Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 2yga_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLU 4.A N VAL 158.A O GLU 4.A H 3.140 2.272 PHE 6.A N PHE 156.A O PHE 6.A H 2.907 1.926 PHE 8.A N GLY 154.A O PHE 8.A H 2.679 1.691 GLN 9.A N GLY 94.A O GLN 9.A H 3.073 2.078 GLN 9.A NE2 GLU 11.A OE1 GLN 9.A HE22 3.529 2.747 GLU 11.A N GLN 9.A OE1 GLU 11.A H 2.943 2.053 THR 13.A N GLN 9.A O THR 13.A H 3.208 2.258 GLN 14.A N ALA 10.A O GLN 14.A H 3.072 2.162 LEU 15.A N GLU 11.A O LEU 15.A H 2.712 1.733 MET 16.A N ILE 12.A O MET 16.A H 2.986 2.045 SER 17.A N THR 13.A O SER 17.A H 3.097 2.280 SER 17.A N GLN 14.A O SER 17.A H 2.981 2.252 LEU 18.A N GLN 14.A O LEU 18.A H 3.085 2.123 ILE 19.A N LEU 15.A O ILE 19.A H 3.113 2.140 ILE 20.A N MET 16.A O ILE 20.A H 3.075 2.079 ASN 21.A N SER 17.A O ASN 21.A H 3.135 2.254 ASN 21.A ND2 SER 17.A O ASN 21.A HD21 2.886 1.937 VAL 23.A N THR 22.A OG1 VAL 23.A H 2.309 1.565 LYS 27.A N SER 25.A O LYS 27.A H 2.626 1.763 ILE 29.A N ASN 26.A O ILE 29.A H 3.400 2.422 PHE 30.A N LYS 27.A O PHE 30.A H 3.206 2.212 LEU 31.A N GLU 28.A O LEU 31.A H 3.370 2.428 ARG 32.A NE GLU 33.A OE2 ARG 32.A HE 3.188 2.465 ARG 32.A NH2 GLU 33.A OE2 ARG 32.A HH21 2.724 1.867 ARG 32.A NH2 SER 115.A O ARG 32.A HH22 2.717 1.921 GLU 33.A N ILE 29.A O GLU 33.A H 3.086 2.122 LEU 34.A N PHE 30.A O LEU 34.A H 2.995 2.017 ILE 35.A N LEU 31.A O ILE 35.A H 2.913 1.921 SER 36.A N ARG 32.A O SER 36.A H 2.886 1.946 ASN 37.A N GLU 33.A O ASN 37.A H 2.863 1.904 ALA 38.A N LEU 34.A O ALA 38.A H 2.900 1.976 SER 39.A N ILE 35.A O SER 39.A H 2.761 1.781 ASP 40.A N SER 36.A O ASP 40.A H 2.893 1.984 ALA 41.A N ASN 37.A O ALA 41.A H 2.934 1.997 LEU 42.A N ALA 38.A O LEU 42.A H 2.900 1.981 ASP 43.A N SER 39.A O ASP 43.A H 2.858 1.878 LYS 44.A N ASP 40.A O LYS 44.A H 2.939 1.985 LYS 44.A NZ ASP 40.A OD1 LYS 44.A HZ3 3.535 2.845 LYS 44.A NZ ASP 40.A OD2 LYS 44.A HZ3 2.672 1.677 ILE 45.A N ALA 41.A O ILE 45.A H 3.113 2.130 ARG 46.A N LEU 42.A O ARG 46.A H 3.032 2.082 ARG 46.A NE TYR 203.A OH ARG 46.A HE 3.243 2.281 ARG 46.A NH2 TYR 203.A OH ARG 46.A HH21 3.442 2.567 TYR 47.A N ASP 43.A O TYR 47.A H 2.810 1.854 LYS 48.A N LYS 44.A O LYS 48.A H 2.921 1.948 SER 49.A N ILE 45.A O SER 49.A H 2.928 2.156 SER 49.A N ARG 46.A O SER 49.A H 3.243 2.529 SER 49.A OG ARG 46.A O SER 49.A HG 2.705 1.726 LEU 50.A N TYR 47.A O LEU 50.A H 3.288 2.379 SER 51.A N LYS 48.A O SER 51.A H 3.481 2.516 ASP 52.A N SER 49.A O ASP 52.A H 3.473 2.484 GLN 55.A N ASP 52.A O GLN 55.A H 3.212 2.242 GLN 55.A NE2 ASP 52.A OD2 GLN 55.A HE21 2.744 1.749 LEU 56.A N PRO 53.A O LEU 56.A H 3.335 2.379 GLU 57.A N LYS 54.A O GLU 57.A H 3.229 2.244 THR 58.A OG1 ASN 141.A OD1 THR 58.A HG1 2.736 1.738 GLU 59.A N LEU 56.A O GLU 59.A H 3.206 2.265 ASP 61.A N GLU 59.A OE2 ASP 61.A H 3.293 2.336 PHE 63.A N SER 80.A OG PHE 63.A H 3.053 2.217 ILE 64.A N PRO 204.A O ILE 64.A H 2.929 1.940 ARG 65.A N ARG 78.A O ARG 65.A H 2.731 1.796 ARG 65.A NE GLN 206.A OE1 ARG 65.A HE 2.596 1.656 ARG 65.A NH2 GLN 206.A OE1 ARG 65.A HH21 2.915 2.131 ILE 66.A N GLN 206.A O ILE 66.A H 2.775 1.784 THR 67.A N GLU 76.A O THR 67.A H 2.914 1.940 LYS 69.A N VAL 74.A O LYS 69.A H 2.864 1.877 LYS 69.A NZ GLU 76.A OE2 LYS 69.A HZ3 2.718 1.738 GLN 72.A N LYS 69.A O GLN 72.A H 3.079 2.296 LYS 73.A N PRO 70.A O LYS 73.A H 3.132 2.204 LYS 73.A NZ ASP 179.A OD1 LYS 73.A HZ1 2.875 1.878 VAL 74.A N LYS 69.A O VAL 74.A H 3.144 2.159 LEU 75.A N LEU 175.A O LEU 75.A H 2.858 1.949 GLU 76.A N THR 67.A O GLU 76.A H 3.049 2.058 ILE 77.A N LEU 173.A O ILE 77.A H 2.886 1.971 ARG 78.A N ARG 65.A O ARG 78.A H 2.851 1.899 ASP 79.A N THR 171.A O ASP 79.A H 3.015 2.094 SER 80.A N PHE 63.A O SER 80.A H 3.231 2.323 SER 80.A OG ASP 61.A O SER 80.A HG 2.603 1.678 GLY 81.A N ASP 79.A OD1 GLY 81.A H 2.634 1.732 ILE 82.A N ALA 41.A O ILE 82.A H 3.042 2.234 MET 84.A N SER 138.A OG MET 84.A H 2.681 1.773 LYS 86.A N ASP 143.A OD2 LYS 86.A H 2.969 1.977 LYS 86.A NZ GLU 4.A OE1 LYS 86.A HZ3 2.663 1.793 GLY 88.A N THR 85.A OG1 GLY 88.A H 3.103 2.136 LEU 89.A N THR 85.A O LEU 89.A H 2.789 1.821 ILE 90.A N LYS 86.A O ILE 90.A H 2.954 1.997 ASN 91.A N ALA 87.A O ASN 91.A H 2.951 1.996 LEU 92.A N GLY 88.A O LEU 92.A H 2.957 2.002 LEU 93.A N LEU 89.A O LEU 93.A H 3.379 2.562 THR 95.A N ILE 90.A O THR 95.A H 3.297 2.332 THR 95.A OG1 ILE 90.A O THR 95.A HG1 2.864 1.868 ILE 96.A N ASN 91.A O ILE 96.A H 3.122 2.150 THR 101.A N LYS 98.A O THR 101.A H 3.216 2.232 PHE 104.A N GLY 100.A O PHE 104.A H 2.996 2.047 MET 105.A N THR 101.A O MET 105.A H 3.404 2.448 GLU 106.A N LYS 102.A O GLU 106.A H 3.122 2.154 ALA 107.A N ALA 103.A O ALA 107.A H 2.878 1.927 LEU 108.A N PHE 104.A O LEU 108.A H 2.707 1.715 SER 109.A N MET 105.A O SER 109.A H 2.887 1.913 SER 109.A OG GLU 106.A O SER 109.A HG 3.062 2.105 ALA 110.A N ALA 107.A O ALA 110.A H 3.018 2.141 GLY 111.A N LEU 108.A O GLY 111.A H 3.152 2.174 ALA 112.A N ALA 107.A O ALA 112.A H 3.009 2.082 SER 115.A N ASP 113.A OD1 SER 115.A H 3.306 2.355 SER 115.A OG ASP 113.A OD2 SER 115.A HG 2.795 1.803 MET 116.A N ASP 113.A O MET 116.A H 2.994 2.019 ILE 117.A N VAL 114.A O ILE 117.A H 2.732 1.739 GLN 119.A N MET 116.A O GLN 119.A H 2.799 1.919 PHE 120.A N ILE 117.A O PHE 120.A H 3.259 2.358 GLY 121.A N GLY 118.A O GLY 121.A H 3.218 2.278 VAL 122.A N ILE 117.A O VAL 122.A H 3.432 2.446 TYR 125.A N VAL 122.A O TYR 125.A H 3.002 2.068 SER 126.A N GLY 123.A O SER 126.A H 2.824 1.857 SER 126.A OG GLY 123.A O SER 126.A HG 2.596 1.634 LEU 127.A N PHE 124.A O LEU 127.A H 3.307 2.308 PHE 128.A N TYR 125.A O PHE 128.A H 3.254 2.260 LEU 129.A N SER 126.A O LEU 129.A H 2.875 1.918 VAL 130.A N LEU 127.A O VAL 130.A H 3.263 2.330 ALA 131.A N LEU 127.A O ALA 131.A H 3.023 2.195 ASP 132.A N PHE 176.A O ASP 132.A H 3.247 2.362 ARG 133.A NE GLU 149.A OE2 ARG 133.A HE 2.823 1.932 ARG 133.A NH2 GLU 149.A OE2 ARG 133.A HH21 2.874 2.023 VAL 134.A N SER 150.A O VAL 134.A H 2.998 2.057 GLN 135.A N ARG 174.A O GLN 135.A H 3.035 2.089 GLN 135.A NE2 GLU 149.A OE1 GLN 135.A HE21 3.433 2.610 VAL 136.A N TRP 148.A O VAL 136.A H 2.817 1.862 ILE 137.A N ILE 172.A O ILE 137.A H 2.943 1.958 SER 138.A N TYR 146.A O SER 138.A H 3.088 2.150 SER 138.A OG THR 171.A OG1 SER 138.A HG 3.075 2.079 LYS 139.A N GLY 170.A O LYS 139.A H 2.704 1.750 LYS 139.A NZ SER 140.A O LYS 139.A HZ1 2.727 1.790 ASN 141.A ND2 GLN 55.A O ASN 141.A HD22 2.941 2.066 ASN 141.A ND2 GLN 55.A OE1 ASN 141.A HD21 2.779 1.797 ASP 142.A N SER 140.A OG ASP 142.A H 3.091 2.105 ASP 143.A N SER 140.A O ASP 143.A H 3.432 2.502 GLN 145.A NE2 ASP 161.A OD2 GLN 145.A HE21 2.814 1.841 GLN 145.A NE2 GLU 165.A O GLN 145.A HE22 3.053 2.062 TYR 146.A N SER 138.A O TYR 146.A H 3.125 2.194 ILE 147.A N THR 159.A O ILE 147.A H 2.789 1.811 TRP 148.A N VAL 136.A O TRP 148.A H 2.852 1.857 GLU 149.A N THR 157.A O GLU 149.A H 2.846 1.947 SER 150.A N VAL 134.A O SER 150.A H 3.188 2.234 ALA 152.A N SER 150.A OG ALA 152.A H 3.085 2.104 GLY 153.A N ASN 151.A OD1 GLY 153.A H 3.043 2.143 PHE 156.A N PHE 6.A O PHE 156.A H 2.913 2.024 THR 157.A N GLU 149.A O THR 157.A H 2.917 1.996 VAL 158.A N GLU 4.A O VAL 158.A H 2.908 1.953 THR 159.A N ILE 147.A O THR 159.A H 2.784 1.874 THR 159.A OG1 SER 3.A OG THR 159.A HG1 2.610 1.718 ASP 161.A N GLN 145.A O ASP 161.A H 2.858 1.869 VAL 163.A N ASP 161.A OD1 VAL 163.A H 2.795 1.817 ASN 164.A N ASP 161.A OD1 ASN 164.A H 3.043 2.279 ASN 164.A ND2 ASP 161.A OD2 ASN 164.A HD21 2.845 1.884 ARG 166.A NE ASN 164.A O ARG 166.A HE 3.174 2.451 ARG 166.A NH1 ASP 161.A O ARG 166.A HH12 2.972 2.011 ARG 166.A NH2 ASP 161.A O ARG 166.A HH22 3.390 2.591 ARG 166.A NH2 ASP 161.A OD1 ARG 166.A HH22 3.225 2.484 ARG 166.A NH2 ASN 164.A O ARG 166.A HH21 2.536 1.565 ILE 167.A N GLN 145.A OE1 ILE 167.A H 3.116 2.205 ARG 169.A NE SER 80.A O ARG 169.A HE 3.329 2.567 ARG 169.A NE GLY 81.A O ARG 169.A HE 3.010 2.145 ARG 169.A NH1 THR 58.A OG1 ARG 169.A HH11 3.215 2.394 ARG 169.A NH1 GLU 59.A O ARG 169.A HH12 3.216 2.488 ARG 169.A NH2 GLU 59.A O ARG 169.A HH22 2.830 1.966 ARG 169.A NH2 SER 80.A O ARG 169.A HH21 2.737 1.768 GLY 170.A N LYS 139.A O GLY 170.A H 2.862 1.879 THR 171.A N ASP 79.A O THR 171.A H 3.074 2.125 ILE 172.A N ILE 137.A O ILE 172.A H 2.680 1.719 LEU 173.A N ILE 77.A O LEU 173.A H 2.746 1.758 ARG 174.A N GLN 135.A O ARG 174.A H 2.816 1.820 ARG 174.A NE GLU 76.A OE2 ARG 174.A HE 2.913 1.982 ARG 174.A NH1 GLN 135.A OE1 ARG 174.A HH11 2.898 2.092 ARG 174.A NH1 ASN 164.A OD1 ARG 174.A HH12 3.064 2.167 ARG 174.A NH2 GLU 76.A OE2 ARG 174.A HH21 3.335 2.568 ARG 174.A NH2 ASN 164.A OD1 ARG 174.A HH22 3.156 2.292 LEU 175.A N LEU 75.A O LEU 175.A H 2.787 1.802 PHE 176.A N ARG 133.A O PHE 176.A H 3.073 2.076 LEU 177.A N LYS 73.A O LEU 177.A H 3.044 2.177 LYS 178.A N VAL 130.A O LYS 178.A H 2.811 1.827 LYS 178.A NZ ILE 20.A O LYS 178.A HZ2 3.188 2.231 LYS 178.A NZ PHE 128.A O LYS 178.A HZ3 2.893 1.896 LYS 178.A NZ LEU 129.A O LYS 178.A HZ1 3.236 2.600 GLN 181.A N LYS 178.A O GLN 181.A H 3.327 2.377 GLN 181.A NE2 ASP 180.A OD2 GLN 181.A HE21 2.834 1.913 TYR 184.A N GLN 181.A O TYR 184.A H 3.502 2.503 LEU 185.A N LEU 182.A O LEU 185.A H 2.943 1.961 GLU 186.A N GLU 183.A O GLU 186.A H 2.996 2.017 ARG 189.A NE GLU 183.A OE2 ARG 189.A HE 2.960 1.960 ARG 189.A NH2 GLU 28.A OE1 ARG 189.A HH22 2.475 1.510 ILE 190.A N GLU 186.A O ILE 190.A H 2.970 2.005 LYS 191.A N GLU 187.A O LYS 191.A H 3.029 2.039 GLU 192.A N LYS 188.A O GLU 192.A H 3.079 2.245 GLU 192.A N ARG 189.A O GLU 192.A H 3.205 2.504 VAL 193.A N ARG 189.A O VAL 193.A H 3.072 2.086 ILE 194.A N ILE 190.A O ILE 194.A H 3.065 2.069 LYS 195.A N LYS 191.A O LYS 195.A H 3.000 2.056 ARG 196.A N GLU 192.A O ARG 196.A H 3.020 2.074 ARG 196.A NH2 GLU 192.A OE2 ARG 196.A HH22 3.326 2.365 HIS 197.A N VAL 193.A O HIS 197.A H 3.035 2.127 HIS 197.A NE2 GLU 28.A OE2 HIS 197.A HE2 2.814 1.837 SER 198.A N ILE 194.A O SER 198.A H 2.861 2.000 TYR 203.A OH ASP 43.A OD1 TYR 203.A HH 2.460 1.576 GLN 206.A N ILE 64.A O GLN 206.A H 2.735 1.751 VAL 208.A N ILE 66.A O VAL 208.A H 2.910 1.947