Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 2kdo_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): THR 7.A OG1 ILE 5.A O THR 7.A HG1 3.138 2.344 GLN 11.A N ASN 10.A OD1 GLN 11.A H 2.631 1.768 ARG 13.A N GLN 54.A OE1 ARG 13.A H 2.842 1.938 ARG 13.A NH1 ILE 12.A O ARG 13.A HH11 2.759 1.922 ASN 16.A N ARG 13.A O ASN 16.A H 3.069 2.124 ASN 16.A ND2 PRO 8.A O ASN 16.A HD22 2.698 1.769 ALA 18.A N CYS 33.A O ALA 18.A H 2.695 1.775 ARG 21.A NE GLU 94.A OE1 ARG 21.A HE 2.722 1.751 ARG 21.A NH1 GLU 30.A OE1 ARG 21.A HH11 2.667 1.669 MET 22.A N PHE 29.A O MET 22.A H 2.811 1.862 LYS 23.A NZ GLU 94.A OE2 LYS 23.A HZ2 2.634 1.599 ARG 24.A N LYS 27.A O ARG 24.A H 2.983 2.131 ARG 28.A NH1 LYS 27.A O ARG 28.A HH11 3.180 2.271 PHE 29.A N MET 22.A O PHE 29.A H 3.141 2.302 GLU 30.A N PHE 59.A O GLU 30.A H 2.804 1.820 ILE 31.A N VAL 20.A O ILE 31.A H 2.890 1.910 TYR 34.A N VAL 52.A O TYR 34.A H 2.719 1.787 TYR 34.A OH ASN 10.A O TYR 34.A HH 2.743 1.796 LYS 35.A N ASN 16.A O LYS 35.A H 3.214 2.379 LYS 35.A NZ ASN 16.A OD1 LYS 35.A HZ3 2.730 1.701 ASN 36.A ND2 ASN 36.A O ASN 36.A HD21 2.899 2.263 LYS 37.A N LYS 35.A O LYS 37.A H 2.854 2.113 LYS 37.A NZ ASP 99.A OD1 LYS 37.A HZ2 2.616 1.611 GLY 40.A N LYS 37.A O GLY 40.A H 2.830 1.935 ARG 42.A N VAL 39.A O ARG 42.A H 3.120 2.238 ARG 42.A NE THR 91.A OG1 ARG 42.A HE 2.762 1.789 ARG 42.A NH2 THR 91.A OG1 ARG 42.A HH21 3.306 2.544 SER 43.A N GLY 40.A O SER 43.A H 3.002 2.073 VAL 45.A N GLY 40.A O VAL 45.A H 2.860 1.895 LYS 47.A NZ ASP 48.A OD1 LYS 47.A HZ3 2.632 1.630 LYS 47.A NZ GLU 51.A OE1 LYS 47.A HZ2 2.661 1.662 ASP 50.A N ASP 48.A OD2 ASP 50.A H 2.661 1.704 GLU 51.A N ASP 48.A OD2 GLU 51.A H 2.702 1.803 LEU 53.A N ASP 50.A O LEU 53.A H 3.003 2.092 GLN 54.A NE2 GLN 11.A O GLN 54.A HE22 2.760 1.884 GLN 54.A NE2 GLU 51.A O GLN 54.A HE21 3.515 2.848 THR 55.A N ALA 32.A O THR 55.A H 3.451 2.537 SER 57.A N THR 55.A OG1 SER 57.A H 3.335 2.440 SER 57.A OG THR 55.A OG1 SER 57.A HG 2.786 1.845 PHE 59.A N GLU 30.A O PHE 59.A H 2.699 1.716 VAL 60.A N GLN 66.A O VAL 60.A H 2.959 2.002 VAL 62.A N GLU 30.A OE2 VAL 62.A H 2.811 1.876 LYS 64.A N ASN 61.A O LYS 64.A H 3.349 2.623 LYS 64.A N ASN 61.A OD1 LYS 64.A H 2.783 1.971 GLY 65.A N ASN 61.A O GLY 65.A H 2.861 1.937 GLN 66.A N ASN 61.A O GLN 66.A H 3.232 2.277 ALA 68.A N VAL 58.A O ALA 68.A H 2.754 1.847 LYS 69.A N ASP 72.A OD2 LYS 69.A H 2.722 1.744 LYS 69.A NZ ASP 72.A OD2 LYS 69.A HZ3 2.619 1.578 LYS 70.A NZ GLU 71.A OE1 LYS 70.A HZ2 2.792 1.866 LYS 70.A NZ GLU 71.A OE2 LYS 70.A HZ2 2.913 1.998 LEU 73.A N LYS 69.A O LEU 73.A H 3.043 2.071 ILE 74.A N LYS 70.A O ILE 74.A H 3.345 2.533 SER 75.A N ASP 72.A O SER 75.A H 2.967 2.168 SER 75.A OG GLU 71.A O SER 75.A HG 2.717 1.778 ALA 76.A N ASP 72.A O ALA 76.A H 2.708 1.730 PHE 77.A N LEU 73.A O PHE 77.A H 2.885 2.023 GLY 78.A N LEU 73.A O GLY 78.A H 3.111 2.152 GLN 82.A NE2 HIS 56.A O GLN 82.A HE21 2.870 1.924 THR 83.A OG1 ASP 81.A OD1 THR 83.A HG1 2.637 1.679 THR 83.A OG1 ASP 81.A OD2 THR 83.A HG1 3.316 2.615 GLU 84.A N ASP 81.A OD2 GLU 84.A H 2.717 1.819 CYS 86.A N GLN 82.A O CYS 86.A H 2.702 1.726 CYS 86.A SG GLN 82.A O CYS 86.A HG 3.103 2.248 CYS 86.A SG GLN 82.A OE1 CYS 86.A HG 3.082 1.905 LYS 87.A N THR 83.A O LYS 87.A H 2.799 1.909 LYS 87.A NZ GLU 84.A OE1 LYS 87.A HZ1 2.629 1.643 GLN 88.A N GLU 84.A O GLN 88.A H 3.080 2.162 ILE 89.A N ILE 85.A O ILE 89.A H 2.995 2.043 LEU 90.A N CYS 86.A O LEU 90.A H 2.883 2.057 THR 91.A N LYS 87.A O THR 91.A H 3.115 2.299 THR 91.A N GLN 88.A O THR 91.A H 3.222 2.516 LYS 92.A N GLN 88.A O LYS 92.A H 2.762 1.979 GLU 94.A N ARG 21.A O GLU 94.A H 2.663 1.700 VAL 95.A N GLY 93.A O VAL 95.A H 2.996 2.241 GLN 96.A NE2 VAL 19.A O GLN 96.A HE21 2.891 2.028 GLN 96.A NE2 GLU 94.A O GLN 96.A HE21 3.380 2.792 SER 98.A OG HIS 103.A O SER 98.A HG 3.228 2.290 LYS 100.A NZ GLU 101.A OE2 LYS 100.A HZ2 2.628 1.620 ARG 102.A NE LYS 100.A O ARG 102.A HE 2.920 1.989 LEU 106.A N THR 104.A O LEU 106.A H 2.726 1.967 MET 109.A N LEU 106.A O MET 109.A H 2.950 2.041 ARG 111.A N GLN 108.A O ARG 111.A H 3.015 2.164 ASP 112.A N MET 109.A O ASP 112.A H 3.168 2.355 THR 115.A N ARG 111.A O THR 115.A H 2.944 2.210 THR 115.A N ASP 112.A O THR 115.A H 3.045 2.274 THR 115.A OG1 ARG 111.A O THR 115.A HG1 2.702 1.790 ILE 116.A N ASP 112.A O ILE 116.A H 3.408 2.525 VAL 117.A N ILE 113.A O VAL 117.A H 3.013 2.086 ALA 118.A N ALA 114.A O ALA 118.A H 2.994 2.266 LYS 120.A N VAL 117.A O LYS 120.A H 3.161 2.433 LYS 120.A NZ ASP 215.A OD1 LYS 120.A HZ3 2.820 1.949 LYS 120.A NZ ASP 215.A OD2 LYS 120.A HZ3 2.805 2.042 CYS 121.A N ALA 118.A O CYS 121.A H 3.124 2.170 CYS 121.A SG VAL 117.A O CYS 121.A HG 3.022 1.703 ASN 123.A ND2 PRO 124.A O ASN 123.A HD21 2.850 2.021 ASN 123.A ND2 LYS 127.A O ASN 123.A HD22 2.739 1.771 LYS 127.A NZ THR 126.A O LYS 127.A HZ2 3.052 2.268 THR 131.A N ARG 128.A O THR 131.A H 3.041 2.082 THR 131.A OG1 ARG 128.A O THR 131.A HG1 2.655 1.709 VAL 132.A N TYR 130.A O VAL 132.A H 2.820 2.120 LEU 134.A N THR 131.A O LEU 134.A H 3.021 2.239 GLU 136.A N VAL 132.A O GLU 136.A H 2.824 1.904 ARG 137.A N ILE 133.A O ARG 137.A H 2.951 2.051 ALA 138.A N ILE 135.A O ALA 138.A H 3.260 2.513 MET 139.A N ILE 135.A O MET 139.A H 2.885 2.022 LYS 140.A N GLU 136.A O LYS 140.A H 2.934 1.947 LYS 140.A NZ GLU 136.A OE1 LYS 140.A HZ2 2.616 1.572 ASP 141.A N ALA 138.A O ASP 141.A H 3.321 2.524 ILE 142.A N ALA 138.A O ILE 142.A H 3.385 2.446 HIS 143.A N MET 139.A O HIS 143.A H 3.258 2.315 LYS 147.A NZ VAL 97.A O LYS 147.A HZ3 2.701 1.691 LYS 147.A NZ ASP 99.A OD2 LYS 147.A HZ1 2.594 1.655 ASN 149.A ND2 ASN 149.A O ASN 149.A HD21 2.872 2.172 LYS 150.A N LYS 147.A O LYS 150.A H 3.482 2.602 SER 151.A OG ASN 149.A O SER 151.A HG 3.471 2.756 THR 152.A OG1 SER 43.A OG THR 152.A HG1 2.798 1.859 GLN 154.A N THR 152.A O GLN 154.A H 2.871 2.013 GLN 155.A N SER 151.A O GLN 155.A H 3.148 2.217 GLN 155.A NE2 GLU 158.A OE1 GLN 155.A HE21 2.743 1.760 VAL 159.A N GLN 155.A O VAL 159.A H 2.885 1.907 ILE 160.A N ALA 156.A O ILE 160.A H 3.490 2.530 LYS 161.A N LEU 157.A O LYS 161.A H 3.178 2.366 GLN 162.A N GLU 158.A O GLN 162.A H 2.762 1.865 LEU 163.A N VAL 159.A O LEU 163.A H 3.156 2.232 LYS 164.A N ILE 160.A O LYS 164.A H 3.358 2.419 GLU 165.A N LYS 161.A O GLU 165.A H 2.867 2.053 LYS 166.A N LEU 163.A O LYS 166.A H 3.196 2.452 LYS 166.A NZ ASP 141.A OD2 LYS 166.A HZ2 2.653 1.626 MET 167.A N LEU 163.A O MET 167.A H 2.963 2.185 LYS 168.A NZ LYS 164.A O LYS 168.A HZ2 2.926 1.912 LYS 168.A NZ LYS 166.A O LYS 168.A HZ1 2.940 1.987 GLU 170.A N VAL 122.A O GLU 170.A H 2.723 1.750 HIS 173.A ND1 ILE 214.A O HIS 173.A HD1 2.922 2.015 ARG 177.A N GLU 237.A O ARG 177.A H 2.635 1.670 ARG 177.A NE GLU 209.A OE2 ARG 177.A HE 2.712 1.730 ARG 177.A NH1 GLU 246.A O ARG 177.A HH12 3.027 2.208 ARG 177.A NH2 GLU 209.A OE1 ARG 177.A HH21 2.753 1.750 ARG 177.A NH2 GLU 246.A O ARG 177.A HH22 2.750 1.809 PHE 178.A N ILE 210.A O PHE 178.A H 2.914 1.961 ILE 179.A N SER 235.A O ILE 179.A H 2.790 1.821 GLY 185.A N PRO 181.A O GLY 185.A H 2.716 1.859 LYS 186.A N VAL 182.A O LYS 186.A H 2.963 2.102 LYS 186.A NZ GLU 190.A OE1 LYS 186.A HZ2 2.571 1.535 LYS 187.A NZ ASN 183.A O LYS 187.A HZ1 2.796 1.855 LYS 187.A NZ LYS 186.A O LYS 187.A HZ2 2.845 1.866 LYS 189.A N GLY 185.A O LYS 189.A H 3.221 2.282 LYS 191.A N LEU 188.A O LYS 191.A H 3.011 2.086 LYS 191.A NZ GLU 229.A OE2 LYS 191.A HZ2 2.623 1.584 LEU 192.A N LEU 188.A O LEU 192.A H 2.763 1.784 LYS 193.A NZ GLU 202.A OE2 LYS 193.A HZ1 2.641 1.601 ILE 196.A N LYS 193.A O ILE 196.A H 2.882 2.035 ILE 199.A N VAL 211.A O ILE 199.A H 3.012 2.114 GLU 200.A N GLU 200.A OE1 GLU 200.A H 2.703 1.742 SER 201.A N ILE 199.A O SER 201.A H 2.666 1.807 GLU 202.A N ASP 248.A O GLU 202.A H 3.217 2.236 ASP 203.A N GLU 209.A O ASP 203.A H 2.857 2.012 TYR 204.A OH GLU 202.A OE1 TYR 204.A HH 2.594 1.622 GLY 205.A N ASP 203.A OD1 GLY 205.A H 2.772 1.906 LEU 208.A N LEU 180.A O LEU 208.A H 2.949 2.101 GLU 209.A N GLN 207.A O GLU 209.A H 2.977 2.222 ILE 210.A N PHE 178.A O ILE 210.A H 3.260 2.402 CYS 212.A N LEU 176.A O CYS 212.A H 3.107 2.399 CYS 212.A SG LYS 197.A O CYS 212.A HG 2.969 1.646 GLY 217.A N ASP 119.A O GLY 217.A H 2.763 1.849 CYS 218.A N ASP 215.A O CYS 218.A H 3.085 2.225 CYS 218.A SG ASP 119.A OD1 CYS 218.A HG 3.014 1.825 PHE 219.A N PRO 216.A O PHE 219.A H 3.043 2.113 GLU 221.A N CYS 218.A O GLU 221.A H 2.884 2.053 ILE 222.A N CYS 218.A O ILE 222.A H 3.180 2.406 ASP 223.A N PHE 219.A O ASP 223.A H 2.910 1.957 LEU 225.A N ILE 222.A O LEU 225.A H 3.234 2.315 ILE 226.A N ILE 222.A O ILE 226.A H 3.121 2.154 LYS 227.A N ASP 223.A O LYS 227.A H 2.862 1.938 LYS 228.A N LEU 225.A O LYS 228.A H 3.131 2.233 LYS 228.A NZ GLU 229.A OE1 LYS 228.A HZ3 2.771 1.756 LYS 228.A NZ GLU 229.A OE2 LYS 228.A HZ3 2.870 2.123 GLU 229.A N LEU 225.A O GLU 229.A H 2.859 1.944 THR 230.A N ILE 226.A O THR 230.A H 3.117 2.150 LYS 231.A N ILE 226.A O LYS 231.A H 2.870 1.925 LYS 231.A NZ ASP 223.A OD1 LYS 231.A HZ3 2.661 1.694 LYS 231.A NZ ASP 223.A OD2 LYS 231.A HZ3 2.934 2.193 LYS 233.A NZ GLU 184.A OE1 LYS 233.A HZ2 2.737 1.720 GLY 234.A N THR 230.A O GLY 234.A H 2.710 1.730 SER 235.A N ILE 179.A O SER 235.A H 3.128 2.150 GLU 237.A N ARG 177.A O GLU 237.A H 2.735 1.796 VAL 238.A N GLU 237.A OE1 VAL 238.A H 2.857 1.948 LEU 239.A N ARG 175.A O LEU 239.A H 2.848 1.879 LYS 242.A NZ GLU 246.A OE2 LYS 242.A HZ3 2.622 1.582 ASP 248.A N GLU 202.A O ASP 248.A H 2.742 1.835 LYS 250.A NZ GLU 249.A O LYS 250.A HZ1 2.788 1.777