Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1yao_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A N THR 40.A OG1 LYS 1.A H2 2.750 1.726 LYS 1.A N ASP 87.A OD1 LYS 1.A H3 2.939 2.186 LYS 1.A NZ GLU 7.A OE2 LYS 1.A HZ2 2.855 1.901 PHE 3.A N TYR 38.A O PHE 3.A H 2.928 1.989 GLU 4.A N GLU 7.A OE1 GLU 4.A H 3.214 2.254 ARG 5.A NH1 TYR 124.A O ARG 5.A HH11 2.928 1.976 ARG 5.A NH1 GLN 126.A O ARG 5.A HH12 3.006 2.140 ARG 5.A NH2 GLN 126.A O ARG 5.A HH22 2.943 2.046 LEU 8.A N GLU 4.A O LEU 8.A H 3.060 2.100 ALA 9.A N ARG 5.A O ALA 9.A H 3.070 2.113 ARG 10.A N CYS 6.A O ARG 10.A H 2.970 1.997 ARG 10.A NH1 CYS 128.A O ARG 10.A HH11 3.042 2.096 THR 11.A N GLU 7.A O THR 11.A H 3.045 2.120 LEU 12.A N LEU 8.A O LEU 12.A H 2.815 1.857 LYS 13.A N ALA 9.A O LYS 13.A H 3.124 2.193 ARG 14.A N ARG 10.A O ARG 14.A H 3.123 2.180 LEU 15.A N THR 11.A O LEU 15.A H 3.080 2.244 GLY 16.A N LYS 13.A O GLY 16.A H 2.984 2.067 MET 17.A N LEU 12.A O MET 17.A H 3.199 2.252 GLY 19.A N ILE 23.A O GLY 19.A H 2.782 1.979 TYR 20.A N MET 17.A O TYR 20.A H 3.128 2.161 ARG 21.A NE VAL 100.A O ARG 21.A HE 3.680 2.715 GLY 22.A N GLY 19.A O GLY 22.A H 2.921 2.079 ILE 23.A N TYR 20.A O ILE 23.A H 2.931 1.984 LEU 25.A N ASP 18.A OD1 LEU 25.A H 3.046 2.168 ASN 27.A N SER 24.A O ASN 27.A H 2.926 2.144 ASN 27.A ND2 SER 24.A OG ASN 27.A HD22 2.823 2.018 TRP 28.A N SER 24.A O TRP 28.A H 3.324 2.404 MET 29.A N LEU 25.A O MET 29.A H 2.939 2.003 CYS 30.A N ALA 26.A O CYS 30.A H 2.896 1.962 CYS 30.A SG ARG 115.A O no hydrogen 3.686 N/A LEU 31.A N ASN 27.A O LEU 31.A H 2.930 1.998 ALA 32.A N TRP 28.A O ALA 32.A H 2.941 1.975 LYS 33.A N MET 29.A O LYS 33.A H 2.917 1.977 TRP 34.A N CYS 30.A O TRP 34.A H 3.136 2.171 GLU 35.A N LEU 31.A O GLU 35.A H 2.843 1.928 SER 36.A N ALA 32.A O SER 36.A H 3.012 2.057 SER 36.A OG VAL 56.A O SER 36.A HG 2.772 1.924 GLY 37.A N ALA 32.A O GLY 37.A H 3.176 2.475 GLY 37.A N LYS 33.A O GLY 37.A H 2.905 2.157 TYR 38.A N ALA 32.A O TYR 38.A H 3.422 2.489 ASN 39.A N SER 36.A OG ASN 39.A H 3.259 2.459 THR 40.A N LYS 1.A O THR 40.A H 2.927 1.948 ARG 41.A N ASN 39.A OD1 ARG 41.A H 3.116 2.166 ALA 42.A N ASN 39.A O ALA 42.A H 3.506 2.555 ASN 44.A N ASP 53.A O ASN 44.A H 3.023 2.139 ASN 46.A N SER 51.A O ASN 46.A H 2.814 1.858 ASN 46.A ND2 SER 51.A O ASN 46.A HD22 3.261 2.559 ASN 46.A ND2 SER 51.A OG ASN 46.A HD22 3.195 2.327 ASN 46.A ND2 ASP 53.A OD2 ASN 46.A HD21 3.294 2.378 ASP 49.A N ASN 46.A O ASP 49.A H 3.321 2.494 ARG 50.A N ASN 46.A O ARG 50.A H 2.941 2.252 SER 51.A N ASP 49.A OD1 SER 51.A H 3.265 2.445 THR 52.A N SER 61.A OG THR 52.A H 3.020 2.047 ASP 53.A N ASN 44.A O ASP 53.A H 2.861 1.896 TYR 54.A N ILE 59.A O TYR 54.A H 2.908 1.968 GLY 55.A N ALA 42.A O GLY 55.A H 2.798 1.964 GLN 58.A N GLY 55.A O GLN 58.A H 3.119 2.236 GLN 58.A NE2 ALA 42.A O GLN 58.A HE21 2.960 2.292 GLN 58.A NE2 ASP 53.A O GLN 58.A HE21 3.616 3.014 GLN 58.A NE2 GLY 55.A O GLN 58.A HE22 2.908 1.926 ILE 59.A N TYR 54.A O ILE 59.A H 3.047 2.141 ASN 60.A ND2 SER 51.A OG ASN 60.A HD21 2.887 1.921 ASN 60.A ND2 ASP 53.A OD1 ASN 60.A HD22 2.896 1.953 SER 61.A N THR 52.A O SER 61.A H 2.930 2.016 SER 61.A OG ASP 67.A OD2 SER 61.A HG 3.488 2.665 ARG 62.A N ASN 60.A OD1 ARG 62.A H 2.857 1.933 ARG 62.A NH1 ASP 49.A O ARG 62.A HH12 3.140 2.427 ARG 62.A NH2 ASP 49.A O ARG 62.A HH22 2.979 2.214 ARG 62.A NH2 PRO 71.A O ARG 62.A HH21 2.938 2.156 TRP 64.A N ASN 60.A O TRP 64.A H 3.183 2.269 ASN 66.A N LEU 79.A O ASN 66.A H 2.953 1.978 GLY 68.A N ASN 66.A OD1 GLY 68.A H 3.072 2.204 LYS 69.A NZ ASP 67.A OD2 LYS 69.A HZ3 3.450 2.512 THR 70.A OG1 SER 61.A OG THR 70.A HG1 2.787 1.907 VAL 74.A N ARG 62.A O VAL 74.A H 2.754 1.798 ASN 75.A ND2 LEU 79.A O ASN 75.A HD21 3.383 2.790 ALA 76.A N TYR 63.A O ALA 76.A H 2.743 1.782 CYS 77.A N TRP 64.A O CYS 77.A H 2.885 1.982 CYS 77.A SG CYS 95.A O no hydrogen 3.535 N/A HIS 78.A N ASN 75.A O HIS 78.A H 2.989 2.177 LEU 79.A N ASN 75.A OD1 LEU 79.A H 2.976 2.042 SER 80.A OG SER 82.A OG SER 80.A HG 2.733 1.893 CYS 81.A N ASN 66.A O CYS 81.A H 2.967 2.025 SER 82.A N SER 80.A OG SER 82.A H 3.197 2.288 ALA 83.A N SER 80.A O ALA 83.A H 2.956 2.072 LEU 84.A N CYS 81.A O LEU 84.A H 2.971 2.087 LEU 85.A N SER 82.A O LEU 85.A H 2.942 2.011 GLN 86.A NE2 ALA 83.A O GLN 86.A HE22 2.985 2.011 GLN 86.A NE2 ASP 91.A OD2 GLN 86.A HE21 3.065 2.264 ALA 90.A N ASN 88.A OD1 ALA 90.A H 2.937 2.000 VAL 93.A N ILE 89.A O VAL 93.A H 2.924 2.005 ALA 94.A N ALA 90.A O ALA 94.A H 3.005 2.052 CYS 95.A N ASP 91.A O CYS 95.A H 2.970 2.065 ALA 96.A N ALA 92.A O ALA 96.A H 2.855 1.965 LYS 97.A N VAL 93.A O LYS 97.A H 2.898 1.968 LYS 97.A NZ LEU 15.A O LYS 97.A HZ2 2.802 1.950 ARG 98.A N ALA 94.A O ARG 98.A H 3.202 2.300 ARG 98.A NH1 ARG 98.A O ARG 98.A HH11 2.814 1.918 ARG 98.A NH1 ASP 102.A OD1 ARG 98.A HH12 3.012 2.013 VAL 99.A N CYS 95.A O VAL 99.A H 2.958 2.013 VAL 100.A N ALA 96.A O VAL 100.A H 3.203 2.250 ARG 101.A N ARG 98.A O ARG 101.A H 3.060 2.177 ARG 101.A NH1 TYR 20.A OH ARG 101.A HH11 2.794 1.865 ASP 102.A N VAL 99.A O ASP 102.A H 3.207 2.263 GLY 105.A N ASP 102.A O GLY 105.A H 3.030 2.181 ARG 107.A N GLN 104.A O ARG 107.A H 3.116 2.308 ALA 108.A N GLY 105.A O ALA 108.A H 3.069 2.123 TRP 109.A N ILE 106.A O TRP 109.A H 3.352 2.388 TRP 109.A NE1 PHE 57.A O TRP 109.A HE1 2.754 1.957 TRP 112.A N TRP 109.A O TRP 112.A H 3.082 2.317 TRP 112.A NE1 ASN 27.A OD1 TRP 112.A HE1 2.958 2.076 ASN 114.A N VAL 110.A O ASN 114.A H 3.178 2.223 ARG 115.A N ALA 111.A O ARG 115.A H 2.834 1.868 CYS 116.A N TRP 112.A O CYS 116.A H 2.835 2.016 GLN 117.A N TRP 112.A O GLN 117.A H 2.833 1.936 ARG 119.A N CYS 116.A O ARG 119.A H 3.187 2.357 ARG 119.A NH2 ASN 114.A O ARG 119.A HH21 2.824 1.896 ARG 122.A N ASP 120.A OD1 ARG 122.A H 3.394 2.477 GLN 123.A NE2 ASP 120.A O GLN 123.A HE22 3.248 2.290 TYR 124.A N VAL 121.A O TYR 124.A H 3.170 2.262 VAL 125.A N ARG 122.A O VAL 125.A H 3.118 2.227 GLN 126.A NE2 ARG 122.A O GLN 126.A HE22 3.061 2.221 CYS 128.A N VAL 125.A O CYS 128.A H 3.202 2.265 CYS 128.A SG GLN 126.A O no hydrogen 3.865 N/A