Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 2kul_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 16.A NZ GLN 45.A OE1 LYS 16.A HZ3 2.946 2.099 HIS 18.A ND1 PRO 42.A O HIS 18.A HD1 2.702 1.745 GLN 22.A N ALA 20.A O GLN 22.A H 2.641 1.760 GLY 26.A N VAL 39.A O GLY 26.A H 2.817 1.860 GLU 27.A N ALA 24.A O GLU 27.A H 3.178 2.237 ILE 29.A N TRP 37.A O ILE 29.A H 2.764 1.833 ASP 31.A N LYS 35.A O ASP 31.A H 2.919 1.996 MET 32.A N SER 116.A O MET 32.A H 2.754 1.788 ALA 33.A N ASP 31.A OD2 ALA 33.A H 2.676 1.709 LYS 34.A N ASP 31.A O LYS 34.A H 2.989 2.114 LYS 35.A N ASP 31.A OD1 LYS 35.A H 3.286 2.383 LYS 35.A NZ ASP 65.A OD2 LYS 35.A HZ2 2.632 1.591 TRP 37.A N ILE 29.A O TRP 37.A H 2.721 1.800 TRP 37.A NE1 ASP 31.A OD1 TRP 37.A HE1 2.769 1.812 LYS 38.A NZ ASP 55.A OD2 LYS 38.A HZ1 2.658 1.631 VAL 39.A N GLU 27.A O VAL 39.A H 3.112 2.137 GLY 40.A N LEU 53.A O GLY 40.A H 2.838 1.883 ILE 43.A N ILE 51.A O ILE 43.A H 2.916 2.206 GLY 44.A N ILE 51.A O GLY 44.A H 2.995 2.033 CYS 50.A N GLY 44.A O CYS 50.A H 2.862 1.981 TYR 52.A N VAL 70.A O TYR 52.A H 3.046 2.076 LEU 53.A N LEU 41.A O LEU 53.A H 2.860 1.895 ALA 54.A N CYS 68.A O ALA 54.A H 3.119 2.178 ASP 55.A N LYS 38.A O ASP 55.A H 2.968 2.207 MET 56.A N LYS 38.A O MET 56.A H 2.982 2.007 SER 59.A N ASN 57.A O SER 59.A H 3.035 2.319 CYS 68.A N ALA 66.A O CYS 68.A H 2.729 1.839 CYS 68.A SG ASP 65.A O CYS 68.A HG 2.936 1.694 VAL 69.A N MET 131.A O VAL 69.A H 2.872 1.901 VAL 70.A N TYR 52.A O VAL 70.A H 2.853 1.892 LYS 71.A N MET 129.A O LYS 71.A H 2.906 2.017 LYS 71.A NZ GLU 83.A OE1 LYS 71.A HZ2 2.617 1.605 GLU 73.A N ARG 127.A O GLU 73.A H 2.925 2.069 SER 75.A N SER 125.A O SER 75.A H 3.025 2.212 ASN 77.A N PRO 74.A O ASN 77.A H 3.060 2.122 PHE 81.A N ASN 77.A OD1 PHE 81.A H 2.891 1.995 GLU 83.A N PRO 79.A O GLU 83.A H 2.844 1.873 LEU 84.A N LEU 80.A O LEU 84.A H 2.690 1.734 LYS 85.A N PHE 81.A O LYS 85.A H 2.950 2.056 PHE 86.A N THR 82.A O PHE 86.A H 3.195 2.228 TYR 87.A N GLU 83.A O TYR 87.A H 2.714 1.790 GLN 88.A N LEU 84.A O GLN 88.A H 2.765 1.786 ARG 89.A N LYS 85.A O ARG 89.A H 3.060 2.241 ARG 89.A NH1 ARG 89.A O ARG 89.A HH11 3.075 2.091 ALA 90.A N PHE 86.A O ALA 90.A H 2.696 1.884 ALA 90.A N TYR 87.A O ALA 90.A H 3.315 2.597 ALA 91.A N TYR 87.A O ALA 91.A H 2.775 1.840 LYS 92.A N ALA 90.A O LYS 92.A H 2.879 2.071 ILE 96.A N LYS 92.A O ILE 96.A H 2.774 1.797 GLN 97.A N PRO 93.A O GLN 97.A H 3.178 2.206 LYS 98.A N GLU 94.A O LYS 98.A H 3.146 2.206 TRP 99.A N GLN 95.A O TRP 99.A H 2.945 1.963 ILE 100.A N ILE 96.A O ILE 100.A H 2.988 2.071 ARG 101.A N GLN 97.A O ARG 101.A H 3.155 2.239 THR 102.A N LYS 98.A O THR 102.A H 3.009 2.087 THR 102.A OG1 LYS 98.A O THR 102.A HG1 2.678 1.771 ARG 103.A N TRP 99.A O ARG 103.A H 2.828 1.924 ARG 103.A NH1 GLU 170.A OE2 ARG 103.A HH12 2.558 1.580 ARG 103.A NH2 GLU 170.A OE1 ARG 103.A HH22 2.919 1.961 ARG 103.A NH2 GLU 170.A OE2 ARG 103.A HH22 3.024 2.261 LYS 104.A N ARG 101.A O LYS 104.A H 3.398 2.522 LEU 105.A N ILE 100.A O LEU 105.A H 2.904 2.015 LYS 106.A N ASP 163.A OD1 LYS 106.A H 2.773 1.784 TYR 107.A N ASP 163.A OD2 TYR 107.A H 3.384 2.404 TRP 114.A N ILE 130.A O TRP 114.A H 3.541 2.569 SER 116.A N ASP 31.A OD2 SER 116.A H 2.741 1.832 SER 116.A OG TYR 113.A OH SER 116.A HG 2.856 2.000 GLY 117.A N PHE 128.A O GLY 117.A H 2.875 1.928 HIS 119.A N TYR 126.A O HIS 119.A H 2.759 1.780 LYS 121.A N LYS 124.A O LYS 121.A H 2.820 1.838 LYS 121.A NZ GLU 27.A OE1 LYS 121.A HZ2 2.755 1.860 LYS 121.A NZ GLU 27.A OE2 LYS 121.A HZ2 2.990 2.134 LYS 124.A N LYS 121.A O LYS 124.A H 2.952 2.012 TYR 126.A N HIS 119.A O TYR 126.A H 2.922 1.964 ARG 127.A N GLU 73.A O ARG 127.A H 2.730 1.803 ARG 127.A NE SER 75.A OG ARG 127.A HE 2.835 1.899 ARG 127.A NH2 SER 75.A OG ARG 127.A HH21 3.098 2.271 PHE 128.A N GLY 117.A O PHE 128.A H 2.791 1.838 MET 129.A N LYS 71.A O MET 129.A H 3.156 2.214 ILE 130.A N GLY 115.A O ILE 130.A H 2.799 1.853 MET 131.A N VAL 69.A O MET 131.A H 2.710 1.752 ASP 137.A N GLU 345.A O ASP 137.A H 3.034 2.108 LEU 138.A N LEU 183.A O LEU 138.A H 3.405 2.472 LYS 140.A N ASP 137.A OD1 LYS 140.A H 2.621 1.652 LYS 140.A NZ GLU 143.A OE1 LYS 140.A HZ2 2.676 1.630 ILE 141.A N ASP 137.A O ILE 141.A H 3.169 2.224 TYR 142.A N LEU 138.A O TYR 142.A H 2.945 2.174 ALA 144.A N LYS 140.A O ALA 144.A H 2.896 1.923 ASN 145.A N ILE 141.A O ASN 145.A H 2.808 1.893 ALA 146.A N GLU 143.A O ALA 146.A H 3.135 2.226 LYS 147.A N TYR 142.A O LYS 147.A H 2.794 1.966 ARG 148.A N ASN 145.A O ARG 148.A H 3.129 2.164 PHE 149.A N TRP 254.A O PHE 149.A H 3.288 2.396 LYS 152.A NZ ASP 336.A OD2 LYS 152.A HZ2 2.618 1.679 LYS 152.A NZ ASP 340.A OD1 LYS 152.A HZ1 2.855 1.906 VAL 154.A N SER 150.A O VAL 154.A H 2.869 1.894 LEU 155.A N ARG 151.A O LEU 155.A H 2.716 1.780 GLN 156.A N LYS 152.A O GLN 156.A H 3.211 2.267 GLN 156.A NE2 ASP 335.A OD1 GLN 156.A HE21 2.749 1.906 LEU 157.A N THR 153.A O LEU 157.A H 3.015 2.086 SER 158.A N VAL 154.A O SER 158.A H 2.825 1.855 SER 158.A OG VAL 154.A O SER 158.A HG 2.702 1.750 LEU 159.A N LEU 155.A O LEU 159.A H 2.735 1.856 ARG 160.A N GLN 156.A O ARG 160.A H 3.228 2.259 ARG 160.A NH1 ASP 191.A O ARG 160.A HH12 2.776 1.965 ARG 160.A NH2 ASP 191.A O ARG 160.A HH22 2.779 1.966 ILE 161.A N LEU 157.A O ILE 161.A H 3.134 2.242 LEU 162.A N SER 158.A O LEU 162.A H 2.765 1.895 ASP 163.A N LEU 159.A O ASP 163.A H 3.193 2.260 ILE 164.A N ARG 160.A O ILE 164.A H 3.118 2.156 LEU 165.A N ILE 161.A O LEU 165.A H 2.752 1.817 GLU 166.A N LEU 162.A O GLU 166.A H 3.192 2.237 TYR 167.A N ASP 163.A O TYR 167.A H 3.255 2.302 ILE 168.A N ILE 164.A O ILE 168.A H 2.887 1.978 HIS 169.A N LEU 165.A O HIS 169.A H 2.888 2.020 HIS 169.A ND1 TYR 173.A O HIS 169.A HD1 2.809 1.835 GLU 170.A N GLU 166.A O GLU 170.A H 2.973 2.218 HIS 171.A N ILE 168.A O HIS 171.A H 3.471 2.585 GLU 172.A N ILE 168.A O GLU 172.A H 3.407 2.431 VAL 174.A N TYR 202.A O VAL 174.A H 2.768 2.063 HIS 175.A NE2 ASP 197.A O HIS 175.A HE2 2.778 1.805 GLY 176.A N ASP 222.A OD2 GLY 176.A H 2.771 1.932 LYS 179.A N ASN 182.A OD1 LYS 179.A H 2.845 1.899 LYS 179.A NZ THR 224.A OG1 LYS 179.A HZ1 2.773 1.738 LYS 179.A NZ GLU 226.A OE2 LYS 179.A HZ2 2.663 1.633 ASN 182.A N LYS 179.A O ASN 182.A H 2.829 1.892 ASN 182.A ND2 VAL 196.A O ASN 182.A HD21 3.359 2.736 ASN 182.A ND2 ASP 197.A OD2 ASN 182.A HD22 2.757 1.894 LEU 183.A N ALA 180.A O LEU 183.A H 3.392 2.475 LEU 184.A N TYR 194.A O LEU 184.A H 2.752 1.786 LEU 185.A N SER 136.A O LEU 185.A H 2.728 1.773 ASN 186.A N GLN 192.A O ASN 186.A H 3.400 2.440 ASN 186.A ND2 TYR 194.A OH ASN 186.A HD21 3.033 2.278 TYR 187.A N ARG 133.A O TYR 187.A H 3.057 2.088 LYS 188.A N ASN 186.A OD1 LYS 188.A H 3.082 2.114 ASN 189.A N ASN 186.A O ASN 189.A H 2.991 2.019 ASN 189.A ND2 ASN 189.A O ASN 189.A HD21 2.968 2.304 GLN 192.A N ASN 189.A O GLN 192.A H 3.265 2.316 TYR 194.A N LEU 184.A O TYR 194.A H 2.759 1.779 LEU 195.A N GLY 109.A O LEU 195.A H 2.702 1.842 VAL 196.A N ASN 182.A O VAL 196.A H 3.010 2.089 TYR 198.A N GLU 83.A OE2 TYR 198.A H 2.829 1.834 ARG 203.A NH1 ARG 203.A O ARG 203.A HH11 3.067 2.133 ARG 203.A NH1 GLU 215.A OE2 ARG 203.A HH12 2.695 1.701 ARG 203.A NH2 GLU 215.A OE2 ARG 203.A HH22 3.453 2.755 TYR 204.A N GLU 172.A O TYR 204.A H 2.813 1.836 CYS 205.A SG HIS 171.A O CYS 205.A HG 3.056 1.745 GLU 207.A N GLU 172.A OE1 GLU 207.A H 2.751 1.780 GLY 208.A N PRO 206.A O GLY 208.A H 2.655 1.805 VAL 209.A N PRO 206.A O VAL 209.A H 3.167 2.284 LYS 211.A NZ GLU 212.A OE1 LYS 211.A HZ1 2.923 2.052 LYS 214.A N GLU 212.A O LYS 214.A H 2.983 2.262 LYS 214.A NZ ASP 216.A OD1 LYS 214.A HZ2 3.399 2.495 LYS 214.A NZ ASP 216.A OD2 LYS 214.A HZ2 2.712 1.760 CYS 220.A N HIS 233.A O CYS 220.A H 3.100 2.176 HIS 221.A N ALA 232.A O HIS 221.A H 2.795 2.001 THR 224.A N ASP 177.A OD2 THR 224.A H 2.727 1.754 THR 224.A OG1 ASP 177.A OD1 THR 224.A HG1 2.995 2.286 THR 224.A OG1 ASP 177.A OD2 THR 224.A HG1 2.718 1.780 PHE 227.A N ASP 177.A OD1 PHE 227.A H 3.293 2.455 THR 228.A N THR 224.A O THR 228.A H 3.308 2.426 THR 228.A OG1 ASP 222.A O THR 228.A HG1 3.380 2.569 SER 229.A OG ASP 231.A OD1 SER 229.A HG 2.755 1.834 ASN 234.A N ILE 230.A O ASN 234.A H 2.903 2.001 ASN 234.A ND2 ASN 234.A O ASN 234.A HD21 2.678 1.709 GLY 235.A N ASP 231.A O GLY 235.A H 3.088 2.278 VAL 236.A N ASP 231.A O VAL 236.A H 3.119 2.222 ARG 240.A NE GLU 166.A OE1 ARG 240.A HE 2.833 1.975 ARG 240.A NH2 GLU 166.A OE1 ARG 240.A HH21 2.709 1.794 ARG 241.A N TYR 311.A O ARG 241.A H 3.355 2.483 ARG 241.A NH1 GLU 245.A OE1 ARG 241.A HH12 2.718 1.702 ARG 241.A NH2 GLU 245.A OE2 ARG 241.A HH22 2.590 1.628 GLY 242.A N SER 239.A O GLY 242.A H 2.844 1.995 LEU 244.A N ARG 240.A O LEU 244.A H 2.972 2.014 GLU 245.A N ARG 241.A O GLU 245.A H 2.886 2.046 ILE 246.A N GLY 242.A O ILE 246.A H 2.941 1.970 LEU 247.A N ASP 243.A O LEU 247.A H 3.001 2.038 GLY 248.A N LEU 244.A O GLY 248.A H 3.059 2.138 TYR 249.A N GLU 245.A O TYR 249.A H 3.113 2.217 CYS 250.A N ILE 246.A O CYS 250.A H 3.096 2.171 CYS 250.A SG ILE 178.A O CYS 250.A HG 3.432 2.190 MET 251.A N LEU 247.A O MET 251.A H 2.877 1.953 ILE 252.A N GLY 248.A O ILE 252.A H 3.099 2.127 GLN 253.A N TYR 249.A O GLN 253.A H 3.025 2.147 GLN 253.A NE2 GLU 262.A OE1 GLN 253.A HE22 2.683 1.694 TRP 254.A N CYS 250.A O TRP 254.A H 3.074 2.119 LEU 255.A N MET 251.A O LEU 255.A H 3.065 2.246 THR 256.A N ILE 252.A O THR 256.A H 2.885 2.062 THR 256.A OG1 ILE 252.A O THR 256.A HG1 2.642 1.691 GLY 257.A N GLN 253.A O GLY 257.A H 2.870 1.963 HIS 258.A ND1 ASP 263.A OD1 HIS 258.A HD1 2.659 1.676 LEU 259.A N GLU 262.A OE1 LEU 259.A H 3.196 2.209 TRP 261.A NE1 GLU 226.A O TRP 261.A HE1 3.169 2.368 GLU 262.A N LEU 259.A O GLU 262.A H 2.841 1.992 ASP 263.A N LEU 259.A O ASP 263.A H 3.141 2.210 ASN 264.A ND2 PRO 260.A O ASN 264.A HD21 2.905 1.927 LEU 265.A N GLU 262.A O LEU 265.A H 3.055 2.186 LYS 266.A N ASN 264.A O LYS 266.A H 2.637 1.746 TYR 270.A N ASP 267.A OD1 TYR 270.A H 2.691 1.732 VAL 271.A N ASP 267.A O VAL 271.A H 3.285 2.324 ARG 272.A N PRO 268.A O ARG 272.A H 3.177 2.253 ASP 273.A N LYS 269.A O ASP 273.A H 2.733 1.774 SER 274.A N TYR 270.A O SER 274.A H 2.853 1.892 SER 274.A OG TYR 270.A O SER 274.A HG 2.666 1.726 LYS 275.A N VAL 271.A O LYS 275.A H 3.199 2.266 LYS 275.A NZ ILE 225.A O LYS 275.A HZ2 2.817 2.023 LYS 275.A NZ GLU 226.A O LYS 275.A HZ2 2.941 2.152 ILE 276.A N ARG 272.A O ILE 276.A H 3.041 2.060 ARG 277.A N ASP 273.A O ARG 277.A H 2.688 1.764 TYR 278.A N SER 274.A O TYR 278.A H 2.970 2.025 ARG 279.A N LYS 275.A O ARG 279.A H 3.090 2.230 ARG 279.A NE LYS 275.A O ARG 279.A HE 3.130 2.432 ARG 279.A NH1 GLU 245.A OE2 ARG 279.A HH11 2.612 1.601 GLU 280.A N ILE 276.A O GLU 280.A H 2.980 2.244 LEU 285.A N ASN 281.A O LEU 285.A H 2.738 1.764 MET 286.A N ILE 282.A O MET 286.A H 2.822 1.885 ASP 287.A N ALA 283.A O ASP 287.A H 3.208 2.273 LYS 288.A N SER 284.A O LYS 288.A H 3.009 2.249 CYS 289.A N MET 286.A O CYS 289.A H 3.212 2.282 CYS 289.A SG LEU 285.A O CYS 289.A HG 2.848 1.564 GLU 298.A N GLU 298.A OE2 GLU 298.A H 2.622 1.711 ALA 300.A N PRO 296.A O ALA 300.A H 3.129 2.229 LYS 301.A N GLY 297.A O LYS 301.A H 2.795 1.816 LYS 301.A NZ GLU 304.A OE1 LYS 301.A HZ3 2.606 1.611 TYR 302.A N GLU 298.A O TYR 302.A H 2.954 2.029 TYR 302.A OH LEU 244.A O TYR 302.A HH 2.961 2.026 MET 303.A N ILE 299.A O MET 303.A H 2.820 1.889 GLU 304.A N ALA 300.A O GLU 304.A H 2.964 2.028 THR 305.A N LYS 301.A O THR 305.A H 2.848 1.948 THR 305.A OG1 LYS 301.A O THR 305.A HG1 2.636 1.681 VAL 306.A N TYR 302.A O VAL 306.A H 2.872 1.955 LYS 307.A N MET 303.A O LYS 307.A H 3.059 2.152 LYS 307.A NZ ARG 279.A O LYS 307.A HZ2 2.941 1.984 LEU 308.A N GLU 304.A O LEU 308.A H 2.961 2.223 LEU 309.A N VAL 306.A O LEU 309.A H 3.521 2.622 ASP 310.A N LYS 307.A O ASP 310.A H 3.346 2.438 TYR 311.A OH ASP 231.A OD2 TYR 311.A HH 2.687 1.766 GLU 313.A N LEU 309.A O GLU 313.A H 3.053 2.170 ASN 319.A N LEU 316.A O ASN 319.A H 3.085 2.348 LEU 320.A N LEU 316.A O LEU 320.A H 3.274 2.351 ARG 321.A N TYR 317.A O ARG 321.A H 2.706 1.797 ARG 321.A NH1 ASP 163.A OD1 ARG 321.A HH12 2.627 1.621 ASP 322.A N GLU 318.A O ASP 322.A H 2.772 1.931 ILE 323.A N ASN 319.A O ILE 323.A H 3.108 2.153 LEU 324.A N LEU 320.A O LEU 324.A H 3.072 2.115 LEU 325.A N ARG 321.A O LEU 325.A H 3.069 2.119 GLN 326.A N ASP 322.A O GLN 326.A H 2.761 1.862 GLY 327.A N ILE 323.A O GLY 327.A H 2.941 1.998 LEU 328.A N LEU 324.A O LEU 328.A H 3.001 2.034 LYS 329.A N LEU 325.A O LYS 329.A H 2.755 1.844 ALA 330.A N GLN 326.A O ALA 330.A H 2.936 2.208 ALA 330.A N GLY 327.A O ALA 330.A H 3.079 2.390 ILE 331.A N GLY 327.A O ILE 331.A H 3.424 2.574 ILE 331.A N LEU 328.A O ILE 331.A H 3.343 2.598 GLY 332.A N LYS 329.A O GLY 332.A H 3.042 2.200 SER 333.A N LEU 328.A O SER 333.A H 2.972 2.067 LYS 338.A N ASP 335.A O LYS 338.A H 3.448 2.475 GLY 347.A N ASP 137.A OD2 GLY 347.A H 2.701 1.712 LYS 352.A N ASP 197.A OD1 LYS 352.A H 2.720 1.796 LYS 352.A NZ ASP 197.A OD2 LYS 352.A HZ1 2.625 1.622 LYS 359.A NZ THR 353.A OG1 LYS 359.A HZ3 2.768 1.763