Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1qnj_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 1.A N LEU 134.A O VAL 1.A H3 2.902 2.177 VAL 1.A N ASP 187.A OD1 VAL 1.A H2 3.540 2.662 VAL 1.A N ASP 187.A OD2 VAL 1.A H2 2.711 2.047 VAL 2.A N SER 182.A O VAL 2.A H 2.867 2.077 THR 5.A N GLN 147.A O THR 5.A H 2.864 2.031 ALA 7.A N LEU 145.A O ALA 7.A H 2.880 2.050 GLN 8.A NE2 ASN 10.A OD1 GLN 8.A HE21 2.583 1.787 ARG 9.A NH1 ASP 66.A OD1 ARG 9.A HH12 2.878 2.022 SER 11.A N GLN 8.A O SER 11.A H 3.100 2.247 TRP 12.A NE1 GLN 147.A OE1 TRP 12.A HE1 2.842 2.007 GLN 15.A N TRP 12.A O GLN 15.A H 3.048 2.211 GLN 15.A NE2 ILE 16.A O GLN 15.A HE21 2.982 2.141 ILE 16.A N GLY 32.A O ILE 16.A H 2.965 2.135 SER 17.A N VAL 56.A O SER 17.A H 3.057 2.209 LEU 18.A N CYS 30.A O LEU 18.A H 2.836 2.004 GLN 19.A N ARG 54A.A O GLN 19.A H 2.935 2.082 GLN 19.A NE2 SER 17.A OG GLN 19.A HE21 2.898 2.097 TYR 20.A N ALA 27.A O TYR 20.A H 2.935 2.116 ARG 21.A N THR 52.A O ARG 21.A H 2.923 2.145 SER 25.A N SER 22A.A O SER 25.A H 2.648 1.887 SER 25.A OG SER 22A.A O SER 25.A HG 2.356 1.921 ALA 27.A N TYR 20.A O ALA 27.A H 2.875 2.045 HIS 28.A NE2 GLY 186.A O no hydrogen 2.883 N/A THR 29.A N LEU 18.A O THR 29.A H 2.888 2.034 CYS 30.A N LEU 18.A O CYS 30.A H 3.256 2.448 CYS 30.A SG THR 29.A O no hydrogen 3.054 N/A GLY 31.A N SER 188.A O GLY 31.A H 2.764 2.006 THR 33.A N MET 41.A O THR 33.A H 2.831 2.001 LEU 34.A N SER 14.A O LEU 34.A H 2.877 2.027 ILE 35.A N TRP 39.A O ILE 35.A H 2.877 2.047 ARG 36.A N TRP 39.A O ARG 36.A H 3.157 2.304 ARG 36.A NH1 ILE 35.A O ARG 36.A HH11 3.003 2.172 TRP 39.A N ARG 36.A O TRP 39.A H 3.124 2.270 VAL 40.A N LEU 97.A O VAL 40.A H 2.910 2.067 MET 41.A N THR 33.A O MET 41.A H 2.834 1.988 THR 42.A N ALA 95.A O THR 42.A H 2.922 2.065 THR 42.A OG1 GLY 31.A O THR 42.A HG1 2.825 2.188 HIS 45.A N ASP 93.A OD1 HIS 45.A H 2.815 1.997 HIS 45.A ND1 ASP 93.A OD2 HIS 45.A HD1 2.698 1.844 CYS 46.A N ALA 43.A O CYS 46.A H 3.126 2.418 VAL 47.A N ALA 44.A O VAL 47.A H 3.006 2.188 ASP 48.A N HIS 45.A O ASP 48.A H 3.347 2.500 ARG 49.A NH2 THR 29.A OG1 ARG 49.A HH22 3.061 2.455 VAL 55.A N VAL 72.A O VAL 55.A H 2.844 1.988 VAL 56.A N SER 17.A O VAL 56.A H 2.871 2.036 VAL 57.A N GLN 70.A O VAL 57.A H 2.994 2.177 HIS 60.A N GLU 59.A OE1 HIS 60.A H 3.094 2.451 HIS 60.A N ASP 66.A OD2 HIS 60.A H 3.184 2.409 HIS 60.A NE2 GLU 6.A OE2 no hydrogen 2.781 N/A ASN 61.A N ASP 66.A OD2 ASN 61.A H 2.831 1.979 LEU 62.A N GLN 143.A O LEU 62.A H 2.850 2.025 ASN 63.A N ASN 61.A OD1 ASN 63.A H 2.872 2.062 GLN 64.A N ASN 61.A O GLN 64.A H 3.451 2.596 ASP 66.A N GLU 69.A OE2 ASP 66.A H 2.817 1.971 GLY 67.A N ASN 65.A OD1 GLY 67.A H 3.031 2.256 THR 68.A N GLU 69.A OE1 THR 68.A H 3.142 2.455 THR 68.A OG1 GLY 58.A O THR 68.A HG1 2.661 1.910 GLU 69.A N GLU 69.A OE1 GLU 69.A H 2.771 1.994 GLN 70.A N VAL 57.A O GLN 70.A H 2.910 2.072 GLN 70.A NE2 THR 104.A O GLN 70.A HE22 2.903 2.048 VAL 72.A N VAL 55.A O VAL 72.A H 2.934 2.102 VAL 74.A N PHE 53.A O VAL 74.A H 3.401 2.579 GLN 75.A N ARG 98.A O GLN 75.A H 2.815 2.014 LYS 76.A N ARG 98.A O LYS 76.A H 3.236 2.444 VAL 78.A N LEU 96.A O VAL 78.A H 2.811 1.953 HIS 80.A N ILE 94.A O HIS 80.A H 3.086 2.247 TRP 83.A N HIS 80.A O TRP 83.A H 3.012 2.170 TRP 83.A NE1 ASP 48.A OD1 TRP 83.A HE1 3.035 2.196 ASP 86.A N ASN 84.A OD1 ASP 86.A H 2.981 2.189 ASP 87.A N ASN 84.A O ASP 87.A H 2.872 2.070 GLY 91.A N VAL 88.A O GLY 91.A H 2.988 2.173 ILE 94.A N TYR 92.A O ILE 94.A H 2.898 2.228 ALA 95.A N THR 42.A O ALA 95.A H 2.923 2.134 LEU 96.A N VAL 78.A O LEU 96.A H 2.832 1.985 LEU 97.A N VAL 40.A O LEU 97.A H 2.783 1.941 ARG 98.A N LYS 76.A O ARG 98.A H 2.871 2.059 ARG 98.A NE GLN 75.A OE1 ARG 98.A HE 2.720 1.982 ARG 98.A NH1 ASN 240.A O ARG 98.A HH11 2.789 2.012 ARG 98.A NH2 GLN 75.A OE1 ARG 98.A HH21 3.078 2.441 LEU 99.A N ASN 38.A O LEU 99.A H 2.838 1.982 ALA 100.A N GLY 73.A O ALA 100.A H 2.866 2.047 VAL 103.A N GLN 37.A O VAL 103.A H 2.894 2.052 THR 104.A N GLN 70.A OE1 THR 104.A H 2.952 2.114 ASN 106.A N VAL 109.A O ASN 106.A H 2.912 2.089 TYR 108.A N ASN 106.A OD1 TYR 108.A H 2.857 2.087 VAL 109.A N ASN 106.A O VAL 109.A H 3.109 2.290 GLN 110.A N PRO 13.A O GLN 110.A H 3.061 2.230 GLN 110.A NE2 ASN 106.A O GLN 110.A HE21 2.855 2.006 GLY 112.A N LEU 34.A O GLY 112.A H 2.749 1.889 GLY 118.A N SER 227.A O GLY 118.A H 2.979 2.135 THR 119.A N ARG 116.A O THR 119.A H 3.158 2.338 ASN 124.A N THR 152.A O ASN 124.A H 2.806 2.079 SER 125.A N THR 152.A OG1 SER 125.A H 3.020 2.221 SER 125.A OG ALA 122.A O SER 125.A HG 2.663 1.899 CYS 127.A SG SER 125.A O no hydrogen 3.719 N/A TYR 128.A N HIS 193.A O TYR 128.A H 2.822 1.997 ILE 129.A N ALA 148.A O ILE 129.A H 2.954 2.187 THR 130.A OG1 HIS 193.A NE2 THR 130.A HG1 2.894 2.111 GLY 131.A N GLN 146.A O GLY 131.A H 2.991 2.181 TRP 132.A NE1 HIS 60.A O TRP 132.A HE1 2.946 2.110 GLY 133.A N ASP 187.A OD1 GLY 133.A H 2.757 1.992 LEU 134.A N GLN 185.A O LEU 134.A H 2.802 1.966 THR 135.A N GLN 140.A O THR 135.A H 3.087 2.297 GLY 139.A N ARG 136.A O GLY 139.A H 2.834 2.159 ALA 142.A N TRP 132.A O ALA 142.A H 2.975 2.278 LEU 145.A N HIS 60.A O LEU 145.A H 2.983 2.266 GLN 146.A N GLY 131.A O GLN 146.A H 3.015 2.189 GLN 146.A NE2 THR 144.A O GLN 146.A HE21 3.129 2.293 GLN 147.A N THR 5.A O GLN 147.A H 2.874 2.036 ALA 148.A N ILE 129.A O ALA 148.A H 2.947 2.137 LEU 150.A N CYS 127.A O LEU 150.A H 2.907 2.075 THR 152.A N SER 125.A O THR 152.A H 2.956 2.144 VAL 153.A N CYS 174.A O VAL 153.A H 2.913 2.062 ASP 154.A N ASN 123.A OD1 ASP 154.A H 2.897 2.057 ILE 157.A N ASP 154.A OD1 ILE 157.A H 2.984 2.148 CYS 158.A N ASP 154.A O CYS 158.A H 2.743 1.902 SER 159.A N TYR 155.A O SER 159.A H 2.823 2.029 SER 159.A OG TYR 155.A O SER 159.A HG 2.715 1.940 SER 160.A N ILE 157.A O SER 160.A H 3.067 2.253 TYR 163.A N SER 160.A O TYR 163.A H 2.994 2.306 TRP 164.A N CYS 158.A O TRP 164.A H 2.856 2.029 TRP 164.A NE1 PRO 220.A O TRP 164.A HE1 2.856 2.075 GLY 165.A N SER 160.A O GLY 165.A H 2.936 2.188 THR 167.A N TRP 164.A O THR 167.A H 3.224 2.463 LYS 169.A NZ SER 166.A O LYS 169.A HZ1 2.764 1.913 LYS 169.A NZ ALA 89A.A O LYS 169.A HZ2 2.795 2.046 MET 172.A N LYS 169.A O MET 172.A H 3.026 2.289 VAL 173.A N PHE 223.A O VAL 173.A H 2.800 1.972 ALA 175.A N THR 221.A O ALA 175.A H 2.992 2.173 GLY 176.A N PRO 151.A O GLY 176.A H 2.859 2.029 VAL 180.A N ASP 178.A OD1 VAL 180.A H 2.722 1.898 SER 182.A N VAL 2.A O SER 182.A H 3.049 2.259 SER 182.A OG GLY 183.A O SER 182.A HG 2.832 2.171 GLY 183.A N THR 221.A OG1 GLY 183.A H 2.950 2.143 CYS 184.A N ASP 187.A OD2 CYS 184.A H 2.815 2.041 CYS 184.A SG ARG 136.A O no hydrogen 3.859 N/A CYS 184.A SG GLN 185.A OE1 no hydrogen 3.329 N/A ASP 187.A N CYS 184.A O ASP 187.A H 2.970 2.146 SER 188.A OG HIS 45.A NE2 no hydrogen 3.166 N/A GLY 189.A N THR 206.A O GLY 189.A H 2.806 1.951 GLY 190.A N ASP 187.A O GLY 190.A H 3.079 2.258 LEU 192.A N GLY 204.A O LEU 192.A H 2.965 2.144 HIS 193.A N TYR 128.A O HIS 193.A H 2.906 2.055 CYS 194.A N ALA 201.A O CYS 194.A H 2.837 1.988 LEU 195.A N PRO 126.A O LEU 195.A H 3.142 2.300 VAL 196.A N GLN 199.A O VAL 196.A H 2.962 2.104 GLN 199.A N VAL 196.A O GLN 199.A H 3.023 2.184 ALA 201.A N CYS 194.A O ALA 201.A H 2.993 2.164 VAL 202.A N VAL 113.A O VAL 202.A H 2.806 1.954 HIS 203.A N LEU 192.A O HIS 203.A H 2.912 2.226 GLY 204.A N LEU 192.A O GLY 204.A H 3.409 2.619 VAL 205.A N THR 224.A O VAL 205.A H 3.036 2.224 THR 206.A N GLY 190.A O THR 206.A H 2.870 2.038 THR 206.A OG1 GLY 190.A O THR 206.A HG1 3.332 2.536 SER 207.A N VAL 222.A O SER 207.A H 2.847 2.055 SER 207.A OG ASP 93.A OD2 SER 207.A HG 2.693 1.874 PHE 208.A N VAL 222.A O PHE 208.A H 3.067 2.238 GLY 213.A N SER 210.A O GLY 213.A H 3.188 2.438 CYS 214.A N THR 137.A OG1 CYS 214.A H 2.982 2.169 CYS 214.A SG GLN 185.A OE1 no hydrogen 3.241 N/A ASN 215.A ND2 GLY 179.A O ASN 215.A HD21 2.942 2.151 ARG 218.A N GLY 177.A O ARG 218.A H 2.993 2.154 LYS 219.A N VAL 216A.A O LYS 219.A H 3.025 2.222 LYS 219.A NZ TYR 163.A O LYS 219.A HZ1 2.722 1.989 LYS 219.A NZ SER 162B.A O LYS 219.A HZ1 3.350 2.791 THR 221.A N ALA 175.A O THR 221.A H 2.935 2.318 VAL 222.A N PHE 208.A O VAL 222.A H 2.973 2.140 PHE 223.A N VAL 173.A O PHE 223.A H 2.814 2.011 THR 224.A N VAL 205.A O THR 224.A H 2.812 2.030 THR 224.A OG1 ASP 93.A O THR 224.A HG1 2.758 1.954 ARG 225.A N SER 171.A O ARG 225.A H 2.882 2.051 ARG 225.A NE ASN 170.A O ARG 225.A HE 2.939 2.142 ARG 225.A NH1 SER 227.A OG ARG 225.A HH11 2.923 2.106 ARG 225.A NH2 ASN 170.A O ARG 225.A HH21 2.983 2.224 VAL 226.A N HIS 203.A O VAL 226.A H 3.007 2.182 SER 227.A OG THR 119.A O SER 227.A HG 2.689 1.881 ALA 228.A N ARG 225.A O ALA 228.A H 2.988 2.174 TYR 229.A N VAL 226.A O TYR 229.A H 2.854 2.027 ILE 233.A N TYR 229.A O ILE 233.A H 2.880 2.024 ASN 234.A N ILE 230.A O ASN 234.A H 2.912 2.069 ASN 235.A N SER 231.A O ASN 235.A H 2.772 1.945 VAL 236.A N TRP 232.A O VAL 236.A H 2.923 2.103 ILE 237.A N ILE 233.A O ILE 237.A H 3.009 2.164 ALA 238.A N ASN 234.A O ALA 238.A H 3.006 2.203 SER 239.A N ASN 235.A O SER 239.A H 3.157 2.490 SER 239.A N VAL 236.A O SER 239.A H 3.172 2.488 ASN 240.A N ILE 237.A O ASN 240.A H 3.324 2.496 ASN 240.A ND2 VAL 236.A O ASN 240.A HD21 2.955 2.125 SER 22A.A N SER 25.A O SER 22A.A H 2.650 1.800 ARG 54A.A N GLN 19.A O ARG 54A.A H 2.874 2.042 ARG 54A.A NE GLN 19.A OE1 ARG 54A.A HE 2.882 2.123 ARG 54A.A NH2 GLN 19.A OE1 ARG 54A.A HH21 2.844 2.079 ARG 181A.A N ASP 178.A OD1 ARG 181A.A H 2.812 1.958 ARG 181A.A NE ASP 178.A OD2 ARG 181A.A HE 3.111 2.279 ALA 90B.A N ASP 87.A O ALA 90B.A H 3.070 2.288