Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 2yha_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 3.A N THR 41.A O VAL 3.A H 2.917 2.092 ALA 4.A N ASN 138.A O ALA 4.A H 3.000 2.202 ARG 5.A N THR 137.A O ARG 5.A H 2.856 2.021 CYS 7.A N ASN 131.A OD1 CYS 7.A H 2.947 2.203 CYS 7.A SG ARG 8.A O CYS 7.A HG 3.416 2.336 ARG 8.A N PHE 134.A O ARG 8.A H 3.053 2.207 ILE 10.A N PRO 44.A O ILE 10.A H 2.935 2.090 GLU 11.A N GLN 76.A OE1 GLU 11.A H 2.767 2.000 LYS 12.A N GLN 76.A OE1 LYS 12.A H 3.030 2.235 LYS 12.A NZ SER 74.A O LYS 12.A HZ1 2.914 2.115 TRP 13.A NE1 ASN 46.A O TRP 13.A HE1 2.739 1.897 THR 14.A N PHE 77.A O THR 14.A H 3.199 2.459 THR 14.A OG1 SER 50.A O THR 14.A HG1 2.670 1.897 LEU 16.A N VAL 79.A O LEU 16.A H 2.878 2.071 GLU 17.A N MET 53.A O GLU 17.A H 2.732 1.884 LEU 18.A N LEU 81.A O LEU 18.A H 3.002 2.153 LYS 19.A N MET 55.A O LYS 19.A H 2.814 1.977 ASN 24.A ND2 GLU 17.A OE2 ASN 24.A HD21 2.832 2.017 ALA 30.A N GLY 26.A O ALA 30.A H 2.986 2.168 MET 31.A N VAL 27.A O MET 31.A H 2.892 2.087 THR 32.A N PRO 28.A O THR 32.A H 2.960 2.199 THR 32.A OG1 PRO 28.A O THR 32.A HG1 2.926 2.129 ALA 33.A N GLN 29.A O ALA 33.A H 2.928 2.106 PHE 34.A N ALA 30.A O PHE 34.A H 2.768 1.952 ALA 35.A N MET 31.A O ALA 35.A H 3.101 2.259 GLU 36.A N THR 32.A O GLU 36.A H 3.052 2.220 PHE 37.A N ALA 33.A O PHE 37.A H 2.878 2.066 LEU 38.A N PHE 34.A O LEU 38.A H 2.935 2.087 ASN 39.A N ALA 35.A O ASN 39.A H 2.879 2.029 ARG 40.A N GLU 36.A O ARG 40.A H 2.956 2.129 THR 41.A N PHE 37.A O THR 41.A H 3.051 2.316 THR 41.A N LEU 38.A O THR 41.A H 2.986 2.357 THR 41.A OG1 LEU 38.A O THR 41.A HG1 2.794 2.034 GLY 42.A N ASN 39.A O GLY 42.A H 2.817 2.006 ILE 43.A N LEU 38.A O ILE 43.A H 3.180 2.344 ILE 45.A N ILE 43.A O ILE 45.A H 2.783 2.068 ASN 46.A N ILE 10.A O ASN 46.A H 2.874 2.019 ASN 46.A ND2 GLU 11.A O ASN 46.A HD21 3.065 2.238 ARG 48.A N ASN 46.A OD1 ARG 48.A H 3.079 2.237 SER 50.A N TRP 13.A O SER 50.A H 2.924 2.123 MET 53.A N TYR 15.A O MET 53.A H 3.082 2.289 MET 55.A N GLU 17.A O MET 55.A H 2.963 2.180 GLU 63.A N SER 60.A OG GLU 63.A H 3.250 2.407 PHE 64.A N SER 60.A O PHE 64.A H 3.296 2.457 PHE 65.A N GLU 61.A O PHE 65.A H 3.043 2.205 ALA 66.A N LYS 62.A O ALA 66.A H 3.157 2.347 LYS 67.A N GLU 63.A O LYS 67.A H 3.061 2.269 VAL 68.A N PHE 64.A O VAL 68.A H 3.059 2.287 MET 72.A N VAL 68.A O MET 72.A H 2.887 2.030 SER 73.A N LYS 69.A O SER 73.A H 2.940 2.149 SER 74.A N GLU 70.A O SER 74.A H 3.110 2.506 SER 74.A N LEU 71.A O SER 74.A H 3.331 2.548 SER 74.A OG LEU 71.A O SER 74.A HG 3.461 2.678 HIS 75.A ND1 LEU 71.A O HIS 75.A HD1 2.872 2.017 GLN 76.A N LYS 12.A O GLN 76.A H 2.779 1.977 GLN 76.A NE2 LYS 9.A O GLN 76.A HE22 3.260 2.414 VAL 78.A N HIS 104.A O VAL 78.A H 3.028 2.226 VAL 79.A N THR 14.A O VAL 79.A H 2.974 2.148 VAL 80.A N VAL 106.A O VAL 80.A H 2.757 1.897 LEU 81.A N LEU 16.A O LEU 81.A H 2.807 1.975 LEU 82.A N CYS 108.A O LEU 82.A H 2.742 1.947 ILE 89.A N ASP 86.A OD1 ILE 89.A H 2.995 2.179 TYR 90.A N ASP 86.A O TYR 90.A H 3.074 2.241 ASN 91.A N VAL 87.A O ASN 91.A H 2.935 2.140 MET 92.A N ALA 88.A O MET 92.A H 3.301 2.477 VAL 93.A N ILE 89.A O VAL 93.A H 3.030 2.175 LYS 94.A N TYR 90.A O LYS 94.A H 2.904 2.065 LYS 94.A NZ THR 105.A OG1 LYS 94.A HZ1 2.804 1.980 ARG 95.A N ASN 91.A O ARG 95.A H 2.950 2.161 ARG 95.A NE GLU 61.A OE2 ARG 95.A HE 2.790 1.939 ARG 95.A NH1 ILE 328.A O ARG 95.A HH11 2.936 2.104 ARG 95.A NH2 GLU 61.A OE1 ARG 95.A HH21 3.005 2.151 ALA 96.A N MET 92.A O ALA 96.A H 3.032 2.213 ALA 97.A N VAL 93.A O ALA 97.A H 2.898 2.080 ASP 98.A N LYS 94.A O ASP 98.A H 2.745 1.924 ILE 99.A N ARG 95.A O ILE 99.A H 3.203 2.419 THR 100.A N ARG 95.A O THR 100.A H 3.218 2.444 THR 100.A N ALA 96.A O THR 100.A H 3.242 2.625 PHE 101.A N ALA 96.A O PHE 101.A H 2.814 2.005 VAL 103.A N ALA 97.A O VAL 103.A H 2.768 1.986 VAL 106.A N VAL 78.A O VAL 106.A H 3.259 2.512 CYS 108.A N VAL 80.A O CYS 108.A H 2.845 2.014 ALA 110.A N LEU 82.A O ALA 110.A H 2.851 2.092 LYS 112.A N VAL 109.A O LYS 112.A H 3.002 2.408 PHE 113.A N VAL 109.A O PHE 113.A H 2.921 2.087 LEU 114.A N ALA 110.A O LEU 114.A H 2.830 2.050 SER 115.A N GLU 111.A O SER 115.A H 3.191 2.491 GLN 119.A N THR 116.A O GLN 119.A H 3.181 2.332 GLN 119.A NE2 PHE 113.A O GLN 119.A HE21 2.784 1.949 TYR 122.A N GLY 118.A O TYR 122.A H 3.140 2.320 PHE 123.A N GLN 119.A O PHE 123.A H 2.872 2.043 ALA 124.A N LEU 120.A O ALA 124.A H 2.955 2.169 ASN 125.A N GLY 121.A O ASN 125.A H 3.365 2.583 VAL 126.A N TYR 122.A O VAL 126.A H 3.069 2.228 GLY 127.A N PHE 123.A O GLY 127.A H 2.794 1.972 LEU 128.A N ALA 124.A O LEU 128.A H 3.072 2.242 LYS 129.A N ASN 125.A O LYS 129.A H 3.408 2.623 VAL 130.A N VAL 126.A O VAL 130.A H 3.034 2.250 ASN 131.A N GLY 127.A O ASN 131.A H 2.910 2.078 ASN 131.A ND2 ARG 5.A O ASN 131.A HD22 3.193 2.355 ASN 131.A ND2 ASN 138.A OD1 ASN 131.A HD21 2.916 2.135 LEU 132.A N LEU 128.A O LEU 132.A H 3.340 2.540 LYS 133.A N LYS 129.A O LYS 133.A H 2.928 2.103 PHE 134.A N VAL 130.A O PHE 134.A H 3.095 2.303 GLY 135.A N LEU 132.A O GLY 135.A H 3.035 2.213 GLY 136.A N ASN 131.A O GLY 136.A H 2.875 2.042 THR 137.A N ARG 5.A O THR 137.A H 2.903 2.160 ASN 138.A ND2 LEU 128.A O ASN 138.A HD22 2.830 1.977 LEU 148.A N ILE 145.A O LEU 148.A H 2.947 2.170 ALA 149.A N ILE 145.A O ALA 149.A H 3.294 2.471 LYS 150.A N PRO 146.A O LYS 150.A H 3.299 2.487 GLY 151.A N LEU 148.A O GLY 151.A H 3.048 2.213 MET 154.A N ASN 234.A O MET 154.A H 2.963 2.133 VAL 155.A N THR 184.A OG1 VAL 155.A H 2.892 2.045 VAL 156.A N LEU 236.A O VAL 156.A H 2.766 2.054 GLY 157.A N VAL 182.A O GLY 157.A H 2.918 2.084 TYR 158.A N PHE 238.A O TYR 158.A H 2.894 2.127 ASP 159.A N GLY 180.A O ASP 159.A H 2.994 2.177 THR 161.A N ILE 178.A O THR 161.A H 2.860 2.014 ALA 167.A N ASN 165.A OD1 ALA 167.A H 2.758 2.003 ALA 175.A N PRO 172.A O ALA 175.A H 3.378 2.526 SER 177.A N ASN 199.A O SER 177.A H 3.096 2.296 ILE 178.A N THR 161.A O ILE 178.A H 2.787 1.961 VAL 179.A N TRP 197.A O VAL 179.A H 2.844 1.995 GLY 180.A N ASP 159.A O GLY 180.A H 3.003 2.182 LEU 181.A N MET 195.A O LEU 181.A H 2.889 2.087 VAL 182.A N GLY 157.A O VAL 182.A H 2.820 1.992 SER 183.A N PRO 193.A O SER 183.A H 3.253 2.475 THR 184.A N VAL 155.A O THR 184.A H 3.034 2.260 HIS 188.A N ASP 186.A OD1 HIS 188.A H 2.915 2.209 LEU 189.A N ASP 186.A OD1 LEU 189.A H 3.165 2.426 GLN 191.A NE2 LEU 132.A O GLN 191.A HE22 2.992 2.185 GLN 191.A NE2 GLY 136.A O GLN 191.A HE21 2.827 1.999 TRP 192.A NE1 LEU 189.A O TRP 192.A HE1 2.983 2.283 MET 195.A N LEU 181.A O MET 195.A H 2.821 2.020 TRP 197.A N VAL 179.A O TRP 197.A H 3.153 2.392 ASN 198.A ND2 GLN 330.A OE1 ASN 198.A HD22 2.964 2.110 ASN 198.A ND2 PHE 348.A O ASN 198.A HD21 3.072 2.319 ASN 199.A N SER 177.A O ASN 199.A H 2.792 1.933 ASN 199.A ND2 SER 177.A OG ASN 199.A HD21 3.095 2.287 GLY 202.A N ASN 199.A O GLY 202.A H 3.024 2.176 GLN 203.A N ALA 173.A O GLN 203.A H 2.885 2.027 SER 205.A N GLY 202.A O SER 205.A H 2.912 2.292 MET 206.A N GLY 202.A O MET 206.A H 3.029 2.217 THR 207.A N GLN 203.A O THR 207.A H 2.880 2.047 GLU 208.A N GLU 204.A O GLU 208.A H 3.126 2.397 GLN 209.A N MET 206.A O GLN 209.A H 3.075 2.304 GLN 209.A NE2 ASN 198.A O GLN 209.A HE22 3.043 2.185 GLN 209.A NE2 SER 205.A O GLN 209.A HE21 3.329 2.521 PHE 210.A N MET 206.A O PHE 210.A H 2.956 2.175 THR 211.A OG1 LEU 257.A O THR 211.A HG1 2.981 2.178 LYS 213.A N GLN 209.A O LYS 213.A H 3.057 2.222 PHE 214.A N PHE 210.A O PHE 214.A H 2.840 1.986 LYS 215.A N THR 211.A O LYS 215.A H 3.001 2.174 LYS 215.A NZ GLU 219.A OE2 LYS 215.A HZ1 2.747 2.091 THR 216.A N ASP 212.A O THR 216.A H 3.305 2.539 THR 216.A N LYS 213.A O THR 216.A H 3.118 2.524 THR 216.A OG1 LYS 213.A O THR 216.A HG1 2.827 2.008 ARG 217.A N PHE 214.A O ARG 217.A H 2.881 2.227 ARG 217.A NE THR 216.A OG1 ARG 217.A HE 3.169 2.400 ARG 217.A NH2 THR 216.A OG1 ARG 217.A HH21 3.154 2.397 LEU 218.A N PHE 214.A O LEU 218.A H 3.232 2.438 GLU 219.A N LYS 215.A O GLU 219.A H 3.046 2.227 LEU 220.A N THR 216.A O LEU 220.A H 2.854 2.069 TRP 221.A N ARG 217.A O TRP 221.A H 3.064 2.239 ARG 222.A N LEU 218.A O ARG 222.A H 3.047 2.250 SER 223.A N GLU 219.A O SER 223.A H 2.985 2.247 SER 223.A OG LEU 220.A O SER 223.A HG 3.331 2.583 ASN 224.A N TRP 221.A O ASN 224.A H 3.205 2.381 ASN 224.A ND2 ILE 185.A O ASN 224.A HD21 3.032 2.386 ALA 226.A N ASN 224.A OD1 ALA 226.A H 3.318 2.509 ASN 227.A N ASN 224.A O ASN 227.A H 2.851 2.033 ASN 227.A ND2 ILE 185.A O ASN 227.A HD22 2.739 1.937 ASN 227.A ND2 TRP 221.A O ASN 227.A HD21 3.018 2.169 ASN 228.A N PRO 225.A O ASN 228.A H 3.025 2.227 SER 230.A N ASN 227.A O SER 230.A H 2.993 2.222 GLU 233.A N LYS 152.A O GLU 233.A H 2.832 2.145 ASN 234.A N LYS 152.A O ASN 234.A H 3.155 2.359 ASN 234.A ND2 LYS 152.A O ASN 234.A HD21 3.609 2.831 ASN 234.A ND2 THR 153.A OG1 ASN 234.A HD21 3.271 2.655 ILE 235.A N ARG 273.A O ILE 235.A H 2.967 2.228 LEU 236.A N MET 154.A O LEU 236.A H 2.877 2.060 ILE 237.A N THR 275.A O ILE 237.A H 2.839 2.047 PHE 238.A N VAL 156.A O PHE 238.A H 2.713 1.870 ARG 239.A N ILE 277.A O ARG 239.A H 2.940 2.117 ARG 239.A NE GLU 254.A OE1 ARG 239.A HE 2.870 2.014 ARG 239.A NH1 ASP 240.A O ARG 239.A HH11 3.023 2.212 ARG 239.A NH2 GLU 254.A OE1 ARG 239.A HH21 3.421 2.742 ARG 239.A NH2 GLU 254.A OE2 ARG 239.A HH21 2.755 1.916 ASP 240.A N TYR 158.A O ASP 240.A H 2.952 2.132 SER 243.A N GLN 246.A OE1 SER 243.A H 2.997 2.164 SER 243.A OG GLN 170.A OE1 SER 243.A HG 3.508 3.022 GLN 246.A N SER 243.A O GLN 246.A H 2.664 1.841 PHE 247.A N GLU 244.A O PHE 247.A H 3.279 2.425 VAL 250.A N GLN 246.A O VAL 250.A H 3.149 2.358 ILE 251.A N PHE 247.A O ILE 251.A H 3.061 2.227 LYS 252.A N GLN 248.A O LYS 252.A H 2.740 1.904 ASP 253.A N MET 249.A O ASP 253.A H 2.860 2.052 GLU 254.A N VAL 250.A O GLU 254.A H 3.180 2.418 LEU 255.A N VAL 250.A O LEU 255.A H 3.116 2.305 LEU 257.A N GLU 254.A O LEU 257.A H 2.975 2.232 ARG 259.A N LEU 255.A O ARG 259.A H 3.006 2.171 ARG 259.A NH1 GLU 288.A OE2 ARG 259.A HH12 2.901 2.161 ARG 259.A NH2 GLU 288.A OE2 ARG 259.A HH22 2.923 2.188 ALA 260.A N PRO 256.A O ALA 260.A H 2.915 2.135 ALA 261.A N LEU 257.A O ALA 261.A H 3.126 2.346 CYS 262.A N VAL 258.A O CYS 262.A H 3.038 2.264 CYS 262.A SG VAL 258.A O CYS 262.A HG 3.433 2.366 LYS 263.A N ARG 259.A O LYS 263.A H 2.988 2.175 LEU 264.A N ALA 260.A O LEU 264.A H 3.111 2.400 LEU 264.A N ALA 261.A O LEU 264.A H 3.147 2.503 VAL 265.A N CYS 262.A O VAL 265.A H 3.148 2.361 TYR 266.A N CYS 262.A O TYR 266.A H 2.983 2.152 LYS 270.A N PRO 267.A O LYS 270.A H 3.012 2.202 ARG 273.A N GLU 233.A O ARG 273.A H 2.993 2.247 ARG 273.A NE ASN 234.A OD1 ARG 273.A HE 3.017 2.345 ARG 273.A NH1 ASP 293.A OD1 ARG 273.A HH12 2.886 2.029 ARG 273.A NH2 ASN 234.A OD1 ARG 273.A HH21 2.751 2.017 ARG 273.A NH2 ASP 293.A OD2 ARG 273.A HH22 3.044 2.236 ILE 274.A N GLU 288.A OE1 ILE 274.A H 2.877 2.073 THR 275.A N ILE 235.A O THR 275.A H 3.125 2.309 LEU 276.A N VAL 286.A O LEU 276.A H 2.910 2.107 ILE 277.A N ILE 237.A O ILE 277.A H 2.840 2.021 VAL 278.A N THR 283.A O VAL 278.A H 2.965 2.125 THR 283.A N VAL 278.A O THR 283.A H 3.110 2.325 LEU 285.A N LEU 276.A O LEU 285.A H 2.872 2.032 VAL 286.A N LEU 276.A O VAL 286.A H 3.411 2.581 GLU 288.A N ILE 274.A O GLU 288.A H 3.144 2.478 ILE 289.A N ASP 287.A OD1 ILE 289.A H 3.187 2.425 PHE 290.A N ASP 287.A OD1 PHE 290.A H 2.974 2.128 ARG 291.A N ASP 287.A OD2 ARG 291.A H 2.939 2.120 ASP 293.A N ILE 289.A O ASP 293.A H 2.953 2.123 TYR 294.A N PHE 290.A O TYR 294.A H 2.660 1.912 GLY 295.A N ARG 291.A O GLY 295.A H 3.073 2.335 LYS 297.A N TYR 294.A O LYS 297.A H 2.724 1.989 ALA 298.A N GLY 295.A O ALA 298.A H 3.282 2.568 THR 301.A N LYS 297.A O THR 301.A H 2.862 2.172 THR 301.A N ALA 298.A O THR 301.A H 2.911 2.229 LEU 302.A N ALA 298.A O LEU 302.A H 3.228 2.460 GLU 303.A N ALA 299.A O GLU 303.A H 3.290 2.531 GLN 304.A N ASP 300.A O GLN 304.A H 3.179 2.379 LEU 305.A N THR 301.A O LEU 305.A H 3.106 2.415 THR 306.A N LEU 302.A O THR 306.A H 2.908 2.139 HIS 307.A N GLU 303.A O HIS 307.A H 3.031 2.277 ASP 308.A N GLN 304.A O ASP 308.A H 2.942 2.085 MET 309.A N LEU 305.A O MET 309.A H 3.048 2.381 CYS 310.A N THR 306.A O CYS 310.A H 3.333 2.506 CYS 310.A SG THR 306.A O CYS 310.A HG 3.405 2.253 TYR 311.A N HIS 307.A O TYR 311.A H 3.017 2.169 LEU 312.A N ASP 308.A O LEU 312.A H 3.095 2.259 TYR 317.A N CYS 313.A O TYR 317.A H 2.892 2.093 TYR 318.A N PRO 314.A O TYR 318.A H 2.648 1.802 ALA 319.A N PRO 315.A O ALA 319.A H 2.945 2.110 ASP 320.A N ALA 316.A O ASP 320.A H 3.037 2.241 LEU 321.A N TYR 317.A O LEU 321.A H 2.939 2.178 VAL 322.A N TYR 318.A O VAL 322.A H 2.961 2.141 CYS 323.A N ALA 319.A O CYS 323.A H 3.018 2.185 ASP 324.A N ASP 320.A O ASP 324.A H 2.968 2.120 ARG 325.A N LEU 321.A O ARG 325.A H 2.999 2.161 ARG 325.A NH1 ASP 98.A OD2 ARG 325.A HH11 2.921 2.158 ARG 325.A NH1 TYR 366.A O ARG 325.A HH12 3.266 2.623 ALA 326.A N VAL 322.A O ALA 326.A H 2.925 2.141 ARG 327.A N CYS 323.A O ARG 327.A H 3.061 2.282 ARG 327.A NE THR 161.A OG1 ARG 327.A HE 3.365 2.659 ARG 327.A NH2 THR 161.A OG1 ARG 327.A HH21 2.896 2.057 ARG 327.A NH2 HIS 162.A O ARG 327.A HH22 3.114 2.547 ILE 328.A N ASP 324.A O ILE 328.A H 3.410 2.629 HIS 329.A N ARG 325.A O HIS 329.A H 2.826 1.990 HIS 329.A NE2 ASP 98.A OD2 HIS 329.A HE2 2.850 2.028 GLN 330.A N ALA 326.A O GLN 330.A H 2.932 2.189 GLN 330.A NE2 ASN 198.A OD1 GLN 330.A HE22 3.028 2.196 LYS 331.A NZ ASP 335.A OD1 LYS 331.A HZ3 3.383 2.552 LYS 331.A NZ ASP 335.A OD2 LYS 331.A HZ3 3.218 2.584 PHE 334.A N GLN 330.A O PHE 334.A H 3.079 2.261 ASP 335.A N LYS 331.A O ASP 335.A H 2.893 2.044 ALA 336.A N GLU 332.A O ALA 336.A H 2.997 2.188 LEU 337.A N LEU 333.A O LEU 337.A H 2.935 2.169 ASP 338.A N PHE 334.A O ASP 338.A H 3.304 2.593 GLU 339.A N ALA 336.A O GLU 339.A H 3.031 2.222 ASN 340.A N ALA 336.A O ASN 340.A H 3.344 2.604 PHE 348.A N LYS 344.A O PHE 348.A H 3.000 2.177 ALA 349.A N THR 345.A O ALA 349.A H 3.093 2.260 ARG 350.A N ASP 346.A O ARG 350.A H 3.073 2.265 ARG 350.A NE ASP 347.A OD1 ARG 350.A HE 3.177 2.355 ARG 350.A NH2 ASP 347.A OD1 ARG 350.A HH21 3.329 2.571 TRP 351.A N ASP 347.A O TRP 351.A H 2.869 2.015 GLY 352.A N PHE 348.A O GLY 352.A H 3.280 2.486 ASN 353.A N ALA 349.A O ASN 353.A H 3.172 2.412 SER 354.A N ARG 350.A O SER 354.A H 2.881 2.074 GLY 355.A N TRP 351.A O GLY 355.A H 3.148 2.437 HIS 358.A N ASP 98.A O HIS 358.A H 2.937 2.081 ASN 360.A ND2 PHE 101.A O ASN 360.A HD21 3.560 3.042 ASN 360.A ND2 GLY 102.A O ASN 360.A HD21 3.015 2.178 LEU 361.A N HIS 358.A O LEU 361.A H 2.951 2.133 ARG 362.A N PRO 359.A O ARG 362.A H 3.318 2.458 SER 364.A N LEU 361.A O SER 364.A H 2.924 2.145 ILE 368.A N MET 365.A O ILE 368.A H 3.264 2.419