Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 2yj8_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 5.A N TYR 170.A O VAL 5.A H 2.850 2.030 TRP 7.A N VAL 168.A O TRP 7.A H 2.826 1.968 TRP 7.A NE1 VAL 126.A O TRP 7.A HE1 2.664 1.726 ARG 8.A N ASP 6.A OD1 ARG 8.A H 3.102 2.355 ARG 8.A NE ASP 6.A OD1 ARG 8.A HE 3.026 2.077 ARG 8.A NE ASP 6.A OD2 ARG 8.A HE 3.330 2.652 ARG 8.A NH2 ASP 6.A OD2 ARG 8.A HH21 2.982 2.176 GLU 9.A N ASP 6.A O GLU 9.A H 3.078 2.343 LYS 10.A N TRP 7.A O LYS 10.A H 3.153 2.360 GLY 11.A N ARG 8.A O GLY 11.A H 3.186 2.345 TYR 12.A N TRP 7.A O TYR 12.A H 3.314 2.463 THR 14.A OG1 PRO 15.A O no hydrogen 3.516 N/A THR 14.A OG1 GLU 35.A OE1 no hydrogen 2.886 N/A LYS 17.A NZ GLU 35.A OE2 no hydrogen 2.914 N/A LYS 17.A NZ SER 47.A OG no hydrogen 2.920 N/A LYS 17.A NZ LEU 48.A O no hydrogen 3.355 N/A LYS 17.A NZ GLU 50.A OE2 no hydrogen 2.748 N/A LYS 17.A NZ GLU 86.A OE1 no hydrogen 3.020 N/A GLN 19.A N SER 187.A O GLN 19.A H 2.919 2.076 GLN 19.A NE2 CYS 22.A O no hydrogen 3.019 N/A GLY 20.A N ASN 18.A OD1 GLY 20.A H 2.944 2.100 GLY 23.A N CYS 65.A O GLY 23.A H 2.792 2.092 SER 24.A OG CYS 22.A O no hydrogen 3.526 N/A SER 24.A OG TYR 91.A OH no hydrogen 2.691 N/A CYS 25.A SG HIS 163.A ND1 no hydrogen 3.609 N/A TRP 26.A NE1 GLY 64.A O TRP 26.A HE1 3.159 2.276 ALA 27.A N SER 24.A O ALA 27.A H 2.847 2.189 PHE 28.A N SER 24.A O PHE 28.A H 3.309 2.527 SER 29.A N CYS 25.A O SER 29.A H 2.926 2.099 SER 29.A OG SER 133.A OG no hydrogen 3.093 N/A SER 29.A OG VAL 165.A O no hydrogen 2.701 N/A ALA 30.A N TRP 26.A O ALA 30.A H 2.988 2.164 THR 31.A N ALA 27.A O THR 31.A H 2.896 2.044 THR 31.A OG1 ALA 27.A O no hydrogen 3.213 N/A THR 31.A OG1 PHE 28.A O no hydrogen 3.141 N/A THR 31.A OG1 GLU 50.A OE2 no hydrogen 2.663 N/A GLY 32.A N PHE 28.A O GLY 32.A H 2.953 2.141 ALA 33.A N SER 29.A O ALA 33.A H 3.032 2.223 LEU 34.A N.A ALA 30.A O LEU 34.A H.A 2.937 2.102 LEU 34.A N.B ALA 30.A O LEU 34.A H.B 2.918 2.066 GLU 35.A N THR 31.A O GLU 35.A H 2.775 1.934 GLY 36.A N GLY 32.A O GLY 36.A H 3.189 2.360 GLN 37.A N ALA 33.A O GLN 37.A H 3.073 2.275 GLN 37.A NE2 VAL 129.A O no hydrogen 2.909 N/A MET 38.A N LEU 34.A O.A MET 38.A H 2.859 2.012 MET 38.A N LEU 34.A O.B MET 38.A H 2.757 1.908 PHE 39.A N GLU 35.A O PHE 39.A H 2.962 2.150 ARG 40.A N GLY 36.A O ARG 40.A H 2.984 2.155 ARG 40.A NE VAL 129.A O ARG 40.A HE 3.076 2.456 LYS 41.A N GLN 37.A O LYS 41.A H 3.081 2.291 LYS 41.A NZ VAL 219.A OXT no hydrogen 3.125 N/A THR 42.A N MET 38.A O THR 42.A H 2.834 2.029 THR 42.A OG1 MET 38.A O no hydrogen 2.967 N/A GLY 43.A N PHE 39.A O GLY 43.A H 2.808 2.005 ARG 44.A N THR 42.A OG1 ARG 44.A H 3.034 2.231 ARG 44.A NH1 THR 42.A O ARG 44.A HH11 2.885 2.273 SER 47.A OG GLU 86.A OE1 no hydrogen 3.518 N/A LEU 48.A N GLU 35.A OE2 LEU 48.A H 2.879 2.045 SER 49.A N ASP 84.A O SER 49.A H 3.022 2.232 SER 49.A OG TYR 89.A O no hydrogen 2.765 N/A GLN 51.A NE2 ASP 55.A OD1 no hydrogen 2.766 N/A GLN 51.A NE2 ASP 55.A OD2 no hydrogen 3.565 N/A GLN 51.A NE2 THR 94.A O no hydrogen 2.792 N/A ASN 52.A N SER 49.A OG ASN 52.A H 2.861 2.033 ASN 52.A ND2 TYR 76.A OH no hydrogen 2.917 N/A VAL 54.A N GLU 50.A O VAL 54.A H 2.830 2.009 ASP 55.A N GLN 51.A O ASP 55.A H 2.829 1.999 CYS 56.A N ASN 52.A O CYS 56.A H 3.112 2.454 CYS 56.A SG ASN 52.A O no hydrogen 3.248 N/A CYS 56.A SG TYR 89.A OH no hydrogen 3.903 N/A SER 57.A N LEU 53.A O SER 57.A H 3.293 2.513 SER 57.A OG LEU 53.A O no hydrogen 2.702 N/A GLN 60.A N SER 57.A O GLN 60.A H 3.280 2.621 GLN 60.A NE2 ASP 79.A OD2 no hydrogen 2.892 N/A GLY 61.A N GLY 58.A O GLY 61.A H 2.880 2.066 ASN 62.A N SER 57.A O ASN 62.A H 3.220 2.398 ASN 62.A ND2 SER 57.A OG no hydrogen 2.889 N/A GLU 63.A N.A GLY 67.A O GLU 63.A H.A 2.848 2.072 GLU 63.A N.B GLY 67.A O GLU 63.A H.B 2.899 2.081 CYS 65.A N GLU 95.A OE2.B CYS 65.A H 2.891 2.179 ASN 66.A N GLU 63.A O.A ASN 66.A H 2.753 1.943 ASN 66.A N GLU 63.A O.B ASN 66.A H 2.925 2.101 LEU 69.A N ASN 62.A OD1 LEU 69.A H 2.823 1.992 ALA 73.A N LEU 69.A O ALA 73.A H 3.046 2.240 PHE 74.A N MET 70.A O PHE 74.A H 2.882 2.067 GLN 75.A N ASP 71.A O GLN 75.A H 2.916 2.125 GLN 75.A NE2 GLN 75.A O no hydrogen 3.553 N/A GLN 75.A NE2 GLN 78.A OE1 no hydrogen 3.231 N/A GLN 75.A NE2 ASP 79.A OD1 no hydrogen 2.913 N/A TYR 76.A N TYR 72.A O TYR 76.A H 2.933 2.101 VAL 77.A N ALA 73.A O VAL 77.A H 3.067 2.256 GLN 78.A N PHE 74.A O GLN 78.A H 3.143 2.312 ASP 79.A N GLN 75.A O ASP 79.A H 2.776 1.926 ASN 80.A N TYR 76.A O ASN 80.A H 2.753 1.943 ASN 80.A ND2 GLY 82.A O no hydrogen 2.908 N/A GLY 81.A N VAL 77.A O GLY 81.A H 3.023 2.434 GLY 81.A N GLN 78.A O GLY 81.A H 3.342 2.584 GLY 82.A N VAL 77.A O GLY 82.A H 3.251 2.628 LEU 83.A N SER 105.A OG LEU 83.A H 3.116 2.467 LEU 83.A N ALA 107.A O LEU 83.A H 3.184 2.601 ASP 84.A N ASN 52.A OD1 ASP 84.A H 2.890 2.031 SER 85.A N TYR 104.A O SER 85.A H 3.357 2.609 SER 85.A OG SER 88.A OG no hydrogen 3.082 N/A GLU 86.A N SER 47.A O GLU 86.A H 2.870 2.018 SER 88.A N SER 85.A OG SER 88.A H 3.034 2.201 SER 88.A OG SER 85.A O no hydrogen 2.966 N/A SER 88.A OG SER 85.A OG no hydrogen 3.082 N/A TYR 89.A N SER 85.A O TYR 89.A H 3.108 2.477 TYR 89.A N GLU 86.A O TYR 89.A H 3.284 2.555 TYR 89.A OH ASP 55.A OD2 no hydrogen 2.619 N/A TYR 91.A OH GLN 19.A O no hydrogen 2.594 N/A TYR 91.A OH SER 24.A OG no hydrogen 2.691 N/A GLU 92.A N.A GLN 51.A OE1 GLU 92.A H.A 2.707 1.854 GLU 92.A N.B GLN 51.A OE1 GLU 92.A H.B 2.726 1.869 THR 94.A OG1 GLU 92.A O.B no hydrogen 3.517 N/A THR 94.A OG1 GLU 96.A OE2 no hydrogen 2.750 N/A GLU 96.A N ASP 55.A OD1 GLU 96.A H 2.928 2.110 LYS 99.A N TYR 89.A OH LYS 99.A H 2.911 2.079 LYS 99.A NZ SER 97.A O no hydrogen 2.818 N/A LYS 99.A NZ SER 97.A OG no hydrogen 3.107 N/A ASN 101.A N ASP 84.A OD2 ASN 101.A H 3.025 2.170 LYS 103.A N ASN 101.A OD1 LYS 103.A H 3.011 2.196 TYR 104.A N ASN 101.A O TYR 104.A H 3.064 2.239 SER 105.A N PRO 102.A O SER 105.A H 3.167 2.313 SER 105.A OG LEU 83.A O no hydrogen 3.453 N/A VAL 106.A N LEU 83.A O VAL 106.A H 2.961 2.142 ASN 108.A ND2.A GLY 81.A O no hydrogen 2.711 N/A ASP 109.A N ASN 108.A OD1.B ASP 109.A H 2.884 2.224 THR 110.A N THR 218.A O THR 110.A H 2.843 2.018 THR 110.A OG1 THR 218.A OG1 no hydrogen 2.755 N/A VAL 113.A N TYR 216.A O VAL 113.A H 2.914 2.087 ILE 115.A N ALA 214.A O ILE 115.A H 2.942 2.092 LYS 117.A NZ SER 212.A O no hydrogen 2.777 N/A GLN 118.A N PRO 116.A O GLN 118.A H 2.836 2.084 LYS 120.A NZ ASP 203.A OD2 no hydrogen 3.490 N/A LEU 122.A N GLN 118.A O LEU 122.A H 3.042 2.233 MET 123.A N GLU 119.A O MET 123.A H 2.907 2.107 LYS 124.A N LYS 120.A O LYS 124.A H 3.095 2.261 ALA 125.A N ALA 121.A O ALA 125.A H 2.955 2.139 VAL 126.A N LEU 122.A O VAL 126.A H 2.904 2.055 ALA 127.A N MET 123.A O ALA 127.A H 2.911 2.091 THR 128.A N LYS 124.A O THR 128.A H 3.160 2.456 THR 128.A N ALA 125.A O THR 128.A H 3.245 2.592 THR 128.A OG1 LYS 124.A O no hydrogen 2.715 N/A VAL 129.A N ALA 125.A O VAL 129.A H 2.763 1.954 ILE 132.A N VAL 167.A O ILE 132.A H 2.930 2.135 SER 133.A N SER 215.A O SER 133.A H 2.915 2.221 SER 133.A OG SER 29.A O no hydrogen 3.077 N/A SER 133.A OG SER 29.A OG no hydrogen 3.093 N/A VAL 134.A N VAL 165.A O VAL 134.A H 2.973 2.127 ILE 136.A N HIS 163.A O ILE 136.A H 2.881 2.055 ASP 137.A N CYS 208.A O ASP 137.A H 2.820 2.002 ALA 138.A N ASP 162.A OD1 ALA 138.A H 2.841 2.003 GLY 139.A N ASP 137.A OD1 GLY 139.A H 3.088 2.243 HIS 140.A NE2 ASP 155.A OD2 no hydrogen 3.062 N/A SER 142.A OG TYR 151.A OH no hydrogen 2.709 N/A SER 142.A OG GLU 153.A OE1 no hydrogen 2.751 N/A PHE 143.A N HIS 140.A O PHE 143.A H 2.993 2.269 LEU 144.A N HIS 140.A O LEU 144.A H 3.412 2.602 PHE 145.A N GLU 141.A O PHE 145.A H 2.981 2.170 TYR 146.A N PHE 143.A O TYR 146.A H 3.086 2.247 TYR 146.A OH GLY 149.A O no hydrogen 2.574 N/A TYR 151.A N LYS 199.A O.A TYR 151.A H 2.917 2.096 TYR 151.A N LYS 199.A O.B TYR 151.A H 2.608 1.774 TYR 151.A OH SER 142.A OG no hydrogen 2.709 N/A GLU 153.A N HIS 207.A NE2.A GLU 153.A H 2.733 1.929 GLU 153.A N HIS 207.A NE2.B GLU 153.A H 2.875 2.039 ASP 155.A N GLU 153.A OE2 ASP 155.A H 2.876 2.034 CYS 156.A N GLU 153.A O CYS 156.A H 2.801 1.951 CYS 156.A SG ASP 137.A O no hydrogen 3.311 N/A SER 157.A N ASP 137.A OD2 SER 157.A H 2.844 2.018 SER 158.A OG ARG 205.A O no hydrogen 3.479 N/A SER 158.A OG ASN 206.A O no hydrogen 2.972 N/A GLU 159.A N SER 157.A OG GLU 159.A H 2.933 2.109 ASP 160.A N SER 157.A OG ASP 160.A H 2.749 2.070 ASP 162.A N ILE 136.A O ASP 162.A H 2.972 2.179 HIS 163.A NE2 ASN 186.A OD1 no hydrogen 2.820 N/A VAL 165.A N VAL 134.A O VAL 165.A H 2.874 2.030 LEU 166.A N LYS 185.A O LEU 166.A H 3.242 2.451 VAL 167.A N ILE 132.A O VAL 167.A H 2.822 2.004 VAL 168.A N LEU 183.A O.A VAL 168.A H 2.802 1.958 VAL 168.A N LEU 183.A O.B VAL 168.A H 2.903 2.092 TYR 170.A N VAL 5.A O TYR 170.A H 2.837 2.073 TYR 170.A OH PRO 2.A O no hydrogen 2.728 N/A GLY 171.A N TYR 181.A O GLY 171.A H 3.000 2.196 GLU 173.A N ASN 179.A O GLU 173.A H 2.603 1.791 ASN 179.A ND2 SER 176.A O no hydrogen 3.054 N/A LYS 180.A NZ ASP 203.A OD2 no hydrogen 3.104 N/A TYR 181.A N GLY 171.A O TYR 181.A H 2.940 2.112 TRP 182.A N MET 200.A O.A TRP 182.A H 2.722 1.946 TRP 182.A N MET 200.A O.B TRP 182.A H 2.964 2.109 TRP 182.A NE1 GLU 119.A OE2 TRP 182.A HE1 2.862 1.857 LEU 183.A N.A GLY 169.A O LEU 183.A H.A 2.950 2.109 LEU 183.A N.B GLY 169.A O LEU 183.A H.B 2.956 2.150 VAL 184.A N VAL 198.A O VAL 184.A H 2.981 2.192 LYS 185.A N LEU 166.A O LYS 185.A H 2.777 1.967 LYS 185.A NZ THR 14.A O no hydrogen 2.959 N/A LYS 185.A NZ PRO 15.A O no hydrogen 3.286 N/A ASN 186.A N GLY 196.A O ASN 186.A H 3.049 2.216 SER 187.A N ASN 186.A OD1 SER 187.A H 2.798 2.046 SER 187.A OG GLN 19.A OE1 no hydrogen 2.680 N/A GLY 189.A N LYS 17.A O GLY 189.A H 3.066 2.255 TRP 192.A NE1 PHE 143.A O TRP 192.A HE1 3.113 2.322 MET 194.A N TYR 197.A O MET 194.A H 2.871 2.018 GLY 196.A N TRP 192.A O GLY 196.A H 2.760 2.041 TYR 197.A N MET 194.A O TYR 197.A H 3.057 2.223 VAL 198.A N VAL 184.A O VAL 198.A H 2.915 2.105 LYS 199.A N.A TYR 146.A OH LYS 199.A H.A 3.293 2.468 LYS 199.A N.B TYR 146.A OH LYS 199.A H.B 3.347 2.511 LYS 199.A NZ.A GLU 173.A OE2 no hydrogen 2.712 N/A LYS 199.A NZ.B GLU 173.A OE2 no hydrogen 3.501 N/A MET 200.A N.A TRP 182.A O MET 200.A H.A 2.751 1.914 MET 200.A N.B TRP 182.A O MET 200.A H.B 3.016 2.248 ALA 201.A N TYR 151.A O ALA 201.A H 3.041 2.199 LYS 202.A N LYS 180.A O LYS 202.A H 3.002 2.169 LYS 202.A NZ ASP 203.A OD2 no hydrogen 2.836 N/A ASP 203.A N GLU 119.A OE2 ASP 203.A H 2.915 2.094 ASN 206.A N GLU 119.A OE1 ASN 206.A H 2.914 2.133 ASN 206.A ND2 SER 212.A OG no hydrogen 2.837 N/A CYS 208.A SG ASP 137.A O no hydrogen 3.807 N/A GLY 209.A N ASN 206.A O GLY 209.A H 3.024 2.195 ILE 210.A N HIS 207.A O.B ILE 210.A H 3.374 2.533 ALA 211.A N ASN 206.A OD1 ALA 211.A H 2.820 1.968 SER 212.A N GLY 209.A O SER 212.A H 2.802 1.955 SER 212.A OG SER 158.A O no hydrogen 2.659 N/A SER 215.A N SER 133.A O SER 215.A H 2.868 2.066 SER 215.A OG ASP 71.A OD1 no hydrogen 2.723 N/A TYR 216.A N VAL 113.A O TYR 216.A H 3.090 2.321 THR 218.A N GLY 111.A O THR 218.A H 2.902 2.086 THR 218.A OG1 THR 110.A OG1 no hydrogen 2.755 N/A