Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1qpj_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLU 4.A N ASP 1.A O GLU 4.A H 2.925 2.054 VAL 5.A N VAL 71.A O VAL 5.A H 3.263 2.406 ARG 7.A NH1 GLN 74.A O ARG 7.A HH12 3.172 2.190 THR 9.A N PRO 6.A O THR 9.A H 3.192 2.245 THR 9.A OG1 PRO 6.A O THR 9.A HG1 2.956 2.040 LEU 10.A N ARG 7.A O LEU 10.A H 3.235 2.300 LYS 11.A N TYR 28.A O LYS 11.A H 3.054 2.252 VAL 13.A N MET 26.A O VAL 13.A H 2.768 1.859 GLU 14.A N MET 26.A O GLU 14.A H 3.499 2.548 ARG 15.A NH1 GLU 23.A OE2 ARG 15.A HH11 2.866 2.006 LEU 16.A N VAL 24.A O LEU 16.A H 2.677 1.760 GLY 17.A N VAL 24.A O GLY 17.A H 3.175 2.223 GLY 19.A N GLY 22.A O GLY 19.A H 2.687 1.919 GLY 22.A N GLY 19.A O GLY 22.A H 3.105 2.137 VAL 24.A N GLY 17.A O VAL 24.A H 2.869 1.950 TRP 25.A N VAL 37.A O TRP 25.A H 3.005 2.054 TRP 25.A NE1 GLU 23.A OE1 TRP 25.A HE1 2.816 1.887 MET 26.A N GLU 14.A O MET 26.A H 2.707 1.770 GLY 27.A N VAL 35.A O GLY 27.A H 2.974 2.084 TYR 28.A N LYS 11.A O TYR 28.A H 2.990 2.059 TYR 29.A N THR 33.A O TYR 29.A H 2.736 1.802 ASN 30.A N THR 9.A O ASN 30.A H 2.601 1.711 HIS 32.A N ASN 30.A O HIS 32.A H 2.811 2.007 THR 33.A N TYR 29.A O THR 33.A H 3.331 2.381 VAL 35.A N GLY 27.A O VAL 35.A H 2.762 1.863 ALA 36.A N THR 81.A O ALA 36.A H 2.845 1.883 VAL 37.A N TRP 25.A O VAL 37.A H 2.896 1.985 LYS 38.A N ILE 79.A O LYS 38.A H 2.674 1.767 LYS 38.A NZ GLU 53.A OE2 LYS 38.A HZ3 2.566 1.612 SER 39.A N GLU 23.A O SER 39.A H 2.933 1.960 SER 39.A OG GLU 23.A O SER 39.A HG 3.346 2.404 LYS 41.A N PHE 21.A O LYS 41.A H 2.868 1.967 SER 44.A N LYS 41.A O SER 44.A H 2.868 1.941 SER 44.A OG LYS 41.A O SER 44.A HG 2.913 2.086 ALA 49.A N SER 46.A OG ALA 49.A H 3.010 2.069 PHE 50.A N SER 46.A O PHE 50.A H 3.016 2.137 LEU 51.A N PRO 47.A O LEU 51.A H 2.942 1.985 ALA 52.A N ALA 49.A O ALA 52.A H 3.425 2.585 GLU 53.A N PHE 50.A O GLU 53.A H 3.186 2.317 ASN 55.A N LEU 51.A O ASN 55.A H 3.012 2.112 LEU 56.A N ALA 52.A O LEU 56.A H 3.151 2.328 MET 57.A N GLU 53.A O MET 57.A H 3.361 2.489 LYS 58.A N ALA 54.A O LYS 58.A H 3.177 2.444 LYS 58.A N ASN 55.A O LYS 58.A H 3.195 2.436 LYS 58.A NZ ASN 55.A OD1 LYS 58.A HZ2 3.007 2.254 GLN 59.A N LEU 56.A O GLN 59.A H 3.074 2.271 LEU 60.A N LEU 56.A O LEU 60.A H 3.257 2.526 GLN 61.A NE2 LYS 58.A O GLN 61.A HE21 3.363 2.423 ARG 64.A N HIS 62.A ND1 ARG 64.A H 2.942 1.998 ARG 64.A NE CYS 143.A O ARG 64.A HE 2.909 1.994 ARG 64.A NH2 CYS 143.A O ARG 64.A HH21 3.057 2.200 LEU 65.A N HIS 62.A O LEU 65.A H 3.145 2.212 VAL 66.A N ILE 145.A O VAL 66.A H 2.987 2.022 ARG 67.A N GLU 82.A OE1 ARG 67.A H 2.873 1.943 TYR 69.A N ILE 80.A O TYR 69.A H 2.932 1.979 ALA 70.A N ILE 80.A O ALA 70.A H 3.311 2.344 VAL 71.A N TRP 3.A O VAL 71.A H 2.876 1.984 VAL 72.A N TYR 78.A O VAL 72.A H 3.006 2.032 THR 73.A N GLU 4.A OE1 THR 73.A H 3.506 2.586 THR 73.A N GLU 4.A OE2 THR 73.A H 2.837 2.026 THR 73.A OG1 GLU 4.A OE1 THR 73.A HG1 2.830 2.110 THR 73.A OG1 GLU 4.A OE2 THR 73.A HG1 3.030 2.110 TYR 78.A N VAL 72.A O TYR 78.A H 2.895 1.967 ILE 79.A N LYS 38.A O ILE 79.A H 2.858 1.925 ILE 80.A N ALA 70.A O ILE 80.A H 2.863 1.965 THR 81.A N ALA 36.A O THR 81.A H 2.805 1.849 THR 81.A OG1 GLU 82.A O THR 81.A HG1 3.053 2.172 GLU 82.A N ARG 67.A O GLU 82.A H 2.905 1.977 ASN 86.A N VAL 137.A O ASN 86.A H 2.880 2.031 ASN 86.A ND2 SER 138.A O ASN 86.A HD21 2.881 1.964 GLY 87.A N MET 84.A O GLY 87.A H 3.208 2.261 LEU 89.A N ILE 135.A O LEU 89.A H 2.865 1.923 VAL 90.A N ALA 132.A O VAL 90.A H 3.482 2.613 ASP 91.A N SER 88.A O ASP 91.A H 3.203 2.486 PHE 92.A N SER 88.A O PHE 92.A H 2.902 1.940 LEU 93.A N LEU 89.A O LEU 93.A H 3.107 2.179 LYS 94.A N ASP 91.A O LYS 94.A H 3.188 2.315 THR 95.A N PHE 92.A O THR 95.A H 2.860 1.942 GLY 98.A N THR 95.A OG1 GLY 98.A H 3.265 2.396 ILE 99.A N THR 95.A O ILE 99.A H 2.985 2.058 LEU 101.A N GLY 98.A O LEU 101.A H 3.203 2.370 ASN 104.A ND2 THR 265.A OG1 ASN 104.A HD21 3.177 2.219 LYS 105.A N THR 102.A O LYS 105.A H 2.984 2.248 LYS 105.A NZ ASP 108.A OD2 LYS 105.A HZ2 3.041 2.202 LYS 105.A NZ LEU 141.A O LYS 105.A HZ3 2.853 1.965 LEU 106.A N THR 102.A O LEU 106.A H 3.011 2.105 LEU 107.A N ILE 103.A O LEU 107.A H 2.907 2.020 ASP 108.A N ASN 104.A O ASP 108.A H 3.197 2.306 MET 109.A N LYS 105.A O MET 109.A H 3.029 2.063 ALA 110.A N LEU 106.A O ALA 110.A H 3.038 2.130 ALA 111.A N LEU 107.A O ALA 111.A H 3.005 2.039 GLN 112.A N ASP 108.A O GLN 112.A H 2.872 2.006 GLN 112.A NE2 ASP 108.A OD1 GLN 112.A HE21 2.972 2.018 GLN 112.A NE2 ASP 108.A OD2 GLN 112.A HE21 3.552 2.836 ILE 113.A N MET 109.A O ILE 113.A H 2.886 1.969 ALA 114.A N ALA 110.A O ALA 114.A H 2.967 2.034 GLU 115.A N ALA 111.A O GLU 115.A H 2.943 2.078 GLY 116.A N GLN 112.A O GLY 116.A H 3.071 2.182 MET 117.A N ILE 113.A O MET 117.A H 2.793 1.848 ALA 118.A N ALA 114.A O ALA 118.A H 2.680 1.956 PHE 119.A N GLU 115.A O PHE 119.A H 3.393 2.465 ILE 120.A N GLY 116.A O ILE 120.A H 3.173 2.205 GLU 121.A N MET 117.A O GLU 121.A H 2.960 2.070 GLU 122.A N ALA 118.A O GLU 122.A H 2.843 1.906 ARG 123.A N PHE 119.A O ARG 123.A H 3.051 2.182 ARG 123.A NH2 ARG 123.A O ARG 123.A HH21 3.487 2.777 ASN 124.A N GLU 121.A O ASN 124.A H 3.017 2.079 TYR 125.A N ILE 120.A O TYR 125.A H 3.147 2.202 ILE 126.A N ARG 152.A O ILE 126.A H 2.883 1.987 HIS 127.A N ASP 186.A OD2 HIS 127.A H 2.801 1.851 HIS 127.A NE2 ALA 146.A O HIS 127.A HE2 2.844 1.983 ARG 128.A N ASP 186.A OD1 ARG 128.A H 2.803 1.967 ARG 128.A NE LEU 150.A O ARG 128.A HE 2.869 1.973 ARG 128.A NH2 LEU 150.A O ARG 128.A HH21 3.184 2.400 ASP 129.A N HIS 127.A ND1 ASP 129.A H 3.177 2.376 ALA 132.A N GLU 196.A OE1 ALA 132.A H 2.933 1.962 ASN 134.A N ARG 131.A O ASN 134.A H 2.913 2.071 ASN 134.A ND2 ASP 129.A O ASN 134.A HD21 2.811 1.848 ILE 135.A N ALA 132.A O ILE 135.A H 3.055 2.115 LEU 136.A N LYS 144.A O LEU 136.A H 2.834 1.890 VAL 137.A N GLY 87.A O VAL 137.A H 2.906 2.016 SER 138.A N SER 142.A O SER 138.A H 2.844 1.883 THR 140.A N SER 138.A OG THR 140.A H 3.095 2.220 THR 140.A OG1 SER 138.A OG THR 140.A HG1 3.018 2.285 LEU 141.A N SER 138.A O LEU 141.A H 3.125 2.261 SER 142.A OG SER 138.A OG SER 142.A HG 2.706 1.893 CYS 143.A N GLN 112.A OE1 CYS 143.A H 2.833 1.908 LYS 144.A N LEU 136.A O LYS 144.A H 2.904 1.955 LYS 144.A NZ GLN 63.A O LYS 144.A HZ1 2.888 1.954 LYS 144.A NZ GLU 82.A OE2 LYS 144.A HZ2 2.769 1.850 ILE 145.A N ARG 64.A O ILE 145.A H 2.979 2.034 ALA 146.A N ASN 134.A O ALA 146.A H 2.942 2.049 GLY 149.A N ASP 147.A OD1 GLY 149.A H 3.211 2.272 ALA 151.A N PHE 148.A O ALA 151.A H 3.224 2.402 ARG 152.A N ILE 126.A O ARG 152.A H 3.016 2.106 ARG 152.A NH1 GLY 149.A O ARG 152.A HH12 3.457 2.495 ARG 152.A NH1 ALA 151.A O ARG 152.A HH11 2.804 1.890 ILE 154.A N ASN 124.A O ILE 154.A H 2.676 1.765 ALA 160.A N GLY 179.A O ALA 160.A H 3.062 2.120 ALA 164.A N ARG 161.A O ALA 164.A H 3.245 2.345 LYS 169.A NZ PRO 204.A O LYS 169.A HZ1 2.909 1.961 LYS 169.A NZ MET 208.A O LYS 169.A HZ3 2.727 1.752 TRP 170.A N PRO 167.A O TRP 170.A H 2.961 2.157 TRP 170.A NE1 GLU 196.A OE1 TRP 170.A HE1 3.095 2.125 THR 171.A N PRO 167.A O THR 171.A H 2.955 2.235 THR 171.A N ILE 168.A O THR 171.A H 3.418 2.614 GLU 174.A N GLU 174.A OE1 GLU 174.A H 2.885 2.028 ILE 176.A N ALA 172.A O ILE 176.A H 3.067 2.175 ASN 177.A N PRO 173.A O ASN 177.A H 2.764 1.877 TYR 178.A N GLU 174.A O TYR 178.A H 2.952 2.011 GLY 179.A N ALA 175.A O GLY 179.A H 2.892 2.197 THR 180.A N GLU 174.A O THR 180.A H 3.465 2.547 THR 182.A N SER 185.A OG THR 182.A H 3.072 2.162 LYS 184.A N THR 182.A OG1 LYS 184.A H 3.096 2.303 LYS 184.A NZ ARG 248.A O LYS 184.A HZ2 2.841 1.898 SER 185.A N THR 182.A O SER 185.A H 2.888 2.045 SER 185.A OG GLU 174.A OE2 SER 185.A HG 3.005 2.079 ASP 186.A N THR 182.A O ASP 186.A H 3.458 2.563 VAL 187.A N ILE 183.A O VAL 187.A H 3.017 2.165 TRP 188.A N LYS 184.A O TRP 188.A H 3.255 2.361 SER 189.A N SER 185.A O SER 189.A H 3.221 2.273 PHE 190.A N ASP 186.A O PHE 190.A H 2.836 1.920 GLY 191.A N VAL 187.A O GLY 191.A H 3.116 2.225 ILE 192.A N TRP 188.A O ILE 192.A H 3.283 2.354 LEU 193.A N SER 189.A O LEU 193.A H 2.751 1.865 LEU 194.A N PHE 190.A O LEU 194.A H 2.749 1.928 GLU 196.A N ILE 192.A O GLU 196.A H 3.254 2.370 ILE 197.A N LEU 193.A O ILE 197.A H 3.046 2.211 VAL 198.A N LEU 194.A O VAL 198.A H 3.092 2.115 THR 199.A N THR 195.A O THR 199.A H 3.059 2.214 THR 199.A OG1 THR 195.A O THR 199.A HG1 2.925 2.127 HIS 200.A N ILE 197.A O HIS 200.A H 2.936 2.022 HIS 200.A ND1 LEU 93.A O HIS 200.A HD1 3.294 2.453 GLY 201.A N GLU 196.A O GLY 201.A H 2.805 1.898 ARG 202.A N THR 199.A OG1 ARG 202.A H 3.033 2.220 MET 208.A N TYR 205.A O MET 208.A H 2.915 2.011 THR 209.A N GLU 212.A OE1 THR 209.A H 2.806 1.881 VAL 213.A N THR 209.A O VAL 213.A H 2.987 2.101 ILE 214.A N ASN 210.A O ILE 214.A H 3.133 2.172 GLN 215.A N PRO 211.A O GLN 215.A H 3.133 2.189 ASN 216.A N GLU 212.A O ASN 216.A H 3.002 2.044 LEU 217.A N VAL 213.A O LEU 217.A H 2.939 2.002 GLU 218.A N ILE 214.A O GLU 218.A H 3.001 2.124 ARG 219.A N GLN 215.A O ARG 219.A H 3.284 2.466 ARG 219.A N ASN 216.A O ARG 219.A H 3.160 2.441 GLY 220.A N LEU 217.A O GLY 220.A H 3.039 2.196 TYR 221.A N ASN 216.A O TYR 221.A H 3.017 2.289 ARG 222.A NE TRP 241.A O ARG 222.A HE 2.776 1.921 ARG 222.A NH1 LEU 217.A O ARG 222.A HH12 3.294 2.507 ARG 222.A NH1 TYR 221.A O ARG 222.A HH11 3.026 2.113 ARG 222.A NH2 TRP 241.A O ARG 222.A HH21 2.877 2.038 ARG 225.A NE GLU 231.A OE1 ARG 225.A HE 2.738 1.829 ARG 225.A NE GLU 231.A OE2 ARG 225.A HE 3.328 2.501 ARG 225.A NH2 GLU 231.A OE2 ARG 225.A HH21 2.924 1.999 CYS 229.A N PRO 226.A O CYS 229.A H 3.248 2.475 CYS 229.A SG PRO 230.A O no hydrogen 3.596 N/A TYR 234.A N PRO 230.A O TYR 234.A H 3.038 2.088 TYR 234.A OH MET 223.A O TYR 234.A HH 2.723 1.841 GLN 235.A N GLU 231.A O GLN 235.A H 2.954 2.027 GLN 235.A NE2 GLU 231.A OE2 GLN 235.A HE21 2.956 1.999 LEU 236.A N GLU 232.A O LEU 236.A H 3.069 2.221 MET 237.A N LEU 233.A O MET 237.A H 2.810 1.947 ARG 238.A N TYR 234.A O ARG 238.A H 2.895 1.978 LEU 239.A N GLN 235.A O LEU 239.A H 3.254 2.407 LEU 239.A N LEU 236.A O LEU 239.A H 3.300 2.613 CYS 240.A SG LEU 236.A O no hydrogen 3.454 N/A TRP 241.A N ARG 238.A O TRP 241.A H 2.768 1.990 GLU 246.A N GLU 246.A OE1 GLU 246.A H 2.725 1.847 ASP 247.A N ARG 244.A O ASP 247.A H 2.721 1.820 ARG 248.A N PRO 245.A O ARG 248.A H 3.049 2.100 ARG 248.A NE LYS 242.A O ARG 248.A HE 2.983 2.023 ARG 248.A NH1 GLU 174.A OE2 ARG 248.A HH12 2.932 2.025 ARG 248.A NH1 LYS 184.A O ARG 248.A HH11 2.677 1.739 ARG 248.A NH2 GLU 174.A OE1 ARG 248.A HH22 2.848 1.853 ARG 248.A NH2 LYS 242.A O ARG 248.A HH21 3.363 2.566 ARG 248.A NH2 GLU 243.A O ARG 248.A HH21 3.484 2.636 PHE 251.A N GLU 121.A OE1 PHE 251.A H 3.124 2.446 PHE 251.A N GLU 121.A OE2 PHE 251.A H 2.805 1.861 LEU 254.A N THR 250.A O LEU 254.A H 3.128 2.191 ARG 255.A N PHE 251.A O ARG 255.A H 2.776 1.844 ARG 255.A NE ASP 252.A OD1 ARG 255.A HE 3.116 2.312 ARG 255.A NH1 GLU 259.A OE2 ARG 255.A HH11 2.793 1.907 ARG 255.A NH2 ASP 252.A OD1 ARG 255.A HH21 2.912 1.970 SER 256.A N ASP 252.A O SER 256.A H 2.854 1.964 VAL 257.A N TYR 253.A O VAL 257.A H 2.895 1.950 LEU 258.A N LEU 254.A O LEU 258.A H 3.030 2.085 GLU 259.A N ARG 255.A O GLU 259.A H 2.947 2.043 ASP 260.A N SER 256.A O ASP 260.A H 3.141 2.231 PHE 261.A N VAL 257.A O PHE 261.A H 2.852 2.020 PHE 262.A N LEU 258.A O PHE 262.A H 2.881 2.003 THR 263.A N GLU 259.A O THR 263.A H 2.903 1.946 ALA 264.A N ASP 260.A O ALA 264.A H 3.127 2.267 THR 265.A N PHE 262.A O THR 265.A H 3.051 2.136