Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1pd2_1.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 5.A N GLU 55.A O LYS 5.A H 3.003 2.106 LYS 5.A NZ ASN 3.A O LYS 5.A HZ2 3.356 2.670 LYS 5.A NZ GLU 55.A OE1 LYS 5.A HZ1 2.865 1.973 LEU 6.A N GLU 30.A O LEU 6.A H 2.915 1.957 LEU 7.A N VAL 53.A O LEU 7.A H 3.005 2.076 TYR 8.A N HIS 32.A O TYR 8.A H 3.174 2.246 ASN 10.A N ILE 34.A O ASN 10.A H 3.255 2.468 MET 11.A N PHE 9.A O MET 11.A H 2.724 1.979 ARG 12.A N LEU 199.A O ARG 12.A H 2.855 1.938 ARG 12.A NH1 THR 197.A O ARG 12.A HH12 2.849 2.038 ARG 12.A NH2 LYS 198.A O ARG 12.A HH22 2.971 2.079 GLY 13.A N LEU 199.A OXT GLY 13.A H 2.843 1.898 ARG 14.A N TYR 8.A OH ARG 14.A H 2.867 1.897 ARG 14.A NH2 ASP 96.A OD1 ARG 14.A HH22 2.506 1.725 ARG 14.A NH2 ASP 96.A OD2 ARG 14.A HH22 3.526 2.574 GLU 16.A N ARG 12.A O GLU 16.A H 2.983 2.228 ARG 19.A N ALA 15.A O ARG 19.A H 3.187 2.248 ARG 19.A NE ASP 31.A OD1 ARG 19.A HE 2.930 1.972 ARG 19.A NH1 MET 11.A O ARG 19.A HH12 2.915 2.065 ARG 19.A NH1 ARG 12.A O ARG 19.A HH12 3.321 2.534 ARG 19.A NH1 GLU 16.A OE1 ARG 19.A HH11 2.890 1.998 ARG 19.A NH2 MET 11.A O ARG 19.A HH22 3.305 2.584 TYR 20.A N GLU 16.A O TYR 20.A H 2.960 2.093 ILE 21.A N ILE 17.A O ILE 21.A H 3.167 2.204 PHE 22.A N ILE 18.A O PHE 22.A H 2.986 2.020 ALA 23.A N ARG 19.A O ALA 23.A H 3.141 2.203 TYR 24.A N TYR 20.A O TYR 24.A H 2.872 1.920 LEU 25.A N ILE 21.A O LEU 25.A H 2.917 1.956 ASP 26.A N ALA 23.A O ASP 26.A H 3.065 2.203 ILE 27.A N PHE 22.A O ILE 27.A H 2.916 1.968 GLU 30.A N TYR 4.A O GLU 30.A H 2.832 1.869 HIS 32.A N LEU 6.A O HIS 32.A H 2.982 2.201 ARG 33.A NE ASP 31.A OD2 ARG 33.A HE 3.007 2.163 ARG 33.A NH1 ASN 10.A OD1 ARG 33.A HH11 2.757 2.024 ARG 33.A NH2 ASP 31.A OD2 ARG 33.A HH21 3.213 2.437 ILE 34.A N TYR 8.A O ILE 34.A H 2.828 1.958 GLU 35.A N ASP 38.A OD2 GLU 35.A H 2.957 2.056 ASP 38.A N GLU 35.A O ASP 38.A H 2.880 1.989 TRP 39.A N GLU 35.A O TRP 39.A H 3.411 2.593 TRP 39.A N GLN 36.A O TRP 39.A H 3.120 2.366 LYS 41.A N ASP 38.A O LYS 41.A H 2.946 2.102 ILE 42.A N ASP 38.A O ILE 42.A H 3.448 2.550 LYS 43.A N TRP 39.A O LYS 43.A H 2.815 1.840 LYS 43.A NZ GLY 49.A O LYS 43.A HZ3 2.944 2.077 THR 45.A N ILE 42.A O THR 45.A H 2.868 1.911 THR 45.A OG1 ILE 42.A O THR 45.A HG1 2.780 1.844 LEU 46.A N LYS 43.A O LEU 46.A H 3.218 2.295 GLY 49.A N LEU 46.A O GLY 49.A H 3.035 2.116 VAL 53.A N LEU 7.A O VAL 53.A H 3.279 2.386 LEU 54.A N LEU 61.A O LEU 54.A H 2.964 2.033 GLU 55.A N LYS 5.A O GLU 55.A H 2.788 1.827 VAL 56.A N LEU 59.A O VAL 56.A H 2.757 1.799 GLY 58.A N GLU 55.A OE1 GLY 58.A H 2.879 1.982 LEU 59.A N VAL 56.A O LEU 59.A H 2.768 2.039 LEU 61.A N LEU 54.A O LEU 61.A H 2.798 1.825 ILE 67.A N GLN 63.A O ILE 67.A H 2.930 1.978 ALA 68.A N SER 64.A O ALA 68.A H 2.893 1.984 ARG 69.A N LEU 65.A O ARG 69.A H 3.045 2.116 ARG 69.A NE ASP 89.A OD1 ARG 69.A HE 2.950 1.988 TYR 70.A N ALA 66.A O TYR 70.A H 3.112 2.298 LEU 71.A N ILE 67.A O LEU 71.A H 2.980 2.058 THR 72.A N ALA 68.A O THR 72.A H 3.130 2.349 LYS 73.A N TYR 70.A O LYS 73.A H 3.452 2.536 ALA 78.A N THR 75.A O ALA 78.A H 3.520 2.592 GLY 79.A N ASP 76.A O GLY 79.A H 2.913 2.005 LYS 80.A N TYR 145.A OH LYS 80.A H 2.820 1.846 THR 81.A N GLU 84.A OE1 THR 81.A H 3.113 2.242 GLU 84.A N THR 81.A OG1 GLU 84.A H 3.314 2.369 GLN 85.A N THR 81.A O GLN 85.A H 2.965 2.084 GLN 85.A NE2 GLY 79.A O GLN 85.A HE22 3.144 2.190 CYS 86.A N GLU 82.A O CYS 86.A H 3.132 2.245 GLN 87.A N LEU 83.A O GLN 87.A H 3.128 2.215 VAL 88.A N GLU 84.A O VAL 88.A H 2.898 2.012 ASP 89.A N GLN 85.A O ASP 89.A H 3.021 2.067 ALA 90.A N CYS 86.A O ALA 90.A H 2.843 1.901 VAL 91.A N GLN 87.A O VAL 91.A H 3.140 2.231 VAL 92.A N VAL 88.A O VAL 92.A H 3.247 2.282 ASP 93.A N ASP 89.A O ASP 93.A H 2.950 2.009 THR 94.A N ALA 90.A O THR 94.A H 2.914 2.015 LEU 95.A N VAL 91.A O LEU 95.A H 3.020 2.069 ASP 96.A N VAL 92.A O ASP 96.A H 2.910 1.991 ASP 97.A N ASP 93.A O ASP 97.A H 2.956 2.080 PHE 98.A N THR 94.A O PHE 98.A H 3.415 2.472 MET 99.A N LEU 95.A O MET 99.A H 3.189 2.211 SER 100.A N ASP 96.A O SER 100.A H 3.062 2.258 SER 100.A OG ASP 96.A O SER 100.A HG 2.912 2.036 LEU 101.A N PHE 98.A O LEU 101.A H 2.884 2.008 PHE 102.A N MET 99.A O PHE 102.A H 3.477 2.596 TRP 104.A N PHE 102.A O TRP 104.A H 2.807 1.957 TRP 104.A NE1 MET 99.A O TRP 104.A HE1 2.953 2.005 GLU 106.A N PRO 103.A O GLU 106.A H 2.942 1.990 ASN 108.A N GLU 106.A OE2 ASN 108.A H 3.167 2.289 GLN 109.A NE2 GLU 107.A O GLN 109.A HE22 2.945 2.052 ASP 110.A N ASN 108.A OD1 ASP 110.A H 2.892 2.034 LEU 111.A N ASN 108.A OD1 LEU 111.A H 2.959 2.003 LYS 112.A N ASN 108.A O LYS 112.A H 3.048 2.084 LYS 112.A NZ TRP 104.A O LYS 112.A HZ3 3.496 2.599 ARG 114.A N ASP 110.A O ARG 114.A H 2.989 2.210 ARG 114.A NH1 ASP 110.A OD1 ARG 114.A HH11 2.987 2.020 ARG 114.A NH1 ASP 110.A OD2 ARG 114.A HH11 3.277 2.586 THR 115.A N LEU 111.A O THR 115.A H 2.664 1.859 THR 115.A N LYS 112.A O THR 115.A H 2.818 2.116 THR 115.A OG1 LEU 111.A O THR 115.A HG1 2.908 1.959 PHE 116.A N LYS 112.A O PHE 116.A H 2.828 1.854 ASN 117.A N GLU 113.A O ASN 117.A H 3.338 2.471 ASN 117.A ND2 GLU 113.A O ASN 117.A HD22 3.014 2.075 ASP 118.A N ARG 114.A O ASP 118.A H 3.267 2.395 LEU 119.A N THR 115.A O LEU 119.A H 2.875 1.912 LEU 120.A N PHE 116.A O LEU 120.A H 2.860 1.890 THR 121.A N ASN 117.A O THR 121.A H 3.054 2.287 THR 121.A N ASP 118.A O THR 121.A H 3.142 2.372 THR 121.A OG1 ASN 117.A O THR 121.A HG1 2.741 1.799 THR 121.A OG1 ASP 118.A O THR 121.A HG1 3.382 2.925 ARG 122.A N ASP 118.A O ARG 122.A H 2.654 1.793 GLN 123.A NE2 ASP 118.A OD2 GLN 123.A HE21 3.489 2.698 ALA 124.A N LEU 119.A O ALA 124.A H 2.999 2.020 HIS 126.A N GLN 123.A O HIS 126.A H 2.863 2.013 LEU 127.A N GLN 123.A O LEU 127.A H 3.392 2.460 LEU 128.A N ALA 124.A O LEU 128.A H 2.760 1.794 LYS 129.A N PRO 125.A O LYS 129.A H 3.049 2.182 ASP 130.A N HIS 126.A O ASP 130.A H 3.148 2.195 LEU 131.A N LEU 127.A O LEU 131.A H 2.867 1.909 ASP 132.A N LEU 128.A O ASP 132.A H 2.832 1.914 THR 133.A N LYS 129.A O THR 133.A H 2.849 1.909 THR 133.A OG1 LYS 129.A O THR 133.A HG1 2.832 1.937 TYR 134.A N ASP 130.A O TYR 134.A H 2.772 1.850 LEU 135.A N LEU 131.A O LEU 135.A H 2.937 1.972 GLY 136.A N ASP 132.A O GLY 136.A H 2.931 2.018 LYS 138.A N LEU 135.A O LYS 138.A H 2.986 2.027 LYS 138.A NZ TYR 134.A O LYS 138.A HZ3 3.190 2.329 LYS 138.A NZ PHE 141.A O LYS 138.A HZ1 2.748 1.847 TRP 140.A N GLY 143.A O TRP 140.A H 2.996 2.131 PHE 141.A N ASP 150.A OD1 PHE 141.A H 2.936 1.971 THR 147.A N ASP 150.A OD2 THR 147.A H 3.012 2.074 TRP 148.A N LEU 77.A O TRP 148.A H 2.922 1.989 ASP 150.A N THR 147.A O ASP 150.A H 3.134 2.407 TYR 152.A N TRP 148.A O TYR 152.A H 3.031 2.107 TRP 153.A N ALA 149.A O TRP 153.A H 3.006 2.094 TRP 153.A NE1 LEU 174.A O TRP 153.A HE1 3.107 2.160 ASP 154.A N ASP 150.A O ASP 154.A H 3.150 2.239 ILE 155.A N PHE 151.A O ILE 155.A H 2.892 1.977 CYS 156.A N TYR 152.A O CYS 156.A H 2.780 1.828 CYS 156.A SG TYR 152.A O no hydrogen 3.395 N/A SER 157.A N TRP 153.A O SER 157.A H 2.933 1.967 THR 158.A N ASP 154.A O THR 158.A H 3.167 2.339 THR 158.A OG1 ASP 154.A O THR 158.A HG1 2.763 1.840 LEU 160.A N CYS 156.A O LEU 160.A H 3.122 2.151 LEU 161.A N SER 157.A O LEU 161.A H 2.933 2.053 VAL 162.A N THR 158.A O VAL 162.A H 3.270 2.516 VAL 162.A N THR 159.A O VAL 162.A H 2.842 2.103 LEU 163.A N THR 159.A O LEU 163.A H 3.101 2.264 LYS 164.A N LEU 160.A O LYS 164.A H 2.812 1.842 LYS 164.A NZ ASP 166.A OD1 LYS 164.A HZ3 2.660 1.808 LEU 167.A N LYS 164.A O LEU 167.A H 2.734 1.840 GLY 169.A N ASP 166.A O GLY 169.A H 3.271 2.313 TYR 171.A N LEU 168.A O TYR 171.A H 2.842 1.911 ARG 173.A NE ASP 132.A OD1 ARG 173.A HE 3.365 2.393 ARG 173.A NH1 ASP 137.A OD1 ARG 173.A HH11 3.295 2.429 ARG 173.A NH2 ASP 132.A OD2 ARG 173.A HH21 3.160 2.177 VAL 175.A N TYR 171.A O VAL 175.A H 3.033 2.149 SER 176.A N PRO 172.A O SER 176.A H 2.732 1.821 LEU 177.A N ARG 173.A O LEU 177.A H 2.963 1.999 ARG 178.A N LEU 174.A O ARG 178.A H 3.222 2.265 ARG 178.A NE SER 157.A OG ARG 178.A HE 2.947 2.016 ARG 178.A NH2 THR 158.A OG1 ARG 178.A HH21 3.167 2.466 ASN 179.A N VAL 175.A O ASN 179.A H 3.051 2.124 LYS 180.A N SER 176.A O LYS 180.A H 2.825 1.902 LYS 180.A NZ GLU 139.A O LYS 180.A HZ3 2.804 2.094 VAL 181.A N LEU 177.A O VAL 181.A H 3.042 2.068 GLN 182.A N ARG 178.A O GLN 182.A H 3.004 2.111 GLN 182.A NE2 ASP 154.A OD1 GLN 182.A HE22 2.869 1.926 ALA 183.A N ASN 179.A O ALA 183.A H 2.968 2.265 ALA 183.A N LYS 180.A O ALA 183.A H 2.883 2.119 ILE 184.A N LYS 180.A O ILE 184.A H 3.316 2.589 ILE 184.A N VAL 181.A O ILE 184.A H 3.327 2.458 SER 188.A N ILE 184.A O SER 188.A H 2.797 1.837 SER 188.A OG GLN 182.A O SER 188.A HG 2.570 1.851 ALA 189.A N PRO 185.A O ALA 189.A H 2.946 1.986 TRP 190.A N ALA 186.A O TRP 190.A H 3.276 2.365 TRP 190.A NE1 GLU 16.A OE2 TRP 190.A HE1 2.779 1.884 ILE 191.A N ILE 187.A O ILE 191.A H 2.780 1.812 LEU 192.A N SER 188.A O LEU 192.A H 3.065 2.139 LYS 193.A N ALA 189.A O LYS 193.A H 3.010 2.106 ARG 194.A N TRP 190.A O ARG 194.A H 2.686 1.861 ARG 194.A NE GLU 16.A OE2 ARG 194.A HE 3.091 2.244 ARG 194.A NH2 GLU 16.A OE2 ARG 194.A HH21 2.985 2.106 THR 197.A OG1 ASN 10.A O THR 197.A HG1 3.161 2.318