Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 2lyv_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 3.A NZ GLU 66.A OE1 LYS 3.A HZ3 2.741 1.704 LYS 3.A NZ GLU 67.A OE2 LYS 3.A HZ2 2.737 1.702 SER 6.A N GLU 5.A OE2 SER 6.A H 2.832 1.960 LYS 8.A N GLU 9.A OE1 LYS 8.A H 3.342 2.443 LYS 8.A NZ GLU 5.A OE2 LYS 8.A HZ3 2.766 1.813 LEU 13.A N PRO 10.A O LEU 13.A H 2.873 2.040 ARG 14.A N GLU 11.A O ARG 14.A H 3.190 2.301 ARG 14.A NH1 ALA 63.A O ARG 14.A HH11 2.816 1.903 LYS 15.A N GLU 11.A O LYS 15.A H 2.757 2.041 LEU 16.A N VAL 60.A O LEU 16.A H 2.727 1.759 PHE 17.A N LYS 87.A O PHE 17.A H 2.653 1.716 ILE 18.A N GLY 58.A O ILE 18.A H 2.701 1.736 GLY 19.A N GLU 85.A O GLY 19.A H 2.843 1.864 LEU 21.A N GLY 56.A O LEU 21.A H 2.789 1.854 SER 22.A N THR 25.A OG1 SER 22.A H 2.956 2.110 THR 25.A N SER 22.A O THR 25.A H 3.337 2.375 THR 25.A OG1 ASP 80.A OD2 THR 25.A HG1 3.385 2.541 SER 29.A OG ASP 80.A OD2 SER 29.A HG 2.736 1.773 LEU 30.A N THR 26.A O LEU 30.A H 2.898 1.983 ARG 31.A N ASP 27.A O ARG 31.A H 2.907 1.940 ARG 31.A NH1 GLU 35.A OE2 ARG 31.A HH11 2.871 1.920 ARG 31.A NH1 LEU 40.A O ARG 31.A HH12 2.838 2.053 ARG 31.A NH2 LEU 40.A O ARG 31.A HH22 3.186 2.517 SER 32.A N GLU 28.A O SER 32.A H 3.095 2.140 HIS 33.A N SER 29.A O HIS 33.A H 3.087 2.208 PHE 34.A N LEU 30.A O PHE 34.A H 3.244 2.261 GLU 35.A N ARG 31.A O GLU 35.A H 2.686 1.774 GLN 36.A N HIS 33.A O GLN 36.A H 3.159 2.223 GLN 36.A NE2 HIS 33.A O GLN 36.A HE21 2.811 1.867 TRP 37.A N PHE 34.A O TRP 37.A H 3.074 2.120 THR 41.A N THR 61.A O THR 41.A H 2.729 1.810 ASP 42.A N THR 61.A O ASP 42.A H 3.339 2.378 CYS 43.A SG ASP 27.A O CYS 43.A HG 3.084 1.783 VAL 44.A N PHE 59.A O VAL 44.A H 2.976 2.014 MET 46.A N PHE 57.A O MET 46.A H 2.806 1.922 ASP 48.A N ARG 53.A O ASP 48.A H 2.680 1.712 ASN 50.A N ASP 48.A OD1 ASN 50.A H 3.151 2.206 ASN 50.A ND2 ASP 48.A OD1 ASN 50.A HD21 2.817 1.834 THR 51.A N ASP 48.A OD2 THR 51.A H 2.680 1.740 THR 51.A OG1 ASP 48.A OD2 THR 51.A HG1 3.146 2.360 ARG 53.A NH1 LYS 52.A O ARG 53.A HH11 2.962 2.092 SER 54.A N PHE 23.A O SER 54.A H 3.495 2.606 SER 54.A OG THR 25.A O SER 54.A HG 2.790 1.900 ARG 55.A N MET 46.A O ARG 55.A H 2.902 1.983 GLY 58.A N ILE 18.A O GLY 58.A H 2.824 1.891 PHE 59.A N VAL 44.A O PHE 59.A H 2.860 1.912 VAL 60.A N LEU 16.A O VAL 60.A H 2.947 2.025 THR 61.A N ASP 42.A O THR 61.A H 2.721 1.740 TYR 62.A N ARG 14.A O TYR 62.A H 2.895 1.922 TYR 62.A OH PHE 34.A O TYR 62.A HH 2.740 1.780 ALA 63.A N THR 39.A O ALA 63.A H 2.795 1.990 THR 64.A OG1 GLU 67.A OE1 THR 64.A HG1 2.729 1.846 VAL 68.A N THR 64.A O VAL 68.A H 3.384 2.521 ASP 69.A N VAL 65.A O ASP 69.A H 2.962 2.031 ALA 70.A N GLU 66.A O ALA 70.A H 3.203 2.225 ALA 71.A N GLU 67.A O ALA 71.A H 3.299 2.505 ALA 71.A N VAL 68.A O ALA 71.A H 2.871 2.180 MET 72.A N VAL 68.A O MET 72.A H 2.776 1.889 ASN 73.A N ASP 69.A O ASN 73.A H 2.845 1.874 ALA 74.A N ALA 70.A O ALA 74.A H 3.271 2.504 ARG 75.A N MET 72.A O ARG 75.A H 3.301 2.366 ARG 75.A NE GLU 85.A OE1 ARG 75.A HE 2.702 1.726 ARG 75.A NH1 ASP 155.A OD2 ARG 75.A HH12 3.172 2.468 ARG 75.A NH2 GLU 85.A OE1 ARG 75.A HH21 3.291 2.546 HIS 77.A NE2 ALA 71.A O HIS 77.A HE2 2.756 1.780 ARG 82.A N VAL 79.A O ARG 82.A H 3.037 2.253 VAL 84.A N HIS 77.A O VAL 84.A H 2.862 1.984 GLU 85.A N GLY 19.A O GLU 85.A H 2.758 1.776 LYS 87.A N PHE 17.A O LYS 87.A H 2.686 1.801 LYS 87.A NZ HIS 101.A O LYS 87.A HZ1 2.808 1.851 LYS 87.A NZ THR 103.A OG1 LYS 87.A HZ3 2.868 1.917 ARG 88.A NH2 ASP 157.A OD1 ARG 88.A HH21 2.665 1.658 ALA 89.A N LYS 15.A O ALA 89.A H 3.177 2.226 SER 91.A OG GLN 12.A OE1 SER 91.A HG 2.764 1.811 SER 95.A N SER 91.A O SER 95.A H 2.726 1.789 GLN 96.A N GLU 93.A O GLN 96.A H 3.501 2.615 ARG 97.A N ASP 94.A O ARG 97.A H 2.985 2.061 LYS 105.A NZ ASP 154.A O LYS 105.A HZ1 2.994 2.004 LYS 106.A NZ GLU 135.A OE2 LYS 106.A HZ2 2.782 1.835 ILE 107.A N VAL 151.A O ILE 107.A H 3.029 2.085 PHE 108.A N ARG 178.A O PHE 108.A H 2.905 1.942 VAL 109.A N ALA 149.A O VAL 109.A H 2.850 1.884 GLY 110.A N GLU 176.A O GLY 110.A H 2.774 1.831 GLY 111.A N GLY 147.A O GLY 111.A H 3.142 2.205 THR 116.A N LYS 145.A O THR 116.A H 3.072 2.148 GLU 117.A N HIS 120.A ND1 GLU 117.A H 3.027 2.056 HIS 120.A N GLU 117.A O HIS 120.A H 3.129 2.382 LEU 121.A N GLU 117.A O LEU 121.A H 3.496 2.549 ARG 122.A N GLU 118.A O ARG 122.A H 2.708 1.775 ARG 122.A NE GLU 118.A OE1 ARG 122.A HE 2.760 1.775 ARG 122.A NH2 GLU 118.A OE1 ARG 122.A HH21 3.345 2.589 ASP 123.A N HIS 119.A O ASP 123.A H 3.248 2.341 TYR 124.A N HIS 120.A O TYR 124.A H 3.350 2.581 TYR 124.A OH HIS 168.A ND1 TYR 124.A HH 2.756 1.914 PHE 125.A N LEU 121.A O PHE 125.A H 2.756 1.778 GLU 126.A N ARG 122.A O GLU 126.A H 2.852 2.033 GLN 127.A N TYR 124.A O GLN 127.A H 3.309 2.502 GLN 127.A NE2 ASP 123.A O GLN 127.A HE21 3.384 2.451 TYR 128.A N PHE 125.A O TYR 128.A H 2.950 2.082 TYR 128.A OH TYR 124.A OH TYR 128.A HH 2.986 2.119 GLY 129.A N PHE 125.A O GLY 129.A H 3.397 2.601 LYS 130.A NZ ASP 154.A OD1 LYS 130.A HZ2 2.837 1.821 GLU 132.A N THR 152.A O GLU 132.A H 2.793 1.890 VAL 133.A N THR 152.A O VAL 133.A H 3.441 2.493 GLU 135.A N PHE 150.A O GLU 135.A H 2.790 1.954 ASP 139.A N LYS 144.A O ASP 139.A H 2.725 1.780 GLY 141.A N ASP 139.A OD1 GLY 141.A H 2.880 2.101 SER 142.A N ASP 139.A OD1 SER 142.A H 2.785 1.801 ARG 146.A NE ASP 139.A OD2 ARG 146.A HE 2.798 1.828 ARG 146.A NH1 GLU 114.A OE1 ARG 146.A HH11 2.794 2.080 ARG 146.A NH2 ASP 139.A OD1 ARG 146.A HH21 3.392 2.614 ARG 146.A NH2 ASP 139.A OD2 ARG 146.A HH21 3.262 2.472 ALA 149.A N VAL 109.A O ALA 149.A H 2.654 1.699 PHE 150.A N GLU 135.A O PHE 150.A H 2.706 1.783 VAL 151.A N ILE 107.A O VAL 151.A H 3.062 2.113 THR 152.A N VAL 133.A O THR 152.A H 2.965 2.070 PHE 153.A N LYS 105.A O PHE 153.A H 2.701 1.747 ASP 154.A N LYS 130.A O ASP 154.A H 2.966 1.995 ASP 157.A N ASP 155.A OD1 ASP 157.A H 2.897 1.925 SER 158.A OG TYR 128.A O SER 158.A HG 3.206 2.502 ASP 160.A N HIS 156.A O ASP 160.A H 2.930 2.005 LYS 161.A N ASP 157.A O LYS 161.A H 2.936 2.015 LYS 161.A NZ ASP 69.A OD1 LYS 161.A HZ1 2.890 1.865 LYS 161.A NZ ASP 157.A OD1 LYS 161.A HZ2 2.824 1.795 ILE 162.A N SER 158.A O ILE 162.A H 3.348 2.539 VAL 163.A N VAL 159.A O VAL 163.A H 2.882 2.060 ILE 164.A N ASP 160.A O ILE 164.A H 3.242 2.402 GLN 165.A N ILE 162.A O GLN 165.A H 3.000 2.102 HIS 168.A N CYS 175.A O HIS 168.A H 2.975 2.028 HIS 168.A NE2 ILE 162.A O HIS 168.A HE2 2.753 1.793 VAL 170.A N HIS 173.A O VAL 170.A H 2.751 1.837 HIS 173.A N VAL 170.A O HIS 173.A H 2.926 2.170 CYS 175.A N HIS 168.A O CYS 175.A H 2.867 1.987 CYS 175.A SG HIS 173.A ND1 CYS 175.A HG 3.286 2.041 GLU 176.A N GLY 110.A O GLU 176.A H 2.973 2.039 VAL 177.A N LYS 166.A O VAL 177.A H 2.639 1.662 ARG 178.A N PHE 108.A O ARG 178.A H 3.152 2.382 LYS 179.A NZ ASP 94.A OD2 LYS 179.A HZ1 2.849 1.823 LYS 179.A NZ ALA 100.A O LYS 179.A HZ3 2.917 2.033 LYS 179.A NZ ASP 160.A OD1 LYS 179.A HZ2 2.726 1.885 ALA 180.A N LYS 106.A O ALA 180.A H 2.889 1.952 MET 186.A N SER 182.A O MET 186.A H 2.757 1.851 ALA 187.A N LYS 183.A O ALA 187.A H 2.982 2.085 SER 188.A N GLN 184.A O SER 188.A H 2.762 1.796 SER 188.A OG GLU 185.A O SER 188.A HG 2.775 2.055 ARG 194.A N ARG 196.A O ARG 194.A H 2.992 2.037 ARG 194.A NH1 GLN 193.A O ARG 194.A HH11 2.887 2.180 GLY 195.A N GLN 193.A OE1 GLY 195.A H 2.948 2.014