Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1ral_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N ARG 263.A O MET 1.A H3 3.289 2.546 SER 3.A OG MET 1.A O SER 3.A HG 3.489 2.613 ARG 7.A NH2 GLU 77.A O ARG 7.A HH22 3.250 2.411 VAL 8.A N ILE 16.A O VAL 8.A H 2.773 1.920 ASN 14.A N LEU 10.A O ASN 14.A H 3.095 2.146 ILE 16.A N VAL 8.A O ILE 16.A H 2.977 2.072 VAL 18.A N LEU 6.A O VAL 18.A H 2.943 2.042 GLY 20.A N PRO 267.A O GLY 20.A H 2.638 1.794 PHE 21.A N HIS 48.A O PHE 21.A H 3.414 2.495 GLY 22.A N ILE 269.A O GLY 22.A H 2.755 1.932 THR 24.A OG1 THR 23.A O THR 24.A HG1 2.622 1.910 LYS 31.A N GLU 27.A O LYS 31.A H 3.233 2.551 LYS 31.A NZ LYS 28.A O LYS 31.A HZ3 2.689 1.821 GLU 33.A N LYS 31.A O GLU 33.A H 3.178 2.271 VAL 34.A N GLU 60.A OE1 VAL 34.A H 3.350 2.610 LYS 36.A N GLU 33.A O LYS 36.A H 3.060 2.099 THR 38.A N VAL 34.A O THR 38.A H 2.914 1.957 THR 38.A OG1 ILE 35.A O THR 38.A HG1 3.180 2.300 LYS 39.A N ILE 35.A O LYS 39.A H 2.824 1.974 ILE 40.A N LYS 36.A O ILE 40.A H 2.887 1.969 ALA 41.A N THR 38.A O ALA 41.A H 3.102 2.242 ILE 42.A N THR 38.A O ILE 42.A H 3.209 2.280 ASP 43.A N LYS 39.A O ASP 43.A H 3.307 2.366 ASN 44.A N ALA 41.A O ASN 44.A H 2.972 2.056 ASN 44.A ND2 ASN 44.A O ASN 44.A HD22 2.771 1.965 GLY 45.A N ILE 42.A O GLY 45.A H 3.446 2.465 ARG 47.A NH1 ILE 42.A O ARG 47.A HH12 3.360 2.448 HIS 48.A ND1 PHE 49.A O HIS 48.A HD1 3.250 2.426 PHE 49.A N PHE 80.A O PHE 49.A H 2.994 2.084 ASP 50.A N PHE 21.A O ASP 50.A H 2.957 2.239 SER 51.A N THR 82.A O SER 51.A H 2.889 1.959 SER 51.A OG THR 23.A OG1 SER 51.A HG 3.130 2.175 TYR 55.A OH ASP 50.A OD1 TYR 55.A HH 3.255 2.364 GLU 56.A N LEU 54.A O GLU 56.A H 2.793 1.930 GLU 60.A N VAL 57.A O GLU 60.A H 2.696 1.906 VAL 61.A N VAL 57.A O VAL 61.A H 2.902 2.189 VAL 61.A N GLU 58.A O VAL 61.A H 3.089 2.300 GLY 62.A N GLU 58.A O GLY 62.A H 2.647 1.767 ILE 65.A N VAL 61.A O ILE 65.A H 3.140 2.181 ARG 66.A N GLY 62.A O ARG 66.A H 2.789 1.818 ARG 66.A NE GLN 107.A O ARG 66.A HE 3.025 2.169 SER 67.A N ALA 64.A O SER 67.A H 2.977 2.090 SER 67.A OG ALA 64.A O SER 67.A HG 2.732 1.844 LYS 68.A N ALA 64.A O LYS 68.A H 3.225 2.388 LYS 68.A N ILE 65.A O LYS 68.A H 2.717 2.001 ILE 69.A N ILE 65.A O ILE 69.A H 3.199 2.280 ASP 71.A N SER 67.A O ASP 71.A H 2.997 2.077 GLY 72.A N LYS 68.A O GLY 72.A H 3.302 2.394 THR 73.A N LYS 68.A O THR 73.A H 3.230 2.322 VAL 74.A N LYS 68.A O VAL 74.A H 3.323 2.351 ARG 76.A NH1 ASP 112.A OD1 ARG 76.A HH12 3.012 2.133 ARG 76.A NH1 ASP 112.A OD2 ARG 76.A HH12 3.481 2.777 ARG 76.A NH2 ASP 112.A OD1 ARG 76.A HH22 3.063 2.202 ASP 78.A N LYS 75.A O ASP 78.A H 2.840 1.902 ILE 79.A N ARG 76.A O ILE 79.A H 2.619 1.890 PHE 80.A N ARG 47.A O PHE 80.A H 3.001 2.034 THR 82.A N PHE 49.A O THR 82.A H 2.892 1.936 LYS 84.A NZ ASP 50.A OD1 LYS 84.A HZ3 2.769 1.980 LYS 84.A NZ TYR 55.A OH LYS 84.A HZ1 2.754 1.960 LEU 85.A N ILE 115.A O LEU 85.A H 3.043 2.067 TRP 86.A NE1 PHE 128.A O TRP 86.A HE1 3.121 2.156 SER 87.A OG MET 120.A O SER 87.A HG 2.919 2.072 PHE 89.A N THR 88.A OG1 PHE 89.A H 2.812 2.118 ARG 91.A NH1 GLU 140.A O ARG 91.A HH12 2.877 1.909 LEU 94.A N ARG 91.A O LEU 94.A H 3.113 2.178 VAL 95.A N PRO 92.A O VAL 95.A H 3.433 2.539 THR 97.A N LEU 94.A O THR 97.A H 2.888 1.977 THR 97.A OG1 LEU 94.A O THR 97.A HG1 3.262 2.692 CYS 98.A N VAL 95.A O CYS 98.A H 2.812 1.932 GLU 100.A N ARG 96.A O GLU 100.A H 2.852 1.886 LYS 101.A N THR 97.A O LYS 101.A H 2.691 1.778 THR 102.A N CYS 98.A O THR 102.A H 2.660 1.918 THR 102.A OG1 CYS 98.A O THR 102.A HG1 3.033 2.286 LEU 103.A N LEU 99.A O LEU 103.A H 2.715 1.924 LYS 104.A N GLU 100.A O LYS 104.A H 2.783 1.817 SER 105.A OG LYS 101.A O SER 105.A HG 2.783 1.934 THR 106.A N THR 102.A O THR 106.A H 3.117 2.271 THR 106.A OG1 THR 102.A O THR 106.A HG1 2.732 1.949 GLN 107.A N LEU 103.A O GLN 107.A H 3.147 2.409 GLN 107.A N LYS 104.A O GLN 107.A H 3.247 2.482 VAL 111.A N LEU 159.A O VAL 111.A H 3.393 2.447 LEU 113.A N TYR 81.A O LEU 113.A H 3.291 2.430 TYR 114.A N SER 162.A O TYR 114.A H 3.197 2.405 TYR 114.A OH THR 102.A OG1 TYR 114.A HH 2.740 1.857 ILE 115.A N SER 83.A O ILE 115.A H 3.314 2.521 ILE 116.A N GLY 164.A O ILE 116.A H 3.122 2.175 LEU 122.A N SER 87.A O LEU 122.A H 2.986 2.086 ARG 131.A NH1 PHE 129.A O ARG 131.A HH11 2.978 2.147 ASP 132.A N LYS 136.A O ASP 132.A H 2.958 2.019 LYS 136.A N ASP 132.A OD2 LYS 136.A H 3.348 2.564 LEU 138.A N PRO 130.A O LEU 138.A H 3.118 2.136 VAL 142.A N GLU 140.A O VAL 142.A H 2.980 2.282 CYS 145.A N ASP 143.A OD1 CYS 145.A H 3.198 2.476 ASP 146.A N ASP 143.A O ASP 146.A H 3.234 2.513 THR 147.A N ASP 143.A O THR 147.A H 2.965 2.064 THR 147.A OG1 HIS 90.A O THR 147.A HG1 3.062 2.292 TRP 148.A N ILE 144.A O TRP 148.A H 2.980 2.011 TRP 148.A NE1 TYR 184.A O TRP 148.A HE1 3.132 2.241 GLU 149.A N CYS 145.A O GLU 149.A H 2.775 1.855 ALA 150.A N ASP 146.A O ALA 150.A H 2.890 1.924 MET 151.A N TRP 148.A O MET 151.A H 2.881 2.004 GLU 152.A N TRP 148.A O GLU 152.A H 3.007 2.036 LYS 153.A N GLU 149.A O LYS 153.A H 3.457 2.487 CYS 154.A N MET 151.A O CYS 154.A H 3.096 2.367 CYS 154.A SG ALA 150.A O no hydrogen 3.509 N/A LYS 155.A N GLU 152.A O LYS 155.A H 2.893 2.148 ASP 156.A N GLU 152.A O ASP 156.A H 3.094 2.126 ALA 157.A N LYS 153.A O ALA 157.A H 2.714 1.941 GLY 158.A N LYS 155.A O GLY 158.A H 2.812 1.911 LEU 159.A N CYS 154.A O LEU 159.A H 3.046 2.181 LYS 161.A N VAL 111.A O LYS 161.A H 2.553 1.841 SER 162.A OG LYS 161.A O SER 162.A HG 2.718 1.844 GLY 164.A N TYR 114.A O GLY 164.A H 2.863 2.084 VAL 165.A N CYS 188.A O VAL 165.A H 2.978 2.001 SER 166.A OG VAL 165.A O SER 166.A HG 2.671 1.834 PHE 168.A N ASN 189.A OD1 PHE 168.A H 3.507 2.561 ASN 169.A N GLN 172.A OE1 ASN 169.A H 3.119 2.212 ARG 171.A N ASN 169.A OD1 ARG 171.A H 2.957 2.005 GLN 172.A NE2 ASN 167.A O GLN 172.A HE21 3.450 2.668 LEU 173.A N ASN 169.A O LEU 173.A H 2.732 1.889 GLU 174.A N CYS 170.A O GLU 174.A H 3.433 2.515 ARG 175.A N ARG 171.A O ARG 175.A H 3.509 2.616 ILE 176.A N GLN 172.A O ILE 176.A H 3.391 2.438 LEU 177.A N LEU 173.A O LEU 177.A H 3.371 2.424 ASN 178.A N ARG 175.A O ASN 178.A H 2.788 1.894 ASN 178.A ND2 GLU 174.A O ASN 178.A HD22 3.195 2.626 LYS 179.A NZ GLU 149.A OE2 LYS 179.A HZ1 3.143 2.368 LYS 179.A NZ PRO 180.A O LYS 179.A HZ2 3.189 2.361 LYS 183.A N GLU 152.A OE2 LYS 183.A H 3.221 2.251 ASN 189.A N ILE 212.A O ASN 189.A H 3.303 2.382 ASN 189.A ND2 PHE 168.A O ASN 189.A HD21 3.105 2.174 VAL 191.A N ASN 189.A O VAL 191.A H 2.753 2.044 CYS 193.A N TYR 216.A O CYS 193.A H 3.447 2.605 CYS 193.A SG LEU 197.A O no hydrogen 3.801 N/A CYS 193.A SG GLN 199.A OE1 no hydrogen 3.511 N/A HIS 194.A N LEU 197.A O HIS 194.A H 2.852 2.065 HIS 194.A ND1 CYS 217.A O HIS 194.A HD1 2.782 1.908 LEU 197.A N HIS 194.A O LEU 197.A H 3.093 2.180 GLN 199.A N GLN 199.A OE1 GLN 199.A H 2.663 1.908 GLN 199.A NE2 GLU 192.A O GLN 199.A HE21 3.523 2.640 MET 202.A N GLN 199.A O MET 202.A H 3.078 2.251 LEU 203.A N GLN 199.A O LEU 203.A H 2.886 1.966 ASP 204.A N SER 200.A O ASP 204.A H 2.887 1.914 TYR 205.A N LEU 203.A O TYR 205.A H 2.717 1.847 CYS 206.A N MET 202.A O CYS 206.A H 2.709 1.766 LYS 207.A N LEU 203.A O LYS 207.A H 3.506 2.598 SER 208.A N TYR 205.A O SER 208.A H 2.901 2.175 LYS 209.A N TYR 205.A O LYS 209.A H 3.333 2.521 LYS 209.A N CYS 206.A O LYS 209.A H 2.761 2.007 LYS 209.A NZ SER 208.A OG LYS 209.A HZ3 2.856 1.837 ASP 210.A N LYS 207.A O ASP 210.A H 3.068 2.247 ILE 211.A N CYS 206.A O ILE 211.A H 2.880 1.993 ILE 212.A N VAL 187.A O ILE 212.A H 2.672 1.843 SER 215.A N VAL 266.A O SER 215.A H 3.031 2.131 SER 215.A OG THR 218.A OG1 SER 215.A HG 2.949 2.248 TYR 216.A N VAL 191.A O TYR 216.A H 3.359 2.457 CYS 217.A SG GLU 192.A OE2 no hydrogen 3.887 N/A CYS 217.A SG SER 221.A OG no hydrogen 3.529 N/A THR 218.A OG1 CYS 193.A O THR 218.A HG1 3.387 2.571 GLY 220.A N CYS 217.A O GLY 220.A H 2.922 2.050 SER 222.A N GLY 220.A O SER 222.A H 2.660 1.932 SER 222.A OG GLY 220.A O SER 222.A HG 3.527 2.658 ARG 223.A N SER 221.A O ARG 223.A H 2.715 1.859 LYS 225.A N ARG 223.A O LYS 225.A H 2.731 1.937 TRP 227.A N LYS 225.A O TRP 227.A H 2.697 1.800 VAL 228.A N LYS 225.A O VAL 228.A H 3.117 2.329 GLN 230.A N GLN 230.A OE1 GLN 230.A H 2.693 1.956 ASP 238.A N LEU 235.A O ASP 238.A H 2.847 2.016 LEU 241.A N ASP 238.A OD1 LEU 241.A H 3.030 2.111 CYS 242.A N ASP 238.A O CYS 242.A H 2.903 2.072 ALA 243.A N PRO 239.A O ALA 243.A H 3.061 2.259 ILE 244.A N VAL 240.A O ILE 244.A H 3.008 2.056 LYS 247.A N ALA 243.A O LYS 247.A H 2.938 1.983 TYR 248.A N ILE 244.A O TYR 248.A H 2.853 2.029 ALA 253.A N THR 251.A O ALA 253.A H 2.722 1.967 ALA 256.A N PRO 252.A O ALA 256.A H 2.856 1.960 LEU 257.A N ALA 253.A O LEU 257.A H 2.914 2.011 ARG 258.A N LEU 254.A O ARG 258.A H 2.823 1.861 ARG 258.A NH1 GLN 262.A OE1 ARG 258.A HH12 2.815 1.981 ARG 258.A NH2 GLN 262.A OE1 ARG 258.A HH22 2.685 1.820 TYR 259.A N VAL 255.A O TYR 259.A H 3.172 2.187 TYR 259.A OH ASP 297.A OD2 TYR 259.A HH 2.998 2.154 GLN 260.A N LEU 257.A O GLN 260.A H 2.748 2.047 LEU 261.A N LEU 257.A O LEU 261.A H 3.162 2.187 GLN 262.A N ARG 258.A O GLN 262.A H 2.844 1.919 GLN 262.A NE2 ASP 2.A OD1 GLN 262.A HE22 3.008 2.326 GLN 262.A NE2 GLN 262.A O GLN 262.A HE22 3.337 2.479 ARG 263.A N TYR 259.A O ARG 263.A H 2.807 2.036 ARG 263.A N GLN 260.A O ARG 263.A H 2.942 2.229 GLY 264.A N GLN 260.A O GLY 264.A H 3.169 2.317 VAL 266.A N LEU 213.A O VAL 266.A H 3.036 2.087 LEU 268.A N SER 215.A O LEU 268.A H 2.928 2.083 ILE 269.A N GLY 20.A O ILE 269.A H 2.722 1.826 ARG 270.A NE SER 271.A O ARG 270.A HE 3.410 2.453 SER 271.A OG ARG 270.A O SER 271.A HG 2.877 2.005 ARG 276.A N ASN 273.A O ARG 276.A H 3.403 2.568 ILE 277.A N ALA 274.A O ILE 277.A H 2.657 1.879 LYS 278.A N ALA 274.A O LYS 278.A H 3.114 2.269 LYS 278.A N LYS 275.A O LYS 278.A H 3.297 2.581 GLU 279.A N LYS 275.A O GLU 279.A H 3.250 2.306 THR 281.A N LYS 278.A O THR 281.A H 3.278 2.368 GLN 282.A N GLU 279.A O GLN 282.A H 3.102 2.362 GLN 282.A NE2 LYS 278.A O GLN 282.A HE21 2.912 2.218 VAL 283.A N LEU 280.A O VAL 283.A H 3.361 2.405 GLU 285.A N GLN 282.A O GLU 285.A H 2.739 1.816 GLN 287.A NE2 PHE 286.A O GLN 287.A HE22 2.954 2.042 ALA 289.A N TYR 248.A OH ALA 289.A H 3.051 2.077 MET 293.A N ALA 289.A O MET 293.A H 2.798 1.839 LYS 294.A N SER 290.A O LYS 294.A H 2.939 1.980 LYS 294.A NZ ASP 297.A OD1 LYS 294.A HZ1 3.026 2.275 ALA 295.A N GLU 291.A O ALA 295.A H 2.908 2.087 LEU 296.A N ASP 292.A O LEU 296.A H 2.728 1.992 LEU 296.A N MET 293.A O LEU 296.A H 2.784 1.998 ASP 297.A N MET 293.A O ASP 297.A H 2.553 1.790 LEU 299.A N LEU 296.A O LEU 299.A H 3.290 2.431 ARG 301.A N TYR 196.A O ARG 301.A H 3.025 2.105 ASN 302.A N TYR 196.A O ASN 302.A H 3.067 2.175 TYR 305.A OH PRO 233.A O TYR 305.A HH 2.744 1.825