Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 2k8m_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 2.A N SER 125.A OG LYS 2.A H 2.735 1.909 LEU 3.A N LEU 123.A O LEU 3.A H 2.978 2.206 LYS 5.A N ALA 27.A O LYS 5.A H 3.334 2.466 LEU 6.A N ARG 121.A O LEU 6.A H 2.777 1.794 GLN 7.A N GLN 25.A O GLN 7.A H 2.941 2.021 GLN 7.A NE2 GLN 25.A OE1 GLN 7.A HE21 2.950 2.046 TYR 8.A N GLU 119.A O TYR 8.A H 3.055 2.077 TYR 8.A OH GLU 119.A OE2 TYR 8.A HH 2.621 1.679 SER 9.A N GLY 22.A O SER 9.A H 2.897 1.915 SER 9.A OG GLY 22.A O SER 9.A HG 3.545 2.672 LEU 10.A N THR 117.A O LEU 10.A H 2.911 1.953 ASP 11.A N LEU 20.A O ASP 11.A H 3.209 2.247 ASP 13.A N GLN 18.A O ASP 13.A H 2.996 2.054 GLN 15.A N ASP 13.A OD1 GLN 15.A H 2.726 1.766 GLN 15.A NE2 ASP 13.A OD1 GLN 15.A HE21 2.968 2.020 GLN 15.A NE2 ASP 13.A OD2 GLN 15.A HE21 2.857 2.105 ASN 16.A N ASP 13.A OD1 ASN 16.A H 3.483 2.571 GLN 18.A N ASP 13.A O GLN 18.A H 3.287 2.343 LEU 19.A N PHE 73.A O LEU 19.A H 3.241 2.313 LEU 20.A N ASP 11.A O LEU 20.A H 2.714 1.800 VAL 21.A N PHE 71.A O VAL 21.A H 3.159 2.215 GLY 22.A N SER 9.A O GLY 22.A H 3.429 2.564 ILE 24.A N GLN 7.A O ILE 24.A H 2.704 1.780 GLN 25.A N GLN 7.A O GLN 25.A H 3.386 2.492 ALA 27.A N LYS 5.A O ALA 27.A H 3.167 2.218 LEU 32.A N THR 37.A O LEU 32.A H 2.887 2.033 THR 37.A N ASP 33.A O THR 37.A H 3.279 2.376 SER 38.A OG PRO 30.A O SER 38.A HG 2.771 1.831 ASP 39.A N ASP 91.A OD1 ASP 39.A H 2.796 1.818 TYR 41.A N TYR 90.A O TYR 41.A H 2.709 1.738 LYS 43.A N ALA 88.A O LYS 43.A H 2.862 1.876 LYS 43.A NZ TYR 41.A OH LYS 43.A HZ3 3.165 2.235 LYS 43.A NZ GLU 55.A OE2 LYS 43.A HZ1 2.651 1.628 VAL 44.A N PHE 54.A O VAL 44.A H 3.205 2.277 PHE 45.A N VAL 86.A O PHE 45.A H 3.014 2.044 LYS 50.A N LEU 47.A O LYS 50.A H 3.071 2.343 LYS 51.A N ASP 49.A OD2 LYS 51.A H 3.059 2.138 LYS 51.A NZ ASP 49.A O LYS 51.A HZ3 3.143 2.212 LYS 51.A NZ ASP 49.A OD1 LYS 51.A HZ2 2.719 1.692 LYS 52.A NZ ASP 49.A OD2 LYS 52.A HZ3 2.737 1.781 LYS 52.A NZ LYS 74.A O LYS 52.A HZ2 2.771 1.908 THR 56.A N VAL 42.A O THR 56.A H 3.044 2.100 THR 56.A OG1 VAL 42.A O THR 56.A HG1 2.670 1.708 LYS 57.A N GLU 69.A OE2 LYS 57.A H 3.261 2.449 HIS 59.A ND1 PRO 40.A O HIS 59.A HD1 2.694 1.741 HIS 59.A NE2 GLU 69.A OE2 HIS 59.A HE2 2.625 1.658 ARG 60.A NH1 ARG 60.A O ARG 60.A HH11 2.784 1.788 LYS 61.A N ASP 39.A OD1 LYS 61.A H 2.716 1.743 LYS 61.A NZ ASP 33.A OD2 LYS 61.A HZ3 2.685 1.671 LYS 61.A NZ ASP 39.A OD1 LYS 61.A HZ2 2.659 1.639 THR 62.A N SER 38.A O THR 62.A H 2.906 1.938 ASN 64.A N THR 62.A OG1 ASN 64.A H 3.374 2.417 ASN 64.A ND2 ASN 64.A O ASN 64.A HD21 2.815 2.063 ASN 68.A ND2 ASN 68.A O ASN 68.A HD21 2.769 1.904 GLU 69.A N GLU 69.A OE1 GLU 69.A H 2.821 2.058 GLN 70.A NE2 THR 72.A OG1 GLN 70.A HE22 2.907 2.009 PHE 71.A N VAL 21.A O PHE 71.A H 3.080 2.131 PHE 73.A N LEU 19.A O PHE 73.A H 3.109 2.225 LYS 74.A N THR 72.A O LYS 74.A H 2.848 2.091 TYR 77.A N ASN 17.A OD1 TYR 77.A H 2.894 1.955 GLU 79.A N PRO 76.A O GLU 79.A H 2.752 1.834 LEU 80.A N TYR 77.A O LEU 80.A H 3.268 2.347 LYS 83.A NZ ASP 49.A OD1 LYS 83.A HZ1 2.742 1.706 LYS 83.A NZ GLU 79.A OE1 LYS 83.A HZ2 2.715 1.675 VAL 86.A N PHE 45.A O VAL 86.A H 3.232 2.292 MET 87.A N PHE 104.A O MET 87.A H 2.799 1.828 ALA 88.A N LYS 43.A O ALA 88.A H 3.231 2.312 VAL 89.A N GLY 102.A O VAL 89.A H 2.948 2.000 TYR 90.A N TYR 41.A O TYR 90.A H 2.896 1.939 ASP 91.A N ASP 99.A O ASP 91.A H 3.523 2.596 ASP 93.A N ASP 91.A OD2 ASP 93.A H 2.778 1.915 PHE 95.A N ASP 93.A OD1 PHE 95.A H 2.956 1.982 SER 96.A N ASP 93.A OD2 SER 96.A H 2.807 1.820 HIS 98.A N SER 96.A O HIS 98.A H 2.754 1.880 HIS 98.A ND1 ASP 93.A OD1 HIS 98.A HD1 2.609 1.615 ILE 101.A N VAL 89.A O ILE 101.A H 3.289 2.457 GLU 103.A N GLN 124.A O GLU 103.A H 2.912 1.962 PHE 104.A N MET 87.A O PHE 104.A H 3.017 2.211 LYS 105.A NZ GLU 103.A OE1 LYS 105.A HZ2 2.596 1.550 VAL 106.A N LEU 85.A O VAL 106.A H 3.349 2.410 MET 108.A N LYS 83.A O MET 108.A H 3.442 2.600 THR 110.A N PRO 107.A O THR 110.A H 3.122 2.320 VAL 111.A N PRO 107.A O VAL 111.A H 3.293 2.377 GLY 114.A N ASP 112.A OD2 GLY 114.A H 2.851 1.980 THR 117.A N LEU 10.A O THR 117.A H 2.714 1.780 GLU 119.A N TYR 8.A O GLU 119.A H 3.066 2.112 ARG 121.A NE GLU 119.A OE2 ARG 121.A HE 3.156 2.399 ARG 121.A NH2 GLU 119.A OE1 ARG 121.A HH21 3.381 2.621 ARG 121.A NH2 GLU 119.A OE2 ARG 121.A HH21 2.632 1.646 LEU 123.A N GLY 4.A O LEU 123.A H 2.861 1.881 GLN 124.A N GLU 103.A O GLN 124.A H 3.476 2.525 SER 125.A OG LYS 2.A O SER 125.A HG 2.639 1.768 ALA 126.A N GLN 124.A O ALA 126.A H 2.937 2.163 GLU 127.A N SER 125.A O GLU 127.A H 3.003 2.260 LYS 128.A NZ GLU 103.A OE2 LYS 128.A HZ1 2.615 1.584 LYS 128.A NZ ALA 126.A O LYS 128.A HZ2 2.840 1.947