Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 2jc5_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 2.A N TYR 254.A O LEU 2.A H 2.888 2.134 LYS 3.A N ASP 30.A OD2 LYS 3.A H 2.900 2.061 LYS 3.A NZ SER 27.A O LYS 3.A HZ1.A 3.236 2.661 ILE 4.A N VAL 252.A O ILE 4.A H 2.964 2.127 ILE 5.A N ILE 31.A O ILE 5.A H 2.972 2.150 SER 6.A N LEU 250.A O SER 6.A H 2.866 2.035 ALA 7.A N CYS 33.A O ALA 7.A H 2.862 2.051 ASN 8.A ND2 GLU 36.A OE1.B ASN 8.A HD22.A 2.977 2.040 ASN 8.A ND2 ASP 149.A OD2 ASN 8.A HD21.A 2.843 2.024 VAL 9.A N GLN 35.A O VAL 9.A H 2.890 2.103 ASN 10.A N ASN 8.A OD1 ASN 10.A H 2.925 2.155 GLY 11.A N GLU 36.A O.A GLY 11.A H 2.812 2.013 GLY 11.A N GLU 36.A O.B GLY 11.A H 2.807 2.002 ILE 12.A N LEU 37.A O ILE 12.A H 2.911 2.092 ARG 13.A NH2 LYS 38.A O ARG 13.A HH21 2.849 2.069 ALA 15.A N GLY 11.A O ALA 15.A H 2.909 2.090 TYR 16.A N ILE 12.A O TYR 16.A H 2.892 2.062 LYS 17.A N ARG 13.A O LYS 17.A H 3.271 2.557 LYS 17.A N SER 14.A O LYS 17.A H 3.036 2.401 LYS 18.A N ALA 15.A O LYS 18.A H 3.000 2.233 PHE 20.A N ALA 15.A O PHE 20.A H 3.031 2.185 GLU 22.A N GLU 22.A OE1 GLU 22.A H 2.789 2.044 TYR 23.A N GLY 19.A O TYR 23.A H 3.147 2.321 ILE 24.A N PHE 20.A O ILE 24.A H 2.998 2.244 ILE 24.A N TYR 21.A O ILE 24.A H 3.197 2.597 ALA 26.A N GLU 22.A O ALA 26.A H 2.911 2.061 SER 27.A N TYR 23.A O SER 27.A H 2.843 2.027 GLY 28.A N ALA 25.A O GLY 28.A H 3.053 2.219 ALA 29.A N SER 27.A OG ALA 29.A H 3.089 2.260 ASP 30.A N LYS 3.A O ASP 30.A H 2.924 2.176 ILE 31.A N LYS 3.A O ILE 31.A H 3.290 2.475 VAL 32.A N TYR 72.A O VAL 32.A H 2.850 2.034 CYS 33.A N ILE 5.A O CYS 33.A H 2.807 1.970 CYS 33.A SG ILE 106.A O.A no hydrogen 3.550 N/A VAL 34.A N ALA 70.A O VAL 34.A H 2.884 2.057 GLN 35.A N ALA 7.A O GLN 35.A H 2.935 2.160 GLN 35.A NE2 CYS 33.A O GLN 35.A HE22.A 3.393 2.853 GLN 35.A NE2 SER 107.A OG GLN 35.A HE21.A 3.019 2.197 GLU 36.A N.B GLY 68.A O GLU 36.A H.B 2.800 2.216 LEU 37.A N GLY 68.A O LEU 37.A H 3.149 2.340 LYS 38.A N SER 67.A O LYS 38.A H 2.827 2.016 GLN 40.A N ASP 43.A OD2 GLN 40.A H 2.888 2.052 GLN 40.A NE2 ALA 61.A O GLN 40.A HE21.A 3.053 2.234 GLN 40.A NE2 GLU 62.A O GLN 40.A HE22.A 2.865 2.368 ASP 43.A N GLN 40.A O ASP 43.A H 2.863 2.076 LEU 44.A N GLU 41.A O LEU 44.A H 3.080 2.244 MET 48.A N SER 45.A O MET 48.A H 2.913 2.141 LYS 49.A N SER 45.A O LYS 49.A H 3.197 2.599 LYS 49.A N ALA 46.A O LYS 49.A H 3.160 2.407 ASN 50.A N ALA 46.A O ASN 50.A H 2.874 2.030 ASN 50.A ND2 MET 54.A O ASN 50.A HD21.A 2.930 1.881 HIS 52.A N TYR 21.A OH HIS 52.A H 3.182 2.396 HIS 52.A NE2 TYR 21.A O HIS 52.A HE2.A 2.725 1.869 GLY 53.A N ASN 50.A O GLY 53.A H 3.024 2.260 MET 54.A N PRO 51.A O MET 54.A H 2.874 2.024 HIS 55.A N SER 73.A O HIS 55.A H 2.814 2.068 HIS 57.A N VAL 71.A O HIS 57.A H 3.017 2.212 TRP 58.A NE1 GLU 41.A OE1.A TRP 58.A HE1 3.012 2.206 HIS 59.A N VAL 69.A O HIS 59.A H 2.883 2.072 CYS 60.A SG.A ALA 39.A O no hydrogen 3.476 N/A CYS 60.A SG.B ALA 61.A O no hydrogen 3.997 N/A GLU 62.A N ARG 91.A O GLU 62.A H 2.933 2.094 SER 67.A OG GLU 92.A O SER 67.A HG.A 2.630 2.224 GLY 68.A N GLY 93.A O GLY 68.A H 2.974 2.322 VAL 69.A N HIS 59.A O VAL 69.A H 3.070 2.271 ALA 70.A N VAL 34.A O ALA 70.A H 3.018 2.200 VAL 71.A N HIS 57.A O VAL 71.A H 2.812 1.993 TYR 72.A N VAL 32.A O TYR 72.A H 2.797 1.947 SER 73.A N HIS 55.A O SER 73.A H 2.839 2.045 LYS 74.A N ASP 30.A O LYS 74.A H 2.975 2.155 ASP 78.A N ASP 99.A O ASP 78.A H 2.855 2.145 ASN 79.A ND2.A ASP 99.A OD2 ASN 79.A HD21.A 2.917 1.935 ASN 79.A ND2.B ASP 78.A OD1 ASN 79.A HD21.B 3.257 2.517 GLN 81.A N ARG 97.A O GLN 81.A H 2.853 2.028 GLN 81.A NE2 GLY 83.A O GLN 81.A HE21.A 2.895 2.128 GLY 83.A N PHE 95.A O GLY 83.A H 2.884 2.084 MET 84.A N ASP 90.A OD1 MET 84.A H 2.827 1.993 GLY 85.A N ASP 90.A OD2 GLY 85.A H 2.671 1.974 PHE 89.A N ILE 86.A O PHE 89.A H 3.145 2.463 ASP 90.A N ILE 86.A O ASP 90.A H 2.865 2.010 ARG 91.A N GLU 87.A O ARG 91.A H 2.941 2.139 ARG 91.A NH2.B GLU 88.A O no hydrogen 3.434 N/A ARG 91.A NH2.B GLU 92.A OE2 no hydrogen 3.515 N/A GLU 92.A N PHE 89.A O GLU 92.A H 2.878 2.061 GLY 93.A N ASP 90.A O GLY 93.A H 3.134 2.301 ARG 94.A NE GLU 92.A OE1 ARG 94.A HE 2.773 1.955 ARG 94.A NH1 TYR 109.A O ARG 94.A HH11 2.890 2.055 ARG 94.A NH2 GLU 92.A OE1 ARG 94.A HH21 3.066 2.386 VAL 96.A N SER 107.A O VAL 96.A H 3.144 2.335 ARG 97.A N GLN 81.A O ARG 97.A H 2.907 2.071 ARG 97.A NE ASP 99.A OD1 ARG 97.A HE 2.944 2.179 ARG 97.A NE SER 104.A OG ARG 97.A HE 3.407 2.614 ARG 97.A NH1 GLU 140.A OE2 ARG 97.A HH12 2.913 2.063 ARG 97.A NH2 SER 104.A OG ARG 97.A HH21 2.964 2.304 ARG 97.A NH2 GLU 140.A OE1 ARG 97.A HH22 2.894 2.044 ARG 97.A NH2 GLU 140.A OE2 ARG 97.A HH22 3.544 2.885 CYS 98.A N VAL 105.A O CYS 98.A H 2.890 2.040 ASP 99.A N ASN 79.A O.A ASP 99.A H 2.903 2.047 ASP 99.A N ASN 79.A O.B ASP 99.A H 2.826 1.988 PHE 100.A N LEU 103.A O PHE 100.A H 2.723 1.881 GLY 101.A N ASP 78.A OD2 GLY 101.A H 2.856 1.996 LEU 103.A N PHE 100.A O LEU 103.A H 2.952 2.116 SER 104.A N ASP 143.A O SER 104.A H 2.787 1.987 VAL 105.A N CYS 98.A O VAL 105.A H 2.904 2.080 ILE 106.A N.A VAL 145.A O ILE 106.A H.A 2.920 2.098 ILE 106.A N.B VAL 145.A O ILE 106.A H.B 2.927 2.113 SER 107.A N VAL 96.A O SER 107.A H 2.941 2.163 SER 107.A OG VAL 34.A O SER 107.A HG.A 2.921 2.240 SER 107.A OG ALA 70.A O SER 107.A HG.A 3.465 2.828 LEU 108.A N CYS 147.A O LEU 108.A H 2.890 2.170 TYR 109.A N ARG 94.A O TYR 109.A H 2.990 2.174 LEU 110.A N ASP 149.A O LEU 110.A H 2.908 2.056 ARG 119.A N ALA 116.A O ARG 119.A H 3.025 2.386 ARG 119.A NH1 GLU 92.A OE2 ARG 119.A HH12 2.985 2.173 ARG 119.A NH2 GLU 92.A OE1 ARG 119.A HH22 2.997 2.167 GLN 120.A N ALA 116.A O GLN 120.A H 3.015 2.208 GLN 120.A NE2 GLU 175.A OE2 GLN 120.A HE22.A 2.910 2.074 GLN 121.A N.A GLU 117.A O GLN 121.A H.A 2.820 2.007 GLN 121.A N.B GLU 117.A O GLN 121.A H.B 2.830 2.041 GLN 121.A NE2.A GLU 117.A OE2.A GLN 121.A HE21.A 3.175 2.319 VAL 122.A N GLU 118.A O VAL 122.A H 2.970 2.155 LYS 123.A N ARG 119.A O LYS 123.A H 2.833 2.011 LYS 123.A NZ ASN 151.A O LYS 123.A HZ2.A 2.785 1.887 LYS 123.A NZ GLU 175.A OE2 LYS 123.A HZ1.A 2.751 1.900 TYR 124.A N GLN 120.A O TYR 124.A H 2.938 2.111 ARG 125.A N GLN 121.A O.A ARG 125.A H 2.876 2.032 ARG 125.A N GLN 121.A O.B ARG 125.A H 2.966 2.125 ARG 125.A NE.B GLU 88.A OE1.A ARG 125.A HE.B 3.546 2.670 ARG 125.A NE.B GLU 88.A OE2.A ARG 125.A HE.B 3.314 2.548 ARG 125.A NH1.A GLU 88.A OE1.A ARG 125.A HH12.A 2.068 1.316 ARG 125.A NH2.A GLU 88.A OE2.A ARG 125.A HH22.A 1.992 1.205 ARG 125.A NH2.B GLU 88.A OE2.A ARG 125.A HH21.B 2.753 1.908 PHE 126.A N VAL 122.A O PHE 126.A H 2.800 1.987 LEU 127.A N LYS 123.A O LEU 127.A H 2.947 2.119 ASP 128.A N TYR 124.A O ASP 128.A H 3.090 2.293 ALA 129.A N ARG 125.A O ALA 129.A H 2.987 2.193 PHE 130.A N PHE 126.A O PHE 130.A H 2.785 2.005 TYR 131.A N LEU 127.A O TYR 131.A H 3.019 2.201 LEU 134.A N PHE 130.A O LEU 134.A H 2.944 2.122 GLU 135.A N TYR 131.A O GLU 135.A H 2.944 2.146 ALA 136.A N PRO 132.A O ALA 136.A H 2.924 2.084 MET 137.A N MET 133.A O MET 137.A H 2.812 1.972 LYS 138.A N LEU 134.A O LYS 138.A H 2.995 2.164 ASN 139.A N GLU 135.A O ASN 139.A H 3.094 2.356 ASN 139.A N ALA 136.A O ASN 139.A H 3.095 2.509 GLU 140.A N MET 137.A O GLU 140.A H 3.077 2.277 ARG 142.A NE SER 104.A OG ARG 142.A HE 3.322 2.593 ARG 142.A NH1 GLY 101.A O ARG 142.A HH12 3.065 2.428 ARG 142.A NH2 GLY 101.A O ARG 142.A HH22 2.809 2.099 ARG 142.A NH2 SER 104.A OG ARG 142.A HH21 2.917 2.172 ASP 143.A N ARG 102.A O ASP 143.A H 2.946 2.129 VAL 145.A N SER 104.A O VAL 145.A H 2.906 2.092 VAL 146.A N MET 224.A O VAL 146.A H 2.814 1.972 CYS 147.A N ILE 106.A O.A CYS 147.A H 2.978 2.175 CYS 147.A N ILE 106.A O.B CYS 147.A H 2.778 2.010 GLY 148.A N TYR 222.A O GLY 148.A H 3.064 2.258 ASP 149.A N LEU 108.A O ASP 149.A H 3.094 2.361 TRP 150.A N ILE 220.A O TRP 150.A H 2.884 2.090 ASN 151.A N ASP 149.A OD1 ASN 151.A H 3.069 2.407 ALA 153.A N GLY 170.A O ALA 153.A H 2.825 1.996 GLN 155.A N ASP 158.A OD2 GLN 155.A H 2.772 1.973 ASP 158.A N GLN 155.A O ASP 158.A H 2.903 2.080 LEU 159.A N ASN 156.A O LEU 159.A H 3.340 2.481 LYS 160.A N GLY 217.A O LYS 160.A H 2.952 2.149 LYS 160.A NZ.B ASP 215.A O LYS 160.A HZ3.B 2.943 2.194 GLY 164.A N ASN 161.A OD1 GLY 164.A H 2.931 2.200 GLN 166.A NE2 TRP 162.A O GLN 166.A HE21.A 3.317 2.539 GLN 166.A NE2 LYS 163.A O GLN 166.A HE21.A 3.604 3.031 ASN 168.A N ASN 165.A O ASN 168.A H 3.018 2.171 GLY 170.A N GLU 175.A OE1 GLY 170.A H 2.782 2.012 PHE 171.A N ASN 168.A O PHE 171.A H 2.976 2.136 LEU 172.A N GLU 175.A OE1 LEU 172.A H 3.139 2.297 GLU 174.A N GLU 174.A OE1.A GLU 174.A H 2.634 1.907 ARG 176.A N LEU 172.A O ARG 176.A H 2.981 2.143 ARG 176.A NE HIS 154.A O ARG 176.A HE 2.937 2.174 ARG 176.A NH2 GLN 155.A OE1.B ARG 176.A HH21 3.210 2.473 GLU 177.A N PRO 173.A O GLU 177.A H 2.953 2.118 TRP 178.A N GLU 174.A O TRP 178.A H 3.089 2.329 ILE 179.A N GLU 175.A O ILE 179.A H 3.121 2.287 GLY 180.A N ARG 176.A O GLY 180.A H 2.944 2.113 LYS 181.A N GLU 177.A O LYS 181.A H 2.928 2.172 VAL 182.A N TRP 178.A O VAL 182.A H 3.014 2.193 ILE 183.A N ILE 179.A O ILE 183.A H 3.073 2.256 HIS 184.A N GLY 180.A O HIS 184.A H 2.744 1.888 LYS 185.A N LYS 181.A O LYS 185.A H 2.794 2.022 LEU 186.A N LYS 181.A O LEU 186.A H 2.936 2.124 GLY 187.A N ILE 183.A O GLY 187.A H 2.999 2.356 TRP 188.A N VAL 182.A O TRP 188.A H 3.134 2.330 TRP 188.A NE1 LEU 134.A O TRP 188.A HE1 3.123 2.378 THR 189.A N VAL 225.A O THR 189.A H 2.924 2.085 MET 191.A N GLN 223.A O MET 191.A H 3.028 2.188 TRP 192.A NE1 VAL 199.A O TRP 192.A HE1 2.896 2.065 ARG 193.A NH1 TYR 196.A O ARG 193.A HH11 2.807 2.237 ARG 193.A NH1 VAL 199.A O ARG 193.A HH12 2.788 1.944 ARG 193.A NH2 ASP 158.A OD1 ARG 193.A HH21 2.778 1.947 ARG 193.A NH2 VAL 199.A O ARG 193.A HH22 3.411 2.757 ARG 193.A NH2 PRO 200.A O ARG 193.A HH22 3.101 2.352 THR 194.A N ASP 190.A O THR 194.A H 2.977 2.165 LEU 195.A N MET 191.A O LEU 195.A H 2.932 2.088 TYR 196.A N TRP 192.A O TYR 196.A H 2.905 2.106 VAL 199.A N TYR 196.A O VAL 199.A H 3.167 2.309 THR 203.A N TRP 218.A O THR 203.A H 2.878 2.052 TRP 204.A N TRP 218.A O TRP 204.A H 2.941 2.248 TRP 204.A NE1 ASP 246.A OD2 TRP 204.A HE1 3.035 2.243 TRP 205.A N ASP 246.A O TRP 205.A H 3.192 2.357 TRP 205.A NE1 ASP 215.A OD1 TRP 205.A HE1 2.910 2.086 GLY 209.A N ASN 207.A OD1 GLY 209.A H 2.793 2.101 ALA 211.A N ASN 207.A OD1 ALA 211.A H 3.280 2.495 TYR 212.A N GLY 209.A O TYR 212.A H 3.106 2.506 ALA 213.A N GLY 209.A O ALA 213.A H 2.914 2.065 LYS 214.A N GLN 210.A O.A LYS 214.A H 2.818 2.003 LYS 214.A N GLN 210.A O.B LYS 214.A H 3.007 2.212 ASP 215.A N TYR 212.A O ASP 215.A H 2.930 2.112 VAL 216.A N ALA 211.A O VAL 216.A H 2.882 2.058 TRP 218.A N TRP 204.A O TRP 218.A H 2.867 2.078 ARG 219.A N ASP 158.A O ARG 219.A H 2.714 1.881 ARG 219.A NE ASP 158.A OD1 ARG 219.A HE 2.817 2.017 ARG 219.A NH1 ASP 190.A OD1 ARG 219.A HH12 2.928 2.111 ARG 219.A NH1 ASP 190.A OD2 ARG 219.A HH12 3.350 2.684 ARG 219.A NH2 ASP 158.A OD1 ARG 219.A HH21 2.985 2.258 ARG 219.A NH2 ASP 190.A OD2 ARG 219.A HH22 2.837 2.004 ILE 220.A N THR 203.A OG1 ILE 220.A H 3.212 2.469 TYR 222.A N GLY 148.A O TYR 222.A H 2.961 2.162 GLN 223.A NE2 ILE 4.A O GLN 223.A HE22.A 2.993 2.152 GLN 223.A NE2 LEU 250.A O GLN 223.A HE21.A 3.295 2.708 MET 224.A N VAL 146.A O MET 224.A H 2.958 2.113 VAL 225.A N THR 189.A O VAL 225.A H 2.912 2.152 THR 226.A N ILE 144.A O THR 226.A H 3.140 2.350 THR 226.A OG1 ARG 142.A O THR 226.A HG1.A 3.555 2.807 ALA 230.A N THR 226.A O ALA 230.A H 2.934 2.127 ALA 231.A N PRO 227.A O ALA 231.A H 3.175 2.382 LYS 232.A N LEU 229.A O LYS 232.A H 2.895 2.098 ALA 233.A N ALA 230.A O ALA 233.A H 3.168 2.334 VAL 234.A N GLU 253.A O VAL 234.A H 2.871 2.027 ALA 236.A N TYR 196.A OH ALA 236.A H 3.045 2.246 HIS 237.A N VAL 251.A O HIS 237.A H 2.921 2.142 TYR 239.A N PRO 249.A O TYR 239.A H 2.885 2.053 LYS 243.A NZ SER 245.A O LYS 243.A HZ1.A 2.891 2.160 SER 245.A OG ASN 8.A O SER 245.A HG.A 2.623 1.802 HIS 247.A N SER 245.A OG HIS 247.A H 3.086 2.244 HIS 247.A ND1 ASP 221.A OD2 HIS 247.A HD1.A 2.639 1.753 ALA 248.A N THR 203.A O ALA 248.A H 2.829 2.050 LEU 250.A N SER 6.A O LEU 250.A H 2.875 2.027 VAL 251.A N HIS 237.A O VAL 251.A H 2.885 2.026 VAL 252.A N ILE 4.A O VAL 252.A H 2.999 2.157 GLU 253.A N SER 235.A O GLU 253.A H 2.937 2.086 TYR 254.A N LEU 2.A O TYR 254.A H 2.817 1.976 ASP 255.A N LYS 232.A O ASP 255.A H 2.801 1.945 TYR 256.A OH ASP 143.A OD2 TYR 256.A HH.A 2.623 1.977