Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1rla_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ILE 3.A N ASN 41.A O ILE 3.A H 2.759 1.874 GLU 4.A N ILE 88.A O GLU 4.A H 2.875 1.920 ILE 5.A N ARG 43.A O ILE 5.A H 2.948 2.029 ILE 6.A N VAL 90.A O ILE 6.A H 2.874 1.922 GLY 7.A N GLY 46.A O GLY 7.A H 3.030 2.063 ALA 8.A N LEU 92.A O ALA 8.A H 2.829 1.879 PHE 10.A N ALA 8.A O PHE 10.A H 2.792 2.028 GLY 13.A N ASP 95.A OD2 GLY 13.A H 3.075 2.263 GLN 14.A N SER 11.A O GLN 14.A H 3.208 2.256 GLN 14.A NE2 SER 11.A O GLN 14.A HE22 3.276 2.318 GLN 14.A NE2 ARG 16.A O GLN 14.A HE21 2.805 1.869 GLY 18.A N GLU 20.A OE1 GLY 18.A H 2.941 2.051 GLU 20.A N GLU 20.A OE1 GLU 20.A H 2.930 2.085 LYS 21.A N GLY 18.A O LYS 21.A H 2.989 2.126 GLY 22.A N VAL 19.A O GLY 22.A H 2.990 2.079 ALA 25.A N LYS 21.A O ALA 25.A H 3.079 2.104 LEU 26.A N GLY 22.A O LEU 26.A H 3.156 2.211 ARG 27.A N PRO 23.A O ARG 27.A H 2.940 2.032 ARG 27.A NE ASP 44.A OD2 ARG 27.A HE 2.959 2.173 ARG 27.A NH1 ASP 47.A OD1 ARG 27.A HH12 2.776 1.891 ARG 27.A NH1 ASP 47.A OD2 ARG 27.A HH12 3.259 2.378 ARG 27.A NH2 ASP 44.A OD1 ARG 27.A HH21 3.264 2.391 ARG 27.A NH2 ASP 47.A OD1 ARG 27.A HH22 2.882 2.040 LYS 28.A N ALA 24.A O LYS 28.A H 2.834 1.881 ALA 29.A N ALA 25.A O ALA 29.A H 3.203 2.386 GLY 30.A N ARG 27.A O GLY 30.A H 2.758 1.869 LEU 31.A N LEU 26.A O LEU 31.A H 3.307 2.411 LYS 34.A N GLY 30.A O LYS 34.A H 2.858 1.893 LEU 35.A N LEU 31.A O LEU 35.A H 2.976 2.115 LYS 36.A N VAL 32.A O LYS 36.A H 3.238 2.384 GLU 37.A N LYS 34.A O GLU 37.A H 3.313 2.436 THR 38.A N LEU 35.A O THR 38.A H 2.986 2.051 THR 38.A OG1 LEU 35.A O THR 38.A HG1 2.669 1.766 TYR 40.A N THR 38.A OG1 TYR 40.A H 3.411 2.489 ASN 41.A N LYS 1.A O ASN 41.A H 3.177 2.215 ARG 43.A N ILE 3.A O ARG 43.A H 2.840 1.893 ARG 43.A NH1 GLU 4.A OE1 ARG 43.A HH11 3.390 2.454 HIS 45.A N ILE 5.A O HIS 45.A H 2.790 1.894 GLY 46.A N ASP 44.A OD1 GLY 46.A H 2.978 2.055 LEU 48.A N GLY 7.A O LEU 48.A H 3.130 2.154 SER 57.A N ASN 55.A O SER 57.A H 2.873 2.126 PHE 59.A N VAL 62.A O PHE 59.A H 2.864 1.967 VAL 62.A N PHE 59.A O VAL 62.A H 3.032 2.218 LYS 63.A N GLY 133.A O LYS 63.A H 3.163 2.199 ASN 64.A ND2 LYS 12.A O ASN 64.A HD22 3.516 2.631 ARG 66.A N ASP 56.A OD1 ARG 66.A H 3.151 2.329 ARG 66.A NH1 ASP 56.A OD1 ARG 66.A HH11 2.775 1.935 ARG 66.A NH1 SER 57.A O ARG 66.A HH12 2.787 1.826 SER 67.A N ASP 56.A OD2 SER 67.A H 2.807 1.916 SER 67.A OG ASP 56.A OD2 SER 67.A HG 2.728 2.058 VAL 68.A N ASN 64.A O VAL 68.A H 2.983 2.027 GLY 69.A N PRO 65.A O GLY 69.A H 2.764 1.857 LYS 70.A N ARG 66.A O LYS 70.A H 2.829 1.889 ALA 71.A N SER 67.A O ALA 71.A H 2.998 2.039 ASN 72.A N VAL 68.A O ASN 72.A H 3.071 2.155 ASN 72.A ND2 VAL 68.A O ASN 72.A HD22 2.894 2.007 ASN 72.A ND2 SER 97.A O ASN 72.A HD21 3.432 2.666 GLU 73.A N GLY 69.A O GLU 73.A H 3.031 2.250 GLN 74.A N LYS 70.A O GLN 74.A H 3.062 2.094 LEU 75.A N ALA 71.A O LEU 75.A H 2.973 2.037 ALA 76.A N ASN 72.A O ALA 76.A H 3.037 2.112 ALA 77.A N GLU 73.A O ALA 77.A H 3.162 2.277 VAL 78.A N GLN 74.A O VAL 78.A H 3.156 2.183 VAL 79.A N LEU 75.A O VAL 79.A H 2.964 1.983 ALA 80.A N ALA 76.A O ALA 80.A H 2.918 1.994 GLU 81.A N ALA 77.A O GLU 81.A H 3.025 2.089 THR 82.A N VAL 78.A O THR 82.A H 3.042 2.077 THR 82.A OG1 VAL 79.A O THR 82.A HG1 3.541 2.672 GLN 83.A N VAL 79.A O GLN 83.A H 2.965 2.006 GLN 83.A NE2 SER 89.A OG GLN 83.A HE22 2.888 2.004 GLN 83.A NE2 SER 266.A O GLN 83.A HE21 2.937 2.047 LYS 84.A N ALA 80.A O LYS 84.A H 2.950 2.114 ASN 85.A N GLU 81.A O ASN 85.A H 3.305 2.399 GLY 86.A N GLN 83.A O GLY 86.A H 3.002 2.119 THR 87.A N THR 82.A O THR 87.A H 3.322 2.385 THR 87.A OG1 THR 82.A O THR 87.A HG1 3.239 2.301 ILE 88.A N PRO 2.A O ILE 88.A H 2.781 1.814 VAL 90.A N GLU 4.A O VAL 90.A H 3.087 2.164 VAL 91.A N LEU 268.A O VAL 91.A H 2.809 1.860 LEU 92.A N ILE 6.A O LEU 92.A H 2.949 2.024 GLY 93.A N ILE 270.A O GLY 93.A H 2.898 1.920 GLY 94.A N VAL 19.A O GLY 94.A H 2.769 1.856 ASP 95.A N PHE 10.A O ASP 95.A H 3.041 2.140 HIS 96.A N GLU 272.A OE2 HIS 96.A H 2.996 2.042 SER 97.A N ASP 95.A OD1 SER 97.A H 3.034 2.105 MET 98.A N ASP 95.A O MET 98.A H 3.216 2.240 ALA 99.A N HIS 96.A O ALA 99.A H 3.112 2.156 ILE 100.A N SER 97.A O ILE 100.A H 3.005 2.045 GLY 101.A N ASN 72.A OD1 GLY 101.A H 2.807 1.914 SER 102.A N MET 98.A O SER 102.A H 3.058 2.093 ILE 103.A N ALA 99.A O ILE 103.A H 2.783 1.839 SER 104.A N ILE 100.A O SER 104.A H 3.009 2.090 GLY 105.A N GLY 101.A O GLY 105.A H 2.822 1.853 HIS 106.A N SER 102.A O HIS 106.A H 3.178 2.232 HIS 106.A ND1 HIS 223.A ND1 HIS 106.A HD1 2.807 1.835 ALA 107.A N ILE 103.A O ALA 107.A H 2.847 1.911 ARG 108.A N SER 104.A O ARG 108.A H 3.155 2.310 ARG 108.A N GLY 105.A O ARG 108.A H 3.189 2.465 VAL 109.A N HIS 106.A O VAL 109.A H 3.217 2.501 HIS 110.A N HIS 106.A O HIS 110.A H 2.876 1.913 LEU 113.A N HIS 110.A O LEU 113.A H 3.216 2.341 CYS 114.A N PRO 221.A O CYS 114.A H 3.012 2.081 CYS 114.A SG PRO 221.A O no hydrogen 3.677 N/A VAL 115.A N ASP 168.A O VAL 115.A H 2.808 1.845 ILE 116.A N HIS 223.A O ILE 116.A H 2.931 1.972 TRP 117.A N VAL 170.A O TRP 117.A H 2.841 1.868 TRP 117.A NE1 ASP 119.A OD2 TRP 117.A HE1 3.054 2.322 VAL 118.A N SER 225.A O VAL 118.A H 3.004 2.050 ASP 119.A N ILE 172.A O ASP 119.A H 3.186 2.240 ALA 120.A N ASP 229.A OD1 ALA 120.A H 3.353 2.397 HIS 121.A N ASP 119.A OD1 HIS 121.A H 3.034 2.116 HIS 121.A ND1 ASP 119.A OD1 no hydrogen 3.161 N/A ILE 124.A N GLU 181.A OE2 ILE 124.A H 2.986 2.064 ASN 125.A N GLY 137.A O ASN 125.A H 3.172 2.301 ASN 125.A ND2 ASP 178.A OD2 ASN 125.A HD21 3.100 2.137 THR 126.A N THR 129.A OG1 THR 126.A H 2.789 1.861 THR 129.A N THR 126.A O THR 129.A H 2.854 2.072 THR 129.A N THR 126.A OG1 THR 129.A H 3.219 2.442 THR 129.A OG1 ASN 125.A OD1 THR 129.A HG1 3.111 2.144 THR 130.A N THR 126.A O THR 130.A H 3.116 2.395 THR 130.A OG1 THR 126.A O THR 130.A HG1 3.227 2.315 HIS 136.A N GLY 13.A O HIS 136.A H 2.695 1.820 HIS 136.A ND1 GLU 272.A OE2 no hydrogen 3.269 N/A GLY 137.A N ASN 134.A O GLY 137.A H 3.236 2.313 GLN 138.A N LEU 135.A O GLN 138.A H 3.020 2.089 GLN 138.A NE2 ASN 134.A O GLN 138.A HE22 3.291 2.341 VAL 140.A N ASP 123.A O VAL 140.A H 3.274 2.383 ALA 141.A N GLN 138.A O ALA 141.A H 2.952 2.131 LEU 143.A N VAL 140.A O LEU 143.A H 3.113 2.265 LEU 144.A N VAL 140.A O LEU 144.A H 3.086 2.276 LYS 145.A N ILE 164.A O LYS 145.A H 2.953 2.008 GLU 146.A N GLU 146.A OE1 GLU 146.A H 2.789 2.013 LEU 147.A N LEU 144.A O LEU 147.A H 3.282 2.388 LYS 148.A N LYS 145.A O LYS 148.A H 3.003 2.089 LYS 150.A N LEU 147.A O LYS 150.A H 3.380 2.429 PHE 157.A N VAL 154.A O PHE 157.A H 3.118 2.167 TRP 159.A NE1 GLY 69.A O TRP 159.A HE1 2.993 2.178 VAL 160.A N PHE 157.A O VAL 160.A H 3.139 2.208 CYS 163.A SG THR 161.A O no hydrogen 3.536 N/A ILE 164.A N LEU 143.A O ILE 164.A H 3.354 2.417 SER 165.A N ASP 168.A OD2 SER 165.A H 3.131 2.171 ALA 166.A N GLU 146.A OE1 ALA 166.A H 2.955 2.169 ALA 166.A N GLU 146.A OE2 ALA 166.A H 3.473 2.538 ASP 168.A N SER 165.A O ASP 168.A H 2.915 1.959 VAL 170.A N VAL 115.A O VAL 170.A H 3.003 2.084 TYR 171.A N LYS 191.A O TYR 171.A H 3.279 2.356 TYR 171.A OH THR 122.A O TYR 171.A HH 2.763 1.913 ILE 172.A N TRP 117.A O ILE 172.A H 3.008 2.078 GLY 173.A N PHE 193.A O GLY 173.A H 2.929 1.981 ARG 175.A N ALA 120.A O ARG 175.A H 2.921 1.948 ARG 175.A NE GLY 173.A O ARG 175.A HE 3.397 2.676 ARG 175.A NH1 ASP 229.A O ARG 175.A HH12 3.240 2.465 ARG 175.A NH1 VAL 243.A O ARG 175.A HH11 2.819 1.954 ARG 175.A NH2 GLY 173.A O ARG 175.A HH21 3.160 2.268 ARG 175.A NH2 GLY 230.A O ARG 175.A HH22 2.543 1.818 ASP 176.A N ALA 120.A O ASP 176.A H 3.020 2.171 ASP 178.A N GLU 181.A OE1 ASP 178.A H 3.034 2.093 HIS 182.A N ASP 178.A O HIS 182.A H 2.907 1.943 TYR 183.A N PRO 179.A O TYR 183.A H 2.941 2.006 ILE 184.A N GLY 180.A O ILE 184.A H 3.042 2.091 ILE 185.A N GLU 181.A O ILE 185.A H 2.908 1.939 LYS 186.A N HIS 182.A O LYS 186.A H 3.033 2.102 THR 187.A N TYR 183.A O THR 187.A H 2.830 1.909 THR 187.A OG1 TYR 183.A O THR 187.A HG1 2.848 1.973 LEU 188.A N ILE 184.A O LEU 188.A H 2.869 1.902 GLY 189.A N LYS 186.A O GLY 189.A H 3.427 2.593 ILE 190.A N ILE 185.A O ILE 190.A H 3.204 2.271 PHE 193.A N TYR 171.A O PHE 193.A H 2.895 1.996 SER 194.A N GLU 197.A OE1 SER 194.A H 2.761 1.990 MET 195.A N LEU 174.A O MET 195.A H 3.013 2.048 GLU 197.A N SER 194.A O GLU 197.A H 2.776 2.074 VAL 198.A N SER 194.A O VAL 198.A H 3.065 2.104 ASP 199.A N MET 195.A O ASP 199.A H 2.806 1.859 LYS 200.A N THR 196.A O LYS 200.A H 2.932 1.994 LEU 201.A N GLU 197.A O LEU 201.A H 2.738 1.793 GLY 202.A N VAL 198.A O GLY 202.A H 2.754 1.874 VAL 206.A N GLY 202.A O VAL 206.A H 3.151 2.204 MET 207.A N ILE 203.A O MET 207.A H 3.056 2.116 GLU 208.A N GLY 204.A O GLU 208.A H 3.194 2.264 GLU 209.A N LYS 205.A O GLU 209.A H 3.021 2.077 THR 210.A N VAL 206.A O THR 210.A H 3.000 2.094 PHE 211.A N MET 207.A O PHE 211.A H 3.158 2.211 SER 212.A N GLU 208.A O SER 212.A H 3.124 2.178 SER 212.A OG GLU 208.A O SER 212.A HG 3.287 2.356 TYR 213.A N GLU 209.A O TYR 213.A H 3.015 2.140 LEU 214.A N THR 210.A O LEU 214.A H 2.952 1.996 LEU 215.A N PHE 211.A O LEU 215.A H 2.739 1.860 LYS 219.A NZ LEU 215.A O LYS 219.A HZ1 3.193 2.241 ARG 220.A NE LEU 214.A O ARG 220.A HE 2.856 1.889 ARG 220.A NH1 ASP 112.A O ARG 220.A HH11 2.765 1.902 ARG 220.A NH1 ASP 168.A OD1 ARG 220.A HH12 3.346 2.583 ARG 220.A NH2 ASP 168.A OD1 ARG 220.A HH22 2.994 2.106 ILE 222.A N LEU 264.A O ILE 222.A H 2.937 1.993 HIS 223.A N CYS 114.A O HIS 223.A H 2.956 2.008 HIS 223.A NE2 ASP 269.A OD2 HIS 223.A HE2 2.779 1.840 LEU 224.A N GLY 267.A O LEU 224.A H 2.848 1.890 SER 225.A N ILE 116.A O SER 225.A H 3.047 2.140 PHE 226.A N ASP 269.A O PHE 226.A H 2.868 1.952 ASP 227.A N VAL 118.A O ASP 227.A H 2.863 1.905 VAL 228.A N MET 271.A O VAL 228.A H 3.114 2.133 ASP 229.A N ASP 227.A OD1 ASP 229.A H 3.049 2.097 GLY 230.A N ASP 227.A O GLY 230.A H 2.811 1.902 LEU 231.A N VAL 228.A O LEU 231.A H 3.248 2.282 ASP 232.A N LEU 247.A O ASP 232.A H 2.824 1.874 VAL 234.A N ASP 232.A OD1 VAL 234.A H 3.159 2.217 PHE 235.A N ASP 232.A O PHE 235.A H 2.805 1.899 THR 236.A N ASP 232.A O THR 236.A H 3.092 2.138 ALA 238.A N THR 287.A OG1 ALA 238.A H 2.870 1.930 THR 239.A N PRO 237.A O THR 239.A H 3.028 2.218 GLY 246.A N ASP 232.A OD2 GLY 246.A H 2.736 1.872 LEU 247.A N GLY 230.A O LEU 247.A H 3.361 2.418 SER 248.A N GLU 251.A OE1 SER 248.A H 2.935 2.005 GLY 252.A N SER 248.A O GLY 252.A H 2.891 1.927 LEU 253.A N TYR 249.A O LEU 253.A H 2.941 1.969 TYR 254.A N ARG 250.A O TYR 254.A H 2.989 2.158 ILE 255.A N GLU 251.A O ILE 255.A H 2.946 2.056 THR 256.A N GLY 252.A O THR 256.A H 3.107 2.160 THR 256.A OG1 SER 297.A OG THR 256.A HG1 2.668 1.833 GLU 257.A N LEU 253.A O GLU 257.A H 2.978 2.013 GLU 258.A N TYR 254.A O GLU 258.A H 3.162 2.230 ILE 259.A N ILE 255.A O ILE 259.A H 3.111 2.179 TYR 260.A N THR 256.A O TYR 260.A H 2.842 1.916 LYS 261.A N GLU 257.A O LYS 261.A H 3.004 2.061 LYS 261.A NZ GLU 258.A OE2 LYS 261.A HZ2 3.059 2.135 THR 262.A N GLU 258.A O THR 262.A H 3.319 2.616 THR 262.A N ILE 259.A O THR 262.A H 3.207 2.365 GLY 263.A N TYR 260.A O GLY 263.A H 3.049 2.180 SER 266.A N ILE 222.A O SER 266.A H 2.789 1.870 GLY 267.A N ILE 222.A O GLY 267.A H 3.213 2.319 LEU 268.A N SER 89.A O LEU 268.A H 2.920 2.031 ASP 269.A N LEU 224.A O ASP 269.A H 2.933 2.022 ILE 270.A N VAL 91.A O ILE 270.A H 2.907 1.954 MET 271.A N PHE 226.A O MET 271.A H 2.871 1.898 GLU 272.A N GLY 94.A O GLU 272.A H 2.991 2.022 ASN 274.A N ALA 238.A O ASN 274.A H 2.972 2.018 ASN 274.A ND2 GLY 17.A O ASN 274.A HD21 3.451 2.496 THR 276.A N ASN 274.A OD1 THR 276.A H 3.126 2.409 LEU 277.A N ASN 274.A O LEU 277.A H 3.171 2.222 GLY 278.A N PRO 275.A O GLY 278.A H 3.505 2.541 LYS 279.A N GLU 283.A OE1 LYS 279.A H 2.923 2.016 GLU 283.A N THR 280.A O GLU 283.A H 2.921 2.153 GLU 283.A N THR 280.A OG1 GLU 283.A H 3.329 2.509 VAL 284.A N PRO 281.A O VAL 284.A H 2.992 2.280 THR 285.A N PRO 281.A O THR 285.A H 2.998 2.033 THR 285.A OG1 PRO 281.A O THR 285.A HG1 3.316 2.387 ARG 286.A N GLU 282.A O ARG 286.A H 2.800 1.860 ARG 286.A NE GLU 282.A OE2 ARG 286.A HE 2.962 2.249 ARG 286.A NH1 VAL 234.A O ARG 286.A HH11 2.639 1.691 THR 287.A N GLU 283.A O THR 287.A H 3.099 2.169 THR 287.A OG1 GLU 283.A O THR 287.A HG1 2.864 1.918 VAL 288.A N VAL 284.A O VAL 288.A H 2.834 1.860 ASN 289.A N THR 285.A O ASN 289.A H 2.865 1.915 THR 290.A N ARG 286.A O THR 290.A H 3.181 2.273 ALA 291.A N THR 287.A O ALA 291.A H 3.080 2.179 VAL 292.A N VAL 288.A O VAL 292.A H 2.835 1.868 ALA 293.A N ASN 289.A O ALA 293.A H 3.004 2.056 LEU 294.A N THR 290.A O LEU 294.A H 2.985 2.084 THR 295.A N ALA 291.A O THR 295.A H 3.028 2.116 LEU 296.A N VAL 292.A O LEU 296.A H 2.953 1.972 SER 297.A N ALA 293.A O SER 297.A H 3.082 2.289 CYS 298.A N LEU 294.A O CYS 298.A H 3.121 2.206 CYS 298.A SG LEU 294.A O no hydrogen 3.571 N/A PHE 299.A N THR 295.A O PHE 299.A H 3.371 2.548 GLY 300.A N SER 297.A O GLY 300.A H 3.166 2.269 THR 301.A N LEU 296.A O THR 301.A H 3.016 2.067 ARG 303.A N GLU 257.A OE2 ARG 303.A H 3.395 2.530 ARG 303.A NE GLU 257.A OE2 ARG 303.A HE 3.012 2.073 ARG 303.A NH2 GLU 257.A OE1 ARG 303.A HH21 3.211 2.225 GLY 305.A N LYS 302.A O GLY 305.A H 3.083 2.169 LYS 308.A N TYR 313.A OH LYS 308.A H 3.142 2.201 THR 311.A N LYS 308.A O THR 311.A H 3.542 2.597