Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1vds_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A N THR 40.A OG1 LYS 1.A H1 2.768 1.783 LYS 1.A NZ GLU 7.A OE1 LYS 1.A HZ3 3.228 2.477 LYS 1.A NZ GLU 7.A OE2 LYS 1.A HZ3 2.859 1.853 PHE 3.A N PHE 38.A O PHE 3.A H 2.900 1.982 GLY 4.A N GLU 7.A OE1 GLY 4.A H 3.028 2.058 ARG 5.A NH1 TRP 123.A O ARG 5.A HH11 2.964 1.994 ARG 5.A NH1 ARG 125.A O ARG 5.A HH12 2.883 1.928 ARG 5.A NH2 ARG 125.A O ARG 5.A HH22 3.248 2.420 LEU 8.A N GLY 4.A O LEU 8.A H 2.865 1.945 ALA 9.A N ARG 5.A O ALA 9.A H 2.951 1.971 ALA 10.A N CYS 6.A O ALA 10.A H 3.041 2.116 ALA 11.A N GLU 7.A O ALA 11.A H 3.107 2.178 MET 12.A N LEU 8.A O MET 12.A H 2.939 1.996 LYS 13.A N ALA 9.A O LYS 13.A H 2.972 2.048 LYS 13.A NZ LEU 129.A O LYS 13.A HZ1 3.330 2.301 ARG 14.A N ALA 10.A O ARG 14.A H 3.061 2.099 HIS 15.A N ALA 11.A O HIS 15.A H 3.065 2.153 HIS 15.A ND1 ALA 11.A O HIS 15.A HD1 2.833 1.907 GLY 16.A N LYS 13.A O GLY 16.A H 2.982 2.042 LEU 17.A N MET 12.A O LEU 17.A H 2.987 2.050 TYR 20.A N LEU 17.A O TYR 20.A H 3.067 2.097 GLY 22.A N ASN 19.A O GLY 22.A H 2.903 2.039 TYR 23.A N TYR 20.A O TYR 23.A H 3.035 2.070 LEU 25.A N ASP 18.A OD1 LEU 25.A H 2.998 2.102 ASN 27.A N SER 24.A O ASN 27.A H 2.873 2.047 TRP 28.A NE1 TYR 23.A O TRP 28.A HE1 3.218 2.454 VAL 29.A N LEU 25.A O VAL 29.A H 3.110 2.160 CYS 30.A N GLY 26.A O CYS 30.A H 2.952 1.999 ALA 31.A N ASN 27.A O ALA 31.A H 2.967 2.034 ALA 32.A N TRP 28.A O ALA 32.A H 3.000 2.047 LYS 33.A N VAL 29.A O LYS 33.A H 2.954 2.061 LYS 33.A NZ ASN 37.A OD1 LYS 33.A HZ2 3.082 2.098 PHE 34.A N CYS 30.A O PHE 34.A H 3.106 2.150 GLU 35.A N ALA 31.A O GLU 35.A H 2.874 2.010 SER 36.A N ALA 32.A O SER 36.A H 2.971 2.054 ASN 37.A N LYS 33.A O ASN 37.A H 2.876 2.137 PHE 38.A N ALA 32.A O PHE 38.A H 3.454 2.492 ASN 39.A N SER 36.A O ASN 39.A H 3.120 2.199 ASN 39.A ND2 LYS 1.A O ASN 39.A HD21 3.630 2.764 THR 40.A N LYS 1.A O THR 40.A H 2.873 1.906 ALA 42.A N ASN 39.A O ALA 42.A H 3.300 2.340 ASN 44.A N ASP 52.A O ASN 44.A H 3.018 2.122 ASN 44.A ND2 ARG 45.A O ASN 44.A HD21 3.240 2.426 ARG 45.A NE GLY 49.A O ARG 45.A HE 3.035 2.155 ARG 45.A NH2 GLY 49.A O ARG 45.A HH21 2.972 2.074 ASN 46.A N SER 50.A O ASN 46.A H 2.818 1.845 ASN 46.A ND2 ASP 52.A OD2 ASN 46.A HD22 3.286 2.395 GLY 49.A N ASN 46.A O GLY 49.A H 2.967 2.052 SER 50.A N ASP 48.A OD1 SER 50.A H 3.115 2.177 SER 50.A OG ASN 46.A OD1 SER 50.A HG 3.216 2.434 THR 51.A N SER 60.A OG THR 51.A H 2.902 1.959 ASP 52.A N ASN 44.A O ASP 52.A H 2.814 1.849 TYR 53.A N ILE 58.A O TYR 53.A H 2.860 2.030 TYR 53.A OH ASP 66.A OD2 TYR 53.A HH 2.646 1.859 GLY 54.A N ALA 42.A O GLY 54.A H 2.834 1.900 GLN 57.A N GLY 54.A O GLN 57.A H 2.910 2.015 GLN 57.A NE2 ALA 42.A O GLN 57.A HE22 2.902 2.254 GLN 57.A NE2 ASP 52.A O GLN 57.A HE22 3.527 2.934 GLN 57.A NE2 GLY 54.A O GLN 57.A HE21 2.936 1.966 ILE 58.A N TYR 53.A O ILE 58.A H 2.969 2.060 ASN 59.A ND2 SER 50.A OG ASN 59.A HD22 2.827 1.888 ASN 59.A ND2 ASP 52.A OD1 ASN 59.A HD21 2.864 1.935 SER 60.A N THR 51.A O SER 60.A H 2.916 2.056 SER 60.A OG ASP 66.A OD2 SER 60.A HG 3.441 2.635 ARG 61.A N ASN 59.A OD1 ARG 61.A H 2.930 2.081 ARG 61.A NE ARG 61.A O ARG 61.A HE 2.954 2.253 TRP 63.A N ASN 59.A O TRP 63.A H 3.114 2.211 ASN 65.A N ILE 78.A O ASN 65.A H 2.833 1.868 ARG 68.A N ASP 66.A OD1 ARG 68.A H 3.064 2.117 ARG 68.A NH2 THR 51.A OG1 ARG 68.A HH21 3.114 2.121 THR 69.A OG1 ASP 66.A OD1 THR 69.A HG1 2.864 1.972 ARG 73.A N ARG 61.A O ARG 73.A H 2.769 1.951 ASN 74.A ND2 ILE 78.A O ASN 74.A HD22 3.614 3.007 LEU 75.A N TRP 62.A O LEU 75.A H 2.895 1.918 CYS 76.A N TRP 63.A O CYS 76.A H 2.963 2.043 ASN 77.A N ASN 74.A O ASN 77.A H 3.035 2.136 ILE 78.A N ASN 74.A OD1 ILE 78.A H 3.045 2.093 CYS 80.A N ASN 65.A O CYS 80.A H 2.831 1.886 ALA 82.A N PRO 79.A O ALA 82.A H 3.004 2.165 LEU 83.A N CYS 80.A O LEU 83.A H 2.933 2.050 LEU 84.A N SER 81.A O LEU 84.A H 2.956 2.017 SER 85.A N ALA 82.A O SER 85.A H 3.559 2.609 ASP 87.A N SER 85.A OG ASP 87.A H 3.072 2.186 THR 89.A N ASP 87.A OD1 THR 89.A H 3.016 2.069 VAL 92.A N ILE 88.A O VAL 92.A H 2.896 1.935 ASN 93.A N THR 89.A O ASN 93.A H 2.872 1.899 CYS 94.A N ALA 90.A O CYS 94.A H 3.034 2.102 ALA 95.A N SER 91.A O ALA 95.A H 2.914 1.964 LYS 96.A N VAL 92.A O LYS 96.A H 2.969 2.033 LYS 96.A NZ HIS 15.A O LYS 96.A HZ3 2.999 2.265 ILE 98.A N CYS 94.A O ILE 98.A H 2.989 2.049 VAL 99.A N ALA 95.A O VAL 99.A H 2.893 1.921 SER 100.A N LYS 96.A O SER 100.A H 3.333 2.539 SER 100.A N LYS 97.A O SER 100.A H 3.218 2.509 ASP 101.A N ILE 98.A O ASP 101.A H 2.939 1.993 MET 105.A N TYR 23.A OH MET 105.A H 3.033 2.083 ASN 106.A N ASN 103.A O ASN 106.A H 3.256 2.410 ALA 107.A N GLY 104.A O ALA 107.A H 3.482 2.513 TRP 108.A N MET 105.A O TRP 108.A H 2.997 2.027 TRP 108.A NE1 LEU 56.A O TRP 108.A HE1 2.767 1.972 ALA 110.A N GLU 35.A OE2 ALA 110.A H 3.211 2.314 ARG 112.A N TRP 108.A O ARG 112.A H 3.113 2.149 ARG 112.A NE ASN 106.A O ARG 112.A HE 3.241 2.365 ARG 112.A NH2 ASN 106.A O ARG 112.A HH21 3.180 2.276 ASN 113.A N VAL 109.A O ASN 113.A H 2.909 2.025 ARG 114.A N ALA 110.A O ARG 114.A H 2.818 2.070 CYS 115.A N TRP 111.A O CYS 115.A H 2.915 2.041 LYS 116.A N TRP 111.A O LYS 116.A H 2.796 1.849 THR 118.A N CYS 115.A O THR 118.A H 2.999 2.095 VAL 120.A N THR 118.A O VAL 120.A H 2.858 2.152 GLN 121.A N GLN 121.A OE1 GLN 121.A H 2.810 1.898 ALA 122.A N ASP 119.A O ALA 122.A H 3.185 2.283 TRP 123.A N VAL 120.A O TRP 123.A H 3.021 2.123 ILE 124.A N GLN 121.A O ILE 124.A H 3.050 2.119 ARG 125.A N ALA 122.A O ARG 125.A H 3.335 2.423 ARG 125.A NH2 ASP 119.A OD2 ARG 125.A HH22 3.006 2.159 CYS 127.A N ILE 124.A O CYS 127.A H 3.199 2.261 CYS 127.A SG ILE 124.A O no hydrogen 3.358 N/A CYS 127.A SG ARG 125.A O no hydrogen 3.955 N/A