Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1yub_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): PHE 11.A N HIS 163.A O PHE 11.A H 2.876 2.162 LEU 18.A N SER 14.A O LEU 18.A H 3.257 2.409 GLN 20.A N VAL 17.A O GLN 20.A H 2.882 2.089 ILE 21.A N VAL 17.A O ILE 21.A H 3.347 2.422 ILE 22.A N LEU 18.A O ILE 22.A H 3.328 2.358 LYS 23.A N ASN 19.A O LYS 23.A H 3.088 2.343 GLN 24.A N ILE 21.A O GLN 24.A H 3.165 2.356 LEU 25.A N ILE 21.A O LEU 25.A H 3.095 2.401 THR 32.A N ARG 94.A O THR 32.A H 3.017 2.112 VAL 33.A N GLN 53.A O VAL 33.A H 2.949 2.059 TYR 34.A N LYS 96.A O TYR 34.A H 2.929 2.142 HIS 42.A ND1 GLY 41.A O HIS 42.A HD1 2.821 2.111 THR 45.A N LEU 43.A O THR 45.A H 2.837 2.091 ALA 48.A N THR 44.A O ALA 48.A H 2.922 2.108 LYS 49.A N LYS 46.A O LYS 49.A H 2.806 2.104 ILE 50.A N LEU 47.A O ILE 50.A H 3.293 2.417 SER 51.A OG GLU 29.A O SER 51.A HG 2.817 2.088 GLN 53.A NE2 THR 32.A OG1 GLN 53.A HE21 2.885 2.188 SER 56.A N THR 78.A O SER 56.A H 3.196 2.398 SER 56.A OG GLU 58.A O SER 56.A HG 2.774 2.223 PHE 64.A N HIS 62.A O PHE 64.A H 2.849 2.068 ASN 65.A ND2 SER 61.A O ASN 65.A HD21 3.126 2.332 LEU 73.A N GLU 69.A O LEU 73.A H 3.147 2.422 ARG 76.A N LYS 52.A O ARG 76.A H 3.321 2.371 THR 78.A N VAL 54.A O THR 78.A H 3.272 2.418 THR 78.A N THR 55.A OG1 THR 78.A H 3.134 2.446 ILE 80.A N SER 56.A O ILE 80.A H 3.305 2.417 PHE 87.A N ILE 84.A O PHE 87.A H 2.831 2.069 GLN 88.A NE2 TYR 34.A OH GLN 88.A HE21 2.917 2.073 GLN 88.A NE2 GLN 88.A O GLN 88.A HE21 3.513 2.978 GLN 93.A NE2 GLN 53.A OE1 GLN 93.A HE22 3.137 2.379 ARG 94.A N THR 30.A O ARG 94.A H 3.270 2.523 TYR 95.A N ALA 119.A O TYR 95.A H 2.942 2.077 GLY 99.A N TYR 123.A O GLY 99.A H 2.900 2.174 ILE 101.A N ILE 125.A O ILE 101.A H 3.072 2.388 ILE 110.A N SER 106.A O ILE 110.A H 3.046 2.094 LYS 111.A N GLN 108.A O LYS 111.A H 2.857 2.093 LYS 112.A N GLN 108.A O LYS 112.A H 3.165 2.247 VAL 113.A N ILE 109.A O VAL 113.A H 3.036 2.085 VAL 114.A N ILE 110.A O VAL 114.A H 3.195 2.402 PHE 115.A N LYS 112.A O PHE 115.A H 2.925 2.108 GLU 116.A N LYS 112.A O GLU 116.A H 2.961 2.102 SER 117.A N VAL 113.A O SER 117.A H 2.847 2.092 ASP 121.A N TYR 95.A O ASP 121.A H 3.306 2.455 ILE 122.A N LEU 175.A O ILE 122.A H 2.954 2.167 TYR 123.A N ILE 97.A O TYR 123.A H 2.958 2.150 LEU 124.A N ILE 173.A O LEU 124.A H 3.317 2.424 ILE 125.A N GLY 99.A O ILE 125.A H 3.032 2.141 VAL 126.A N VAL 171.A O VAL 126.A H 3.313 2.467 ARG 133.A N GLY 129.A O ARG 133.A H 2.866 2.089 THR 134.A N TYR 131.A O THR 134.A H 3.472 2.621 LEU 135.A N TYR 131.A O LEU 135.A H 3.308 2.351 ASP 136.A N LYS 132.A O ASP 136.A H 3.169 2.420 HIS 138.A N ASP 136.A OD1 HIS 138.A H 3.245 2.506 HIS 138.A ND1 ASP 136.A OD2 HIS 138.A HD1 3.340 2.434 THR 140.A N ILE 137.A O THR 140.A H 3.486 2.578 THR 140.A OG1 ARG 139.A O THR 140.A HG1 2.760 2.078 LEU 144.A N THR 140.A O LEU 144.A H 3.320 2.463 LEU 145.A N LEU 141.A O LEU 145.A H 3.230 2.320 HIS 146.A N LEU 143.A O HIS 146.A H 2.960 2.070 THR 147.A N LEU 143.A O THR 147.A H 3.230 2.275 GLN 148.A NE2 LEU 144.A O GLN 148.A HE21 3.308 2.746 VAL 149.A N HIS 146.A O VAL 149.A H 3.003 2.081 SER 150.A N THR 176.A O SER 150.A H 3.030 2.089 LEU 154.A N LEU 172.A O LEU 154.A H 3.374 2.397 LEU 157.A N SER 170.A O LEU 157.A H 2.959 2.095 PHE 162.A N ALA 159.A O PHE 162.A H 2.974 2.088 HIS 163.A N CYS 161.A O HIS 163.A H 3.009 2.248 SER 170.A OG VAL 126.A O SER 170.A HG 3.206 2.299 VAL 171.A N VAL 126.A O VAL 171.A H 2.931 2.082 LEU 172.A N LEU 155.A O LEU 172.A H 3.075 2.110 ILE 173.A N LEU 124.A O ILE 173.A H 3.258 2.285 LYS 174.A N GLN 152.A O LYS 174.A H 3.327 2.428 LEU 175.A N ILE 173.A O LEU 175.A H 2.912 2.212 THR 176.A OG1 SER 150.A O THR 176.A HG1 3.138 2.384 ARG 177.A NE VAL 114.A O ARG 177.A HE 3.257 2.715 HIS 178.A N GLN 148.A O HIS 178.A H 2.928 2.164 ASP 181.A N THR 147.A O ASP 181.A H 3.071 2.095 TRP 187.A N ASP 184.A O TRP 187.A H 3.159 2.356 TYR 190.A N TRP 187.A O TYR 190.A H 2.772 2.066 THR 191.A N TRP 187.A O THR 191.A H 3.031 2.087 THR 191.A OG1 LYS 188.A O THR 191.A HG1 2.819 2.100 TYR 192.A N LYS 188.A O TYR 192.A H 3.542 2.578 PHE 193.A N LEU 189.A O PHE 193.A H 3.245 2.306 VAL 194.A N TYR 190.A O VAL 194.A H 2.979 2.064 SER 195.A N THR 191.A O SER 195.A H 2.968 2.029 LYS 196.A N TYR 192.A O LYS 196.A H 3.264 2.362 TRP 197.A N PHE 193.A O TRP 197.A H 2.997 2.100 VAL 198.A N SER 195.A O VAL 198.A H 2.967 2.087 ASN 199.A N SER 195.A O ASN 199.A H 3.264 2.353 GLU 201.A N LYS 196.A O GLU 201.A H 2.970 2.098 TYR 202.A OH TRP 197.A O TYR 202.A HH 3.391 2.670 GLN 204.A N GLU 201.A O GLN 204.A H 3.202 2.400 LEU 205.A N GLU 201.A O LEU 205.A H 3.020 2.106 PHE 206.A N TYR 202.A O PHE 206.A H 3.029 2.180 GLN 213.A N ASN 209.A O GLN 213.A H 3.010 2.104 ALA 214.A N GLN 210.A O ALA 214.A H 3.298 2.432 MET 215.A N PHE 211.A O MET 215.A H 2.884 2.098 MET 215.A N HIS 212.A O MET 215.A H 2.917 2.195 LYS 216.A N HIS 212.A O LYS 216.A H 3.178 2.224 HIS 217.A N GLN 213.A O HIS 217.A H 3.020 2.098 ALA 218.A N ALA 214.A O ALA 218.A H 3.193 2.383 LYS 219.A N LYS 216.A O LYS 219.A H 2.919 2.101 VAL 220.A N MET 215.A O VAL 220.A H 3.125 2.176 LEU 232.A N TYR 228.A O LEU 232.A H 2.917 2.145 LEU 232.A N GLU 229.A O LEU 232.A H 3.036 2.354 SER 233.A N GLU 229.A O SER 233.A H 3.217 2.294 ILE 234.A N GLN 230.A O ILE 234.A H 2.849 2.072 PHE 235.A N VAL 231.A O PHE 235.A H 3.082 2.226 ASN 236.A N LEU 232.A O ASN 236.A H 2.970 2.087 SER 237.A N SER 233.A O SER 237.A H 2.973 2.093 SER 237.A N ILE 234.A O SER 237.A H 3.065 2.356 TYR 238.A N ILE 234.A O TYR 238.A H 3.364 2.434 LEU 239.A N PHE 235.A O LEU 239.A H 2.899 2.015 LEU 240.A N ASN 236.A O LEU 240.A H 3.090 2.373 LEU 240.A N SER 237.A O LEU 240.A H 2.852 2.094 PHE 241.A N SER 237.A O PHE 241.A H 3.040 2.339 PHE 241.A N TYR 238.A O PHE 241.A H 3.416 2.590 ASN 242.A N TYR 238.A O ASN 242.A H 3.059 2.146 ARG 244.A NH2 GLY 243.A O ARG 244.A HH21 3.278 2.504