Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1vkg_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 3.A N VAL 104.A O VAL 3.A H 3.227 2.434 TYR 4.A N ARG 41.A O TYR 4.A H 2.737 1.834 ILE 5.A N ILE 106.A O ILE 5.A H 3.049 2.090 TYR 6.A N VAL 43.A O TYR 6.A H 2.831 1.953 TYR 10.A N SER 7.A O TYR 10.A H 2.766 2.000 TYR 10.A OH ASN 107.A OD1 TYR 10.A HH 2.698 1.803 VAL 11.A N SER 7.A O VAL 11.A H 3.100 2.140 SER 12.A N PRO 8.A O SER 12.A H 2.885 1.931 SER 12.A OG PRO 8.A O SER 12.A HG 2.652 1.878 MET 13.A N GLU 9.A O MET 13.A H 2.943 2.223 CYS 14.A N TYR 10.A O CYS 14.A H 2.830 1.962 SER 16.A OG MET 13.A O SER 16.A HG 2.614 1.827 ARG 23.A NH1 GLY 276.A O ARG 23.A HH12 3.439 2.439 SER 25.A N ASP 15.A OD1 SER 25.A H 3.214 2.267 MET 26.A N LYS 22.A O MET 26.A H 3.339 2.383 VAL 27.A N ARG 23.A O VAL 27.A H 3.049 2.084 HIS 28.A N ALA 24.A O HIS 28.A H 3.009 2.030 HIS 28.A ND1 TYR 4.A OH HIS 28.A HD1 2.651 1.779 SER 29.A N SER 25.A O SER 29.A H 2.701 1.811 LEU 30.A N MET 26.A O LEU 30.A H 3.147 2.294 LEU 30.A N VAL 27.A O LEU 30.A H 3.182 2.464 ILE 31.A N VAL 27.A O ILE 31.A H 3.060 2.076 GLU 32.A N HIS 28.A O GLU 32.A H 2.712 1.764 ALA 33.A N SER 29.A O ALA 33.A H 2.741 1.866 TYR 34.A N LEU 30.A O TYR 34.A H 2.908 2.035 TYR 34.A OH SER 299.A O TYR 34.A HH 2.847 1.888 ALA 35.A N GLU 32.A O ALA 35.A H 2.631 1.818 LEU 36.A N ILE 31.A O LEU 36.A H 2.842 2.029 LYS 38.A N ALA 35.A O LYS 38.A H 3.148 2.384 GLN 39.A N LEU 36.A O GLN 39.A H 2.757 1.850 GLN 39.A NE2 ALA 35.A O GLN 39.A HE22 2.722 2.096 MET 40.A N HIS 37.A O MET 40.A H 2.815 1.901 ARG 41.A N PRO 2.A O ARG 41.A H 2.945 1.989 VAL 43.A N TYR 4.A O VAL 43.A H 2.820 1.865 LYS 46.A N THR 92.A OG1 LYS 46.A H 3.397 2.523 LYS 46.A NZ GLU 52.A OE1 LYS 46.A HZ2 3.289 2.411 ALA 48.A N ALA 84.A O ALA 48.A H 2.854 1.899 SER 49.A N GLU 52.A OE2 SER 49.A H 3.094 2.265 GLU 52.A N SER 49.A O GLU 52.A H 2.770 1.984 MET 53.A N SER 49.A O MET 53.A H 2.898 1.934 ALA 54.A N MET 50.A O ALA 54.A H 2.776 1.868 THR 55.A N GLU 52.A O THR 55.A H 3.011 2.080 PHE 56.A N MET 53.A O PHE 56.A H 3.171 2.245 HIS 57.A N MET 53.A O HIS 57.A H 2.857 1.890 HIS 57.A ND1 MET 53.A O HIS 57.A HD1 3.220 2.289 THR 58.A N LYS 117.A O THR 58.A H 2.819 1.901 TYR 61.A OH TYR 125.A O TYR 61.A HH 2.665 1.769 LEU 62.A N THR 58.A O LEU 62.A H 3.094 2.156 GLN 63.A N ASP 59.A O GLN 63.A H 2.825 1.874 HIS 64.A N ALA 60.A O HIS 64.A H 2.979 2.052 LEU 65.A N TYR 61.A O LEU 65.A H 2.758 1.804 GLN 66.A N LEU 62.A O GLN 66.A H 2.905 1.952 LYS 67.A N GLN 63.A O LYS 67.A H 2.977 2.019 VAL 68.A N HIS 64.A O VAL 68.A H 2.927 1.950 SER 69.A N LEU 65.A O SER 69.A H 2.853 1.893 GLN 70.A N LYS 67.A O GLN 70.A H 3.577 2.626 GLN 70.A NE2 GLN 66.A O GLN 70.A HE22 2.604 2.002 GLY 72.A N VAL 68.A O GLY 72.A H 2.990 2.080 GLY 78.A N SER 69.A O GLY 78.A H 2.850 1.946 PHE 80.A N SER 69.A OG PHE 80.A H 2.726 1.818 TYR 82.A N GLY 78.A O TYR 82.A H 2.808 1.830 ALA 83.A N ILE 79.A O ALA 83.A H 2.745 1.839 ALA 84.A N PHE 80.A O ALA 84.A H 2.806 1.857 ALA 85.A N ASP 81.A O ALA 85.A H 3.135 2.280 ILE 86.A N TYR 82.A O ILE 86.A H 3.135 2.158 GLY 87.A N ALA 83.A O GLY 87.A H 2.830 1.905 GLY 88.A N ALA 84.A O GLY 88.A H 2.911 2.011 ALA 89.A N ALA 85.A O ALA 89.A H 2.757 1.819 THR 90.A N ILE 86.A O THR 90.A H 2.934 1.958 THR 90.A OG1 ILE 86.A O THR 90.A HG1 3.027 2.067 ILE 91.A N GLY 87.A O ILE 91.A H 3.013 2.028 THR 92.A N GLY 88.A O THR 92.A H 2.770 1.884 THR 92.A OG1 GLY 88.A O THR 92.A HG1 2.645 1.817 ALA 93.A N ALA 89.A O ALA 93.A H 2.986 2.094 ALA 94.A N THR 90.A O ALA 94.A H 2.934 1.988 GLN 95.A N ILE 91.A O GLN 95.A H 2.840 1.873 CYS 96.A N THR 92.A O CYS 96.A H 3.031 2.102 LEU 97.A N ALA 93.A O LEU 97.A H 3.170 2.242 ILE 98.A N ALA 94.A O ILE 98.A H 2.828 1.851 ASP 99.A N GLN 95.A O ASP 99.A H 2.747 1.838 MET 101.A N CYS 96.A O MET 101.A H 3.007 2.097 ALA 105.A N THR 269.A O ALA 105.A H 2.944 2.077 ILE 106.A N VAL 3.A O ILE 106.A H 2.754 1.953 ASN 107.A N ILE 271.A O ASN 107.A H 2.876 1.943 ASN 107.A ND2 THR 90.A OG1 ASN 107.A HD22 3.134 2.320 TRP 108.A NE1 THR 290.A OG1 TRP 108.A HE1 3.175 2.400 GLY 110.A N ASN 107.A O GLY 110.A H 3.074 2.138 GLY 111.A N ASP 128.A OD1 GLY 111.A H 3.140 2.239 GLY 111.A N ASP 128.A OD2 GLY 111.A H 3.224 2.353 TRP 112.A N ASP 128.A OD2 TRP 112.A H 2.897 2.052 TRP 112.A NE1 SER 109.A O TRP 112.A HE1 2.760 1.916 HIS 113.A N GLY 111.A O HIS 113.A H 2.758 2.038 HIS 114.A ND1 ASP 154.A OD2 HIS 114.A HD1 2.948 2.033 LYS 116.A N GLU 119.A O LYS 116.A H 2.808 1.857 LYS 116.A NZ ALA 115.A O LYS 116.A HZ3 3.270 2.334 GLU 119.A N LYS 116.A O GLU 119.A H 3.452 2.466 SER 121.A N CYS 124.A O SER 121.A H 2.967 2.193 CYS 124.A N SER 121.A O CYS 124.A H 2.817 1.937 ASN 127.A ND2 ALA 115.A O ASN 127.A HD22 2.942 1.973 VAL 130.A N ASN 127.A OD1 VAL 130.A H 2.880 1.953 LEU 131.A N ASN 127.A O LEU 131.A H 3.246 2.274 GLY 132.A N ASP 128.A O GLY 132.A H 3.210 2.418 GLY 132.A N ALA 129.A O GLY 132.A H 3.139 2.436 ILE 133.A N ALA 129.A O ILE 133.A H 2.947 1.981 LEU 134.A N VAL 130.A O LEU 134.A H 2.773 1.816 ARG 135.A N LEU 131.A O ARG 135.A H 3.198 2.274 LEU 136.A N GLY 132.A O LEU 136.A H 2.831 2.050 LEU 136.A N ILE 133.A O LEU 136.A H 2.661 1.948 ARG 137.A N ILE 133.A O ARG 137.A H 2.963 2.064 ARG 137.A NE PHE 140.A O ARG 137.A HE 3.167 2.209 ARG 137.A NH2 GLU 141.A O ARG 137.A HH22 3.197 2.319 LYS 139.A N LEU 136.A O LYS 139.A H 3.031 2.068 LYS 139.A NZ ILE 98.A O LYS 139.A HZ1 3.175 2.145 PHE 140.A N LEU 136.A O PHE 140.A H 2.832 1.883 ARG 142.A NH1 VAL 348.A OXT ARG 142.A HH11 3.208 2.446 ARG 142.A NH2 VAL 348.A OXT ARG 142.A HH21 3.431 2.728 ILE 143.A N LYS 165.A O ILE 143.A H 3.028 2.097 LEU 144.A N ALA 230.A O LEU 144.A H 3.102 2.194 TYR 145.A N MET 167.A O TYR 145.A H 2.773 1.875 VAL 146.A N VAL 232.A O VAL 146.A H 2.941 1.995 ASP 147.A N VAL 169.A O ASP 147.A H 2.760 1.900 LEU 148.A N GLN 234.A O LEU 148.A H 2.901 1.926 LEU 150.A N ASP 238.A OD1 LEU 150.A H 3.016 2.053 HIS 151.A N ASP 149.A OD2 HIS 151.A H 2.816 1.882 HIS 151.A ND1 ASP 149.A OD2 no hydrogen 3.016 N/A GLY 153.A N SER 170.A OG GLY 153.A H 3.008 2.032 GLU 157.A N GLY 153.A O GLU 157.A H 3.273 2.293 ASP 158.A N ASP 154.A O ASP 158.A H 2.752 1.864 ALA 159.A N GLY 155.A O ALA 159.A H 2.895 1.983 PHE 160.A N VAL 156.A O PHE 160.A H 3.108 2.209 SER 161.A N ASP 158.A O SER 161.A H 3.104 2.135 THR 163.A N PHE 160.A O THR 163.A H 3.467 2.495 LYS 165.A N THR 163.A OG1 LYS 165.A H 2.889 1.958 MET 167.A N ILE 143.A O MET 167.A H 2.875 1.903 THR 168.A N TYR 196.A O THR 168.A H 3.354 2.477 VAL 169.A N TYR 145.A O VAL 169.A H 2.694 1.854 SER 170.A N VAL 198.A O SER 170.A H 3.035 2.142 LEU 171.A N ASP 147.A O LEU 171.A H 3.220 2.239 HIS 172.A N VAL 200.A O HIS 172.A H 3.268 2.314 HIS 172.A ND1 LYS 173.A O HIS 172.A HD1 3.373 2.416 LYS 173.A N LEU 150.A O LYS 173.A H 2.744 1.868 LYS 173.A NZ ASP 204.A OD2 LYS 173.A HZ2 3.334 2.327 PHE 174.A N ILE 202.A O PHE 174.A H 3.085 2.187 PHE 178.A N SER 175.A O PHE 178.A H 2.745 1.837 GLY 183.A N ASP 187.A OD1 GLY 183.A H 3.177 2.361 ASP 184.A N ASP 187.A OD1 ASP 184.A H 2.840 2.144 VAL 185.A N ASP 184.A OD1 VAL 185.A H 2.782 2.072 ASP 187.A N ASP 184.A O ASP 187.A H 2.929 2.015 LEU 190.A N SER 161.A O LEU 190.A H 2.938 2.059 TYR 195.A N VAL 188.A O TYR 195.A H 2.658 1.774 TYR 196.A OH VAL 348.A OXT TYR 196.A HH 2.797 1.936 VAL 198.A N THR 168.A O VAL 198.A H 2.746 1.827 ASN 199.A ND2 GLU 157.A OE1 ASN 199.A HD21 3.028 2.133 ASN 199.A ND2 ASP 187.A O ASN 199.A HD22 2.773 2.191 VAL 200.A N SER 170.A O VAL 200.A H 2.890 1.921 ILE 202.A N HIS 172.A O ILE 202.A H 2.889 1.988 GLN 203.A N ASN 328.A OD1 GLN 203.A H 3.272 2.531 GLN 203.A NE2 PHE 174.A O GLN 203.A HE21 3.418 2.679 GLY 205.A N SER 247.A O GLY 205.A H 2.869 1.924 TYR 211.A N GLN 207.A O TYR 211.A H 3.040 2.071 TYR 212.A N ASP 208.A O TYR 212.A H 3.206 2.265 GLN 213.A N GLU 209.A O GLN 213.A H 3.192 2.245 ILE 214.A N LYS 210.A O ILE 214.A H 3.105 2.152 CYS 215.A N TYR 211.A O CYS 215.A H 2.863 1.895 GLU 216.A N TYR 212.A O GLU 216.A H 2.771 1.827 SER 217.A N GLN 213.A O SER 217.A H 3.155 2.180 SER 217.A OG GLN 213.A O SER 217.A HG 2.899 1.982 VAL 218.A N ILE 214.A O VAL 218.A H 3.115 2.179 LEU 219.A N CYS 215.A O LEU 219.A H 2.858 1.887 LYS 220.A N GLU 216.A O LYS 220.A H 2.788 1.884 LYS 220.A NZ GLU 221.A OE2 LYS 220.A HZ2 3.395 2.533 GLU 221.A N SER 217.A O GLU 221.A H 2.900 1.927 VAL 222.A N VAL 218.A O VAL 222.A H 3.022 2.046 TYR 223.A N LEU 219.A O TYR 223.A H 2.888 1.939 ALA 225.A N GLU 221.A O ALA 225.A H 2.972 2.171 ASN 227.A N TYR 223.A O ASN 227.A H 2.742 1.999 LYS 229.A N ARG 142.A O LYS 229.A H 2.917 1.999 VAL 231.A N ALA 268.A O VAL 231.A H 2.825 1.868 VAL 232.A N LEU 144.A O VAL 232.A H 2.886 1.999 LEU 233.A N LEU 270.A O LEU 233.A H 2.906 1.931 GLN 234.A N VAL 146.A O GLN 234.A H 3.056 2.132 LEU 235.A N LEU 272.A O LEU 235.A H 3.010 2.089 ALA 237.A N GLY 275.A O ALA 237.A H 2.755 1.916 ALA 241.A N MET 250.A O ALA 241.A H 2.894 1.933 MET 245.A N ASP 243.A OD2 MET 245.A H 2.856 1.979 CYS 246.A N ASP 243.A O CYS 246.A H 2.764 1.892 SER 247.A OG MET 245.A O SER 247.A HG 3.032 2.096 ASN 249.A N ILE 206.A O ASN 249.A H 2.901 1.993 ASN 249.A ND2 SER 322.A O ASN 249.A HD21 2.834 1.861 ASN 249.A ND2 ARG 324.A O ASN 249.A HD22 3.687 3.010 MET 250.A N THR 239.A O MET 250.A H 2.912 1.992 THR 251.A N ASP 208.A OD1 THR 251.A H 3.077 2.203 GLY 254.A N THR 251.A O GLY 254.A H 2.987 2.223 GLY 256.A N PRO 252.A O GLY 256.A H 2.735 1.959 LYS 257.A N VAL 253.A O LYS 257.A H 2.943 2.161 LYS 257.A N GLY 254.A O LYS 257.A H 2.888 2.134 CYS 258.A N GLY 254.A O CYS 258.A H 3.151 2.226 LEU 259.A N ILE 255.A O LEU 259.A H 2.763 1.892 LYS 260.A N GLY 256.A O LYS 260.A H 2.860 1.884 TYR 261.A N LYS 257.A O TYR 261.A H 2.950 2.005 ILE 262.A N CYS 258.A O ILE 262.A H 3.361 2.538 ILE 262.A N LEU 259.A O ILE 262.A H 2.906 2.173 LEU 263.A N LEU 259.A O LEU 263.A H 2.877 1.950 GLN 264.A N LYS 260.A O GLN 264.A H 2.958 1.998 TRP 265.A N ILE 262.A O TRP 265.A H 2.678 1.821 GLN 266.A N LEU 263.A O GLN 266.A H 2.972 2.068 GLN 266.A NE2 GLN 264.A O GLN 266.A HE22 2.860 1.924 THR 269.A N LYS 103.A O THR 269.A H 2.737 1.774 THR 269.A OG1 LEU 267.A O THR 269.A HG1 2.914 1.999 LEU 270.A N VAL 231.A O LEU 270.A H 2.871 1.953 ILE 271.A N ALA 105.A O ILE 271.A H 2.945 2.026 LEU 272.A N LEU 233.A O LEU 272.A H 2.841 1.929 GLY 273.A N GLY 110.A O GLY 273.A H 2.820 2.017 GLY 275.A N ASP 149.A OD1 GLY 275.A H 3.000 2.128 TYR 277.A N ASP 243.A OD1 TYR 277.A H 2.865 2.180 THR 282.A N ASN 278.A O THR 282.A H 2.871 1.925 ALA 283.A N LEU 279.A O ALA 283.A H 2.919 1.958 ARG 284.A N ALA 280.A O ARG 284.A H 2.834 2.036 ARG 284.A NE VAL 316.A O ARG 284.A HE 2.913 2.249 ARG 284.A NH2 VAL 316.A O ARG 284.A HH22 2.970 2.076 CYS 285.A N ASN 281.A O CYS 285.A H 2.717 1.789 TRP 286.A N THR 282.A O TRP 286.A H 2.925 1.948 TRP 286.A NE1 LEU 235.A O TRP 286.A HE1 2.945 2.018 THR 287.A N ALA 283.A O THR 287.A H 2.991 2.097 THR 287.A OG1 ALA 283.A O THR 287.A HG1 2.604 1.776 TYR 288.A N ARG 284.A O TYR 288.A H 2.902 2.076 LEU 289.A N CYS 285.A O LEU 289.A H 2.776 1.805 THR 290.A N TRP 286.A O THR 290.A H 2.775 1.836 THR 290.A OG1 TRP 286.A O THR 290.A HG1 2.714 1.809 GLY 291.A N THR 287.A O GLY 291.A H 3.233 2.551 GLY 291.A N TYR 288.A O GLY 291.A H 2.697 1.868 VAL 292.A N TYR 288.A O VAL 292.A H 3.077 2.140 ILE 293.A N LEU 289.A O ILE 293.A H 2.969 1.990 LEU 294.A N THR 290.A O LEU 294.A H 3.350 2.598 GLY 295.A N VAL 292.A O GLY 295.A H 3.045 2.251 LYS 296.A N GLY 291.A O LYS 296.A H 3.062 2.083 GLU 301.A N SER 299.A OG GLU 301.A H 2.948 1.987 ILE 302.A N TYR 315.A O ILE 302.A H 3.488 2.514 HIS 305.A ND1 SER 29.A OG HIS 305.A HD1 3.157 2.309 PHE 308.A N HIS 305.A O PHE 308.A H 2.855 1.895 ALA 310.A N PHE 307.A O ALA 310.A H 3.178 2.248 TYR 311.A N PHE 308.A O TYR 311.A H 2.930 1.963 LEU 317.A N SER 300.A O LEU 317.A H 3.239 2.465 SER 322.A N ASN 249.A OD1 SER 322.A H 2.685 1.845 ARG 324.A NH1 PHE 248.A O ARG 324.A HH11 3.382 2.451 ARG 327.A N ASP 204.A O ARG 327.A H 2.883 1.909 HIS 331.A ND1 GLN 335.A OE1 HIS 331.A HD1 2.940 1.980 HIS 331.A NE2 GLU 329.A OE1 no hydrogen 2.729 N/A ILE 333.A N GLU 329.A O ILE 333.A H 3.559 2.582 GLN 334.A NE2 ASN 338.A OD1 GLN 334.A HE22 3.248 2.271 GLN 335.A N HIS 331.A O GLN 335.A H 2.756 1.878 ILE 336.A N ARG 332.A O ILE 336.A H 2.875 1.916 LEU 337.A N ILE 333.A O LEU 337.A H 2.846 1.866 ASN 338.A N GLN 334.A O ASN 338.A H 2.914 1.982 TYR 339.A N GLN 335.A O TYR 339.A H 2.947 1.972 ILE 340.A N ILE 336.A O ILE 340.A H 2.899 1.919 LYS 341.A N LEU 337.A O LYS 341.A H 2.945 1.970 LYS 341.A NZ GLU 221.A OE2 LYS 341.A HZ2 3.432 2.651 GLY 342.A N ASN 338.A O GLY 342.A H 2.938 2.075 ASN 343.A N TYR 339.A O ASN 343.A H 2.807 1.836 LEU 344.A N ILE 340.A O LEU 344.A H 2.810 1.875 LYS 345.A N LYS 341.A O LYS 345.A H 3.132 2.433 LYS 345.A N GLY 342.A O LYS 345.A H 2.664 1.875 HIS 346.A N ASN 343.A O HIS 346.A H 2.997 2.088 VAL 347.A N LEU 344.A O VAL 347.A H 2.808 1.872 VAL 348.A N TYR 196.A OH VAL 348.A H 2.884 1.965