Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 2yge_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 3.A OG THR 159.A OG1 SER 3.A HG 2.747 1.762 GLU 4.A N VAL 158.A O GLU 4.A H 2.941 1.944 PHE 6.A N PHE 156.A O PHE 6.A H 2.730 1.762 PHE 8.A N GLY 154.A O PHE 8.A H 2.695 1.698 GLN 9.A N GLY 94.A O GLN 9.A H 2.905 1.921 THR 13.A N GLN 9.A O THR 13.A H 3.197 2.237 GLN 14.A N ALA 10.A O GLN 14.A H 3.143 2.228 LEU 15.A N GLU 11.A O LEU 15.A H 2.886 1.910 MET 16.A N ILE 12.A O MET 16.A H 2.920 1.940 SER 17.A N THR 13.A O SER 17.A H 3.043 2.106 LEU 18.A N GLN 14.A O LEU 18.A H 2.882 1.907 ILE 19.A N LEU 15.A O ILE 19.A H 2.982 1.988 ILE 20.A N MET 16.A O ILE 20.A H 2.762 1.770 ASN 21.A N SER 17.A O ASN 21.A H 3.055 2.091 ASN 21.A ND2 SER 17.A O ASN 21.A HD21 3.028 2.193 TYR 24.A N THR 22.A OG1 TYR 24.A H 3.151 2.177 TYR 24.A OH ASP 113.A OD1.B TYR 24.A HH 2.331 1.555 TYR 24.A OH ASP 113.A OD2.B TYR 24.A HH 3.250 2.520 ASN 26.A ND2 TYR 24.A OH ASN 26.A HD21 3.436 2.616 LYS 27.A N SER 25.A O LYS 27.A H 2.837 2.002 LYS 27.A NZ TYR 24.A O LYS 27.A HZ1 2.902 1.971 ILE 29.A N ASN 26.A O ILE 29.A H 3.385 2.386 PHE 30.A N LYS 27.A O PHE 30.A H 3.098 2.098 LEU 31.A N GLU 28.A O LEU 31.A H 3.201 2.302 ARG 32.A NE GLU 33.A OE2 ARG 32.A HE 3.225 2.531 ARG 32.A NH2 GLU 33.A OE2 ARG 32.A HH21 2.663 1.801 ARG 32.A NH2 SER 115.A O ARG 32.A HH22 2.694 1.888 GLU 33.A N ILE 29.A O GLU 33.A H 3.134 2.200 LEU 34.A N PHE 30.A O LEU 34.A H 3.000 2.050 ILE 35.A N LEU 31.A O ILE 35.A H 2.959 1.987 SER 36.A N ARG 32.A O SER 36.A H 2.910 1.978 ASN 37.A N GLU 33.A O ASN 37.A H 2.895 1.956 ALA 38.A N LEU 34.A O ALA 38.A H 2.864 1.905 SER 39.A N ILE 35.A O SER 39.A H 2.755 1.797 ASP 40.A N SER 36.A O ASP 40.A H 2.885 1.974 ALA 41.A N ASN 37.A O ALA 41.A H 2.883 1.916 LEU 42.A N ALA 38.A O LEU 42.A H 2.914 1.998 ASP 43.A N SER 39.A O ASP 43.A H 2.833 1.894 ARG 44.A N ASP 40.A O ARG 44.A H 2.926 1.955 ILE 45.A N ALA 41.A O ILE 45.A H 3.327 2.349 ARG 46.A N LEU 42.A O ARG 46.A H 3.113 2.158 ARG 46.A NE TYR 203.A OH ARG 46.A HE 3.108 2.169 ARG 46.A NH2 TYR 203.A OH ARG 46.A HH21 3.215 2.335 TYR 47.A N ASP 43.A O TYR 47.A H 2.834 1.869 LYS 48.A N ARG 44.A O LYS 48.A H 2.866 1.875 SER 49.A N ILE 45.A O SER 49.A H 2.842 1.978 SER 49.A OG ARG 46.A O SER 49.A HG 2.555 1.638 LEU 50.A N TYR 47.A O LEU 50.A H 3.019 2.085 SER 51.A N LYS 48.A O SER 51.A H 3.230 2.282 ASP 52.A N SER 49.A O ASP 52.A H 3.419 2.568 GLN 55.A N ASP 52.A O GLN 55.A H 3.167 2.179 GLN 55.A NE2 ASP 52.A OD2 GLN 55.A HE21 2.855 1.859 LEU 56.A N PRO 53.A O LEU 56.A H 3.159 2.162 GLU 57.A N LYS 54.A O GLU 57.A H 3.054 2.069 THR 58.A OG1 ASN 141.A OD1 THR 58.A HG1 2.621 1.642 GLU 59.A N LEU 56.A O GLU 59.A H 2.920 1.960 ASP 61.A N GLU 59.A OE1 ASP 61.A H 3.169 2.204 PHE 63.A N SER 80.A OG PHE 63.A H 3.051 2.239 ILE 64.A N PRO 204.A O ILE 64.A H 3.026 2.046 ARG 65.A N ARG 78.A O ARG 65.A H 2.774 1.818 ARG 65.A NE GLN 206.A OE1 ARG 65.A HE 2.867 1.913 ARG 65.A NH2 GLN 206.A OE1 ARG 65.A HH21 3.149 2.325 ILE 66.A N GLN 206.A O ILE 66.A H 2.676 1.697 THR 67.A N GLU 76.A O THR 67.A H 2.963 2.008 LYS 69.A N VAL 74.A O LYS 69.A H 2.718 1.720 LYS 69.A NZ GLU 76.A OE2 LYS 69.A HZ3 2.658 1.692 GLN 72.A N LYS 69.A O GLN 72.A H 2.938 2.165 LYS 73.A N PRO 70.A O LYS 73.A H 3.066 2.117 LYS 73.A NZ ASP 179.A OD1 LYS 73.A HZ1 2.835 1.842 VAL 74.A N LYS 69.A O VAL 74.A H 3.319 2.321 LEU 75.A N LEU 175.A O LEU 75.A H 2.902 1.974 GLU 76.A N THR 67.A O GLU 76.A H 3.041 2.070 ILE 77.A N LEU 173.A O ILE 77.A H 2.849 1.908 ARG 78.A N ARG 65.A O ARG 78.A H 2.851 1.871 ARG 78.A NH2 ILE 167.A O.B ARG 78.A HH21 2.991 2.260 ASP 79.A N THR 171.A O ASP 79.A H 3.002 2.116 SER 80.A N PHE 63.A O SER 80.A H 3.264 2.410 SER 80.A OG ASP 61.A O SER 80.A HG 2.624 1.693 GLY 81.A N ASP 79.A OD1 GLY 81.A H 2.726 1.805 ILE 82.A N ALA 41.A O ILE 82.A H 3.002 2.184 MET 84.A N SER 138.A OG MET 84.A H 2.794 1.944 THR 85.A N GLU 88.A OE1 THR 85.A H 2.888 1.932 LYS 86.A N ASP 143.A OD2 LYS 86.A H 3.006 2.025 LYS 86.A NZ GLU 4.A OE2 LYS 86.A HZ3 2.606 1.636 GLU 88.A N THR 85.A OG1 GLU 88.A H 3.064 2.082 LEU 89.A N THR 85.A O LEU 89.A H 2.862 1.888 ILE 90.A N LYS 86.A O ILE 90.A H 3.009 2.034 ASN 91.A N ALA 87.A O ASN 91.A H 2.765 1.809 ASN 92.A N GLU 88.A O ASN 92.A H 2.776 1.829 ASN 92.A ND2 GLU 88.A O ASN 92.A HD21 3.255 2.352 LEU 93.A N LEU 89.A O LEU 93.A H 3.087 2.232 THR 95.A N ILE 90.A O THR 95.A H 3.532 2.590 THR 95.A OG1 ILE 90.A O THR 95.A HG1 2.561 1.578 THR 101.A N ASN 98.A O THR 101.A H 3.111 2.126 THR 101.A OG1 ASN 98.A O THR 101.A HG1 3.264 2.285 PHE 104.A N GLY 100.A O PHE 104.A H 2.931 1.956 MET 105.A N THR 101.A O MET 105.A H 3.164 2.170 GLU 106.A N LYS 102.A O GLU 106.A H 2.837 1.873 ALA 107.A N ALA 103.A O ALA 107.A H 2.834 1.902 LEU 108.A N PHE 104.A O LEU 108.A H 2.676 1.722 SER 109.A N MET 105.A O SER 109.A H 3.065 2.119 SER 109.A OG GLU 106.A O SER 109.A HG 2.948 1.976 ALA 110.A N ALA 107.A O ALA 110.A H 3.019 2.158 GLY 111.A N LEU 108.A O GLY 111.A H 3.165 2.222 ALA 112.A N ALA 107.A O ALA 112.A H 3.064 2.094 SER 115.A OG ASP 113.A OD2.B SER 115.A HG 2.661 1.776 MET 116.A N ASP 113.A O MET 116.A H 2.955 1.980 ILE 117.A N VAL 114.A O ILE 117.A H 2.863 1.902 GLN 119.A N MET 116.A O GLN 119.A H 2.792 2.005 PHE 120.A N ILE 117.A O PHE 120.A H 3.168 2.268 GLY 121.A N GLY 118.A O GLY 121.A H 3.187 2.217 VAL 122.A N ILE 117.A O VAL 122.A H 3.455 2.475 TYR 125.A N VAL 122.A O TYR 125.A H 3.151 2.182 SER 126.A N GLY 123.A O SER 126.A H 2.987 2.023 SER 126.A OG GLY 123.A O SER 126.A HG 2.705 1.724 LEU 127.A N PHE 124.A O LEU 127.A H 3.283 2.289 PHE 128.A N TYR 125.A O PHE 128.A H 3.131 2.140 LEU 129.A N SER 126.A O LEU 129.A H 2.993 1.999 VAL 130.A N LEU 127.A O VAL 130.A H 3.285 2.437 ALA 131.A N LEU 127.A O ALA 131.A H 3.039 2.261 ASP 132.A N PHE 176.A O ASP 132.A H 3.234 2.366 ARG 133.A NE GLU 149.A OE2 ARG 133.A HE 2.756 1.869 ARG 133.A NH2 GLU 149.A OE2 ARG 133.A HH21 2.869 2.048 VAL 134.A N SER 150.A O VAL 134.A H 2.982 2.123 GLN 135.A N ARG 174.A O GLN 135.A H 2.915 1.958 GLN 135.A NE2 GLU 149.A OE1 GLN 135.A HE21 3.441 2.689 GLN 135.A NE2 GLU 149.A OE2 GLN 135.A HE21 3.278 2.280 VAL 136.A N TRP 148.A O VAL 136.A H 2.724 1.753 ILE 137.A N ILE 172.A O ILE 137.A H 2.847 1.867 SER 138.A N TYR 146.A O SER 138.A H 3.053 2.117 SER 138.A OG THR 171.A OG1 SER 138.A HG 2.891 1.895 LYS 139.A N GLY 170.A O LYS 139.A H 2.869 1.893 LYS 139.A NZ SER 140.A O LYS 139.A HZ1 2.719 1.798 ASN 141.A ND2 GLN 55.A O ASN 141.A HD22 2.774 1.857 ASN 141.A ND2 GLN 55.A OE1 ASN 141.A HD21 2.847 1.852 ASP 142.A N SER 140.A OG ASP 142.A H 3.012 2.026 ASP 143.A N SER 140.A O ASP 143.A H 2.973 1.974 GLU 144.A N ASP 143.A OD1 GLU 144.A H 2.756 1.891 GLN 145.A NE2 ASP 161.A OD2 GLN 145.A HE21 3.015 2.066 GLN 145.A NE2 GLU 165.A O GLN 145.A HE22 3.057 2.062 TYR 146.A N SER 138.A O TYR 146.A H 3.058 2.118 ILE 147.A N THR 159.A O ILE 147.A H 2.781 1.812 TRP 148.A N VAL 136.A O TRP 148.A H 2.762 1.767 GLU 149.A N THR 157.A O GLU 149.A H 2.895 1.984 SER 150.A N VAL 134.A O SER 150.A H 3.094 2.132 ALA 152.A N SER 150.A OG ALA 152.A H 3.115 2.171 GLY 153.A N ASN 151.A OD1 GLY 153.A H 3.153 2.260 PHE 156.A N PHE 6.A O PHE 156.A H 2.688 1.799 THR 157.A N GLU 149.A O THR 157.A H 3.041 2.117 VAL 158.A N GLU 4.A O VAL 158.A H 2.855 1.921 THR 159.A N ILE 147.A O THR 159.A H 2.937 2.053 ASP 161.A N GLN 145.A O ASP 161.A H 2.912 1.941 VAL 163.A N ASP 161.A OD1 VAL 163.A H 2.894 1.912 ASN 164.A N ASP 161.A OD1 ASN 164.A H 2.921 1.945 ASN 164.A ND2 ASP 161.A OD2 ASN 164.A HD21 2.785 1.811 ARG 166.A NE ASN 164.A O ARG 166.A HE 3.362 2.597 ARG 166.A NH1 ASP 161.A O ARG 166.A HH12 3.106 2.193 ARG 166.A NH2 ASP 161.A O ARG 166.A HH22 3.187 2.307 ARG 166.A NH2 ASP 161.A OD1 ARG 166.A HH22 3.043 2.351 ARG 166.A NH2 ASN 164.A O ARG 166.A HH21 2.740 1.752 ILE 167.A N.A GLN 145.A OE1 ILE 167.A H.A 2.909 1.952 ILE 167.A N.B GLN 145.A OE1 ILE 167.A H.B 2.993 2.104 ARG 169.A NE SER 80.A O ARG 169.A HE 3.159 2.374 ARG 169.A NE GLY 81.A O ARG 169.A HE 3.001 2.144 ARG 169.A NH1 LEU 56.A O ARG 169.A HH12 3.353 2.428 ARG 169.A NH1 THR 58.A OG1 ARG 169.A HH11 3.194 2.390 ARG 169.A NH1 GLU 59.A O ARG 169.A HH12 3.358 2.695 ARG 169.A NH2 GLU 59.A O ARG 169.A HH22 2.862 2.041 ARG 169.A NH2 SER 80.A O ARG 169.A HH21 2.666 1.706 GLY 170.A N LYS 139.A O GLY 170.A H 2.890 1.906 THR 171.A N ASP 79.A O THR 171.A H 3.099 2.176 ILE 172.A N ILE 137.A O ILE 172.A H 2.703 1.730 LEU 173.A N ILE 77.A O LEU 173.A H 2.823 1.828 ARG 174.A N GLN 135.A O ARG 174.A H 2.779 1.781 ARG 174.A NE GLU 76.A OE2 ARG 174.A HE 2.820 1.882 ARG 174.A NH1 GLN 135.A OE1 ARG 174.A HH11 3.019 2.202 ARG 174.A NH1 ASN 164.A OD1 ARG 174.A HH12 2.884 1.959 ARG 174.A NH2 GLU 76.A OE2 ARG 174.A HH21 3.205 2.428 ARG 174.A NH2 ASN 164.A OD1 ARG 174.A HH22 3.172 2.358 LEU 175.A N LEU 75.A O LEU 175.A H 2.839 1.849 PHE 176.A N ARG 133.A O PHE 176.A H 3.000 2.007 LEU 177.A N LYS 73.A O LEU 177.A H 2.961 2.094 LYS 178.A N VAL 130.A O LYS 178.A H 2.889 1.908 LYS 178.A NZ ILE 20.A O LYS 178.A HZ2 3.335 2.477 LYS 178.A NZ PHE 128.A O LYS 178.A HZ3 2.984 2.000 ASP 180.A N ASP 180.A OD1 ASP 180.A H 2.705 1.945 GLN 181.A N LYS 178.A O GLN 181.A H 3.117 2.128 GLN 181.A NE2 ASP 180.A OD2 GLN 181.A HE21 3.178 2.287 TYR 184.A N GLN 181.A O TYR 184.A H 3.518 2.519 LEU 185.A N LEU 182.A O LEU 185.A H 3.072 2.095 GLU 186.A N GLU 183.A O GLU 186.A H 3.108 2.135 ARG 189.A NE GLU 183.A OE2 ARG 189.A HE 3.065 2.093 ARG 189.A NH2 GLU 28.A OE1 ARG 189.A HH22 2.601 1.633 ILE 190.A N GLU 186.A O ILE 190.A H 2.952 1.957 LYS 191.A N GLU 187.A O LYS 191.A H 2.955 1.955 GLU 192.A N LYS 188.A O GLU 192.A H 3.069 2.127 VAL 193.A N ARG 189.A O VAL 193.A H 3.045 2.093 ILE 194.A N ILE 190.A O ILE 194.A H 3.025 2.065 LYS 195.A N LYS 191.A O LYS 195.A H 3.031 2.058 ARG 196.A N GLU 192.A O ARG 196.A H 3.144 2.270 ARG 196.A NE GLU 28.A OE2 ARG 196.A HE 3.064 2.307 ARG 196.A NH2 GLU 28.A OE2 ARG 196.A HH21 2.752 1.904 HIS 197.A N VAL 193.A O HIS 197.A H 3.184 2.299 HIS 197.A NE2 GLU 28.A OE2 HIS 197.A HE2 2.991 2.229 SER 198.A N ILE 194.A O SER 198.A H 2.841 1.926 TYR 203.A OH ASP 43.A OD1 TYR 203.A HH 2.541 1.658 GLN 206.A N ILE 64.A O GLN 206.A H 2.653 1.663 VAL 208.A N ILE 66.A O VAL 208.A H 2.919 1.940