A H 2.810 1.849 GLY 166.A N ALA 162.A O GLY 166.A H 3.102 2.393 TYR 167.A N GLY 182.A O TYR 167.A H 2.990 2.049 ALA 168.A N GLU 328.A OE2 ALA 168.A H 2.946 1.977 LYS 170.A N ASP 180.A O LYS 170.A H 2.922 2.000 GLU 172.A N LYS 175.A O GLU 172.A H 2.774 1.803 ASP 177.A N LYS 170.A O ASP 177.A H 2.836 1.892 LYS 179.A N ASP 177.A OD1 LYS 179.A H 3.016 2.104 ASP 180.A N ASP 177.A O ASP 180.A H 3.078 2.157 GLY 182.A N TYR 167.A O GLY 182.A H 2.845 2.107 GLY 182.A N ALA 168.A O GLY 182.A H 3.464 2.593 VAL 183.A N GLN 365.A OE1 VAL 183.A H 3.161 2.293 ASP 184.A N GLN 365.A OE1 ASP 184.A H 3.301 2.509 ASN 185.A ND2 GLY 165.A O ASN 185.A HD21 2.851 2.014 ALA 188.A N ASN 185.A OD1 ALA 188.A H 2.971 2.035 LYS 189.A N ASN 185.A O LYS 189.A H 3.093 2.153 LYS 189.A NZ ASP 358.A OD1 LYS 189.A HZ1 3.236 2.270 ALA 190.A N ALA 186.A O ALA 190.A H 2.987 2.050 GLY 191.A N GLY 187.A O GLY 191.A H 3.115 2.160 LEU 192.A N ALA 188.A O LEU 192.A H 3.045 2.091 THR 193.A N LYS 189.A O THR 193.A H 2.858 1.965 PHE 194.A N ALA 190.A O PHE 194.A H 3.047 2.130 LEU 195.A N GLY 191.A O LEU 195.A H 3.171 2.299 VAL 196.A N LEU 192.A O VAL 196.A H 2.979 2.085 ASP 197.A N THR 193.A O ASP 197.A H 2.871 1.953 LEU 198.A N PHE 194.A O LEU 198.A H 3.194 2.320 ILE 199.A N LEU 195.A O ILE 199.A H 3.336 2.519 LYS 200.A N VAL 196.A O LYS 200.A H 2.851 1.886 ASN 201.A N ASP 197.A O ASN 201.A H 2.961 2.030 LYS 202.A N ILE 199.A O LYS 202.A H 3.050 2.169 HIS 203.A N LEU 198.A O HIS 203.A H 2.754 1.968 HIS 203.A ND1 ASP 136.A OD2 HIS 203.A HD1 2.798 1.863 MET 204.A N LEU 198.A O MET 204.A H 3.132 2.357 THR 208.A N ASN 205.A O THR 208.A H 3.072 2.118 ILE 212.A N ASP 209.A OD1 ILE 212.A H 2.834 1.897 ALA 213.A N ASP 209.A O ALA 213.A H 3.121 2.161 GLU 214.A N TYR 210.A O GLU 214.A H 3.092 2.193 ALA 215.A N SER 211.A O ALA 215.A H 3.104 2.147 ALA 216.A N ILE 212.A O ALA 216.A H 3.085 2.120 PHE 217.A N ALA 213.A O PHE 217.A H 3.117 2.163 ASN 218.A N GLU 214.A O ASN 218.A H 2.862 1.920 LYS 219.A N ALA 215.A O LYS 219.A H 2.889 2.137 LYS 219.A N ALA 216.A O LYS 219.A H 3.339 2.618 GLY 220.A N PHE 217.A O GLY 220.A H 3.029 2.112 GLU 221.A N ALA 216.A O GLU 221.A H 2.893 2.036 ALA 223.A N SER 145.A O ALA 223.A H 2.916 2.003 THR 225.A N ILE 116.A O THR 225.A H 2.836 1.903 ASN 227.A N SER 114.A O ASN 227.A H 3.304 2.378 ASN 227.A ND2 TYR 210.A OH ASN 227.A HD21 3.349 2.529 GLY 228.A N ASN 227.A OD1 GLY 228.A H 2.913 2.049 ALA 231.A N GLY 228.A O ALA 231.A H 2.886 1.933 TRP 232.A N PRO 229.A O TRP 232.A H 3.376 2.543 SER 233.A OG ARG 230.A O SER 233.A HG 3.486 2.641 ASN 234.A N ALA 231.A O ASN 234.A H 3.040 2.353 ILE 235.A N ALA 231.A O ILE 235.A H 3.442 2.514 ASP 236.A N TRP 232.A O ASP 236.A H 2.870 1.963 THR 237.A N SER 233.A O THR 237.A H 3.282 2.399 THR 237.A OG1 ASN 234.A O THR 237.A HG1 2.909 2.140 SER 238.A N ASN 234.A O SER 238.A H 3.167 2.392 LYS 239.A N ILE 235.A O LYS 239.A H 3.064 2.349 LYS 239.A N ASP 236.A O LYS 239.A H 3.318 2.544 VAL 240.A N SER 238.A OG VAL 240.A H 3.202 2.261 ASN 241.A ND2 ASP 120.A OD1 ASN 241.A HD22 3.438 2.511 GLY 243.A N TYR 117.A O GLY 243.A H 2.911 1.982 THR 245.A N LEU 115.A O THR 245.A H 2.751 1.846 LEU 247.A N ASN 323.A OD1 LEU 247.A H 2.916 1.947 THR 249.A N LYS 127.A O THR 249.A H 2.964 2.010 THR 249.A OG1 LYS 127.A O THR 249.A HG1 3.231 2.271 PHE 250.A N GLN 253.A O PHE 250.A H 2.711 1.780 LYS 251.A N GLU 130.A OE2 LYS 251.A H 2.780 1.920 LYS 251.A NZ ASP 164.A OD2 LYS 251.A HZ3 3.430 2.565 GLN 253.A N PHE 250.A O GLN 253.A H 2.769 1.843 LYS 256.A N PRO 159.A O LYS 256.A H 3.131 2.172 LYS 256.A NZ LYS 326.A O LYS 256.A HZ1 3.311 2.288 VAL 259.A N GLU 328.A O VAL 259.A H 2.865 1.950 GLY 260.A N GLU 111.A O GLY 260.A H 2.940 1.981 LEU 262.A N ALA 109.A O LEU 262.A H 2.957 2.214 SER 263.A N TRP 62.A O SER 263.A H 2.733 1.798 ALA 264.A N TYR 106.A O ALA 264.A H 2.792 1.867 GLY 265.A N ILE 60.A O GLY 265.A H 2.846 1.892 ASN 267.A N ASP 58.A O ASN 267.A H 2.832 1.890 ASN 267.A ND2 ASP 55.A O ASN 267.A HD21 2.946 2.107 ASN 267.A ND2 PRO 57.A O ASN 267.A HD22 2.936 2.016 ALA 268.A N LEU 75.A O ALA 268.A H 2.910 1.942 ALA 269.A N ASN 267.A OD1 ALA 269.A H 3.061 2.111 SER 270.A N ASN 267.A O SER 270.A H 3.098 2.159 ASN 272.A N SER 270.A OG ASN 272.A H 2.932 2.021 ASN 272.A ND2 GLU 3.A O ASN 272.A HD21 2.831 1.872 ASN 272.A ND2 ASP 58.A OD1 ASN 272.A HD22 2.909 1.934 LYS 273.A NZ ALA 268.A O LYS 273.A HZ3 2.753 1.859 LYS 273.A NZ SER 270.A O LYS 273.A HZ1 2.564 1.680 ALA 276.A N ASN 272.A O ALA 276.A H 2.966 2.032 LYS 277.A N LYS 273.A O LYS 277.A H 3.029 2.125 LYS 277.A NZ GLU 281.A OE2 LYS 277.A HZ3 3.217 2.373 GLU 278.A N GLU 274.A O GLU 278.A H 3.055 2.144 PHE 279.A N LEU 275.A O PHE 279.A H 2.912 1.969 LEU 280.A N ALA 276.A O LEU 280.A H 2.981 2.031 GLU 281.A N LYS 277.A O GLU 281.A H 2.995 2.045 ASN 282.A N GLU 278.A O ASN 282.A H 3.013 2.137 ASN 282.A ND2 GLU 278.A OE1 ASN 282.A HD22 2.663 1.917 TYR 283.A N PHE 279.A O TYR 283.A H 2.952 2.174 LEU 284.A N PHE 279.A O LEU 284.A H 2.895 1.939 LEU 285.A N LEU 280.A O LEU 285.A H 2.838 1.913 THR 286.A N LEU 284.A O THR 286.A H 2.815 1.912 GLY 289.A N THR 286.A OG1 GLY 289.A H 2.864 1.997 LEU 290.A N THR 286.A O LEU 290.A H 2.981 2.006 GLU 291.A N ASP 287.A O GLU 291.A H 2.999 2.098 ALA 292.A N GLU 288.A O ALA 292.A H 3.244 2.328 VAL 293.A N GLY 289.A O VAL 293.A H 3.251 2.309 ASN 294.A N LEU 290.A O ASN 294.A H 2.801 1.854 LYS 295.A N GLU 291.A O LYS 295.A H 2.785 1.874 ASP 296.A N VAL 293.A O ASP 296.A H 2.990 2.254 LYS 297.A N VAL 293.A O LYS 297.A H 3.042 2.104 LYS 297.A NZ LYS 15.A O LYS 297.A HZ1 2.995 2.041 LEU 299.A N ASN 294.A OD1 LEU 299.A H 2.862 1.907 VAL 302.A N GLU 308.A OE1 VAL 302.A H 3.018 2.074 ALA 303.A N ILE 108.A O ALA 303.A H 2.876 1.905 LYS 305.A N LYS 88.A O LYS 305.A H 3.063 2.141 LYS 305.A NZ ASP 87.A O LYS 305.A HZ3 2.972 2.243 GLU 308.A N LEU 304.A O GLU 308.A H 2.929 2.006 GLU 309.A N LYS 305.A O GLU 309.A H 3.008 2.098 GLU 310.A N TYR 307.A O GLU 310.A H 3.070 2.356 LEU 311.A N TYR 307.A O LEU 311.A H 3.022 2.118 ALA 312.A N GLU 308.A O ALA 312.A H 2.805 1.920 LYS 313.A N GLU 310.A O LYS 313.A H 3.490 2.551 ASP 314.A N LEU 311.A O ASP 314.A H 2.944 1.988 ARG 316.A N ASP 314.A OD1 ARG 316.A H 2.973 2.123 ARG 316.A NE ASP 314.A OD1 ARG 316.A HE 3.221 2.267 ARG 316.A NE ASP 314.A OD2 ARG 316.A HE 3.437 2.605 ARG 316.A NH1 TYR 242.A OH ARG 316.A HH11 2.754 1.984 ARG 316.A NH2 ASP 314.A OD2 ARG 316.A HH21 3.071 2.106 ILE 317.A N ASP 314.A O ILE 317.A H 2.947 2.214 ALA 318.A N ASP 314.A O ALA 318.A H 3.147 2.179 ALA 319.A N PRO 315.A O ALA 319.A H 2.973 2.046 THR 320.A N ARG 316.A O THR 320.A H 3.134 2.231 MET 321.A N ILE 317.A O MET 321.A H 2.946 1.998 GLU 322.A N ALA 318.A O GLU 322.A H 2.915 2.035 ASN 323.A N ALA 319.A O ASN 323.A H 2.927 1.968 ASN 323.A ND2 SER 114.A OG ASN 323.A HD22 2.679 1.875 ASN 323.A ND2 THR 245.A O ASN 323.A HD21 3.281 2.358 ALA 324.A N THR 320.A O ALA 324.A H 3.008 2.089 GLN 325.A N MET 321.A O GLN 325.A H 2.893 1.965 LYS 326.A N GLU 322.A O LYS 326.A H 3.313 2.581 LYS 326.A N ASN 323.A O LYS 326.A H 3.208 2.473 GLY 327.A N ALA 324.A O GLY 327.A H 3.009 2.109 GLU 328.A N PRO 257.A O GLU 328.A H 2.685 1.730 MET 330.A N VAL 259.A O MET 330.A H 3.202 2.256 ASN 332.A ND2 ARG 98.A O ASN 332.A HD21 3.118 2.169 MET 336.A N ILE 333.A O MET 336.A H 3.158 2.210 SER 337.A N PRO 334.A O SER 337.A H 3.261 2.306 SER 337.A OG PRO 334.A O SER 337.A HG 2.888 1.979 ALA 338.A N GLN 335.A O ALA 338.A H 2.973 2.201 PHE 339.A N GLN 335.A O PHE 339.A H 3.351 2.425 TRP 340.A N MET 336.A O TRP 340.A H 3.029 2.065 TYR 341.A N SER 337.A O TYR 341.A H 3.404 2.461 ALA 342.A N ALA 338.A O ALA 342.A H 2.922 1.963 VAL 343.A N PHE 339.A O VAL 343.A H 2.855 1.894 ARG 344.A N TRP 340.A O ARG 344.A H 3.002 2.113 ARG 344.A NE GLU 153.A OE1 ARG 344.A HE 3.130 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