Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1nkd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): THR 2.A N GLU 5.A OE1 THR 2.A H 2.993 2.148 GLU 5.A N THR 2.A OG1 GLU 5.A H 3.024 2.194 LYS 6.A N THR 2.A O LYS 6.A H 2.958 2.150 THR 7.A N LYS 3.A O THR 7.A H 3.018 2.191 THR 7.A OG1 LYS 3.A O THR 7.A HG1 3.216 2.426 ALA 8.A N GLN 4.A O ALA 8.A H 3.220 2.383 LEU 9.A N GLU 5.A O LEU 9.A H 2.887 2.053 ASN 10.A N LYS 6.A O ASN 10.A H 2.900 2.050 MET 11.A N THR 7.A O MET 11.A H 2.986 2.168 ALA 12.A N ALA 8.A O ALA 12.A H 2.898 2.078 ARG 13.A N LEU 9.A O ARG 13.A H 2.946 2.114 ARG 13.A NE TYR 51.A OH ARG 13.A HE 3.324 2.581 ARG 13.A NH1 ASN 10.A OD1 ARG 13.A HH12 2.917 2.182 ARG 13.A NH2 TYR 51.A OH ARG 13.A HH21 3.174 2.377 PHE 14.A N ASN 10.A O PHE 14.A H 3.015 2.188 ILE 15.A N MET 11.A O ILE 15.A H 2.889 2.051 ARG 16.A N ALA 12.A O ARG 16.A H 3.011 2.176 ARG 16.A NH1 ASP 48.A OD1 ARG 16.A HH11 2.752 1.946 SER 17.A N ARG 13.A O SER 17.A H 3.078 2.257 SER 17.A OG.B ARG 13.A O no hydrogen 3.341 N/A SER 17.A OG.C ARG 13.A O no hydrogen 3.553 N/A SER 17.A OG.C PHE 14.A O no hydrogen 2.980 N/A GLN 18.A N PHE 14.A O GLN 18.A H 2.886 2.053 THR 19.A N ILE 15.A O THR 19.A H 2.899 2.057 THR 19.A OG1 HIS 44.A ND1 THR 19.A HG1 3.148 2.470 LEU 20.A N ARG 16.A O LEU 20.A H 3.182 2.382 THR 21.A N SER 17.A O THR 21.A H 3.056 2.215 THR 21.A OG1 SER 17.A O THR 21.A HG1 3.329 2.601 LEU 22.A N GLN 18.A O LEU 22.A H 2.964 2.123 LEU 23.A N THR 19.A O LEU 23.A H 2.923 2.109 GLU 24.A N LEU 20.A O GLU 24.A H 2.970 2.133 LYS 25.A N THR 21.A O LYS 25.A H 3.055 2.228 LEU 26.A N LEU 22.A O LEU 26.A H 2.888 2.050 ASN 27.A N LEU 23.A O ASN 27.A H 2.839 2.001 GLU 28.A N GLU 24.A O GLU 28.A H 2.994 2.191 LEU 29.A N LYS 25.A O LEU 29.A H 3.308 2.587 LEU 29.A N LEU 26.A O LEU 29.A H 3.206 2.569 ALA 30.A N ASN 27.A O ALA 30.A H 3.077 2.279 ALA 32.A N LEU 29.A O ALA 32.A H 3.226 2.536 ALA 33.A N ALA 30.A O ALA 33.A H 3.082 2.241 ASP 34.A N ASP 31.A O ASP 34.A H 3.390 2.557 GLU 35.A N ASP 34.A OD1 GLU 35.A H 2.799 2.126 ALA 37.A N ALA 33.A O ALA 37.A H 2.840 2.009 ASP 38.A N ASP 34.A O ASP 38.A H 3.000 2.180 ILE 39.A N GLU 35.A O ILE 39.A H 2.992 2.156 CYS 40.A N GLN 36.A O CYS 40.A H 2.853 2.037 CYS 40.A SG THR 19.A O no hydrogen 3.780 N/A GLU 41.A N ALA 37.A O GLU 41.A H 2.877 2.104 SER 42.A N ASP 38.A O SER 42.A H 3.444 2.599 LEU 43.A N ILE 39.A O LEU 43.A H 2.937 2.120 HIS 44.A N CYS 40.A O HIS 44.A H 2.828 1.986 ASP 45.A N GLU 41.A O ASP 45.A H 3.079 2.238 HIS 46.A N SER 42.A O HIS 46.A H 2.925 2.121 ALA 47.A N LEU 43.A O ALA 47.A H 2.868 2.067 ASP 48.A N HIS 44.A O ASP 48.A H 2.890 2.060 GLU 49.A N ASP 45.A O GLU 49.A H 2.971 2.155 LEU 50.A N HIS 46.A O LEU 50.A H 2.986 2.158 TYR 51.A N ALA 47.A O TYR 51.A H 2.968 2.119 ARG 52.A N ASP 48.A O ARG 52.A H 2.928 2.073 ARG 52.A NE ASP 48.A OD1 ARG 52.A HE 3.406 2.608 ARG 52.A NH2 ASP 48.A OD2 ARG 52.A HH21 2.996 2.307 SER 53.A N GLU 49.A O SER 53.A H 2.927 2.103 CYS 54.A N LEU 50.A O CYS 54.A H 2.908 2.055 CYS 54.A SG LEU 50.A O no hydrogen 3.439 N/A LEU 55.A N TYR 51.A O LEU 55.A H 2.884 2.038 ALA 56.A N ARG 52.A O ALA 56.A H 2.987 2.162 ARG 57.A N SER 53.A O ARG 57.A H 3.011 2.217 PHE 58.A N CYS 54.A O PHE 58.A H 2.835 1.994 GLY 59.A N LEU 55.A O GLY 59.A H 3.008 2.329