Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 2nef_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): TRP 2.A NE1 LYS 39.A O TRP 2.A HE1 2.425 1.664 GLU 4.A N ALA 1.A O GLU 4.A H 3.280 2.569 ALA 5.A N LEU 3.A O ALA 5.A H 2.697 1.886 LYS 27.A NZ ASP 31.A OD1 LYS 27.A HZ2 3.368 2.372 ALA 29.A N THR 25.A O ALA 29.A H 3.098 2.268 ALA 29.A N TYR 26.A O ALA 29.A H 2.886 2.190 VAL 30.A N TYR 26.A O VAL 30.A H 3.363 2.419 ASP 31.A N LYS 27.A O ASP 31.A H 2.883 1.913 LEU 32.A N ALA 28.A O LEU 32.A H 2.755 1.834 SER 33.A N ALA 29.A O SER 33.A H 2.651 1.705 HIS 34.A N VAL 30.A O HIS 34.A H 3.106 2.143 HIS 34.A NE2 SER 117.A OG no hydrogen 3.098 N/A PHE 35.A N ASP 31.A O PHE 35.A H 2.792 1.893 LEU 36.A N LEU 32.A O LEU 36.A H 2.889 1.915 LYS 37.A N SER 33.A O LYS 37.A H 3.221 2.403 GLU 38.A N HIS 34.A O GLU 38.A H 3.012 2.043 LYS 39.A N PHE 35.A O LYS 39.A H 3.018 2.221 GLY 44.A N TRP 113.A O GLY 44.A H 2.842 2.067 LEU 45.A N LEU 42.A O LEU 45.A H 3.076 2.204 GLN 52.A NE2 ASP 56.A OD2 GLN 52.A HE22 3.096 2.286 ILE 54.A N ARG 50.A O ILE 54.A H 3.342 2.378 LEU 55.A N ARG 51.A O LEU 55.A H 3.202 2.282 ASP 56.A N GLN 52.A O ASP 56.A H 3.243 2.306 LEU 57.A N ASP 53.A O LEU 57.A H 2.607 1.653 TRP 58.A N ILE 54.A O TRP 58.A H 2.533 1.604 ILE 59.A N LEU 55.A O ILE 59.A H 2.966 1.999 TYR 60.A N ASP 56.A O TYR 60.A H 3.205 2.423 HIS 61.A N LEU 57.A O HIS 61.A H 3.262 2.406 THR 62.A N ILE 59.A O THR 62.A H 3.377 2.505 GLY 64.A N ILE 59.A O GLY 64.A H 2.755 1.931 TYR 65.A OH PRO 23.A O TYR 65.A HH 3.427 2.594 THR 73.A N TYR 80.A O THR 73.A H 3.205 2.280 ARG 79.A N LEU 90.A O ARG 79.A H 3.333 2.573 LEU 82.A N ASN 71.A O LEU 82.A H 3.517 2.599 THR 83.A OG1 TRP 69.A O THR 83.A HG1 2.747 1.852 LYS 89.A N ARG 114.A O LYS 89.A H 3.218 2.276 LEU 90.A N ARG 79.A O LEU 90.A H 3.309 2.547 VAL 91.A N GLU 112.A O VAL 91.A H 3.300 2.408 LEU 98.A N GLU 96.A O LEU 98.A H 2.943 2.138 LYS 103.A NZ ALA 101.A O LYS 103.A HZ1 3.378 2.445 ARG 108.A N PRO 106.A O ARG 108.A H 2.792 1.966 GLU 112.A N VAL 91.A O GLU 112.A H 3.494 2.544 TRP 113.A N LEU 45.A O TRP 113.A H 3.299 2.353 ARG 114.A N LYS 89.A O ARG 114.A H 2.992 2.115 ASP 116.A N CYS 87.A O ASP 116.A H 2.987 2.073 LEU 119.A N ASP 116.A O LEU 119.A H 2.869 1.899 ALA 120.A N SER 117.A O ALA 120.A H 2.949 2.074 PHE 121.A N ARG 118.A O PHE 121.A H 3.025 2.080 HIS 122.A N ARG 118.A O HIS 122.A H 3.223 2.244 GLU 127.A N MET 124.A O GLU 127.A H 2.770 2.054 LEU 128.A N MET 124.A O LEU 128.A H 3.312 2.497 LEU 128.A N ALA 125.A O LEU 128.A H 3.336 2.589 HIS 129.A N ALA 125.A O HIS 129.A H 3.427 2.520 PHE 133.A N PRO 130.A O PHE 133.A H 2.779 1.970