Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 2yj9_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 5.A N TYR 170.A O VAL 5.A H 2.908 2.084 TRP 7.A N VAL 168.A O TRP 7.A H 2.833 1.975 TRP 7.A NE1 VAL 126.A O TRP 7.A HE1 2.746 1.822 ARG 8.A N ASP 6.A OD1 ARG 8.A H 3.000 2.239 ARG 8.A NE ASP 6.A OD1 ARG 8.A HE 3.029 2.090 ARG 8.A NE ASP 6.A OD2 ARG 8.A HE 3.314 2.580 ARG 8.A NH2 ASP 6.A OD2 ARG 8.A HH21 2.975 2.164 GLU 9.A N ASP 6.A O GLU 9.A H 3.088 2.364 LYS 10.A N TRP 7.A O LYS 10.A H 3.177 2.377 GLY 11.A N ARG 8.A O GLY 11.A H 3.236 2.391 TYR 12.A N TRP 7.A O TYR 12.A H 3.253 2.406 THR 14.A OG1 PRO 15.A O no hydrogen 3.554 N/A THR 14.A OG1 GLU 35.A OE1 no hydrogen 2.848 N/A LYS 17.A NZ GLU 35.A OE2 no hydrogen 2.837 N/A LYS 17.A NZ SER 47.A OG no hydrogen 2.903 N/A LYS 17.A NZ GLU 50.A OE2 no hydrogen 2.889 N/A LYS 17.A NZ GLU 86.A OE1 no hydrogen 3.041 N/A GLN 19.A N SER 184.A O GLN 19.A H 2.849 2.005 GLN 19.A NE2 CYS 22.A O no hydrogen 2.996 N/A GLY 20.A N ASN 18.A OD1 GLY 20.A H 2.984 2.142 GLY 23.A N CYS 65.A O GLY 23.A H 2.794 2.088 SER 24.A OG CYS 22.A O no hydrogen 3.467 N/A SER 24.A OG TYR 91.A OH no hydrogen 2.743 N/A TRP 26.A NE1 GLY 64.A O TRP 26.A HE1 3.168 2.301 ALA 27.A N SER 24.A O ALA 27.A H 2.776 2.059 PHE 28.A N SER 24.A O PHE 28.A H 3.311 2.522 SER 29.A N CYS 25.A O SER 29.A H 2.939 2.108 SER 29.A OG SER 133.A OG no hydrogen 3.100 N/A SER 29.A OG VAL 165.A O no hydrogen 2.685 N/A ALA 30.A N TRP 26.A O ALA 30.A H 3.024 2.217 THR 31.A N ALA 27.A O THR 31.A H 2.866 2.015 THR 31.A OG1 ALA 27.A O no hydrogen 3.259 N/A THR 31.A OG1 PHE 28.A O no hydrogen 3.141 N/A THR 31.A OG1 GLU 50.A OE2 no hydrogen 2.606 N/A GLY 32.A N PHE 28.A O GLY 32.A H 2.947 2.134 ALA 33.A N SER 29.A O ALA 33.A H 3.032 2.227 LEU 34.A N.A ALA 30.A O LEU 34.A H.A 2.919 2.086 LEU 34.A N.B ALA 30.A O LEU 34.A H.B 2.912 2.066 GLU 35.A N THR 31.A O GLU 35.A H 2.761 1.928 GLY 36.A N GLY 32.A O GLY 36.A H 3.172 2.384 GLN 37.A N ALA 33.A O GLN 37.A H 3.068 2.285 GLN 37.A NE2 VAL 129.A O no hydrogen 2.918 N/A MET 38.A N LEU 34.A O.A MET 38.A H 2.841 1.985 MET 38.A N LEU 34.A O.B MET 38.A H 2.809 1.952 PHE 39.A N GLU 35.A O PHE 39.A H 3.028 2.242 ARG 40.A N GLY 36.A O ARG 40.A H 2.998 2.178 ARG 40.A NE VAL 129.A O ARG 40.A HE 2.925 2.320 ARG 40.A NH2 VAL 129.A O ARG 40.A HH21 3.255 2.732 LYS 41.A N GLN 37.A O LYS 41.A H 3.021 2.273 THR 42.A N MET 38.A O THR 42.A H 2.872 2.063 THR 42.A OG1 MET 38.A O no hydrogen 3.044 N/A GLY 43.A N PHE 39.A O GLY 43.A H 2.833 2.041 ARG 44.A N THR 42.A OG1 ARG 44.A H 3.028 2.254 SER 47.A OG GLU 86.A OE1 no hydrogen 3.519 N/A LEU 48.A N GLU 35.A OE2 LEU 48.A H 2.864 2.031 SER 49.A N ASP 84.A O SER 49.A H 2.975 2.183 SER 49.A OG TYR 89.A O no hydrogen 2.692 N/A GLN 51.A NE2 ASP 55.A OD1 no hydrogen 2.760 N/A GLN 51.A NE2 ASP 55.A OD2 no hydrogen 3.482 N/A GLN 51.A NE2 THR 94.A O no hydrogen 2.739 N/A ASN 52.A N SER 49.A OG ASN 52.A H 2.929 2.106 ASN 52.A ND2 TYR 76.A OH no hydrogen 2.927 N/A VAL 54.A N GLU 50.A O VAL 54.A H 2.930 2.092 ASP 55.A N GLN 51.A O ASP 55.A H 2.874 2.061 CYS 56.A N ASN 52.A O CYS 56.A H 3.116 2.520 CYS 56.A SG ASN 52.A O no hydrogen 3.215 N/A SER 57.A N LEU 53.A O SER 57.A H 3.236 2.457 SER 57.A OG LEU 53.A O no hydrogen 2.602 N/A GLN 60.A N SER 57.A O GLN 60.A H 3.277 2.605 GLN 60.A NE2 ASP 79.A OD2 no hydrogen 2.873 N/A GLY 61.A N GLY 58.A O GLY 61.A H 2.920 2.153 ASN 62.A N SER 57.A O ASN 62.A H 3.199 2.391 ASN 62.A ND2 SER 57.A OG no hydrogen 2.975 N/A GLU 63.A N GLY 67.A O GLU 63.A H 2.910 2.117 ASN 66.A N GLU 63.A O ASN 66.A H 2.847 2.018 LEU 69.A N ASN 62.A OD1 LEU 69.A H 2.798 1.982 ALA 73.A N LEU 69.A O ALA 73.A H 3.052 2.238 PHE 74.A N MET 70.A O PHE 74.A H 2.872 2.059 GLN 75.A N ASP 71.A O GLN 75.A H 2.924 2.125 GLN 75.A NE2 GLN 78.A OE1 no hydrogen 3.267 N/A GLN 75.A NE2 ASP 79.A OD1 no hydrogen 2.847 N/A TYR 76.A N TYR 72.A O TYR 76.A H 2.915 2.098 VAL 77.A N ALA 73.A O VAL 77.A H 3.024 2.200 GLN 78.A N PHE 74.A O GLN 78.A H 3.178 2.364 ASP 79.A N GLN 75.A O ASP 79.A H 2.832 1.976 ASN 80.A N TYR 76.A O ASN 80.A H 2.709 1.890 ASN 80.A ND2 GLY 82.A O no hydrogen 2.928 N/A GLY 81.A N GLN 78.A O GLY 81.A H 3.309 2.555 LEU 83.A N SER 105.A OG LEU 83.A H 3.138 2.474 ASP 84.A N ASN 52.A OD1 ASP 84.A H 2.860 2.001 SER 85.A N TYR 104.A O SER 85.A H 3.307 2.529 SER 85.A OG SER 88.A OG no hydrogen 3.094 N/A GLU 86.A N SER 47.A O GLU 86.A H 2.846 2.013 SER 88.A N SER 85.A O SER 88.A H 3.212 2.603 SER 88.A N SER 85.A OG SER 88.A H 3.101 2.329 SER 88.A OG SER 85.A O no hydrogen 3.020 N/A SER 88.A OG SER 85.A OG no hydrogen 3.094 N/A TYR 89.A N SER 85.A O TYR 89.A H 3.123 2.477 TYR 89.A N GLU 86.A O TYR 89.A H 3.272 2.544 TYR 89.A OH ASP 55.A OD2 no hydrogen 2.588 N/A TYR 91.A OH GLN 19.A O no hydrogen 2.535 N/A TYR 91.A OH SER 24.A OG no hydrogen 2.743 N/A GLU 92.A N GLN 51.A OE1 GLU 92.A H 2.687 1.834 THR 94.A OG1 GLU 96.A OE2 no hydrogen 2.635 N/A GLU 96.A N ASP 55.A OD1 GLU 96.A H 2.925 2.114 LYS 99.A N TYR 89.A OH LYS 99.A H 2.931 2.116 LYS 99.A NZ SER 97.A O no hydrogen 2.879 N/A LYS 99.A NZ SER 97.A OG no hydrogen 3.235 N/A ASN 101.A N ASP 84.A OD2 ASN 101.A H 2.965 2.114 LYS 103.A N ASN 101.A OD1 LYS 103.A H 3.017 2.225 TYR 104.A N ASN 101.A O TYR 104.A H 3.011 2.172 SER 105.A N PRO 102.A O SER 105.A H 3.137 2.284 SER 105.A OG LEU 83.A O no hydrogen 3.495 N/A VAL 106.A N LEU 83.A O VAL 106.A H 2.971 2.158 THR 110.A N THR 215.A O THR 110.A H 2.859 2.031 THR 110.A OG1 THR 215.A OG1 no hydrogen 2.768 N/A GLY 111.A N ASP 109.A OD1 GLY 111.A H 3.421 2.604 VAL 113.A N TYR 213.A O VAL 113.A H 2.911 2.085 ILE 115.A N ALA 211.A O ILE 115.A H 2.941 2.085 LYS 117.A NZ SER 209.A O no hydrogen 2.699 N/A GLN 118.A N PRO 116.A O GLN 118.A H 2.830 2.102 LEU 122.A N GLN 118.A O LEU 122.A H 3.015 2.209 MET 123.A N GLU 119.A O MET 123.A H 2.956 2.142 LYS 124.A N LYS 120.A O LYS 124.A H 3.121 2.287 ALA 125.A N ALA 121.A O ALA 125.A H 2.981 2.152 VAL 126.A N LEU 122.A O VAL 126.A H 2.888 2.043 ALA 127.A N MET 123.A O ALA 127.A H 2.868 2.037 THR 128.A N LYS 124.A O THR 128.A H 3.119 2.406 THR 128.A N ALA 125.A O THR 128.A H 3.230 2.581 THR 128.A OG1 LYS 124.A O no hydrogen 2.671 N/A VAL 129.A N ALA 125.A O VAL 129.A H 2.762 1.972 ILE 132.A N VAL 167.A O ILE 132.A H 2.945 2.147 SER 133.A N SER 212.A O SER 133.A H 2.916 2.256 SER 133.A OG SER 29.A O no hydrogen 3.052 N/A SER 133.A OG SER 29.A OG no hydrogen 3.100 N/A VAL 134.A N VAL 165.A O VAL 134.A H 2.949 2.101 ILE 136.A N HIS 163.A O ILE 136.A H 2.829 2.003 ASP 137.A N CYS 205.A O ASP 137.A H 2.822 2.011 ALA 138.A N ASP 162.A OD1 ALA 138.A H 2.855 2.004 GLY 139.A N ASP 137.A OD1 GLY 139.A H 3.052 2.216 GLU 141.A N.B GLU 141.A OE1.B GLU 141.A H.B 2.783 2.074 SER 142.A OG TYR 151.A OH no hydrogen 2.685 N/A SER 142.A OG GLU 153.A OE1 no hydrogen 2.627 N/A PHE 143.A N HIS 140.A O PHE 143.A H 2.839 2.096 LEU 144.A N HIS 140.A O LEU 144.A H 3.273 2.460 PHE 145.A N GLU 141.A O.A PHE 145.A H 2.927 2.143 PHE 145.A N GLU 141.A O.B PHE 145.A H 2.890 2.098 TYR 146.A N PHE 143.A O TYR 146.A H 3.141 2.303 TYR 146.A OH GLY 149.A O no hydrogen 2.626 N/A LYS 147.A NZ PHE 145.A O no hydrogen 3.478 N/A TYR 151.A N LYS 196.A O TYR 151.A H 2.641 1.789 TYR 151.A OH SER 142.A OG no hydrogen 2.685 N/A GLU 153.A N HIS 204.A NE2.A GLU 153.A H 3.015 2.221 GLU 153.A N HIS 204.A NE2.B GLU 153.A H 2.889 2.050 ASP 155.A N GLU 153.A OE2 ASP 155.A H 2.952 2.106 CYS 156.A N GLU 153.A O CYS 156.A H 2.901 2.057 CYS 156.A SG ASP 137.A O no hydrogen 3.340 N/A SER 157.A N ASP 137.A OD2 SER 157.A H 2.794 1.955 SER 158.A OG ARG 202.A O no hydrogen 3.316 N/A SER 158.A OG ASN 203.A O no hydrogen 2.754 N/A GLU 159.A N SER 157.A OG GLU 159.A H 3.054 2.220 ASP 160.A N SER 157.A OG ASP 160.A H 2.877 2.155 ASP 162.A N ILE 136.A O ASP 162.A H 2.923 2.134 HIS 163.A NE2 ASN 183.A OD1 no hydrogen 2.856 N/A VAL 165.A N VAL 134.A O VAL 165.A H 2.843 2.001 LEU 166.A N LYS 182.A O LEU 166.A H 3.290 2.502 VAL 167.A N ILE 132.A O VAL 167.A H 2.822 2.017 VAL 168.A N LEU 180.A O VAL 168.A H 2.802 1.970 TYR 170.A N VAL 5.A O TYR 170.A H 2.875 2.111 TYR 170.A OH PRO 2.A O no hydrogen 2.685 N/A GLY 171.A N TYR 178.A O GLY 171.A H 2.965 2.173 GLU 173.A N ASN 176.A O GLU 173.A H 2.780 1.972 LYS 177.A NZ ASP 200.A OD2 no hydrogen 3.132 N/A TYR 178.A N GLY 171.A O TYR 178.A H 2.901 2.068 TRP 179.A N MET 197.A O.A TRP 179.A H 2.742 1.945 TRP 179.A N MET 197.A O.B TRP 179.A H 2.752 1.917 TRP 179.A NE1 GLU 119.A OE2 TRP 179.A HE1 2.873 1.867 LEU 180.A N GLY 169.A O LEU 180.A H 2.885 2.036 VAL 181.A N VAL 195.A O VAL 181.A H 2.966 2.195 LYS 182.A N LEU 166.A O LYS 182.A H 2.746 1.934 LYS 182.A NZ THR 14.A O no hydrogen 2.929 N/A LYS 182.A NZ PRO 15.A O no hydrogen 3.271 N/A ASN 183.A N GLY 193.A O ASN 183.A H 3.104 2.275 SER 184.A N ASN 183.A OD1 SER 184.A H 2.798 2.045 SER 184.A OG GLN 19.A OE1 no hydrogen 2.710 N/A GLY 186.A N LYS 17.A O GLY 186.A H 3.038 2.238 GLU 188.A N GLU 188.A OE1.A GLU 188.A H 2.850 2.082 TRP 189.A NE1 PHE 143.A O TRP 189.A HE1 3.083 2.287 MET 191.A N TYR 194.A O MET 191.A H 2.892 2.045 GLY 193.A N TRP 189.A O GLY 193.A H 2.754 2.052 TYR 194.A N MET 191.A O TYR 194.A H 3.083 2.272 VAL 195.A N VAL 181.A O VAL 195.A H 2.891 2.074 LYS 196.A N TYR 146.A OH LYS 196.A H 3.342 2.496 LYS 196.A NZ GLU 173.A OE2 no hydrogen 2.675 N/A MET 197.A N.A TRP 179.A O MET 197.A H.A 2.928 2.148 MET 197.A N.B TRP 179.A O MET 197.A H.B 2.909 2.097 ALA 198.A N TYR 151.A O ALA 198.A H 3.085 2.292 LYS 199.A N LYS 177.A O LYS 199.A H 3.004 2.175 LYS 199.A NZ ASP 200.A OD2 no hydrogen 2.855 N/A ASP 200.A N GLU 119.A OE2 ASP 200.A H 2.869 2.048 ASN 203.A N GLU 119.A OE1 ASN 203.A H 2.855 2.076 ASN 203.A ND2 SER 209.A OG no hydrogen 2.846 N/A CYS 205.A SG ASP 137.A O no hydrogen 3.820 N/A GLY 206.A N ASN 203.A O GLY 206.A H 2.972 2.142 ILE 207.A N HIS 204.A O.B ILE 207.A H 3.450 2.629 ALA 208.A N ASN 203.A OD1 ALA 208.A H 2.795 1.939 SER 209.A N GLY 206.A O SER 209.A H 2.904 2.056 SER 209.A OG SER 158.A O no hydrogen 2.687 N/A SER 212.A N SER 133.A O SER 212.A H 2.897 2.082 SER 212.A OG ASP 71.A OD1 no hydrogen 2.735 N/A TYR 213.A N VAL 113.A O TYR 213.A H 3.119 2.345 THR 215.A N GLY 111.A O THR 215.A H 2.990 2.179 THR 215.A OG1 THR 110.A OG1 no hydrogen 2.768 N/A