Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 2yko_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 5.A N ARG 1.A O LEU 5.A H 2.853 2.132 GLU 6.A N CYS 2.A O GLU 6.A H 3.150 2.363 GLU 7.A N ASP 3.A O GLU 7.A H 3.050 2.214 ARG 8.A N GLN 4.A O ARG 8.A H 3.115 2.377 VAL 9.A N LEU 5.A O VAL 9.A H 3.019 2.263 SER 10.A N GLU 6.A O SER 10.A H 2.998 2.168 ALA 11.A N GLU 7.A O ALA 11.A H 3.098 2.264 ALA 12.A N ARG 8.A O ALA 12.A H 3.207 2.440 GLU 13.A N VAL 9.A O GLU 13.A H 3.006 2.193 ASP 14.A N SER 10.A O ASP 14.A H 3.004 2.179 GLU 15.A N ALA 11.A O GLU 15.A H 2.842 2.076 ILE 16.A N ALA 12.A O ILE 16.A H 2.804 2.065 ASN 17.A N GLU 13.A O ASN 17.A H 3.077 2.271 GLU 18.A N ASP 14.A O GLU 18.A H 3.059 2.243 ILE 19.A N GLU 15.A O ILE 19.A H 2.909 2.111 LYS 20.A N ILE 16.A O LYS 20.A H 2.890 2.065 ARG 21.A N ASN 17.A O ARG 21.A H 3.156 2.327 GLU 22.A N GLU 18.A O GLU 22.A H 3.021 2.188 GLY 23.A N ILE 19.A O GLY 23.A H 2.841 2.013 LYS 24.A N LYS 20.A O LYS 24.A H 3.020 2.210 PHE 25.A N ARG 21.A O PHE 25.A H 3.201 2.414 ARG 26.A N GLU 22.A O ARG 26.A H 2.866 2.089 GLU 27.A N GLY 23.A O GLU 27.A H 2.799 1.939 LYS 28.A N LYS 24.A O LYS 28.A H 3.160 2.329 ARG 29.A N PHE 25.A O ARG 29.A H 3.342 2.553 ILE 30.A N ARG 26.A O ILE 30.A H 3.011 2.192 LYS 31.A N GLU 27.A O LYS 31.A H 2.946 2.098 ARG 32.A N LYS 28.A O ARG 32.A H 2.996 2.172 ASN 33.A N ARG 29.A O ASN 33.A H 2.893 2.078 GLU 34.A N ILE 30.A O GLU 34.A H 2.840 2.048 GLN 35.A N LYS 31.A O GLN 35.A H 2.945 2.116 SER 36.A N ARG 32.A O SER 36.A H 2.925 2.156 LEU 37.A N ASN 33.A O LEU 37.A H 2.972 2.151 GLN 38.A N GLU 34.A O GLN 38.A H 3.073 2.231 GLN 38.A NE2 THR 136.A OG1 GLN 38.A HE21 2.946 2.104 GLU 39.A N GLN 35.A O GLU 39.A H 3.095 2.293 ILE 40.A N SER 36.A O ILE 40.A H 2.980 2.224 TRP 41.A N LEU 37.A O TRP 41.A H 2.959 2.107 ASP 42.A N GLN 38.A O ASP 42.A H 3.024 2.189 TYR 43.A N GLU 39.A O TYR 43.A H 2.980 2.211 VAL 44.A N ILE 40.A O VAL 44.A H 2.959 2.119 LYS 45.A N TRP 41.A O LYS 45.A H 3.075 2.314 ARG 46.A N TYR 43.A O ARG 46.A H.A 3.325 2.473 ARG 46.A NE.B TYR 161.A OH ARG 46.A HE.B 2.998 2.143 ARG 46.A NH2.B TYR 161.A OH ARG 46.A HH21.B 3.552 2.879 ASN 48.A N LYS 45.A O ASN 48.A H 2.905 2.128 ASN 48.A ND2 ASP 131.A OD2 ASN 48.A HD21 2.960 2.101 LEU 49.A N VAL 100.A O LEU 49.A H 2.870 2.046 ARG 50.A N THR 129.A O ARG 50.A H 2.865 2.022 ARG 50.A NE ASP 131.A OD1 ARG 50.A HE 3.190 2.508 ARG 50.A NH2 ASP 131.A OD1 ARG 50.A HH21 3.209 2.537 LEU 51.A N ILE 98.A O LEU 51.A H 2.716 1.881 ILE 52.A N ARG 127.A O ILE 52.A H 2.823 1.998 LYS 64.A N ASN 61.A OD1 LYS 64.A H 3.116 2.281 LYS 64.A NZ VAL 59.A O LYS 64.A HZ3 2.704 1.875 LEU 65.A N ASN 61.A O LEU 65.A H 3.018 2.224 GLU 66.A N GLY 62.A O GLU 66.A H 2.924 2.109 ASN 67.A N THR 63.A O ASN 67.A H 2.987 2.215 THR 68.A N LYS 64.A O THR 68.A H 2.916 2.073 LEU 69.A N LEU 65.A O LEU 69.A H 2.850 2.063 GLN 70.A N GLU 66.A O GLN 70.A H 2.947 2.200 GLN 70.A NE2 ALA 81.A O GLN 70.A HE22 3.206 2.618 GLN 70.A NE2 ASN 82.A OD1 GLN 70.A HE22 3.526 2.767 ASP 71.A N ASN 67.A O ASP 71.A H 2.936 2.171 ILE 72.A N THR 68.A O ILE 72.A H 3.037 2.268 ILE 73.A N LEU 69.A O ILE 73.A H 3.222 2.435 GLN 74.A N GLN 70.A O GLN 74.A H 2.944 2.101 GLU 75.A N ASP 71.A O GLU 75.A H 3.095 2.345 ASN 76.A N ILE 72.A O ASN 76.A H 3.109 2.504 ASN 76.A N ILE 73.A O ASN 76.A H 3.179 2.417 ASN 76.A ND2 ILE 72.A O ASN 76.A HD21 2.818 1.960 ASN 76.A ND2 THR 120.A O ASN 76.A HD22 2.834 1.988 PHE 77.A N ILE 73.A O PHE 77.A H 2.853 2.024 LEU 80.A N PHE 77.A O LEU 80.A H 3.124 2.304 GLN 86.A N ARG 101.A O GLN 86.A H 2.869 2.169 GLU 87.A N ARG 101.A O GLU 87.A H 3.357 2.533 GLN 89.A N ILE 99.A O GLN 89.A H 3.124 2.333 ARG 90.A NE GLU 60.A OE1 ARG 90.A HE 2.902 2.136 ARG 90.A NH1 VAL 54.A O ARG 90.A HH12 2.856 2.037 ARG 90.A NH1 ARG 96.A O ARG 90.A HH11 2.810 2.107 ARG 90.A NH2 VAL 54.A O ARG 90.A HH22 3.229 2.534 ARG 90.A NH2 PRO 55.A O ARG 90.A HH22 2.925 2.325 ARG 90.A NH2 GLU 60.A OE2 ARG 90.A HH21 2.871 2.012 THR 91.A N HIS 97.A O THR 91.A H 3.042 2.231 ARG 96.A N GLU 56.A OE2 ARG 96.A H 2.993 2.135 ARG 96.A NE GLU 56.A OE2 ARG 96.A HE 3.041 2.184 ARG 96.A NH2 GLU 56.A OE1 ARG 96.A HH21 3.233 2.390 ILE 98.A N LEU 51.A O ILE 98.A H 2.791 1.946 ILE 99.A N GLN 89.A O ILE 99.A H 2.907 2.058 VAL 100.A N LEU 49.A O VAL 100.A H 2.836 1.989 ARG 101.A N GLU 87.A O ARG 101.A H.B 2.788 1.936 ARG 101.A NE.B GLN 86.A OE1 ARG 101.A HE.B 2.441 1.847 ARG 101.A NH1.A GLU 87.A OE1 ARG 101.A HH11.A 2.872 2.244 ARG 101.A NH1.B VAL 44.A O ARG 101.A HH12.B 2.783 1.980 ARG 101.A NH1.B ASN 48.A OD1 ARG 101.A HH11.B 2.818 2.212 ARG 101.A NH2.B VAL 44.A O ARG 101.A HH22.B 3.078 2.380 PHE 102.A N PRO 47.A O PHE 102.A H 2.843 2.004 THR 103.A N GLN 84.A O THR 103.A H 3.058 2.204 LYS 107.A NZ ARG 46.A O LYS 107.A HZ3 3.271 2.532 GLU 108.A N VAL 105.A O GLU 108.A H 2.904 2.120 LYS 109.A N GLU 106.A O LYS 109.A H 2.862 2.098 LEU 110.A N LYS 107.A O LEU 110.A H 3.077 2.229 ARG 111.A N GLU 108.A O ARG 111.A H 3.028 2.201 ALA 112.A N LYS 109.A O ALA 112.A H 2.982 2.159 ALA 113.A N LEU 110.A O ALA 113.A H 3.009 2.370 ARG 114.A N LEU 110.A O ARG 114.A H 2.887 2.127 GLU 115.A N ARG 111.A O GLU 115.A H 2.975 2.309 LYS 116.A N ALA 113.A O LYS 116.A H 3.274 2.468 LYS 116.A NZ ASN 76.A O LYS 116.A HZ1 3.135 2.299 THR 120.A N ASN 76.A OD1 THR 120.A H 2.970 2.201 THR 120.A OG1 GLU 75.A OE2 THR 120.A HG1 2.716 1.956 LEU 121.A N LYS 124.A O LEU 121.A H 2.995 2.227 LYS 122.A N GLU 75.A OE1 LYS 122.A H 2.787 2.011 GLY 123.A N GLU 75.A OE2 GLY 123.A H 3.141 2.303 LYS 124.A N LEU 121.A O LYS 124.A H 3.242 2.424 ILE 126.A N VAL 119.A O ILE 126.A H 2.995 2.226 ARG 127.A N ILE 52.A O ARG 127.A H 2.861 2.097 THR 129.A N ARG 50.A O THR 129.A H 3.032 2.258 SER 133.A N ASP 42.A OD1 SER 133.A H 3.093 2.253 GLU 135.A N GLU 135.A OE1 GLU 135.A H 2.981 2.225 THR 136.A OG1 ASP 42.A OD1 THR 136.A HG1 3.075 2.521 THR 136.A OG1 ASP 42.A OD2 THR 136.A HG1 2.519 1.726 LEU 137.A N SER 133.A O LEU 137.A H 2.950 2.097 GLN 138.A N ALA 134.A O GLN 138.A H 2.948 2.159 ALA 139.A N GLU 135.A O ALA 139.A H 2.958 2.126 ARG 140.A N THR 136.A O ARG 140.A H 2.982 2.208 ARG 140.A NE PRO 162.A O ARG 140.A HE 2.958 2.183 ARG 140.A NH2 PRO 162.A O ARG 140.A HH21 2.883 2.101 ARG 141.A N LEU 137.A O ARG 141.A H 3.247 2.455 GLU 142.A N GLN 138.A O GLU 142.A H 2.993 2.223 TRP 143.A N ALA 139.A O TRP 143.A H 3.239 2.592 TRP 143.A N ARG 140.A O TRP 143.A H 3.095 2.380 TRP 143.A NE1 ALA 163.A O TRP 143.A HE1 2.791 1.999 GLY 144.A N ARG 141.A O GLY 144.A H 2.781 1.970 PHE 147.A N TRP 143.A O PHE 147.A H 2.834 1.985 ASN 148.A N GLY 144.A O ASN 148.A H 3.076 2.268 ILE 149.A N PRO 145.A O ILE 149.A H 3.174 2.380 LEU 150.A N ILE 146.A O LEU 150.A H 3.028 2.187 LYS 151.A N PHE 147.A O LYS 151.A H 2.796 1.982 GLU 152.A N ASN 148.A O GLU 152.A H 2.814 1.975 LYS 153.A N ILE 149.A O LYS 153.A H 2.941 2.280 LYS 153.A N LEU 150.A O LYS 153.A H 3.256 2.601 ASN 154.A N LYS 151.A O ASN 154.A H 3.099 2.266 PHE 155.A N LEU 150.A O PHE 155.A H 2.899 2.075 ARG 158.A N SER 166.A O ARG 158.A H 2.867 2.103 SER 160.A N LYS 164.A O SER 160.A H 2.843 2.040 LYS 164.A N SER 160.A O LYS 164.A H 2.810 1.998 LYS 164.A NZ TYR 161.A O LYS 164.A HZ3 3.545 2.873 LEU 165.A N PHE 176.A O LEU 165.A H 2.989 2.293 SER 166.A N ARG 158.A O SER 166.A H 2.858 2.044 PHE 167.A N LYS 174.A O PHE 167.A H 2.982 2.254 ILE 168.A N PHE 155.A O ILE 168.A H 3.195 2.394 SER 169.A N GLU 172.A O SER 169.A H 3.127 2.404 LYS 174.A N PHE 167.A O LYS 174.A H 2.786 1.927 LYS 174.A NZ GLU 172.A OE1 LYS 174.A HZ1 3.151 2.321 PHE 176.A N LEU 165.A O PHE 176.A H 2.722 1.932 LYS 179.A NZ GLU 142.A O LYS 179.A HZ2 3.156 2.417 GLN 180.A NE2 ASP 183.A OD1 GLN 180.A HE21 3.031 2.295 ARG 182.A N LYS 179.A O ARG 182.A H 3.086 2.257 ARG 182.A NE LEU 199.A O ARG 182.A HE 2.975 2.173 ARG 182.A NH1 GLN 180.A OE1 ARG 182.A HH11 3.320 2.647 ARG 182.A NH2 LEU 199.A O ARG 182.A HH21 3.076 2.324 ASP 183.A N GLN 180.A O ASP 183.A H 3.116 2.304 PHE 184.A N LEU 181.A O PHE 184.A H 2.953 2.207 VAL 185.A N LEU 181.A O VAL 185.A H 2.831 2.011 THR 186.A N ARG 182.A O THR 186.A H 2.959 2.157 THR 187.A N PHE 184.A O THR 187.A H 3.367 2.532 ARG 188.A N VAL 185.A O ARG 188.A H 2.828 2.187 ARG 188.A NH2 GLU 170.A OE1 ARG 188.A HH22 3.038 2.250 LYS 192.A N ARG 188.A O LYS 192.A H 3.085 2.343 GLU 193.A N PRO 189.A O GLU 193.A H 3.140 2.343 LEU 195.A N LEU 191.A O LEU 195.A H 2.870 2.144 LEU 199.A N LEU 195.A O LEU 199.A H 2.843 2.021 ASN 200.A N GLU 197.A O ASN 200.A H 3.052 2.273