Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1yap_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A N THR 40.A OG1 LYS 1.A H1 2.850 1.819 LYS 1.A N ASP 87.A OD1 LYS 1.A H2 2.967 2.169 LYS 1.A NZ GLU 7.A OE2 LYS 1.A HZ3 2.805 1.925 PHE 3.A N TYR 38.A O PHE 3.A H 2.909 1.982 GLU 4.A N GLU 7.A OE1 GLU 4.A H 3.320 2.357 ARG 5.A NH1 TYR 124.A O ARG 5.A HH11 3.127 2.136 ARG 5.A NH1 GLN 126.A O ARG 5.A HH12 2.975 2.010 ARG 5.A NH2 GLN 126.A O ARG 5.A HH22 3.340 2.503 LEU 8.A N GLU 4.A O LEU 8.A H 3.086 2.122 ALA 9.A N ARG 5.A O ALA 9.A H 3.042 2.101 ARG 10.A N CYS 6.A O ARG 10.A H 3.015 2.056 ARG 10.A NH1 CYS 128.A O ARG 10.A HH11 3.108 2.150 THR 11.A N GLU 7.A O THR 11.A H 3.046 2.128 LEU 12.A N LEU 8.A O LEU 12.A H 2.852 1.888 LYS 13.A N ALA 9.A O LYS 13.A H 3.110 2.189 ARG 14.A N ARG 10.A O ARG 14.A H 3.135 2.180 LEU 15.A N THR 11.A O LEU 15.A H 3.090 2.276 GLY 16.A N LYS 13.A O GLY 16.A H 2.968 2.065 MET 17.A N LEU 12.A O MET 17.A H 3.103 2.156 GLY 19.A N ILE 23.A O GLY 19.A H 2.771 1.997 TYR 20.A N MET 17.A O TYR 20.A H 3.056 2.082 GLY 22.A N GLY 19.A O GLY 22.A H 3.028 2.154 ILE 23.A N TYR 20.A O ILE 23.A H 2.975 2.064 LEU 25.A N ASP 18.A OD1 LEU 25.A H 3.050 2.213 ASN 27.A N SER 24.A O ASN 27.A H 2.957 2.188 ASN 27.A ND2 SER 24.A OG ASN 27.A HD22 2.800 1.998 TRP 28.A N SER 24.A O TRP 28.A H 3.294 2.380 MET 29.A N LEU 25.A O MET 29.A H 2.957 2.040 CYS 30.A N ALA 26.A O CYS 30.A H 2.966 2.026 CYS 30.A SG ARG 115.A O no hydrogen 3.669 N/A CYS 30.A SG TYR 124.A OH no hydrogen 3.620 N/A LEU 31.A N ASN 27.A O LEU 31.A H 2.943 2.008 ALA 32.A N TRP 28.A O ALA 32.A H 3.083 2.111 LYS 33.A N MET 29.A O LYS 33.A H 2.938 2.013 TRP 34.A N CYS 30.A O TRP 34.A H 3.193 2.225 GLU 35.A N LEU 31.A O GLU 35.A H 2.868 1.987 SER 36.A N ALA 32.A O SER 36.A H 3.099 2.134 SER 36.A OG ILE 56.A O SER 36.A HG 2.723 1.891 GLY 37.A N ALA 32.A O GLY 37.A H 3.120 2.406 GLY 37.A N LYS 33.A O GLY 37.A H 2.910 2.214 TYR 38.A N ALA 32.A O TYR 38.A H 3.463 2.505 ASN 39.A N SER 36.A OG ASN 39.A H 3.359 2.515 THR 40.A N LYS 1.A O THR 40.A H 2.941 1.966 THR 40.A OG1 GLN 86.A O THR 40.A HG1 3.427 2.781 ARG 41.A N ASN 39.A OD1 ARG 41.A H 3.160 2.200 ALA 42.A N ASN 39.A O ALA 42.A H 3.452 2.504 ASN 44.A N ASP 53.A O ASN 44.A H 3.079 2.179 ASN 46.A N SER 51.A O ASN 46.A H 2.823 1.870 ASN 46.A ND2 SER 51.A O ASN 46.A HD22 3.085 2.368 ASN 46.A ND2 SER 51.A OG ASN 46.A HD22 3.065 2.240 ASN 46.A ND2 ASP 53.A OD2 ASN 46.A HD21 3.443 2.543 ASP 49.A N ASN 46.A O ASP 49.A H 3.237 2.332 SER 51.A N ASP 49.A OD1 SER 51.A H 3.164 2.364 SER 51.A OG ASP 49.A OD2 SER 51.A HG 3.333 2.602 THR 52.A N SER 61.A OG THR 52.A H 3.011 2.047 ASP 53.A N ASN 44.A O ASP 53.A H 2.874 1.909 TYR 54.A N VAL 59.A O TYR 54.A H 2.945 1.993 GLY 55.A N ALA 42.A O GLY 55.A H 2.924 2.131 GLN 58.A N GLY 55.A O GLN 58.A H 3.028 2.164 GLN 58.A NE2 ALA 42.A O GLN 58.A HE21 3.072 2.442 GLN 58.A NE2 GLY 55.A O GLN 58.A HE22 2.919 1.963 VAL 59.A N TYR 54.A O VAL 59.A H 3.164 2.308 ASN 60.A ND2 SER 51.A OG ASN 60.A HD21 2.864 1.908 ASN 60.A ND2 ASP 53.A OD1 ASN 60.A HD22 2.982 2.068 SER 61.A N THR 52.A O SER 61.A H 2.979 2.044 SER 61.A OG ASP 67.A OD2 SER 61.A HG 3.536 2.690 ARG 62.A N ASN 60.A OD1 ARG 62.A H 2.847 1.922 ARG 62.A NE PRO 71.A O ARG 62.A HE 3.256 2.424 ARG 62.A NH1 ASP 49.A O ARG 62.A HH12 3.340 2.536 ARG 62.A NH2 ASP 49.A O ARG 62.A HH22 3.005 2.059 ARG 62.A NH2 PRO 71.A O ARG 62.A HH21 3.007 2.078 TYR 63.A N ASN 60.A O TYR 63.A H 3.311 2.407 TRP 64.A N ASN 60.A O TRP 64.A H 2.987 2.033 ASN 66.A N LEU 79.A O ASN 66.A H 2.909 1.937 GLY 68.A N ASN 66.A OD1 GLY 68.A H 3.022 2.146 LYS 69.A NZ ASP 67.A OD2 LYS 69.A HZ3 3.401 2.448 VAL 74.A N ARG 62.A O VAL 74.A H 2.736 1.792 ASN 75.A ND2 LEU 79.A O ASN 75.A HD21 3.320 2.721 ALA 76.A N TYR 63.A O ALA 76.A H 2.789 1.820 CYS 77.A N TRP 64.A O CYS 77.A H 2.892 1.987 CYS 77.A SG CYS 95.A O no hydrogen 3.584 N/A HIS 78.A N ASN 75.A O HIS 78.A H 3.036 2.210 LEU 79.A N ASN 75.A OD1 LEU 79.A H 2.957 2.028 CYS 81.A N ASN 66.A O CYS 81.A H 2.978 2.041 SER 82.A N SER 80.A OG SER 82.A H 3.269 2.371 ALA 83.A N SER 80.A O ALA 83.A H 3.095 2.265 LEU 84.A N CYS 81.A O LEU 84.A H 3.030 2.156 LEU 85.A N SER 82.A O LEU 85.A H 2.907 1.968 GLN 86.A NE2 ALA 83.A O GLN 86.A HE22 2.806 1.839 GLN 86.A NE2 ASP 91.A OD2 GLN 86.A HE21 3.039 2.285 ALA 90.A N ASN 88.A OD1 ALA 90.A H 2.837 1.894 VAL 93.A N ILE 89.A O VAL 93.A H 2.901 1.961 ALA 94.A N ALA 90.A O ALA 94.A H 3.027 2.079 CYS 95.A N ASP 91.A O CYS 95.A H 2.926 2.025 ALA 96.A N ALA 92.A O ALA 96.A H 2.911 2.037 LYS 97.A N VAL 93.A O LYS 97.A H 2.954 2.023 LYS 97.A NZ LEU 15.A O LYS 97.A HZ2 2.917 2.026 ARG 98.A N ALA 94.A O ARG 98.A H 3.304 2.420 ARG 98.A NH1 ARG 98.A O ARG 98.A HH11 2.702 1.838 ARG 98.A NH1 ASP 102.A OD1 ARG 98.A HH12 3.041 2.062 VAL 99.A N CYS 95.A O VAL 99.A H 3.014 2.074 VAL 100.A N ALA 96.A O VAL 100.A H 3.280 2.333 ARG 101.A N ARG 98.A O ARG 101.A H 3.062 2.197 ARG 101.A NH1 TYR 20.A OH ARG 101.A HH11 2.869 1.955 ASP 102.A N VAL 99.A O ASP 102.A H 3.265 2.317 GLY 105.A N ASP 102.A O GLY 105.A H 2.951 2.079 ARG 107.A N GLN 104.A O ARG 107.A H 3.167 2.386 ALA 108.A N GLY 105.A O ALA 108.A H 3.158 2.195 TRP 109.A N ILE 106.A O TRP 109.A H 3.382 2.404 TRP 109.A NE1 PHE 57.A O TRP 109.A HE1 2.832 2.120 TRP 112.A N TRP 109.A O TRP 112.A H 3.051 2.250 TRP 112.A NE1 ASN 27.A OD1 TRP 112.A HE1 3.010 2.137 ASN 114.A N VAL 110.A O ASN 114.A H 3.109 2.165 ARG 115.A N ALA 111.A O ARG 115.A H 2.924 1.964 CYS 116.A N TRP 112.A O CYS 116.A H 2.815 1.982 GLN 117.A N TRP 112.A O GLN 117.A H 2.864 1.957 ARG 119.A N CYS 116.A O ARG 119.A H 3.226 2.378 ARG 119.A NH2 ASN 114.A O ARG 119.A HH21 2.768 1.944 ARG 122.A N ASP 120.A OD1 ARG 122.A H 3.364 2.483 GLN 123.A NE2 ASP 120.A O GLN 123.A HE22 3.684 2.711 TYR 124.A N VAL 121.A O TYR 124.A H 3.060 2.109 VAL 125.A N ARG 122.A O VAL 125.A H 3.060 2.154 GLN 126.A NE2 ARG 122.A O GLN 126.A HE22 3.521 2.686 CYS 128.A N VAL 125.A O CYS 128.A H 3.161 2.217 CYS 128.A SG VAL 125.A O no hydrogen 3.510 N/A CYS 128.A SG GLN 126.A O no hydrogen 3.987 N/A