Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1yaq_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A N THR 40.A OG1 LYS 1.A H2 2.763 1.783 PHE 3.A N TYR 38.A O PHE 3.A H 2.905 1.962 GLU 4.A N GLU 7.A OE1 GLU 4.A H 3.111 2.162 ARG 5.A NH1 TYR 124.A O ARG 5.A HH11 3.050 2.068 ARG 5.A NH1 GLN 126.A O ARG 5.A HH12 2.936 2.003 ARG 5.A NH2 GLN 126.A O ARG 5.A HH22 3.171 2.344 LEU 8.A N GLU 4.A O LEU 8.A H 3.029 2.075 ALA 9.A N ARG 5.A O ALA 9.A H 3.086 2.123 ARG 10.A N CYS 6.A O ARG 10.A H 3.022 2.057 ARG 10.A NH1 CYS 128.A O ARG 10.A HH11 3.051 2.105 THR 11.A N GLU 7.A O THR 11.A H 3.162 2.293 THR 11.A OG1 GLU 7.A O THR 11.A HG1 2.997 2.054 LEU 12.A N LEU 8.A O LEU 12.A H 2.855 1.899 LYS 13.A N ALA 9.A O LYS 13.A H 3.092 2.156 LYS 13.A NZ VAL 130.A OXT LYS 13.A HZ1 2.846 1.965 ARG 14.A N ARG 10.A O ARG 14.A H 3.065 2.131 LEU 15.A N THR 11.A O LEU 15.A H 3.087 2.237 GLY 16.A N LYS 13.A O GLY 16.A H 3.058 2.149 MET 17.A N LEU 12.A O MET 17.A H 3.171 2.202 GLY 19.A N ILE 23.A O GLY 19.A H 2.828 2.025 TYR 20.A N MET 17.A O TYR 20.A H 3.185 2.214 ARG 21.A NE VAL 100.A O ARG 21.A HE 3.024 2.295 ARG 21.A NH2 VAL 100.A O ARG 21.A HH21 3.161 2.490 GLY 22.A N GLY 19.A O GLY 22.A H 3.017 2.162 ILE 23.A N TYR 20.A O ILE 23.A H 2.918 1.969 LEU 25.A N ASP 18.A OD1 LEU 25.A H 2.961 2.102 ASN 27.A N SER 24.A O ASN 27.A H 2.967 2.194 ASN 27.A ND2 SER 24.A OG ASN 27.A HD22 2.778 1.991 TRP 28.A N SER 24.A O TRP 28.A H 3.365 2.432 MET 29.A N LEU 25.A O MET 29.A H 2.998 2.056 CYS 30.A N ALA 26.A O CYS 30.A H 2.909 1.967 CYS 30.A SG ARG 115.A O no hydrogen 3.741 N/A CYS 30.A SG TYR 124.A OH no hydrogen 3.671 N/A LEU 31.A N ASN 27.A O LEU 31.A H 2.904 1.971 ALA 32.A N TRP 28.A O ALA 32.A H 2.960 1.988 LYS 33.A N MET 29.A O LYS 33.A H 2.972 2.034 TRP 34.A N CYS 30.A O TRP 34.A H 3.174 2.197 TRP 34.A NE1 TYR 124.A OH TRP 34.A HE1 2.950 1.995 GLU 35.A N LEU 31.A O GLU 35.A H 2.842 1.942 SER 36.A N ALA 32.A O SER 36.A H 3.030 2.074 SER 36.A OG ALA 32.A O SER 36.A HG 3.243 2.768 SER 36.A OG ILE 56.A O SER 36.A HG 2.643 1.868 GLY 37.A N ALA 32.A O GLY 37.A H 3.209 2.485 GLY 37.A N LYS 33.A O GLY 37.A H 2.842 2.116 TYR 38.A N ALA 32.A O TYR 38.A H 3.515 2.576 ASN 39.A N SER 36.A OG ASN 39.A H 3.317 2.445 THR 40.A N LYS 1.A O THR 40.A H 2.993 2.016 ARG 41.A N ASN 39.A OD1 ARG 41.A H 3.217 2.293 ALA 42.A N ASN 39.A O ALA 42.A H 3.489 2.540 ASN 44.A N ASP 53.A O ASN 44.A H 3.035 2.121 ASN 44.A ND2 ASP 53.A OD2 ASN 44.A HD22 3.254 2.299 ASN 46.A N SER 51.A O ASN 46.A H 2.838 1.883 ASN 46.A ND2 SER 51.A O ASN 46.A HD22 3.327 2.615 ASN 46.A ND2 SER 51.A OG ASN 46.A HD22 3.196 2.325 ASN 46.A ND2 ASP 53.A OD2 ASN 46.A HD21 3.332 2.391 ASP 49.A N ASN 46.A O ASP 49.A H 3.412 2.560 SER 51.A N ASP 49.A OD1 SER 51.A H 3.140 2.316 SER 51.A OG ASP 49.A OD2 SER 51.A HG 3.201 2.525 THR 52.A N SER 61.A OG THR 52.A H 3.016 2.038 ASP 53.A N ASN 44.A O ASP 53.A H 2.876 1.903 TYR 54.A N ILE 59.A O TYR 54.A H 2.869 1.916 TYR 54.A OH ASP 67.A OD2 TYR 54.A HH 2.669 1.883 GLY 55.A N ALA 42.A O GLY 55.A H 2.807 1.955 GLN 58.A N GLY 55.A O GLN 58.A H 3.011 2.148 GLN 58.A NE2 ALA 42.A O GLN 58.A HE21 3.112 2.421 GLN 58.A NE2 ASP 53.A O GLN 58.A HE21 3.575 2.971 GLN 58.A NE2 GLY 55.A O GLN 58.A HE22 2.924 1.948 ILE 59.A N TYR 54.A O ILE 59.A H 3.049 2.141 ASN 60.A ND2 SER 51.A OG ASN 60.A HD21 2.988 2.024 ASN 60.A ND2 ASP 53.A OD1 ASN 60.A HD22 2.900 1.952 SER 61.A N THR 52.A O SER 61.A H 3.010 2.097 SER 61.A OG THR 70.A OG1 SER 61.A HG 2.770 1.965 ARG 62.A N ASN 60.A OD1 ARG 62.A H 2.910 1.990 ARG 62.A NE PRO 71.A O ARG 62.A HE 3.511 2.705 ARG 62.A NH1 ASP 49.A O ARG 62.A HH12 3.103 2.303 ARG 62.A NH2 ASP 49.A O ARG 62.A HH22 2.887 1.997 ARG 62.A NH2 PRO 71.A O ARG 62.A HH21 3.127 2.175 TRP 64.A N ASN 60.A O TRP 64.A H 3.141 2.217 ASN 66.A N LEU 79.A O ASN 66.A H 2.949 1.982 GLY 68.A N ASN 66.A OD1 GLY 68.A H 3.014 2.119 VAL 74.A N ARG 62.A O VAL 74.A H 2.858 1.897 ASN 75.A ND2 LEU 79.A O ASN 75.A HD21 3.431 2.811 ALA 76.A N TYR 63.A O ALA 76.A H 2.789 1.824 CYS 77.A N TRP 64.A O CYS 77.A H 2.872 1.977 CYS 77.A SG CYS 95.A O no hydrogen 3.516 N/A HIS 78.A N ASN 75.A O HIS 78.A H 3.024 2.167 LEU 79.A N ASN 75.A OD1 LEU 79.A H 2.965 2.022 CYS 81.A N ASN 66.A O CYS 81.A H 2.910 1.960 SER 82.A N SER 80.A OG SER 82.A H 3.219 2.297 ALA 83.A N SER 80.A O ALA 83.A H 3.030 2.179 LEU 84.A N CYS 81.A O LEU 84.A H 2.998 2.131 LEU 85.A N SER 82.A O LEU 85.A H 2.941 2.034 GLN 86.A NE2 ALA 83.A O GLN 86.A HE22 2.955 1.992 GLN 86.A NE2 ASP 91.A OD2 GLN 86.A HE21 2.992 2.219 ALA 90.A N ASN 88.A OD1 ALA 90.A H 2.903 1.936 VAL 93.A N VAL 89.A O VAL 93.A H 2.860 1.931 ALA 94.A N ALA 90.A O ALA 94.A H 2.979 2.046 CYS 95.A N ASP 91.A O CYS 95.A H 2.978 2.095 ALA 96.A N ALA 92.A O ALA 96.A H 2.890 1.966 LYS 97.A N VAL 93.A O LYS 97.A H 2.992 2.061 LYS 97.A NZ LEU 15.A O LYS 97.A HZ2 2.722 1.860 ARG 98.A N ALA 94.A O ARG 98.A H 3.312 2.436 ARG 98.A NH1 ARG 98.A O ARG 98.A HH11 2.965 2.012 ARG 98.A NH1 ASP 102.A OD1 ARG 98.A HH12 2.991 2.060 VAL 99.A N CYS 95.A O VAL 99.A H 2.940 2.006 VAL 100.A N ALA 96.A O VAL 100.A H 3.156 2.215 ARG 101.A N ARG 98.A O ARG 101.A H 3.102 2.191 ARG 101.A NH1 TYR 20.A OH ARG 101.A HH11 2.893 1.985 ASP 102.A N VAL 99.A O ASP 102.A H 3.425 2.485 GLY 105.A N ASP 102.A O GLY 105.A H 2.999 2.115 ARG 107.A N GLN 104.A O ARG 107.A H 3.068 2.233 ALA 108.A N GLY 105.A O ALA 108.A H 3.193 2.224 TRP 109.A N ILE 106.A O TRP 109.A H 3.358 2.395 TRP 109.A NE1 PHE 57.A O TRP 109.A HE1 2.909 2.205 TRP 112.A N TRP 109.A O TRP 112.A H 3.036 2.250 TRP 112.A NE1 ASN 27.A OD1 TRP 112.A HE1 3.065 2.166 ARG 113.A NE ARG 107.A O ARG 113.A HE 3.022 2.187 ARG 113.A NH2 ARG 107.A O ARG 113.A HH21 2.818 1.916 ASN 114.A N VAL 110.A O ASN 114.A H 3.133 2.171 ARG 115.A N ALA 111.A O ARG 115.A H 2.899 1.939 CYS 116.A N TRP 112.A O CYS 116.A H 2.823 1.983 GLN 117.A N TRP 112.A O GLN 117.A H 2.894 1.971 ARG 119.A N CYS 116.A O ARG 119.A H 3.154 2.281 ARG 119.A NH2 ASN 114.A O ARG 119.A HH21 2.724 1.868 ARG 122.A N ASP 120.A OD1 ARG 122.A H 3.430 2.514 TYR 124.A N VAL 121.A O TYR 124.A H 3.173 2.258 VAL 125.A N ARG 122.A O VAL 125.A H 3.081 2.199 GLN 126.A N GLN 123.A O GLN 126.A H 3.541 2.609 GLN 126.A NE2 ARG 122.A O GLN 126.A HE22 2.657 2.044 CYS 128.A N VAL 125.A O CYS 128.A H 3.269 2.322 CYS 128.A SG VAL 125.A O no hydrogen 3.683 N/A CYS 128.A SG GLN 126.A O no hydrogen 3.937 N/A