Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 2yjc_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 5.A N TYR 170.A O VAL 5.A H 2.869 2.048 TRP 7.A N VAL 168.A O TRP 7.A H 2.827 1.969 TRP 7.A NE1 VAL 126.A O TRP 7.A HE1 2.731 1.794 ARG 8.A N ASP 6.A OD1 ARG 8.A H 3.052 2.305 ARG 8.A NE ASP 6.A OD1 ARG 8.A HE 3.016 2.079 ARG 8.A NE ASP 6.A OD2 ARG 8.A HE 3.338 2.646 ARG 8.A NH2 ASP 6.A OD2 ARG 8.A HH21 2.923 2.093 GLU 9.A N ASP 6.A O GLU 9.A H 3.139 2.394 LYS 10.A N TRP 7.A O LYS 10.A H 3.102 2.330 GLY 11.A N ARG 8.A O GLY 11.A H 3.280 2.433 TYR 12.A N TRP 7.A O TYR 12.A H 3.342 2.493 THR 14.A OG1 PRO 15.A O no hydrogen 3.543 N/A THR 14.A OG1 GLU 35.A OE1 no hydrogen 2.812 N/A LYS 17.A NZ GLU 35.A OE2 no hydrogen 2.913 N/A LYS 17.A NZ SER 47.A OG no hydrogen 3.020 N/A LYS 17.A NZ LEU 48.A O no hydrogen 3.323 N/A LYS 17.A NZ GLU 50.A OE2 no hydrogen 2.730 N/A GLN 19.A N SER 187.A O GLN 19.A H 2.830 1.990 GLN 19.A NE2 CYS 22.A O no hydrogen 2.923 N/A GLY 20.A N ASN 18.A OD1 GLY 20.A H 2.964 2.123 GLY 23.A N CYS 65.A O GLY 23.A H 2.798 2.092 SER 24.A OG CYS 22.A O no hydrogen 3.437 N/A SER 24.A OG TYR 91.A OH no hydrogen 2.743 N/A CYS 25.A SG HIS 163.A ND1 no hydrogen 3.557 N/A TRP 26.A NE1 GLY 64.A O TRP 26.A HE1 3.227 2.367 ALA 27.A N SER 24.A O ALA 27.A H 2.788 2.090 PHE 28.A N SER 24.A O PHE 28.A H 3.280 2.489 SER 29.A N CYS 25.A O SER 29.A H 2.926 2.102 SER 29.A OG VAL 165.A O no hydrogen 2.702 N/A ALA 30.A N TRP 26.A O ALA 30.A H 3.017 2.202 THR 31.A N ALA 27.A O THR 31.A H 2.919 2.079 THR 31.A OG1 ALA 27.A O no hydrogen 3.218 N/A THR 31.A OG1 PHE 28.A O no hydrogen 3.116 N/A THR 31.A OG1 GLU 50.A OE2 no hydrogen 2.617 N/A GLY 32.A N PHE 28.A O GLY 32.A H 2.974 2.143 ALA 33.A N SER 29.A O ALA 33.A H 3.073 2.260 LEU 34.A N.A ALA 30.A O LEU 34.A H.A 2.951 2.116 LEU 34.A N.B ALA 30.A O LEU 34.A H.B 2.925 2.080 GLU 35.A N THR 31.A O GLU 35.A H 2.744 1.910 GLY 36.A N GLY 32.A O GLY 36.A H 3.174 2.359 GLN 37.A N ALA 33.A O GLN 37.A H 3.053 2.237 GLN 37.A NE2 VAL 129.A O no hydrogen 2.898 N/A MET 38.A N LEU 34.A O.A MET 38.A H 2.788 1.934 MET 38.A N LEU 34.A O.B MET 38.A H 2.875 2.030 PHE 39.A N GLU 35.A O PHE 39.A H 3.004 2.195 ARG 40.A N GLY 36.A O ARG 40.A H 2.992 2.159 ARG 40.A NE VAL 129.A O ARG 40.A HE 3.050 2.385 ARG 40.A NH2 VAL 129.A O ARG 40.A HH21 3.258 2.631 LYS 41.A N GLN 37.A O LYS 41.A H 2.999 2.207 LYS 41.A NZ VAL 219.A OXT no hydrogen 2.867 N/A THR 42.A N MET 38.A O THR 42.A H 2.852 2.077 THR 42.A OG1 MET 38.A O no hydrogen 2.995 N/A GLY 43.A N PHE 39.A O GLY 43.A H 2.798 1.987 ARG 44.A N THR 42.A OG1 ARG 44.A H 2.973 2.155 ARG 44.A NH1 THR 42.A O ARG 44.A HH11 3.012 2.417 LEU 48.A N GLU 35.A OE2 LEU 48.A H 2.884 2.047 SER 49.A N ASP 84.A O SER 49.A H 3.027 2.237 SER 49.A OG TYR 89.A O no hydrogen 2.727 N/A GLN 51.A NE2 ASP 55.A OD1 no hydrogen 2.795 N/A GLN 51.A NE2 ASP 55.A OD2 no hydrogen 3.504 N/A GLN 51.A NE2 THR 94.A O no hydrogen 2.719 N/A ASN 52.A N SER 49.A OG ASN 52.A H 2.883 2.063 ASN 52.A ND2 TYR 76.A OH no hydrogen 2.881 N/A VAL 54.A N GLU 50.A O VAL 54.A H 2.831 2.005 ASP 55.A N GLN 51.A O ASP 55.A H 2.828 2.001 CYS 56.A N ASN 52.A O CYS 56.A H 3.124 2.525 CYS 56.A SG TYR 89.A OH no hydrogen 3.855 N/A SER 57.A N LEU 53.A O SER 57.A H 3.233 2.467 SER 57.A OG LEU 53.A O no hydrogen 2.671 N/A GLN 60.A N SER 57.A O GLN 60.A H 3.234 2.589 GLN 60.A NE2 ASP 79.A OD2 no hydrogen 2.896 N/A GLY 61.A N GLY 58.A O GLY 61.A H 2.874 2.091 ASN 62.A N SER 57.A O ASN 62.A H 3.240 2.440 ASN 62.A ND2 SER 57.A OG no hydrogen 2.903 N/A GLU 63.A N.A GLY 67.A O GLU 63.A H.A 2.871 2.080 GLU 63.A N.B GLY 67.A O GLU 63.A H.B 2.879 2.076 CYS 65.A SG ALA 93.A O no hydrogen 3.974 N/A ASN 66.A N GLU 63.A O.A ASN 66.A H 2.812 1.976 ASN 66.A N GLU 63.A O.B ASN 66.A H 2.899 2.061 GLY 67.A N GLY 23.A O GLY 67.A H 3.144 2.510 LEU 69.A N ASN 62.A OD1 LEU 69.A H 2.828 2.011 ALA 73.A N LEU 69.A O ALA 73.A H 3.071 2.256 PHE 74.A N MET 70.A O PHE 74.A H 2.895 2.088 GLN 75.A N ASP 71.A O GLN 75.A H 2.939 2.122 GLN 75.A NE2 GLN 75.A O no hydrogen 3.456 N/A GLN 75.A NE2 GLN 78.A OE1 no hydrogen 3.292 N/A GLN 75.A NE2 ASP 79.A OD1 no hydrogen 2.908 N/A TYR 76.A N TYR 72.A O TYR 76.A H 2.906 2.086 VAL 77.A N ALA 73.A O VAL 77.A H 3.080 2.268 GLN 78.A N PHE 74.A O GLN 78.A H 3.165 2.334 ASP 79.A N GLN 75.A O ASP 79.A H 2.868 2.016 ASN 80.A N TYR 76.A O ASN 80.A H 2.763 1.949 ASN 80.A ND2 GLY 82.A O no hydrogen 2.909 N/A GLY 81.A N VAL 77.A O GLY 81.A H 3.002 2.365 GLY 81.A N GLN 78.A O GLY 81.A H 3.299 2.575 GLY 82.A N VAL 77.A O GLY 82.A H 3.231 2.616 LEU 83.A N SER 105.A OG LEU 83.A H 3.151 2.477 ASP 84.A N ASN 52.A OD1 ASP 84.A H 2.883 2.024 SER 85.A N TYR 104.A O SER 85.A H 3.347 2.573 SER 85.A OG SER 88.A OG no hydrogen 3.042 N/A GLU 86.A N SER 47.A O GLU 86.A H 2.909 2.056 SER 88.A N SER 85.A OG SER 88.A H 3.069 2.253 SER 88.A OG SER 85.A O no hydrogen 2.943 N/A SER 88.A OG SER 85.A OG no hydrogen 3.042 N/A TYR 89.A N SER 85.A O TYR 89.A H 3.083 2.481 TYR 89.A N GLU 86.A O TYR 89.A H 3.238 2.497 TYR 89.A OH ASP 55.A OD2 no hydrogen 2.628 N/A TYR 91.A N GLU 86.A OE2 TYR 91.A H 3.073 2.304 TYR 91.A OH GLN 19.A O no hydrogen 2.623 N/A TYR 91.A OH SER 24.A OG no hydrogen 2.743 N/A GLU 92.A N GLN 51.A OE1 GLU 92.A H 2.673 1.818 THR 94.A OG1 GLU 96.A OE2 no hydrogen 2.669 N/A GLU 96.A N ASP 55.A OD1 GLU 96.A H 2.875 2.049 LYS 99.A N.A TYR 89.A OH LYS 99.A H.A 2.850 2.029 LYS 99.A N.B TYR 89.A OH LYS 99.A H.B 2.891 2.078 LYS 99.A NZ.A SER 97.A O no hydrogen 3.131 N/A LYS 99.A NZ.B SER 97.A O no hydrogen 2.781 N/A LYS 99.A NZ.B SER 97.A OG no hydrogen 2.807 N/A ASN 101.A N ASP 84.A OD2 ASN 101.A H 2.971 2.117 LYS 103.A N ASN 101.A OD1 LYS 103.A H 2.936 2.143 TYR 104.A N ASN 101.A O TYR 104.A H 3.042 2.214 SER 105.A N PRO 102.A O SER 105.A H 3.149 2.290 SER 105.A OG LEU 83.A O no hydrogen 3.485 N/A VAL 106.A N LEU 83.A O VAL 106.A H 3.003 2.187 ASP 109.A N ASN 108.A OD1.B ASP 109.A H 2.832 2.175 THR 110.A N THR 218.A O THR 110.A H 2.827 1.995 THR 110.A OG1 THR 218.A OG1 no hydrogen 2.810 N/A GLY 111.A N ASP 109.A OD1 GLY 111.A H 3.375 2.557 VAL 113.A N TYR 216.A O VAL 113.A H 2.832 2.002 ILE 115.A N ALA 214.A O ILE 115.A H 2.922 2.070 LYS 117.A NZ SER 212.A O no hydrogen 2.709 N/A GLN 118.A N PRO 116.A O GLN 118.A H 2.874 2.125 LYS 120.A NZ.A ASP 203.A OD2 no hydrogen 3.560 N/A LEU 122.A N GLN 118.A O LEU 122.A H 2.956 2.142 MET 123.A N.A GLU 119.A O MET 123.A H.A 2.885 2.074 MET 123.A N.B GLU 119.A O MET 123.A H.B 2.858 2.046 LYS 124.A N LYS 120.A O.A LYS 124.A H 3.187 2.357 LYS 124.A N LYS 120.A O.B LYS 124.A H 3.097 2.268 ALA 125.A N ALA 121.A O ALA 125.A H 3.014 2.192 VAL 126.A N LEU 122.A O VAL 126.A H 2.849 1.999 ALA 127.A N MET 123.A O.A ALA 127.A H 2.823 2.011 ALA 127.A N MET 123.A O.B ALA 127.A H 2.866 2.059 THR 128.A N LYS 124.A O THR 128.A H 3.150 2.470 THR 128.A N ALA 125.A O THR 128.A H 3.219 2.526 THR 128.A OG1 LYS 124.A O no hydrogen 2.720 N/A VAL 129.A N ALA 125.A O VAL 129.A H 2.817 2.022 ILE 132.A N VAL 167.A O ILE 132.A H 2.940 2.143 SER 133.A N SER 215.A O SER 133.A H 2.931 2.234 SER 133.A OG SER 29.A O no hydrogen 2.986 N/A SER 133.A OG SER 29.A OG no hydrogen 3.147 N/A VAL 134.A N VAL 165.A O VAL 134.A H 2.962 2.115 ILE 136.A N HIS 163.A O ILE 136.A H 2.865 2.031 ASP 137.A N CYS 208.A O ASP 137.A H 2.834 2.013 ALA 138.A N ASP 162.A OD1 ALA 138.A H 2.875 2.046 GLY 139.A N ASP 137.A OD1 GLY 139.A H 3.063 2.227 HIS 140.A NE2 ASP 155.A OD2 no hydrogen 3.070 N/A SER 142.A OG TYR 151.A OH no hydrogen 2.741 N/A SER 142.A OG GLU 153.A OE1 no hydrogen 2.554 N/A PHE 143.A N HIS 140.A O PHE 143.A H 2.953 2.200 PHE 145.A N GLU 141.A O PHE 145.A H 3.069 2.277 TYR 146.A N PHE 143.A O TYR 146.A H 3.137 2.289 TYR 146.A OH GLY 149.A O no hydrogen 2.574 N/A LYS 147.A NZ PHE 145.A O no hydrogen 3.519 N/A TYR 151.A N LYS 199.A O.A TYR 151.A H 2.819 1.975 TYR 151.A N LYS 199.A O.B TYR 151.A H 2.505 1.698 TYR 151.A OH SER 142.A OG no hydrogen 2.741 N/A GLU 153.A N HIS 207.A NE2.A GLU 153.A H 2.936 2.135 GLU 153.A N HIS 207.A NE2.B GLU 153.A H 2.827 2.012 ASP 155.A N GLU 153.A OE2 ASP 155.A H 2.809 1.949 CYS 156.A N GLU 153.A O CYS 156.A H 2.990 2.140 CYS 156.A SG ASP 137.A O no hydrogen 3.191 N/A SER 157.A N ASP 137.A OD2 SER 157.A H 2.832 2.004 SER 158.A OG ARG 205.A O no hydrogen 3.282 N/A SER 158.A OG ASN 206.A O no hydrogen 2.866 N/A GLU 159.A N SER 157.A OG GLU 159.A H 3.032 2.221 ASP 160.A N SER 157.A OG ASP 160.A H 2.806 2.076 ASP 162.A N ILE 136.A O ASP 162.A H 2.900 2.096 HIS 163.A N ILE 136.A O HIS 163.A H 3.079 2.438 HIS 163.A NE2 ASN 186.A OD1 no hydrogen 2.761 N/A VAL 165.A N VAL 134.A O VAL 165.A H 2.864 2.023 LEU 166.A N LYS 185.A O LEU 166.A H 3.287 2.500 VAL 167.A N ILE 132.A O VAL 167.A H 2.829 2.013 VAL 168.A N LEU 183.A O.A VAL 168.A H 2.902 2.117 VAL 168.A N LEU 183.A O.B VAL 168.A H 2.778 1.929 TYR 170.A N VAL 5.A O TYR 170.A H 2.838 2.085 TYR 170.A OH PRO 2.A O no hydrogen 2.720 N/A GLY 171.A N TYR 181.A O GLY 171.A H 2.894 2.098 GLU 173.A N ASN 179.A O GLU 173.A H 2.590 1.782 ASN 179.A ND2 SER 176.A O no hydrogen 3.378 N/A LYS 180.A NZ ASP 203.A OD2 no hydrogen 2.888 N/A TYR 181.A N GLY 171.A O TYR 181.A H 2.835 2.016 TRP 182.A N MET 200.A O.A TRP 182.A H 2.731 1.940 TRP 182.A N MET 200.A O.B TRP 182.A H 2.924 2.068 TRP 182.A NE1 GLU 119.A OE2 TRP 182.A HE1 2.810 1.816 LEU 183.A N.A GLY 169.A O LEU 183.A H.A 2.904 2.075 LEU 183.A N.B GLY 169.A O LEU 183.A H.B 2.894 2.047 VAL 184.A N VAL 198.A O VAL 184.A H 2.940 2.143 LYS 185.A N LEU 166.A O LYS 185.A H 2.777 1.959 LYS 185.A NZ THR 14.A O no hydrogen 2.928 N/A LYS 185.A NZ PRO 15.A O no hydrogen 3.259 N/A ASN 186.A N GLY 196.A O ASN 186.A H 3.067 2.233 SER 187.A N ASN 186.A OD1 SER 187.A H 2.800 2.057 SER 187.A OG GLN 19.A OE1 no hydrogen 2.729 N/A GLY 189.A N LYS 17.A O GLY 189.A H 3.017 2.236 TRP 192.A NE1 PHE 143.A O TRP 192.A HE1 2.955 2.128 MET 194.A N TYR 197.A O MET 194.A H 2.860 2.016 GLY 196.A N TRP 192.A O GLY 196.A H 2.796 2.105 TYR 197.A N MET 194.A O TYR 197.A H 3.091 2.268 VAL 198.A N VAL 184.A O VAL 198.A H 2.894 2.085 LYS 199.A N.A TYR 146.A OH LYS 199.A H.A 3.298 2.499 LYS 199.A N.B TYR 146.A OH LYS 199.A H.B 3.360 2.533 LYS 199.A NZ.A GLU 173.A OE2 no hydrogen 2.576 N/A LYS 199.A NZ.B GLU 173.A OE2 no hydrogen 3.327 N/A MET 200.A N.A TRP 182.A O MET 200.A H.A 2.754 1.908 MET 200.A N.B TRP 182.A O MET 200.A H.B 3.115 2.400 ALA 201.A N TYR 151.A O ALA 201.A H 3.000 2.162 LYS 202.A N LYS 180.A O LYS 202.A H 3.035 2.203 LYS 202.A NZ ASP 203.A OD2 no hydrogen 2.827 N/A ASP 203.A N GLU 119.A OE2 ASP 203.A H 2.890 2.064 ASN 206.A N GLU 119.A OE1 ASN 206.A H 2.916 2.135 ASN 206.A ND2 SER 212.A OG no hydrogen 2.983 N/A CYS 208.A SG ASP 137.A O no hydrogen 3.830 N/A GLY 209.A N ASN 206.A O GLY 209.A H 3.025 2.203 ILE 210.A N HIS 207.A O.B ILE 210.A H 3.379 2.542 ALA 211.A N ASN 206.A OD1 ALA 211.A H 2.817 1.964 SER 212.A N GLY 209.A O SER 212.A H 2.875 2.030 SER 212.A OG SER 158.A O no hydrogen 2.693 N/A SER 215.A N SER 133.A O SER 215.A H 2.890 2.086 SER 215.A OG ASP 71.A OD1 no hydrogen 2.722 N/A TYR 216.A N VAL 113.A O TYR 216.A H 3.106 2.341 THR 218.A N GLY 111.A O THR 218.A H 2.946 2.133 THR 218.A OG1 THR 110.A OG1 no hydrogen 2.810 N/A