Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1vrc_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ALA 3.A N GLY 60.A O ALA 3.A H 3.046 2.140 ILE 4.A N ASN 29.A O ILE 4.A H 3.405 2.456 VAL 5.A N LEU 62.A O VAL 5.A H 3.002 2.048 ILE 6.A N GLY 31.A O ILE 6.A H 2.916 1.970 GLY 7.A N LEU 64.A O GLY 7.A H 3.036 2.093 HIS 9.A N ASP 66.A OD2 HIS 9.A H 3.072 2.141 HIS 9.A ND1 ASP 66.A OD2 HIS 9.A HD1 2.132 1.272 GLY 10.A N PHE 35.A O GLY 10.A H 2.774 1.968 ALA 13.A N THR 8.A OG1 ALA 13.A H 3.282 2.596 LEU 16.A N ALA 12.A O LEU 16.A H 2.942 2.038 LEU 17.A N ALA 13.A O LEU 17.A H 3.119 2.180 LYS 18.A N GLU 14.A O LYS 18.A H 2.982 2.079 LYS 18.A NZ GLU 14.A OE2 LYS 18.A HZ1 3.312 2.460 THR 19.A N GLN 15.A O THR 19.A H 2.867 1.960 ALA 20.A N LEU 16.A O ALA 20.A H 3.027 2.085 GLU 21.A N LEU 17.A O GLU 21.A H 2.857 1.910 MET 22.A N LYS 18.A O MET 22.A H 2.933 2.224 MET 22.A N THR 19.A O MET 22.A H 3.018 2.294 LEU 23.A N THR 19.A O LEU 23.A H 3.187 2.358 LEU 24.A N ALA 20.A O LEU 24.A H 2.734 1.800 GLY 25.A N GLU 21.A O GLY 25.A H 2.764 1.919 GLN 27.A N GLU 21.A OE2 GLN 27.A H 2.880 1.900 GLN 27.A NE2 GLY 25.A O GLN 27.A HE21 3.230 2.520 ASN 29.A ND2 ASP 56.A O ASN 29.A HD22 3.111 2.137 GLY 31.A N ILE 4.A O GLY 31.A H 2.880 1.928 ILE 33.A N ILE 6.A O ILE 33.A H 3.041 2.150 PHE 35.A N GLY 10.A O PHE 35.A H 3.144 2.202 VAL 36.A N GLU 39.A OE1 VAL 36.A H 2.855 1.882 GLU 39.A N VAL 36.A O GLU 39.A H 3.020 2.078 ASN 40.A ND2 GLU 39.A O ASN 40.A HD21 2.982 2.003 THR 43.A N ASN 40.A O THR 43.A H 3.173 2.484 LEU 44.A N ASN 40.A O LEU 44.A H 3.183 2.223 ILE 45.A N ALA 41.A O ILE 45.A H 2.801 1.917 GLU 46.A N GLU 42.A O GLU 46.A H 3.223 2.282 LYS 47.A N THR 43.A O LYS 47.A H 3.034 2.106 LYS 47.A NZ ASP 34.A O LYS 47.A HZ2 3.311 2.632 LYS 47.A NZ ASP 34.A OD1 LYS 47.A HZ1 3.256 2.283 LYS 47.A NZ GLU 39.A OE2 LYS 47.A HZ3 2.632 1.773 TYR 48.A N LEU 44.A O TYR 48.A H 2.823 1.868 ASN 49.A N ILE 45.A O ASN 49.A H 2.884 1.924 ALA 50.A N GLU 46.A O ALA 50.A H 2.928 2.005 GLN 51.A N LYS 47.A O GLN 51.A H 3.141 2.267 LEU 52.A N TYR 48.A O LEU 52.A H 2.859 1.908 ALA 53.A N ASN 49.A O ALA 53.A H 2.989 2.083 LYS 54.A N GLN 51.A O LYS 54.A H 3.040 2.181 LYS 54.A NZ ALA 50.A O LYS 54.A HZ2 2.686 1.730 LEU 55.A N LEU 52.A O LEU 55.A H 2.794 1.874 ASP 56.A N ASN 29.A OD1 ASP 56.A H 2.934 1.969 THR 58.A N ASP 56.A OD1 THR 58.A H 2.867 1.915 GLY 60.A N THR 57.A O GLY 60.A H 3.197 2.387 VAL 61.A N HIS 85.A O VAL 61.A H 2.788 1.852 LEU 62.A N ALA 3.A O LEU 62.A H 2.919 1.965 PHE 63.A N GLU 87.A O PHE 63.A H 2.872 1.894 LEU 64.A N VAL 5.A O LEU 64.A H 2.855 1.893 VAL 65.A N ILE 89.A O VAL 65.A H 2.882 1.923 ASP 66.A N GLY 7.A O ASP 66.A H 3.235 2.438 THR 67.A N ASP 66.A OD1 THR 67.A H 2.689 1.873 GLY 70.A N THR 67.A O GLY 70.A H 3.523 2.547 ASN 74.A N GLY 70.A O ASN 74.A H 2.752 1.786 ALA 75.A N SER 71.A O ALA 75.A H 2.868 1.899 ALA 76.A N PRO 72.A O ALA 76.A H 3.177 2.240 SER 77.A N PHE 73.A O SER 77.A H 2.872 1.961 ARG 78.A N ASN 74.A O ARG 78.A H 3.223 2.349 ILE 79.A N ALA 75.A O ILE 79.A H 3.379 2.559 ILE 79.A N ALA 76.A O ILE 79.A H 3.094 2.371 VAL 80.A N ALA 76.A O VAL 80.A H 3.110 2.162 VAL 81.A N SER 77.A O VAL 81.A H 3.295 2.495 LYS 83.A N VAL 80.A O LYS 83.A H 2.988 2.049 LYS 83.A NZ ILE 79.A O LYS 83.A HZ1 3.002 2.080 GLU 87.A N VAL 61.A O GLU 87.A H 3.019 2.118 VAL 88.A N GLU 87.A OE1 VAL 88.A H 2.701 1.776 ILE 89.A N PHE 63.A O ILE 89.A H 2.893 1.931 GLY 91.A N ASP 66.A O GLY 91.A H 3.036 2.277 VAL 92.A N VAL 65.A O VAL 92.A H 3.127 2.153 ASN 93.A ND2 GLY 121.A O ASN 93.A HD22 2.844 2.010 MET 96.A N ASN 93.A OD1 MET 96.A H 2.785 1.874 LEU 97.A N ASN 93.A O LEU 97.A H 3.006 2.038 VAL 98.A N ILE 94.A O VAL 98.A H 2.869 1.890 GLU 99.A N PRO 95.A O GLU 99.A H 2.993 2.026 THR 100.A N MET 96.A O THR 100.A H 2.995 2.074 LEU 101.A N LEU 97.A O LEU 101.A H 2.940 1.995 MET 102.A N VAL 98.A O MET 102.A H 2.973 2.064 ALA 103.A N GLU 99.A O ALA 103.A H 2.982 2.027 ARG 104.A N THR 100.A O ARG 104.A H 3.049 2.155 ARG 104.A NH1 THR 1.A OG1 ARG 104.A HH11 3.240 2.338 ARG 104.A NH1 GLU 28.A O ARG 104.A HH12 2.956 1.992 ASP 105.A N MET 102.A O ASP 105.A H 3.493 2.626 ASP 106.A N ALA 103.A O ASP 106.A H 2.903 2.013 ASP 107.A N ARG 104.A O ASP 107.A H 3.240 2.426 SER 109.A N GLU 112.A OE1 SER 109.A H 3.284 2.316 GLU 112.A N SER 109.A OG GLU 112.A H 3.215 2.296 LEU 113.A N SER 109.A O LEU 113.A H 2.993 2.045 VAL 114.A N PHE 110.A O VAL 114.A H 2.982 2.010 ALA 115.A N ASP 111.A O ALA 115.A H 3.082 2.129 LEU 116.A N GLU 112.A O LEU 116.A H 2.993 2.058 ALA 117.A N LEU 113.A O ALA 117.A H 2.879 1.928 VAL 118.A N VAL 114.A O VAL 118.A H 3.210 2.253 GLU 119.A N ALA 115.A O GLU 119.A H 3.010 2.048 THR 120.A N LEU 116.A O THR 120.A H 2.887 1.918 THR 120.A OG1 ALA 117.A O THR 120.A HG1 3.344 2.528 GLY 121.A N ALA 117.A O GLY 121.A H 3.004 2.145 ARG 122.A N VAL 118.A O ARG 122.A H 3.102 2.156 GLU 123.A N GLU 119.A O GLU 123.A H 2.927 1.980 GLY 124.A N THR 120.A O GLY 124.A H 2.953 2.230 VAL 125.A N ARG 122.A O VAL 125.A H 3.225 2.292