Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 2lbd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 5.A N LEU 1.A O LEU 5.A H 3.080 2.136 GLU 6.A N SER 2.A O GLU 6.A H 2.826 1.934 GLU 7.A N PRO 3.A O GLU 7.A H 2.976 2.061 LEU 8.A N GLN 4.A O LEU 8.A H 3.077 2.173 ILE 9.A N LEU 5.A O ILE 9.A H 3.191 2.253 THR 10.A N GLU 6.A O THR 10.A H 3.305 2.376 LYS 11.A N GLU 7.A O LYS 11.A H 2.828 1.868 VAL 12.A N LEU 8.A O VAL 12.A H 2.934 1.971 SER 13.A N ILE 9.A O SER 13.A H 2.950 2.025 LYS 14.A N THR 10.A O LYS 14.A H 2.940 1.982 LYS 14.A NZ GLN 17.A OE1 LYS 14.A HZ1 3.477 2.569 ALA 15.A N LYS 11.A O ALA 15.A H 2.934 1.968 HIS 16.A N VAL 12.A O HIS 16.A H 2.925 1.972 GLN 17.A N SER 13.A O GLN 17.A H 2.882 1.925 GLU 18.A N LYS 14.A O GLU 18.A H 2.854 1.888 THR 19.A N ALA 15.A O THR 19.A H 3.070 2.306 THR 19.A N HIS 16.A O THR 19.A H 3.139 2.373 THR 19.A OG1 ALA 15.A O THR 19.A HG1 3.029 2.115 THR 19.A OG1 HIS 16.A O THR 19.A HG1 3.401 2.847 PHE 20.A N GLN 17.A O PHE 20.A H 3.295 2.413 GLN 25.A N SER 22.A O GLN 25.A H 3.008 2.124 LEU 26.A N LEU 23.A O LEU 26.A H 2.920 1.988 TYR 29.A N GLY 110.A O TYR 29.A H 3.069 2.118 ALA 35.A N ASN 32.A O ALA 35.A H 3.447 2.544 ARG 38.A NH1 ASP 128.A OD2 ARG 38.A HH12 3.037 2.061 ARG 38.A NH2 ASP 128.A OD1 ARG 38.A HH22 2.976 2.002 VAL 39.A N ASN 120.A OD1 VAL 39.A H 2.911 1.953 ASP 42.A N ASN 120.A O ASP 42.A H 2.727 1.774 LEU 45.A N ASP 42.A OD1 LEU 45.A H 2.824 1.955 TRP 46.A N ASP 42.A O TRP 46.A H 2.749 1.817 ASP 47.A N LEU 43.A O ASP 47.A H 2.888 2.001 LYS 48.A N GLY 44.A O LYS 48.A H 3.235 2.299 LYS 48.A NZ GLU 51.A OE2 LYS 48.A HZ3 2.910 2.086 LYS 48.A NZ ASP 109.A OD2 LYS 48.A HZ2 3.255 2.355 PHE 49.A N LEU 45.A O PHE 49.A H 2.812 1.891 SER 50.A N TRP 46.A O SER 50.A H 2.770 1.830 SER 50.A OG TRP 46.A O SER 50.A HG 2.926 1.999 GLU 51.A N ASP 47.A O GLU 51.A H 3.370 2.492 LEU 52.A N LYS 48.A O LEU 52.A H 3.003 2.040 ALA 53.A N PHE 49.A O ALA 53.A H 2.780 1.896 THR 54.A N SER 50.A O THR 54.A H 2.942 1.999 THR 54.A OG1 SER 50.A O THR 54.A HG1 3.014 2.143 LYS 55.A N.1 GLU 51.A O no hydrogen 3.015 N/A LYS 55.A N.2 GLU 51.A O no hydrogen 3.019 N/A LYS 55.A NZ.2 LEU 52.A O no hydrogen 2.600 N/A LYS 55.A O.1 THR 54.A O no hydrogen 3.644 N/A LYS 55.A O.2 THR 54.A O no hydrogen 3.594 N/A CYS 56.A N LEU 52.A O CYS 56.A H 3.061 2.289 CYS 56.A N ALA 53.A O CYS 56.A H 2.883 2.274 ILE 57.A N ALA 53.A O ILE 57.A H 2.863 1.933 ILE 58.A N THR 54.A O ILE 58.A H 3.247 2.307 LYS 59.A N LYS 55.A O.1 LYS 59.A H 3.130 2.226 LYS 59.A N LYS 55.A O.2 LYS 59.A H 3.082 2.174 LYS 59.A NZ GLU 62.A OE1 LYS 59.A HZ1 2.981 1.952 ILE 60.A N CYS 56.A O ILE 60.A H 2.831 2.003 VAL 61.A N ILE 57.A O VAL 61.A H 2.989 2.049 GLU 62.A N ILE 58.A O GLU 62.A H 2.974 2.022 PHE 63.A N LYS 59.A O PHE 63.A H 3.010 2.107 ALA 64.A N ILE 60.A O ALA 64.A H 2.772 1.835 LYS 65.A N VAL 61.A O LYS 65.A H 2.899 1.940 LYS 65.A NZ GLN 78.A OE1 LYS 65.A HZ2 2.916 1.909 ARG 66.A N PHE 63.A O ARG 66.A H 3.090 2.253 ARG 66.A NH1 GLU 18.A OE1 ARG 66.A HH12 3.215 2.401 ARG 66.A NH2 GLU 18.A OE1 ARG 66.A HH22 2.855 1.915 LEU 67.A N ALA 64.A O LEU 67.A H 3.048 2.090 PHE 70.A N LEU 67.A O PHE 70.A H 3.180 2.218 GLY 72.A N GLY 69.A O GLY 72.A H 2.889 2.007 LEU 73.A N PHE 70.A O LEU 73.A H 2.826 1.863 SER 74.A OG GLU 164.A OE1 SER 74.A HG 2.689 1.949 GLN 78.A N SER 74.A O GLN 78.A H 2.883 1.925 GLN 78.A NE2 LEU 73.A O GLN 78.A HE22 3.047 2.114 ILE 79.A N ILE 75.A O ILE 79.A H 3.104 2.146 THR 80.A N ALA 76.A O THR 80.A H 2.935 1.986 LEU 81.A N ASP 77.A O LEU 81.A H 2.862 1.886 LEU 82.A N GLN 78.A O LEU 82.A H 3.009 2.083 LYS 83.A N ILE 79.A O LYS 83.A H 2.793 1.832 LYS 83.A NZ GLU 233.A O LYS 83.A HZ1 2.663 1.756 LYS 83.A NZ GLU 233.A OE1 LYS 83.A HZ2 2.910 2.012 LYS 83.A NZ GLU 236.A O LYS 83.A HZ3 3.248 2.536 ALA 84.A N THR 80.A O ALA 84.A H 2.984 2.031 ALA 85.A N LEU 81.A O ALA 85.A H 3.050 2.225 CYS 86.A N LEU 82.A O CYS 86.A H 2.923 2.145 ILE 89.A N ALA 85.A O ILE 89.A H 2.995 2.017 LEU 90.A N CYS 86.A O LEU 90.A H 2.933 2.003 MET 91.A N LEU 87.A O MET 91.A H 2.893 1.970 LEU 92.A N ASP 88.A O LEU 92.A H 2.853 1.935 ARG 93.A N ILE 89.A O ARG 93.A H 2.812 1.867 ARG 93.A NH2 THR 19.A OG1 ARG 93.A HH22 2.993 2.141 ILE 94.A N LEU 90.A O ILE 94.A H 3.117 2.141 CYS 95.A N MET 91.A O CYS 95.A H 3.147 2.209 CYS 95.A SG MET 91.A O no hydrogen 3.297 N/A CYS 95.A SG VAL 130.A O no hydrogen 3.800 N/A THR 96.A N LEU 92.A O THR 96.A H 3.083 2.349 THR 96.A N ARG 93.A O THR 96.A H 3.093 2.266 THR 96.A OG1 ARG 93.A O THR 96.A HG1 2.705 1.885 ARG 97.A N ILE 94.A O ARG 97.A H 2.939 2.102 ARG 97.A NE PRO 21.A O ARG 97.A HE 2.938 2.124 ARG 97.A NH1 THR 106.A O ARG 97.A HH11 2.975 2.101 ARG 97.A NH2 PRO 21.A O ARG 97.A HH21 2.714 1.812 ARG 97.A NH2 SER 108.A OG ARG 97.A HH22 2.969 1.993 THR 99.A N THR 104.A O THR 99.A H 2.836 1.875 ASP 103.A N PRO 100.A O ASP 103.A H 2.995 2.207 THR 104.A N THR 99.A O THR 104.A H 3.208 2.290 MET 105.A N LEU 113.A O MET 105.A H 3.188 2.243 THR 106.A N ARG 97.A O THR 106.A H 2.969 2.080 THR 106.A OG1 THR 112.A OG1 THR 106.A HG1 3.058 2.101 PHE 107.A N LEU 111.A O PHE 107.A H 2.886 1.915 GLY 110.A N PHE 107.A O GLY 110.A H 3.064 2.131 LEU 111.A N ASP 109.A OD1 LEU 111.A H 2.947 2.029 THR 112.A N TYR 29.A O THR 112.A H 2.859 1.925 THR 112.A OG1 GLY 110.A O THR 112.A HG1 2.900 1.987 LEU 113.A N MET 105.A O LEU 113.A H 3.020 2.096 ASN 114.A N GLN 117.A OE1 ASN 114.A H 3.076 2.130 ARG 115.A N ASP 103.A O ARG 115.A H 3.310 2.627 ARG 115.A NE ASP 103.A OD2 ARG 115.A HE 2.788 1.921 ARG 115.A NH1 ASP 128.A OD1 ARG 115.A HH11 2.898 1.944 ARG 115.A NH2 ASP 103.A OD1 ARG 115.A HH21 2.950 1.959 GLN 117.A N ASN 114.A OD1 GLN 117.A H 2.829 1.874 GLN 117.A NE2 THR 31.A O GLN 117.A HE21 2.976 2.079 GLN 117.A NE2 SER 33.A O GLN 117.A HE22 2.827 1.894 MET 118.A N ASN 114.A O MET 118.A H 2.955 2.022 HIS 119.A N ARG 115.A O HIS 119.A H 3.053 2.117 HIS 119.A ND1 ASN 120.A OD1 HIS 119.A HD1 3.397 2.433 ASN 120.A N THR 116.A O ASN 120.A H 2.901 1.964 ASN 120.A ND2 SER 34.A O ASN 120.A HD22 2.530 1.898 ASN 120.A ND2 HIS 37.A O ASN 120.A HD21 3.233 2.298 ALA 121.A N GLN 117.A O ALA 121.A H 2.723 1.925 GLY 122.A N HIS 119.A O GLY 122.A H 3.169 2.211 PHE 123.A N MET 118.A O PHE 123.A H 3.375 2.451 GLY 124.A N HIS 119.A O GLY 124.A H 3.248 2.347 LEU 126.A N PHE 123.A O LEU 126.A H 2.977 2.063 THR 127.A N GLY 124.A O THR 127.A H 3.298 2.333 VAL 130.A N LEU 126.A O VAL 130.A H 3.152 2.195 PHE 131.A N THR 127.A O PHE 131.A H 3.021 2.085 ALA 132.A N ASP 128.A O ALA 132.A H 2.966 2.173 PHE 133.A N LEU 129.A O PHE 133.A H 2.768 1.868 ALA 134.A N VAL 130.A O ALA 134.A H 2.847 1.901 GLY 135.A N PHE 131.A O GLY 135.A H 2.965 2.025 GLN 136.A N ALA 132.A O GLN 136.A H 3.014 2.109 GLN 136.A NE2 ALA 132.A O GLN 136.A HE22 3.228 2.519 LEU 137.A N ALA 134.A O LEU 137.A H 2.833 1.958 LEU 138.A N ALA 134.A O LEU 138.A H 3.382 2.561 LEU 138.A N GLY 135.A O LEU 138.A H 3.087 2.322 LEU 140.A N LEU 137.A O LEU 140.A H 2.994 2.171 GLU 141.A N LEU 138.A O GLU 141.A H 2.800 1.869 ASP 143.A N GLU 146.A OE1 ASP 143.A H 3.132 2.255 GLU 146.A N ASP 143.A OD1 GLU 146.A H 3.220 2.292 THR 147.A N ASP 143.A O THR 147.A H 3.036 2.077 GLY 148.A N ASP 144.A O GLY 148.A H 2.785 1.918 LEU 149.A N THR 145.A O LEU 149.A H 2.636 1.730 LEU 150.A N GLU 146.A O LEU 150.A H 2.750 1.826 SER 151.A N THR 147.A O SER 151.A H 2.935 2.018 SER 151.A OG THR 147.A O SER 151.A HG 2.908 2.030 ALA 152.A N GLY 148.A O ALA 152.A H 3.003 2.054 ILE 153.A N LEU 149.A O ILE 153.A H 2.952 2.093 CYS 154.A N LEU 150.A O CYS 154.A H 3.099 2.214 CYS 154.A SG LEU 150.A O no hydrogen 3.419 N/A LEU 155.A N SER 151.A O LEU 155.A H 3.137 2.201 ILE 156.A N ALA 152.A O ILE 156.A H 3.080 2.118 CYS 157.A N LEU 155.A O CYS 157.A H 3.078 2.356 ARG 160.A NH2 CYS 154.A O ARG 160.A HH21 2.997 2.118 GLU 164.A N ASP 77.A OD1 GLU 164.A H 2.807 1.861 GLU 165.A N ASP 77.A OD2 GLU 165.A H 3.193 2.362 GLU 167.A N GLU 167.A OE1 GLU 167.A H 3.145 2.407 LYS 168.A N GLU 165.A O LYS 168.A H 3.024 2.305 VAL 169.A N GLU 165.A O VAL 169.A H 3.342 2.428 ASP 170.A N PRO 166.A O ASP 170.A H 2.936 1.999 LYS 171.A N GLU 167.A O LYS 171.A H 3.165 2.276 LEU 172.A N LYS 168.A O LEU 172.A H 3.054 2.214 GLN 173.A N VAL 169.A O GLN 173.A H 2.899 1.998 GLN 173.A NE2 ILE 153.A O GLN 173.A HE22 3.248 2.379 GLU 174.A N ASP 170.A O GLU 174.A H 3.204 2.276 LEU 176.A N GLN 173.A O LEU 176.A H 2.829 2.125 LEU 177.A N GLN 173.A O LEU 177.A H 3.142 2.269 GLU 178.A N GLU 174.A O GLU 178.A H 3.086 2.125 ALA 179.A N PRO 175.A O ALA 179.A H 2.779 1.836 LEU 180.A N LEU 176.A O LEU 180.A H 3.182 2.227 ARG 181.A N LEU 177.A O ARG 181.A H 3.241 2.289 LEU 182.A N GLU 178.A O LEU 182.A H 3.104 2.129 TYR 183.A N ALA 179.A O TYR 183.A H 2.832 1.887 ALA 184.A N LEU 180.A O ALA 184.A H 2.734 1.834 ARG 185.A N ARG 181.A O ARG 185.A H 2.926 1.989 ARG 186.A N LEU 182.A O ARG 186.A H 2.940 2.049 ARG 186.A NH1 GLU 6.A OE2 ARG 186.A HH12 2.934 1.995 ARG 186.A NH2 GLU 6.A OE1 ARG 186.A HH22 2.892 2.095 ARG 187.A N TYR 183.A O ARG 187.A H 3.056 2.094 ARG 187.A NH1 GLU 141.A O ARG 187.A HH12 3.153 2.209 ARG 187.A NH1 GLU 146.A OE2 ARG 187.A HH11 3.145 2.240 ARG 187.A NH2 GLU 141.A O ARG 187.A HH22 3.340 2.482 ARG 188.A N ALA 184.A O ARG 188.A H 3.112 2.239 ARG 188.A NH1 LEU 140.A O ARG 188.A HH12 2.830 1.904 ARG 188.A NH2 LEU 140.A O ARG 188.A HH22 3.066 2.247 GLN 191.A N ARG 188.A O GLN 191.A H 3.256 2.291 MET 194.A N GLN 191.A O MET 194.A H 3.403 2.457 ARG 197.A N TYR 193.A O ARG 197.A H 3.022 2.164 ARG 197.A NE TYR 193.A O ARG 197.A HE 3.439 2.619 MET 198.A N MET 194.A O MET 198.A H 2.773 1.876 LEU 199.A N PHE 195.A O LEU 199.A H 3.025 2.073 MET 200.A N PRO 196.A O MET 200.A H 2.948 2.008 LYS 201.A N ARG 197.A O LYS 201.A H 3.205 2.367 LYS 201.A NZ ASP 204.A OD2 LYS 201.A HZ3 2.740 1.800 ILE 202.A N LEU 199.A O ILE 202.A H 2.982 2.064 THR 203.A N MET 200.A O THR 203.A H 3.042 2.315 ASP 204.A N MET 200.A O ASP 204.A H 3.469 2.560 LEU 205.A N LYS 201.A O LEU 205.A H 3.011 2.045 ARG 206.A N ILE 202.A O ARG 206.A H 2.979 2.092 GLY 207.A N THR 203.A O GLY 207.A H 3.176 2.376 GLY 207.A N ASP 204.A O GLY 207.A H 2.841 2.147 ILE 208.A N ASP 204.A O ILE 208.A H 3.105 2.208 SER 209.A N LEU 205.A O SER 209.A H 3.063 2.122 SER 209.A OG LEU 205.A O SER 209.A HG 2.681 1.817 THR 210.A N ARG 206.A O THR 210.A H 3.269 2.407 LYS 211.A N GLY 207.A O LYS 211.A H 3.291 2.391 GLY 212.A N ILE 208.A O GLY 212.A H 2.733 1.928 ALA 213.A N SER 209.A O ALA 213.A H 2.820 1.920 GLU 214.A N THR 210.A O GLU 214.A H 3.152 2.237 ARG 215.A N LYS 211.A O ARG 215.A H 3.081 2.215 ARG 215.A NE GLY 122.A O ARG 215.A HE 2.859 1.995 ARG 215.A NH1 THR 218.A OG1 ARG 215.A HH11 3.284 2.542 ARG 215.A NH1 GLU 222.A OE2 ARG 215.A HH12 3.445 2.508 ARG 215.A NH2 GLY 122.A O ARG 215.A HH21 3.245 2.518 ALA 216.A N GLY 212.A O ALA 216.A H 3.064 2.292 ALA 216.A N ALA 213.A O ALA 216.A H 3.203 2.502 ILE 217.A N GLU 214.A O ILE 217.A H 3.176 2.466 LEU 219.A N ARG 215.A O LEU 219.A H 2.925 2.005 LYS 220.A N ALA 216.A O LYS 220.A H 2.790 1.936 MET 221.A N ILE 217.A O MET 221.A H 3.278 2.376 GLU 222.A N THR 218.A O GLU 222.A H 3.022 2.175 ILE 223.A N LEU 219.A O ILE 223.A H 3.003 2.227 ARG 232.A N PRO 228.A O ARG 232.A H 3.052 2.162 GLU 233.A N PRO 229.A O GLU 233.A H 2.986 2.068 MET 234.A N LEU 230.A O MET 234.A H 3.108 2.166 LEU 235.A N ILE 231.A O LEU 235.A H 3.185 2.286 GLU 236.A N GLU 233.A O GLU 236.A H 3.152 2.198 ASN 237.A ND2 PRO 238.A O ASN 237.A HD22 3.303 2.338