Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1vdp_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A N THR 40.A OG1 LYS 1.A H1 2.723 1.684 LYS 1.A NZ GLU 7.A OE1 LYS 1.A HZ3 3.095 2.134 PHE 3.A N PHE 38.A O PHE 3.A H 2.812 1.864 GLY 4.A N GLU 7.A OE2 GLY 4.A H 3.086 2.106 ARG 5.A NH1 ARG 125.A O ARG 5.A HH12 3.175 2.337 ARG 5.A NH2 TRP 123.A O ARG 5.A HH21 2.979 2.142 ARG 5.A NH2 ARG 125.A O ARG 5.A HH22 2.906 1.963 CYS 6.A SG ARG 125.A O no hydrogen 3.946 N/A LEU 8.A N GLY 4.A O LEU 8.A H 2.874 1.901 ALA 9.A N ARG 5.A O ALA 9.A H 2.865 1.923 ALA 10.A N CYS 6.A O ALA 10.A H 2.911 1.982 ALA 11.A N GLU 7.A O ALA 11.A H 3.059 2.136 MET 12.A N LEU 8.A O MET 12.A H 2.889 1.925 LYS 13.A N ALA 9.A O LYS 13.A H 2.960 1.997 ARG 14.A N ALA 10.A O ARG 14.A H 2.947 1.989 HIS 15.A N ALA 11.A O HIS 15.A H 2.978 2.186 HIS 15.A ND1 ALA 11.A O HIS 15.A HD1 3.016 2.122 GLY 16.A N LYS 13.A O GLY 16.A H 3.061 2.131 LEU 17.A N MET 12.A O LEU 17.A H 3.254 2.288 TYR 20.A N LEU 17.A O TYR 20.A H 3.017 2.073 GLY 22.A N ASN 19.A O GLY 22.A H 2.893 2.005 TYR 23.A N TYR 20.A O TYR 23.A H 3.166 2.241 LEU 25.A N ASP 18.A OD1 LEU 25.A H 3.003 2.092 ASN 27.A N SER 24.A O ASN 27.A H 2.823 2.046 VAL 29.A N LEU 25.A O VAL 29.A H 2.978 2.023 CYS 30.A N GLY 26.A O CYS 30.A H 2.972 2.030 CYS 30.A SG ARG 114.A O no hydrogen 3.913 N/A ALA 31.A N ASN 27.A O ALA 31.A H 2.914 1.991 ALA 32.A N TRP 28.A O ALA 32.A H 2.989 2.026 LYS 33.A N VAL 29.A O LYS 33.A H 2.928 2.028 LYS 33.A NZ ASN 37.A OD1 LYS 33.A HZ2 3.418 2.645 PHE 34.A N CYS 30.A O PHE 34.A H 2.982 2.041 GLU 35.A N ALA 31.A O GLU 35.A H 2.757 1.947 SER 36.A N ALA 32.A O SER 36.A H 3.078 2.129 PHE 38.A N ALA 32.A O PHE 38.A H 3.416 2.452 ASN 39.A N SER 36.A O ASN 39.A H 3.249 2.316 THR 40.A N LYS 1.A O THR 40.A H 2.894 1.916 GLN 41.A N ASN 39.A OD1 GLN 41.A H 3.016 2.078 ALA 42.A N ASN 39.A O ALA 42.A H 3.192 2.222 ASN 44.A N ASP 52.A O ASN 44.A H 2.943 2.046 ASN 44.A ND2 ASP 52.A OD2 ASN 44.A HD21 3.563 2.697 ASN 46.A N SER 50.A O ASN 46.A H 2.826 1.886 ASN 46.A ND2 SER 50.A OG ASN 46.A HD21 3.324 2.393 ASN 46.A ND2 ASP 52.A OD1 ASN 46.A HD22 3.258 2.540 ASN 46.A ND2 ASP 52.A OD2 ASN 46.A HD22 3.313 2.355 ASN 46.A ND2 ASN 59.A OD1 ASN 46.A HD21 3.494 2.804 GLY 49.A N ASN 46.A O GLY 49.A H 3.023 2.168 SER 50.A N ASP 48.A OD2 SER 50.A H 3.285 2.344 SER 50.A OG ASP 48.A OD2 SER 50.A HG 2.754 1.828 ASP 52.A N ASN 44.A O ASP 52.A H 2.735 1.766 TYR 53.A N ILE 58.A O TYR 53.A H 2.757 1.825 GLY 54.A N ALA 42.A O GLY 54.A H 2.873 1.942 GLN 57.A N GLY 54.A O GLN 57.A H 3.026 2.090 ILE 58.A N TYR 53.A O ILE 58.A H 3.122 2.218 SER 60.A N THR 51.A O SER 60.A H 2.900 2.001 SER 60.A OG THR 51.A O SER 60.A HG 3.029 2.132 ARG 61.A NH1 ASP 48.A O ARG 61.A HH12 2.628 1.684 ARG 61.A NH2 ASP 48.A O ARG 61.A HH22 3.475 2.836 ARG 61.A NH2 PRO 70.A O ARG 61.A HH21 2.969 2.094 TRP 63.A N ASN 59.A O TRP 63.A H 3.086 2.167 ASN 65.A N ILE 78.A O ASN 65.A H 2.859 1.895 GLY 67.A N ASN 65.A OD1 GLY 67.A H 2.954 2.054 ARG 68.A N ASP 66.A OD1 ARG 68.A H 3.232 2.291 THR 69.A OG1 ASP 66.A OD1 THR 69.A HG1 2.683 1.840 SER 72.A OG THR 69.A O SER 72.A HG 2.881 2.072 ARG 73.A N ARG 61.A O ARG 73.A H 2.902 1.948 ASN 74.A ND2 TRP 63.A O ASN 74.A HD21 3.254 2.419 ASN 74.A ND2 ILE 78.A O ASN 74.A HD22 3.022 2.246 LEU 75.A N TRP 62.A O LEU 75.A H 2.856 1.889 CYS 76.A N TRP 63.A O CYS 76.A H 2.880 1.992 ASN 77.A N ASN 74.A O ASN 77.A H 2.933 2.141 CYS 80.A N ASN 65.A O CYS 80.A H 2.854 1.894 ALA 82.A N PRO 79.A O ALA 82.A H 3.105 2.317 LEU 83.A N CYS 80.A O LEU 83.A H 2.990 2.099 LEU 84.A N SER 81.A O LEU 84.A H 2.951 2.037 SER 85.A OG ALA 82.A O SER 85.A HG 3.147 2.268 VAL 92.A N ILE 88.A O VAL 92.A H 2.952 2.004 ASN 93.A N THR 89.A O ASN 93.A H 3.063 2.112 CYS 94.A N ALA 90.A O CYS 94.A H 3.021 2.068 ALA 95.A N SER 91.A O ALA 95.A H 2.873 1.956 LYS 96.A N VAL 92.A O LYS 96.A H 3.041 2.101 ILE 98.A N CYS 94.A O ILE 98.A H 3.071 2.126 VAL 99.A N ALA 95.A O VAL 99.A H 2.818 1.864 SER 100.A OG LYS 96.A O SER 100.A HG 3.157 2.438 ASP 101.A N ILE 98.A O ASP 101.A H 3.001 2.101 MET 105.A N TYR 23.A OH MET 105.A H 3.085 2.128 ASN 106.A N ASN 103.A O ASN 106.A H 3.012 2.264 ALA 107.A N GLY 104.A O ALA 107.A H 3.497 2.522 TRP 108.A N MET 105.A O TRP 108.A H 3.091 2.165 TRP 108.A NE1 LEU 56.A O TRP 108.A HE1 2.926 2.232 ALA 110.A N GLU 35.A OE2 ALA 110.A H 3.284 2.445 TRP 111.A NE1 ASN 27.A OD1 TRP 111.A HE1 3.076 2.154 ARG 112.A N TRP 108.A O ARG 112.A H 3.100 2.148 ASN 113.A N VAL 109.A O ASN 113.A H 2.937 1.975 ARG 114.A N ALA 110.A O ARG 114.A H 2.885 1.999 CYS 115.A N TRP 111.A O CYS 115.A H 2.818 1.963 LYS 116.A N TRP 111.A O LYS 116.A H 2.925 2.001 THR 118.A N CYS 115.A O THR 118.A H 2.992 2.032 ALA 122.A N ASP 119.A O ALA 122.A H 3.443 2.527 TRP 123.A N VAL 120.A O TRP 123.A H 3.049 2.128 ILE 124.A N GLN 121.A O ILE 124.A H 3.188 2.226 ARG 125.A N ALA 122.A O ARG 125.A H 3.188 2.253 CYS 127.A N ILE 124.A O CYS 127.A H 3.100 2.168 CYS 127.A SG ARG 125.A O no hydrogen 3.852 N/A