Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1xad_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N GLY 33.A O MET 1.A H1 2.815 1.779 LYS 2.A N GLU 65.A OE1 LYS 2.A H 2.865 2.038 VAL 3.A N ALA 35.A O VAL 3.A H 2.984 2.055 ALA 4.A N ALA 66.A O ALA 4.A H 2.887 1.976 VAL 5.A N GLU 37.A O VAL 5.A H 2.913 1.930 LEU 6.A N LEU 68.A O LEU 6.A H 2.989 2.015 ASP 9.A N SER 71.A O ASP 9.A H 2.592 1.774 ILE 11.A N SER 275.A O ILE 11.A H 2.779 1.855 GLY 12.A N ASP 9.A O GLY 12.A H 2.926 2.029 VAL 15.A N ILE 11.A O VAL 15.A H 3.041 2.074 THR 16.A N GLY 12.A O THR 16.A H 2.845 1.956 THR 16.A OG1 GLY 12.A O THR 16.A HG1 2.602 1.859 GLU 17.A N PRO 13.A O GLU 17.A H 2.968 2.034 ALA 18.A N GLU 14.A O ALA 18.A H 3.246 2.377 ALA 19.A N VAL 15.A O ALA 19.A H 3.386 2.488 LEU 20.A N THR 16.A O LEU 20.A H 3.258 2.292 LYS 21.A N GLU 17.A O LYS 21.A H 2.911 1.950 LYS 21.A NZ GLU 334.A OE2 LYS 21.A HZ1 3.294 2.270 VAL 22.A N ALA 18.A O VAL 22.A H 3.131 2.215 LEU 23.A N ALA 19.A O LEU 23.A H 2.956 2.046 ARG 24.A N LEU 20.A O ARG 24.A H 2.732 1.819 ARG 24.A NH2 GLU 17.A OE2 ARG 24.A HH22 2.885 2.092 ALA 25.A N LYS 21.A O ALA 25.A H 3.319 2.385 LEU 26.A N VAL 22.A O LEU 26.A H 3.184 2.249 ASP 27.A N LEU 23.A O ASP 27.A H 2.948 2.009 GLU 28.A N ARG 24.A O GLU 28.A H 2.831 1.899 ALA 29.A N ALA 25.A O ALA 29.A H 2.949 2.013 GLU 30.A N LEU 26.A O GLU 30.A H 2.774 1.905 GLY 31.A N GLU 28.A O GLY 31.A H 3.068 2.241 LEU 32.A N ASP 27.A O LEU 32.A H 3.387 2.543 LEU 34.A N ASP 27.A OD1 LEU 34.A H 2.827 2.083 ALA 35.A N MET 1.A O ALA 35.A H 2.848 1.894 GLU 37.A N VAL 3.A O GLU 37.A H 3.483 2.596 PHE 39.A N VAL 5.A O PHE 39.A H 2.872 1.994 GLY 42.A N PRO 52.A O GLY 42.A H 2.865 1.902 GLY 43.A N ASP 9.A OD2 GLY 43.A H 2.695 1.958 ALA 45.A N GLY 42.A O ALA 45.A H 2.773 2.076 ILE 46.A N GLY 42.A O ILE 46.A H 2.845 1.902 ASP 47.A N GLY 43.A O ASP 47.A H 3.124 2.175 ALA 48.A N ALA 44.A O ALA 48.A H 2.823 1.897 PHE 49.A N ALA 45.A O PHE 49.A H 2.625 1.886 GLY 50.A N ILE 46.A O GLY 50.A H 2.718 1.914 GLU 51.A N ALA 45.A O GLU 51.A H 3.434 2.483 THR 57.A N PRO 54.A O THR 57.A H 2.757 2.052 ARG 58.A N PRO 54.A O ARG 58.A H 2.930 1.993 LYS 59.A N GLU 55.A O LYS 59.A H 2.992 2.032 GLY 60.A N PRO 56.A O GLY 60.A H 2.881 2.019 VAL 61.A N THR 57.A O VAL 61.A H 3.027 2.079 GLU 62.A N ARG 58.A O GLU 62.A H 3.056 2.128 GLU 63.A N LYS 59.A O GLU 63.A H 3.080 2.317 GLU 63.A N GLY 60.A O GLU 63.A H 3.318 2.493 ALA 64.A N GLY 60.A O ALA 64.A H 3.031 2.181 GLU 65.A N LYS 2.A O GLU 65.A H 2.670 1.776 ALA 66.A N LYS 2.A O ALA 66.A H 3.285 2.602 VAL 67.A N PRO 267.A O VAL 67.A H 3.067 2.173 LEU 68.A N ALA 4.A O LEU 68.A H 2.984 2.111 LEU 69.A N PHE 269.A O LEU 69.A H 3.014 2.084 GLY 70.A N LEU 6.A O GLY 70.A H 3.057 2.125 GLY 73.A N ASP 9.A OD2 GLY 73.A H 3.139 2.219 TRP 77.A N GLY 74.A O TRP 77.A H 3.353 2.407 TRP 77.A NE1 ASP 47.A OD1 TRP 77.A HE1 3.060 2.110 ASP 78.A N PRO 75.A O ASP 78.A H 2.898 2.095 GLN 79.A NE2 LYS 76.A O GLN 79.A HE22 3.243 2.651 GLN 79.A NE2 ASN 80.A OD1 GLN 79.A HE22 2.868 1.995 ASN 80.A N TRP 77.A O ASN 80.A H 2.640 1.881 LYS 88.A N ARG 85.A O LYS 88.A H 3.129 2.220 GLY 89.A N PRO 86.A O GLY 89.A H 3.153 2.388 LEU 90.A N GLU 87.A O LEU 90.A H 2.730 1.949 LEU 91.A N LYS 88.A O LEU 91.A H 2.936 2.069 SER 92.A N LYS 88.A O SER 92.A H 2.939 1.986 SER 92.A OG LYS 88.A O SER 92.A HG 3.230 2.292 ILE 93.A N GLY 89.A O ILE 93.A H 2.878 1.916 LYS 95.A N LEU 91.A O LYS 95.A H 2.863 1.977 GLN 96.A N SER 92.A O GLN 96.A H 3.010 2.036 GLN 96.A NE2 ARG 58.A O GLN 96.A HE21 3.411 2.499 LEU 97.A N ILE 93.A O LEU 97.A H 3.200 2.242 ASP 98.A N LYS 95.A O ASP 98.A H 3.030 2.112 LEU 99.A N ARG 94.A O LEU 99.A H 3.392 2.420 PHE 100.A N LEU 262.A O PHE 100.A H 2.833 1.924 ASN 102.A N ARG 132.A O ASN 102.A H 2.816 1.974 ASN 102.A ND2 SER 259.A OG ASN 102.A HD21 3.032 2.090 ASN 102.A ND2 ALA 260.A O ASN 102.A HD22 3.498 2.974 LEU 103.A N ALA 260.A O LEU 103.A H 2.876 1.905 ARG 104.A N ILE 130.A O ARG 104.A H 3.088 2.193 VAL 106.A N PHE 128.A O VAL 106.A H 3.007 2.046 VAL 108.A N VAL 126.A O VAL 108.A H 3.458 2.532 LEU 112.A N PHE 109.A O LEU 112.A H 2.640 1.815 SER 113.A N GLU 110.A O SER 113.A H 2.922 1.958 SER 113.A OG GLU 110.A O SER 113.A HG 3.153 2.369 ALA 115.A N LEU 112.A O ALA 115.A H 2.989 2.035 SER 116.A N SER 113.A O SER 116.A H 2.970 2.027 TYR 122.A N LYS 119.A O TYR 122.A H 2.868 1.942 ILE 123.A N LYS 120.A O ILE 123.A H 2.895 2.091 ASP 124.A N LYS 120.A O ASP 124.A H 3.135 2.203 VAL 126.A N ILE 123.A O VAL 126.A H 3.050 2.132 PHE 128.A N VAL 106.A O PHE 128.A H 3.004 2.085 VAL 129.A N ASP 231.A O VAL 129.A H 2.783 1.900 ILE 130.A N ARG 104.A O ILE 130.A H 2.826 1.925 VAL 131.A N VAL 233.A O VAL 131.A H 2.833 1.885 ARG 132.A N ASN 102.A O ARG 132.A H 3.036 2.070 ARG 132.A NE ASN 237.A OD1 ARG 132.A HE 2.910 2.105 ARG 132.A NH2 ASN 237.A OD1 ARG 132.A HH21 2.811 1.940 GLU 133.A N THR 235.A O GLU 133.A H 3.036 2.096 LEU 134.A N PHE 100.A O LEU 134.A H 2.998 2.131 GLY 136.A N GLU 133.A OE1 GLY 136.A H 2.841 2.061 ILE 138.A N GLU 155.A OE1 ILE 138.A H 3.026 2.104 PHE 140.A N GLY 137.A O PHE 140.A H 2.801 1.884 GLY 141.A N GLY 137.A O GLY 141.A H 2.696 1.787 ARG 144.A NH1 TYR 139.A O ARG 144.A HH12 2.944 2.023 ARG 144.A NH1 GLY 141.A O ARG 144.A HH11 3.008 2.353 ARG 144.A NH2 TYR 139.A O ARG 144.A HH22 3.208 2.395 GLY 145.A N TRP 152.A O GLY 145.A H 3.313 2.390 SER 147.A N GLU 150.A O SER 147.A H 2.647 1.848 GLU 150.A N SER 147.A OG GLU 150.A H 2.705 1.915 TRP 152.A N GLY 145.A O TRP 152.A H 3.201 2.251 THR 154.A OG1 PRO 143.A O THR 154.A HG1 2.892 1.979 ARG 156.A NE GLU 142.A O ARG 156.A HE 2.794 1.919 ARG 156.A NH2 GLU 142.A O ARG 156.A HH21 2.978 2.116 TYR 157.A OH GLU 133.A OE1 TYR 157.A HH 2.997 2.294 SER 158.A N GLU 161.A OE2 SER 158.A H 2.939 2.098 LYS 159.A NZ GLU 201.A OE1 LYS 159.A HZ2 3.174 2.213 VAL 162.A N SER 158.A O VAL 162.A H 3.278 2.418 VAL 162.A N LYS 159.A O VAL 162.A H 2.705 2.002 GLU 163.A N LYS 159.A O GLU 163.A H 2.874 1.937 ARG 164.A N PRO 160.A O ARG 164.A H 2.917 1.984 ARG 164.A NH1 THR 135.A OG1 ARG 164.A HH12 3.258 2.400 ALA 166.A N VAL 162.A O ALA 166.A H 3.057 2.167 ARG 167.A N GLU 163.A O ARG 167.A H 3.011 2.100 ARG 167.A N ARG 164.A O ARG 167.A H 2.879 2.161 ARG 167.A NH1 TYR 206.A OH ARG 167.A HH11 2.872 1.886 VAL 168.A N ARG 164.A O VAL 168.A H 3.546 2.582 ALA 169.A N VAL 165.A O ALA 169.A H 3.209 2.362 PHE 170.A N ALA 166.A O PHE 170.A H 3.081 2.215 GLU 171.A N ARG 167.A O GLU 171.A H 2.749 1.795 ALA 172.A N VAL 168.A O ALA 172.A H 2.630 1.837 ALA 173.A N ALA 169.A O ALA 173.A H 2.945 2.131 ARG 174.A N PHE 170.A O ARG 174.A H 2.864 1.962 ARG 176.A N ALA 173.A O ARG 176.A H 2.971 2.042 ARG 176.A NE ASP 231.A OD1 ARG 176.A HE 2.939 2.211 ARG 176.A NH1 ASP 127.A OD1 ARG 176.A HH12 3.139 2.217 ARG 176.A NH2 ASP 127.A OD1 ARG 176.A HH22 3.403 2.552 ARG 176.A NH2 ASP 231.A OD1 ARG 176.A HH21 3.025 2.280 ARG 177.A N ASP 231.A OD1 ARG 177.A H 3.268 2.507 ARG 177.A NH1 ASP 127.A O ARG 177.A HH12 3.514 2.772 ARG 177.A NH2 ASP 127.A O ARG 177.A HH22 2.828 1.845 LYS 178.A N ALA 173.A O LYS 178.A H 3.147 2.256 HIS 179.A N ASP 231.A OD2 HIS 179.A H 3.224 2.274 VAL 180.A N ALA 210.A O VAL 180.A H 2.905 1.920 VAL 181.A N VAL 232.A O VAL 181.A H 2.996 2.114 SER 182.A N GLU 212.A O SER 182.A H 2.899 1.988 VAL 183.A N VAL 234.A O VAL 183.A H 3.120 2.230 ASP 184.A N GLN 214.A O ASP 184.A H 3.004 2.068 LYS 185.A NZ ASN 187.A OD1 LYS 185.A HZ3 2.845 2.105 LYS 185.A NZ ASP 217.A OD2 LYS 185.A HZ1 3.090 2.295 ALA 186.A N ASP 184.A OD1 ALA 186.A H 3.213 2.292 VAL 188.A N LYS 185.A O VAL 188.A H 3.224 2.279 LEU 189.A N LYS 185.A O LEU 189.A H 2.843 1.870 PHE 194.A N GLU 190.A O PHE 194.A H 3.049 2.071 TRP 195.A N VAL 191.A O TRP 195.A H 2.873 1.915 TRP 195.A NE1 SER 182.A OG TRP 195.A HE1 2.763 1.971 ARG 196.A N GLY 192.A O ARG 196.A H 3.152 2.279 ARG 196.A NE ASP 184.A OD2 ARG 196.A HE 2.829 2.070 ARG 196.A NH2 ASP 184.A OD1 ARG 196.A HH21 2.792 1.812 LYS 197.A N GLU 193.A O LYS 197.A H 2.841 1.998 THR 198.A N PHE 194.A O THR 198.A H 3.067 2.094 THR 198.A OG1 PHE 194.A O THR 198.A HG1 2.998 2.086 VAL 199.A N TRP 195.A O VAL 199.A H 3.006 2.023 GLU 200.A N ARG 196.A O GLU 200.A H 3.268 2.528 GLU 200.A N LYS 197.A O GLU 200.A H 2.884 2.179 GLU 201.A N LYS 197.A O GLU 201.A H 2.836 1.995 VAL 202.A N THR 198.A O VAL 202.A H 2.962 1.988 GLY 203.A N VAL 199.A O GLY 203.A H 3.189 2.467 ARG 204.A N GLU 201.A O ARG 204.A H 2.854 1.905 GLY 205.A N VAL 202.A O GLY 205.A H 3.231 2.286 TYR 206.A N GLY 203.A O TYR 206.A H 3.065 2.099 VAL 209.A N TYR 206.A O VAL 209.A H 3.066 2.274 ALA 210.A N LYS 178.A O ALA 210.A H 3.094 2.111 GLU 212.A N VAL 180.A O GLU 212.A H 3.291 2.571 GLN 214.A N SER 182.A O GLN 214.A H 2.842 2.025 VAL 216.A N ASP 184.A O VAL 216.A H 2.919 2.093 MET 219.A N TYR 215.A O MET 219.A H 3.003 2.048 ALA 220.A N VAL 216.A O ALA 220.A H 2.818 1.901 MET 221.A N ASP 217.A O MET 221.A H 3.354 2.493 HIS 222.A N ALA 218.A O HIS 222.A H 2.960 2.066 LEU 223.A N MET 219.A O LEU 223.A H 3.049 2.119 VAL 224.A N MET 221.A O VAL 224.A H 3.176 2.244 ARG 225.A N MET 221.A O ARG 225.A H 2.958 1.989 SER 226.A N HIS 222.A O SER 226.A H 2.931 2.067 PHE 230.A N PRO 227.A O PHE 230.A H 3.417 2.568 VAL 232.A N HIS 179.A O VAL 232.A H 2.936 1.974 VAL 233.A N VAL 129.A O VAL 233.A H 2.917 2.020 VAL 234.A N VAL 181.A O VAL 234.A H 3.038 2.117 THR 235.A N VAL 131.A O THR 235.A H 3.060 2.161 ASN 237.A N TYR 157.A OH ASN 237.A H 3.393 2.474 ASN 237.A ND2 LEU 134.A O ASN 237.A HD21 3.276 2.606 ASN 237.A ND2 GLY 136.A O ASN 237.A HD22 2.785 1.841 GLY 240.A N GLY 236.A O GLY 240.A H 2.710 1.938 ASP 241.A N ASN 237.A O ASP 241.A H 2.778 1.860 ILE 242.A N ILE 238.A O ILE 242.A H 2.866 1.906 LEU 243.A N PHE 239.A O LEU 243.A H 2.937 1.964 SER 244.A N GLY 240.A O SER 244.A H 2.787 1.871 ASP 245.A N ASP 241.A O ASP 245.A H 3.346 2.364 LEU 246.A N ILE 242.A O LEU 246.A H 3.010 2.046 ALA 247.A N LEU 243.A O ALA 247.A H 2.931 1.995 SER 248.A N SER 244.A O SER 248.A H 2.819 2.009 VAL 249.A N LEU 246.A O VAL 249.A H 3.158 2.187 LEU 250.A N ALA 247.A O LEU 250.A H 3.273 2.329 SER 259.A N GLU 270.A O SER 259.A H 2.910 2.050 ALA 260.A N LEU 103.A O ALA 260.A H 3.190 2.364 SER 261.A N VAL 268.A O SER 261.A H 2.958 2.022 LEU 262.A N ALA 101.A O LEU 262.A H 3.255 2.331 ARG 264.A N ASP 98.A O ARG 264.A H 2.978 2.034 GLY 265.A N LEU 97.A O GLY 265.A H 2.699 1.947 THR 266.A OG1 VAL 61.A O THR 266.A HG1 2.890 2.108 VAL 268.A N SER 261.A O VAL 268.A H 3.022 2.118 PHE 269.A N VAL 67.A O PHE 269.A H 3.361 2.509 GLU 270.A N SER 259.A O GLU 270.A H 3.058 2.092 VAL 272.A N LEU 257.A O VAL 272.A H 2.826 1.873 HIS 273.A ND1 GLY 274.A O HIS 273.A HD1 2.891 2.217 ILE 279.A N ALA 276.A O ILE 279.A H 2.975 2.017 ALA 280.A N PRO 277.A O ALA 280.A H 3.234 2.265 GLY 283.A N GLU 14.A OE1 GLY 283.A H 3.268 2.560 ASN 286.A ND2 ASP 326.A OD1 ASN 286.A HD22 3.083 2.268 ASN 286.A ND2 ASP 326.A OD2 ASN 286.A HD22 3.545 2.769 THR 288.A N ASN 286.A OD1 THR 288.A H 2.828 1.882 ILE 291.A N PRO 287.A O ILE 291.A H 2.907 1.940 LEU 292.A N THR 288.A O LEU 292.A H 2.971 2.081 SER 293.A N ALA 289.A O SER 293.A H 2.920 2.196 SER 293.A N ALA 290.A O SER 293.A H 2.775 2.012 ALA 294.A N ALA 290.A O ALA 294.A H 3.040 2.071 ALA 295.A N ILE 291.A O ALA 295.A H 3.169 2.204 MET 296.A N LEU 292.A O MET 296.A H 3.249 2.421 MET 297.A N SER 293.A O MET 297.A H 3.028 2.251 MET 297.A N ALA 294.A O MET 297.A H 2.917 2.192 LEU 298.A N ALA 294.A O LEU 298.A H 3.076 2.112 GLU 299.A N ALA 295.A O GLU 299.A H 3.112 2.150 HIS 300.A N MET 296.A O HIS 300.A H 2.806 1.903 HIS 300.A ND1 MET 296.A O HIS 300.A HD1 3.212 2.408 ALA 301.A N MET 297.A O ALA 301.A H 2.667 1.823 PHE 302.A N MET 297.A O PHE 302.A H 3.139 2.253 LEU 304.A N LEU 298.A O LEU 304.A H 2.723 1.854 VAL 305.A N GLY 303.A O VAL 305.A H 2.932 2.051 LEU 307.A N LEU 304.A O LEU 307.A H 2.955 2.185 ALA 308.A N LEU 304.A O ALA 308.A H 3.023 2.051 ARG 309.A N VAL 305.A O ARG 309.A H 3.088 2.162 ARG 309.A NH1 GLU 299.A OE1 ARG 309.A HH12 2.853 1.906 ARG 309.A NH2 LYS 175.A O ARG 309.A HH21 3.062 2.140 ARG 309.A NH2 GLU 299.A OE2 ARG 309.A HH22 2.894 1.935 LYS 310.A N GLU 306.A O LYS 310.A H 3.430 2.600 VAL 311.A N LEU 307.A O VAL 311.A H 2.858 1.962 GLU 312.A N ALA 308.A O GLU 312.A H 2.944 1.987 ASP 313.A N ARG 309.A O ASP 313.A H 2.899 1.973 ALA 314.A N LYS 310.A O ALA 314.A H 3.058 2.074 VAL 315.A N VAL 311.A O VAL 315.A H 3.018 2.055 ALA 316.A N GLU 312.A O ALA 316.A H 2.965 2.029 LYS 317.A N ASP 313.A O LYS 317.A H 2.781 1.814 ALA 318.A N ALA 314.A O ALA 318.A H 2.802 1.892 LEU 319.A N VAL 315.A O LEU 319.A H 2.926 1.994 LEU 320.A N ALA 316.A O LEU 320.A H 3.021 2.109 GLU 321.A N LYS 317.A O GLU 321.A H 2.820 1.861 THR 322.A N ALA 318.A O THR 322.A H 2.790 1.864 THR 322.A OG1 ALA 318.A O THR 322.A HG1 3.171 2.458 LEU 327.A N PRO 324.A O LEU 327.A H 3.091 2.168 GLY 328.A N PRO 325.A O GLY 328.A H 2.815 2.011 ALA 331.A N PRO 323.A O ALA 331.A H 3.430 2.486 THR 333.A N GLY 283.A O THR 333.A H 2.927 2.050 PHE 336.A N GLY 332.A O PHE 336.A H 2.874 1.940 THR 337.A N THR 333.A O THR 337.A H 2.780 1.814 ALA 338.A N GLU 334.A O ALA 338.A H 2.860 1.977 THR 339.A N ALA 335.A O THR 339.A H 3.387 2.425 VAL 340.A N PHE 336.A O VAL 340.A H 3.193 2.246 LEU 341.A N THR 337.A O LEU 341.A H 3.117 2.211 ARG 342.A N ALA 338.A O ARG 342.A H 2.708 1.774 HIS 343.A N VAL 340.A O HIS 343.A H 3.021 2.174 HIS 343.A ND1 THR 339.A O HIS 343.A HD1 3.071 2.212 LEU 344.A N LEU 341.A O LEU 344.A H 2.706 1.848