Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1vdt_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A N THR 40.A OG1 LYS 1.A H1 2.890 1.864 LYS 1.A NZ GLU 7.A OE2 LYS 1.A HZ3 2.954 2.000 PHE 3.A N PHE 38.A O PHE 3.A H 2.866 1.903 GLY 4.A N GLU 7.A OE1 GLY 4.A H 3.114 2.135 ARG 5.A NH1 TRP 123.A O ARG 5.A HH11 2.888 1.915 ARG 5.A NH1 ARG 125.A O ARG 5.A HH12 2.894 1.994 ARG 5.A NH2 ARG 125.A O ARG 5.A HH22 3.085 2.259 LEU 8.A N GLY 4.A O LEU 8.A H 2.878 1.934 ALA 9.A N ARG 5.A O ALA 9.A H 2.986 2.025 ALA 10.A N CYS 6.A O ALA 10.A H 3.010 2.065 ALA 11.A N GLU 7.A O ALA 11.A H 3.082 2.132 MET 12.A N LEU 8.A O MET 12.A H 2.849 1.879 LYS 13.A N ALA 9.A O LYS 13.A H 2.897 1.958 LYS 13.A NZ LEU 129.A O LYS 13.A HZ1 3.471 2.513 ARG 14.A N ALA 10.A O ARG 14.A H 3.002 2.038 HIS 15.A N ALA 11.A O HIS 15.A H 3.094 2.219 HIS 15.A ND1 ALA 11.A O HIS 15.A HD1 2.887 2.090 GLY 16.A N LYS 13.A O GLY 16.A H 2.846 1.903 LEU 17.A N MET 12.A O LEU 17.A H 3.035 2.064 TYR 20.A N LEU 17.A O TYR 20.A H 2.933 1.970 GLY 22.A N ASN 19.A O GLY 22.A H 3.074 2.146 TYR 23.A N TYR 20.A O TYR 23.A H 3.218 2.252 LEU 25.A N ASP 18.A OD1 LEU 25.A H 3.048 2.151 ASN 27.A N SER 24.A O ASN 27.A H 2.918 2.084 VAL 29.A N LEU 25.A O VAL 29.A H 3.130 2.176 CYS 30.A N GLY 26.A O CYS 30.A H 3.004 2.061 ALA 31.A N ASN 27.A O ALA 31.A H 2.914 1.980 ALA 32.A N TRP 28.A O ALA 32.A H 3.013 2.043 LYS 33.A N VAL 29.A O LYS 33.A H 2.920 1.973 PHE 34.A N CYS 30.A O PHE 34.A H 3.025 2.077 GLU 35.A N ALA 31.A O GLU 35.A H 2.790 1.896 SER 36.A N ALA 32.A O SER 36.A H 2.955 2.012 ASN 37.A N LYS 33.A O ASN 37.A H 2.896 2.187 PHE 38.A N ALA 32.A O PHE 38.A H 3.511 2.565 ASN 39.A N SER 36.A O ASN 39.A H 3.116 2.229 ASN 39.A ND2 LYS 1.A O ASN 39.A HD21 3.656 2.764 THR 40.A N LYS 1.A O THR 40.A H 2.931 1.958 THR 40.A OG1 LEU 84.A O THR 40.A HG1 3.466 2.920 ALA 42.A N ASN 39.A O ALA 42.A H 3.199 2.229 ASN 44.A N ASP 52.A O ASN 44.A H 3.030 2.147 ARG 45.A NH1 GLY 49.A O ARG 45.A HH11 3.259 2.355 ASN 46.A N SER 50.A O ASN 46.A H 2.823 1.854 ASN 46.A ND2 ASP 52.A OD1 ASN 46.A HD22 3.485 2.643 GLY 49.A N ASN 46.A O GLY 49.A H 2.873 1.962 SER 50.A N ASP 48.A OD1 SER 50.A H 3.108 2.153 SER 50.A OG ASP 48.A OD1 SER 50.A HG 2.667 1.744 THR 51.A N SER 60.A OG THR 51.A H 2.913 1.956 ASP 52.A N ASN 44.A O ASP 52.A H 2.840 1.864 TYR 53.A N ILE 58.A O TYR 53.A H 2.838 1.996 TYR 53.A OH ASP 66.A OD2 TYR 53.A HH 2.709 1.860 GLY 54.A N ALA 42.A O GLY 54.A H 2.910 1.990 GLN 57.A N GLY 54.A O GLN 57.A H 3.029 2.101 GLN 57.A NE2 ALA 42.A O GLN 57.A HE22 3.076 2.418 GLN 57.A NE2 ASP 52.A O GLN 57.A HE22 3.697 3.111 GLN 57.A NE2 GLY 54.A O GLN 57.A HE21 2.952 1.978 ILE 58.A N TYR 53.A O ILE 58.A H 2.930 2.018 ASN 59.A ND2 SER 50.A OG ASN 59.A HD22 2.867 1.917 ASN 59.A ND2 ASP 52.A OD2 ASN 59.A HD21 2.911 1.955 SER 60.A N THR 51.A O SER 60.A H 2.925 2.075 ARG 61.A N ASN 59.A OD1 ARG 61.A H 2.932 2.017 TRP 63.A N ASN 59.A O TRP 63.A H 3.106 2.181 ASN 65.A N ILE 78.A O ASN 65.A H 2.926 1.958 ARG 68.A N ASP 66.A OD1 ARG 68.A H 3.138 2.200 ARG 68.A NH2 THR 51.A OG1 ARG 68.A HH21 3.110 2.114 THR 69.A OG1 ASP 66.A OD1 THR 69.A HG1 2.848 1.958 SER 72.A N THR 69.A O SER 72.A H 3.243 2.544 ARG 73.A N ARG 61.A O ARG 73.A H 2.839 1.930 LEU 75.A N TRP 62.A O LEU 75.A H 2.842 1.869 CYS 76.A N TRP 63.A O CYS 76.A H 2.917 2.007 ASN 77.A N ASN 74.A O ASN 77.A H 2.958 2.095 ILE 78.A N ASN 74.A OD1 ILE 78.A H 3.194 2.302 CYS 80.A N ASN 65.A O CYS 80.A H 2.836 1.901 ALA 82.A N PRO 79.A O ALA 82.A H 2.918 2.043 LEU 83.A N CYS 80.A O LEU 83.A H 2.874 2.017 LEU 84.A N SER 81.A O LEU 84.A H 3.042 2.088 SER 85.A N ALA 82.A O SER 85.A H 3.569 2.615 THR 89.A N ASP 87.A OD1 THR 89.A H 3.082 2.130 VAL 92.A N ILE 88.A O VAL 92.A H 2.940 1.970 ASN 93.A N THR 89.A O ASN 93.A H 2.966 2.000 CYS 94.A N ALA 90.A O CYS 94.A H 3.027 2.092 ALA 95.A N SER 91.A O ALA 95.A H 2.877 1.922 LYS 96.A N VAL 92.A O LYS 96.A H 2.955 2.033 LYS 96.A NZ HIS 15.A O LYS 96.A HZ3 2.907 2.158 LYS 97.A N ASN 93.A O LYS 97.A H 3.479 2.604 ILE 98.A N CYS 94.A O ILE 98.A H 2.968 2.024 VAL 99.A N ALA 95.A O VAL 99.A H 2.847 1.881 SER 100.A N LYS 96.A O SER 100.A H 3.357 2.589 SER 100.A N LYS 97.A O SER 100.A H 3.257 2.545 SER 100.A OG LYS 96.A O SER 100.A HG 2.893 2.174 ASP 101.A N ILE 98.A O ASP 101.A H 2.983 2.050 MET 105.A N TYR 23.A OH MET 105.A H 3.092 2.137 ASN 106.A N ASN 103.A O ASN 106.A H 3.190 2.385 ALA 107.A N GLY 104.A O ALA 107.A H 3.411 2.441 TRP 108.A N MET 105.A O TRP 108.A H 2.984 2.015 TRP 108.A NE1 LEU 56.A O TRP 108.A HE1 2.692 1.854 ALA 110.A N GLU 35.A OE2 ALA 110.A H 3.140 2.235 ARG 112.A N TRP 108.A O ARG 112.A H 3.077 2.112 ARG 112.A NH2 ASN 106.A O ARG 112.A HH21 3.467 2.493 ASN 113.A N VAL 109.A O ASN 113.A H 2.994 2.086 ARG 114.A N ALA 110.A O ARG 114.A H 2.934 2.128 CYS 115.A N TRP 111.A O CYS 115.A H 2.868 1.973 LYS 116.A N TRP 111.A O LYS 116.A H 2.800 1.846 THR 118.A N CYS 115.A O THR 118.A H 2.970 2.021 ALA 122.A N ASP 119.A O ALA 122.A H 3.231 2.303 TRP 123.A N VAL 120.A O TRP 123.A H 3.050 2.132 ILE 124.A N GLN 121.A O ILE 124.A H 3.114 2.171 ARG 125.A N ALA 122.A O ARG 125.A H 3.283 2.354 CYS 127.A N ILE 124.A O CYS 127.A H 3.278 2.354 CYS 127.A SG ILE 124.A O no hydrogen 3.525 N/A CYS 127.A SG ARG 125.A O no hydrogen 3.984 N/A