Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1yam_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A N THR 40.A OG1 LYS 1.A H1 2.545 1.706 LYS 1.A N ASP 87.A OD1 LYS 1.A H2 2.896 2.065 LYS 1.A NZ GLU 7.A OE2 LYS 1.A HZ3 2.774 2.037 PHE 3.A N TYR 38.A O PHE 3.A H 2.985 2.047 GLU 4.A N GLU 7.A OE1 GLU 4.A H 3.256 2.297 ARG 5.A NH1 TYR 124.A O ARG 5.A HH11 2.905 1.941 ARG 5.A NH1 GLN 126.A O ARG 5.A HH12 3.005 2.103 ARG 5.A NH2 GLN 126.A O ARG 5.A HH22 3.033 2.155 LEU 8.A N GLU 4.A O LEU 8.A H 3.031 2.082 ALA 9.A N ARG 5.A O ALA 9.A H 3.016 2.067 ARG 10.A N CYS 6.A O ARG 10.A H 2.959 1.989 ARG 10.A NH1 CYS 128.A O ARG 10.A HH11 3.115 2.200 THR 11.A N GLU 7.A O THR 11.A H 3.069 2.130 LEU 12.A N LEU 8.A O LEU 12.A H 2.836 1.878 LYS 13.A N ALA 9.A O LYS 13.A H 3.128 2.190 LYS 13.A NZ VAL 130.A OXT LYS 13.A HZ1 2.846 1.962 ARG 14.A N ARG 10.A O ARG 14.A H 3.160 2.240 LEU 15.A N THR 11.A O LEU 15.A H 3.094 2.265 GLY 16.A N LYS 13.A O GLY 16.A H 3.073 2.170 MET 17.A N LEU 12.A O MET 17.A H 3.174 2.242 GLY 19.A N ILE 23.A O GLY 19.A H 2.756 1.974 TYR 20.A N MET 17.A O TYR 20.A H 3.160 2.187 ARG 21.A NE VAL 100.A O ARG 21.A HE 3.669 2.688 GLY 22.A N GLY 19.A O GLY 22.A H 2.954 2.113 ILE 23.A N TYR 20.A O ILE 23.A H 2.896 1.946 LEU 25.A N ASP 18.A OD1 LEU 25.A H 2.929 2.060 ASN 27.A N SER 24.A O ASN 27.A H 3.005 2.233 ASN 27.A ND2 SER 24.A OG ASN 27.A HD22 2.758 1.911 TRP 28.A N SER 24.A O TRP 28.A H 3.353 2.430 MET 29.A N LEU 25.A O MET 29.A H 2.992 2.055 CYS 30.A N ALA 26.A O CYS 30.A H 2.968 2.026 CYS 30.A SG ARG 115.A O no hydrogen 3.646 N/A CYS 30.A SG TYR 124.A OH no hydrogen 3.756 N/A LEU 31.A N ASN 27.A O LEU 31.A H 2.944 2.009 ALA 32.A N TRP 28.A O ALA 32.A H 2.940 1.966 LYS 33.A N MET 29.A O LYS 33.A H 2.901 1.978 TRP 34.A N CYS 30.A O TRP 34.A H 3.116 2.137 TRP 34.A NE1 TYR 124.A OH TRP 34.A HE1 2.986 2.024 GLU 35.A N LEU 31.A O GLU 35.A H 2.863 1.959 SER 36.A N ALA 32.A O SER 36.A H 3.118 2.161 SER 36.A OG ILE 56.A O SER 36.A HG 2.737 1.926 GLY 37.A N ALA 32.A O GLY 37.A H 3.243 2.495 GLY 37.A N LYS 33.A O GLY 37.A H 2.975 2.249 TYR 38.A N ALA 32.A O TYR 38.A H 3.436 2.492 ASN 39.A N SER 36.A OG ASN 39.A H 3.220 2.373 THR 40.A N LYS 1.A O THR 40.A H 2.963 1.988 THR 40.A OG1 GLN 86.A O THR 40.A HG1 3.366 2.777 ARG 41.A N ASN 39.A OD1 ARG 41.A H 3.066 2.115 ALA 42.A N ASN 39.A O ALA 42.A H 3.555 2.589 ASN 44.A N ASP 53.A O ASN 44.A H 2.996 2.084 ASN 44.A ND2 ASP 53.A OD2 ASN 44.A HD22 3.213 2.369 ASN 46.A N SER 51.A O ASN 46.A H 2.840 1.890 ASN 46.A ND2 SER 51.A O ASN 46.A HD22 3.253 2.531 ASN 46.A ND2 SER 51.A OG ASN 46.A HD22 3.242 2.390 ASN 46.A ND2 ASP 53.A OD2 ASN 46.A HD21 3.570 2.646 ASP 49.A N ASN 46.A O ASP 49.A H 3.285 2.477 ARG 50.A N ASN 46.A O ARG 50.A H 2.838 2.116 SER 51.A N ASP 49.A OD1 SER 51.A H 3.349 2.493 THR 52.A N SER 61.A OG THR 52.A H 3.019 2.038 ASP 53.A N ASN 44.A O ASP 53.A H 2.840 1.876 TYR 54.A N ILE 59.A O TYR 54.A H 2.848 1.917 GLY 55.A N ALA 42.A O GLY 55.A H 2.788 1.929 GLN 58.A N GLY 55.A O GLN 58.A H 2.971 2.098 GLN 58.A NE2 ALA 42.A O GLN 58.A HE21 3.120 2.500 GLN 58.A NE2 ASP 53.A O GLN 58.A HE21 3.594 2.991 GLN 58.A NE2 GLY 55.A O GLN 58.A HE22 2.980 2.001 ILE 59.A N TYR 54.A O ILE 59.A H 3.080 2.195 ASN 60.A ND2 SER 51.A OG ASN 60.A HD21 2.935 1.958 ASN 60.A ND2 ASP 53.A OD1 ASN 60.A HD22 2.938 1.976 SER 61.A N THR 52.A O SER 61.A H 2.997 2.085 SER 61.A OG THR 70.A OG1 SER 61.A HG 2.798 2.095 ARG 62.A N ASN 60.A OD1 ARG 62.A H 2.871 1.962 ARG 62.A NE PRO 71.A O ARG 62.A HE 3.432 2.675 ARG 62.A NH1 ASP 49.A O ARG 62.A HH12 3.272 2.411 ARG 62.A NH2 ASP 49.A O ARG 62.A HH22 3.186 2.293 ARG 62.A NH2 PRO 71.A O ARG 62.A HH21 2.860 1.892 TRP 64.A N ASN 60.A O TRP 64.A H 3.204 2.276 ASN 66.A N LEU 79.A O ASN 66.A H 2.906 1.937 GLY 68.A N ASN 66.A OD1 GLY 68.A H 3.022 2.125 VAL 74.A N ARG 62.A O VAL 74.A H 2.721 1.784 ALA 76.A N TYR 63.A O ALA 76.A H 2.784 1.818 CYS 77.A N TRP 64.A O CYS 77.A H 2.952 2.061 CYS 77.A SG CYS 95.A O no hydrogen 3.524 N/A HIS 78.A N ASN 75.A O HIS 78.A H 3.133 2.274 LEU 79.A N ASN 75.A OD1 LEU 79.A H 2.906 1.975 CYS 81.A N ASN 66.A O CYS 81.A H 3.017 2.078 SER 82.A N SER 80.A OG SER 82.A H 3.213 2.317 ALA 83.A N SER 80.A O ALA 83.A H 3.034 2.174 LEU 84.A N CYS 81.A O LEU 84.A H 3.024 2.130 LEU 85.A N SER 82.A O LEU 85.A H 2.965 2.048 GLN 86.A NE2 ALA 83.A O GLN 86.A HE22 2.919 1.975 GLN 86.A NE2 ASP 91.A OD2 GLN 86.A HE21 3.195 2.390 ALA 90.A N ASN 88.A OD1 ALA 90.A H 3.189 2.255 VAL 93.A N ILE 89.A O VAL 93.A H 2.932 1.994 ALA 94.A N ALA 90.A O ALA 94.A H 3.036 2.095 CYS 95.A N ASP 91.A O CYS 95.A H 3.009 2.109 ALA 96.A N ALA 92.A O ALA 96.A H 2.918 2.001 LYS 97.A N VAL 93.A O LYS 97.A H 2.956 2.028 LYS 97.A NZ LEU 15.A O LYS 97.A HZ2 2.753 1.855 ARG 98.A N ALA 94.A O ARG 98.A H 3.215 2.362 ARG 98.A NH1 ARG 98.A O ARG 98.A HH11 2.954 1.993 ARG 98.A NH1 ASP 102.A OD1 ARG 98.A HH12 2.896 1.930 VAL 99.A N CYS 95.A O VAL 99.A H 2.918 1.997 VAL 100.A N ALA 96.A O VAL 100.A H 3.184 2.246 ARG 101.A N ARG 98.A O ARG 101.A H 3.104 2.213 ARG 101.A NE TYR 20.A OH ARG 101.A HE 2.976 2.039 ARG 101.A NH2 TYR 20.A OH ARG 101.A HH21 3.384 2.584 ASP 102.A N VAL 99.A O ASP 102.A H 3.328 2.388 GLY 105.A N ASP 102.A O GLY 105.A H 3.038 2.168 ARG 107.A N GLN 104.A O ARG 107.A H 3.153 2.323 ALA 108.A N GLY 105.A O ALA 108.A H 3.158 2.204 TRP 109.A N VAL 106.A O TRP 109.A H 3.362 2.392 TRP 109.A NE1 PHE 57.A O TRP 109.A HE1 2.898 2.151 TRP 112.A N TRP 109.A O TRP 112.A H 3.055 2.244 TRP 112.A NE1 ASN 27.A OD1 TRP 112.A HE1 2.966 2.063 ARG 113.A NH1 ARG 107.A O ARG 113.A HH11 2.758 1.997 ASN 114.A N VAL 110.A O ASN 114.A H 3.162 2.227 ARG 115.A N ALA 111.A O ARG 115.A H 3.033 2.081 CYS 116.A N TRP 112.A O CYS 116.A H 2.878 2.046 GLN 117.A N TRP 112.A O GLN 117.A H 2.879 1.949 ARG 119.A N CYS 116.A O ARG 119.A H 3.175 2.318 ARG 119.A NH2 ASN 114.A O ARG 119.A HH21 2.752 1.879 ARG 122.A N ASP 120.A OD1 ARG 122.A H 3.227 2.383 TYR 124.A N VAL 121.A O TYR 124.A H 3.109 2.168 VAL 125.A N ARG 122.A O VAL 125.A H 3.118 2.245 GLN 126.A NE2 ARG 122.A O GLN 126.A HE22 3.077 2.275 CYS 128.A N VAL 125.A O CYS 128.A H 3.294 2.351 CYS 128.A SG VAL 125.A O no hydrogen 3.616 N/A CYS 128.A SG GLN 126.A O no hydrogen 3.914 N/A