Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 2y1q_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): THR 4.A N VAL 95.A O THR 4.A H 2.933 2.101 THR 4.A OG1 VAL 95.A O THR 4.A HG1 3.568 2.806 ALA 7.A N THR 4.A OG1 ALA 7.A H 3.021 2.192 GLN 8.A N THR 4.A O GLN 8.A H 2.935 2.122 LYS 9.A N GLU 5.A O LYS 9.A H 3.037 2.246 VAL 10.A N ARG 6.A O VAL 10.A H 3.038 2.240 LEU 11.A N ALA 7.A O LEU 11.A H 3.050 2.264 ALA 12.A N GLN 8.A O ALA 12.A H 3.045 2.233 LEU 13.A N LYS 9.A O LEU 13.A H 2.821 1.979 ALA 14.A N VAL 10.A O ALA 14.A H 2.828 2.010 GLN 15.A N LEU 11.A O GLN 15.A H 3.108 2.279 GLU 16.A N ALA 12.A O GLU 16.A H 2.926 2.094 GLU 17.A N LEU 13.A O GLU 17.A H 2.902 2.100 ALA 18.A N ALA 14.A O ALA 18.A H 2.994 2.152 LEU 19.A N GLN 15.A O LEU 19.A H 3.060 2.242 ARG 20.A N GLU 16.A O ARG 20.A H 2.890 2.055 ARG 20.A NH2 GLU 17.A OE1 ARG 20.A HH21 3.096 2.517 ARG 20.A NH2 GLN 58.A OE1 ARG 20.A HH21 2.704 2.147 LEU 21.A N GLU 17.A O LEU 21.A H 3.096 2.373 LEU 21.A N ALA 18.A O LEU 21.A H 3.282 2.616 GLY 22.A N LEU 19.A O GLY 22.A H 2.963 2.134 HIS 23.A N ALA 18.A O HIS 23.A H 2.783 1.936 HIS 23.A NE2 GLY 66.A O no hydrogen 2.942 N/A ILE 26.A N HIS 71.A O ILE 26.A H 2.742 1.917 GLY 27.A N HIS 30.A ND1 GLY 27.A H 2.913 2.064 GLU 29.A N GLU 29.A OE1 GLU 29.A H 2.727 1.922 HIS 30.A N GLY 27.A O HIS 30.A H 2.914 2.265 ILE 31.A N GLY 27.A O ILE 31.A H 3.100 2.287 LEU 32.A N THR 28.A O LEU 32.A H 2.936 2.131 LEU 33.A N GLU 29.A O LEU 33.A H 3.054 2.231 GLY 34.A N HIS 30.A O GLY 34.A H 2.886 2.066 LEU 35.A N ILE 31.A O LEU 35.A H 2.830 2.025 VAL 36.A N LEU 32.A O VAL 36.A H 3.121 2.331 ARG 37.A N LEU 33.A O ARG 37.A H 2.906 2.067 GLU 38.A N GLY 34.A O GLU 38.A H 3.031 2.317 GLU 40.A N GLU 38.A O GLU 40.A H 2.985 2.312 GLY 41.A N GLU 38.A OE1 GLY 41.A H 2.812 2.047 ALA 43.A N THR 97.A OG1 ALA 43.A H 3.071 2.214 LYS 45.A N GLY 41.A O LYS 45.A H 2.981 2.143 ALA 46.A N ILE 42.A O ALA 46.A H 2.867 2.070 LEU 47.A N ALA 43.A O LEU 47.A H 2.964 2.120 GLN 48.A N ALA 44.A O GLN 48.A H 2.897 2.061 ALA 49.A N LYS 45.A O ALA 49.A H 2.972 2.185 LEU 50.A N ALA 46.A O LEU 50.A H 3.015 2.312 LEU 50.A N LEU 47.A O LEU 50.A H 3.215 2.577 GLY 51.A N GLN 48.A O GLY 51.A H 3.009 2.168 LEU 52.A N LEU 47.A O LEU 52.A H 3.014 2.185 ILE 57.A N GLY 53.A O ILE 57.A H 3.021 2.188 GLN 58.A N SER 54.A O GLN 58.A H 2.914 2.073 GLN 58.A NE2 GLU 17.A OE1 GLN 58.A HE22 3.056 2.284 GLN 58.A NE2 GLU 62.A OE2 GLN 58.A HE21 3.037 2.214 LYS 59.A N GLU 55.A O LYS 59.A H 2.935 2.141 GLU 60.A N LYS 56.A O GLU 60.A H 3.100 2.295 VAL 61.A N ILE 57.A O VAL 61.A H 2.961 2.115 GLU 62.A N GLN 58.A O GLU 62.A H 3.060 2.211 SER 63.A N LYS 59.A O SER 63.A H.B 3.017 2.249 LEU 64.A N GLU 60.A O LEU 64.A H 3.024 2.272 LEU 64.A N VAL 61.A O LEU 64.A H 3.191 2.581 ILE 65.A N VAL 61.A O ILE 65.A H 3.062 2.289 GLY 66.A N GLU 62.A O GLY 66.A H 3.070 2.406 HIS 71.A N ASN 24.A O HIS 71.A H 2.949 2.151 THR 73.A N ILE 26.A O THR 73.A H 2.912 2.086 ARG 75.A NH1 GLU 107.A OE2 ARG 75.A HH11 2.912 2.150 ALA 76.A N THR 73.A OG1 ALA 76.A H 2.934 2.096 LYS 77.A N THR 73.A O LYS 77.A H 2.977 2.139 LYS 78.A N PRO 74.A O LYS 78.A H 2.975 2.166 LYS 78.A NZ GLU 107.A OE1 LYS 78.A HZ1 3.021 2.352 VAL 79.A N ARG 75.A O VAL 79.A H 2.887 2.064 ILE 80.A N ALA 76.A O ILE 80.A H 3.037 2.217 GLU 81.A N LYS 77.A O GLU 81.A H 2.923 2.106 LEU 82.A N LYS 78.A O LEU 82.A H 2.802 1.965 SER 83.A N VAL 79.A O SER 83.A H.A 2.899 2.184 SER 83.A N ILE 80.A O SER 83.A H.A 3.205 2.598 MET 84.A N GLU 81.A O MET 84.A H 3.107 2.370 GLU 86.A N LEU 82.A O GLU 86.A H 2.963 2.148 ALA 87.A N SER 83.A O ALA 87.A H 2.925 2.108 ARG 88.A N MET 84.A O ARG 88.A H 2.976 2.147 ARG 88.A NH1 ASP 85.A OD1 ARG 88.A HH12 3.249 2.628 LYS 89.A N ASP 85.A O LYS 89.A H 3.042 2.248 LEU 90.A N GLU 86.A O LEU 90.A H 3.223 2.537 LEU 90.A N ALA 87.A O LEU 90.A H 3.030 2.349 GLY 91.A N ARG 88.A O GLY 91.A H 3.004 2.169 HIS 92.A N ALA 87.A O HIS 92.A H 2.942 2.101 VAL 95.A N ARG 2.A O VAL 95.A H 2.827 1.980 GLY 96.A N HIS 99.A ND1 GLY 96.A H 2.890 2.031 GLU 98.A N GLU 98.A OE1 GLU 98.A H 2.772 1.944 HIS 99.A N GLY 96.A O HIS 99.A H 3.031 2.311 ILE 100.A N GLY 96.A O ILE 100.A H 3.392 2.591 LEU 101.A N THR 97.A O LEU 101.A H 3.086 2.249 LEU 102.A N GLU 98.A O LEU 102.A H 2.865 2.030 GLY 103.A N HIS 99.A O GLY 103.A H 2.849 2.079 LEU 104.A N ILE 100.A O LEU 104.A H 2.899 2.088 ILE 105.A N LEU 101.A O ILE 105.A H 2.936 2.106 ARG 106.A N LEU 102.A O ARG 106.A H 2.902 2.083 ARG 106.A NH1 GLU 86.A OE2 ARG 106.A HH11 2.958 2.151 GLU 107.A N GLY 103.A O GLU 107.A H 2.976 2.141 GLY 108.A N LEU 104.A O GLY 108.A H 3.056 2.199 ALA 112.A N THR 28.A OG1 ALA 112.A H 3.045 2.186 ARG 114.A N GLY 110.A O ARG 114.A H 3.039 2.242 VAL 115.A N VAL 111.A O VAL 115.A H 2.881 2.043 LEU 116.A N ALA 112.A O LEU 116.A H 2.873 2.072 ASN 117.A N ALA 113.A O ASN 117.A H 2.883 2.053 ASN 118.A N ARG 114.A O ASN 118.A H 2.877 2.052 ASN 118.A ND2 GLU 60.A OE2 ASN 118.A HD21 2.944 2.005 LEU 119.A N VAL 115.A O LEU 119.A H 2.871 2.133 GLY 120.A N ASN 117.A O GLY 120.A H 3.070 2.285 VAL 121.A N LEU 116.A O VAL 121.A H 2.915 2.055 ASN 124.A ND2 GLN 128.A OE1 ASN 124.A HD22 3.238 2.440 LYS 125.A N SER 122.A OG LYS 125.A H 3.050 2.212 ALA 126.A N SER 122.A O ALA 126.A H 2.948 2.167 ARG 127.A N LEU 123.A O ARG 127.A H 2.937 2.112 ARG 127.A NH1 GLU 86.A OE1 ARG 127.A HH12 2.844 1.993 GLN 128.A N ASN 124.A O GLN 128.A H 2.958 2.133 GLN 129.A N LYS 125.A O GLN 129.A H 2.944 2.154 VAL 130.A N ALA 126.A O VAL 130.A H 3.079 2.247 LEU 131.A N ARG 127.A O LEU 131.A H 2.963 2.130 GLN 132.A N GLN 128.A O GLN 132.A H 2.855 2.025 LEU 133.A N GLN 129.A O LEU 133.A H 3.097 2.264 LEU 134.A N VAL 130.A O LEU 134.A H 3.014 2.203 GLY 135.A N LEU 131.A O GLY 135.A H 2.839 2.157 GLY 135.A N GLN 132.A O GLY 135.A H 3.201 2.547 ASN 136.A N LEU 133.A O ASN 136.A H 3.352 2.547