Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 2yoi_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N SER 45.A OG MET 1.A H3.A 2.875 1.951 MET 1.A N GLU 46.A OE2.B MET 1.A H2.A 2.859 2.063 ILE 3.A N PHE 54.A O ILE 3.A H 2.853 2.002 VAL 5.A N LYS 56.A O VAL 5.A H 3.098 2.256 GLU 9.A N GLU 9.A OE2.B GLU 9.A H 2.809 2.073 GLU 10.A N ASN 7.A OD1 GLU 10.A H 2.872 2.038 PHE 11.A N ASN 7.A O PHE 11.A H 3.056 2.219 GLU 12.A N LYS 8.A O GLU 12.A H.A 2.918 2.081 ALA 13.A N GLU 9.A O ALA 13.A H 3.056 2.236 ILE 14.A N GLU 10.A O ILE 14.A H 2.991 2.154 LEU 15.A N PHE 11.A O LEU 15.A H 3.119 2.289 SER 16.A N GLU 12.A O SER 16.A H 3.019 2.215 GLU 17.A N ALA 13.A O GLU 17.A H 3.025 2.351 ALA 18.A N ILE 14.A O ALA 18.A H 3.033 2.329 LYS 20.A NZ PRO 49.A O LYS 20.A HZ1 2.777 1.891 VAL 22.A N PHE 80.A O VAL 22.A H 2.909 2.058 VAL 23.A N VAL 53.A O VAL 23.A H 2.870 2.035 VAL 24.A N LYS 78.A O VAL 24.A H 2.876 2.033 ASP 25.A N ILE 55.A O ASP 25.A H 2.863 2.021 PHE 26.A N THR 76.A O PHE 26.A H 2.866 2.031 PHE 27.A N VAL 57.A O PHE 27.A H 2.996 2.163 TRP 30.A NE1 ASP 60.A OD2 TRP 30.A HE1 2.807 2.018 CYS 31.A N.A ALA 28.A O CYS 31.A H.A 3.267 2.444 CYS 31.A N.B ALA 28.A O CYS 31.A H.B 3.269 2.421 CYS 31.A SG.B MET 74.A O no hydrogen 3.384 N/A LYS 35.A N GLY 32.A O LYS 35.A H 3.001 2.375 LYS 35.A NZ THR 29.A O LYS 35.A HZ2 2.556 1.728 LYS 35.A NZ CYS 31.A O.A LYS 35.A HZ3 3.418 2.876 MET 36.A N GLY 32.A O MET 36.A H.B 3.291 2.522 ILE 37.A N PRO 33.A O ILE 37.A H 3.046 2.269 ALA 38.A N CYS 34.A O ALA 38.A H 3.018 2.328 PHE 40.A N ILE 37.A O PHE 40.A H 2.926 2.337 PHE 41.A N ILE 37.A O PHE 41.A H 2.897 2.067 GLU 42.A N ALA 38.A O GLU 42.A H 3.029 2.208 GLU 43.A N PRO 39.A O GLU 43.A H 3.040 2.230 LEU 44.A N PHE 40.A O LEU 44.A H 2.918 2.077 SER 45.A N PHE 41.A O SER 45.A H 2.993 2.209 SER 45.A OG GLU 42.A O SER 45.A HG 2.697 2.208 GLU 46.A N GLU 42.A O GLU 46.A H 3.217 2.534 GLU 46.A N GLU 43.A O GLU 46.A H 3.038 2.363 GLU 47.A N GLU 43.A O GLU 47.A H 3.049 2.339 GLU 47.A N LEU 44.A O GLU 47.A H 3.056 2.426 TYR 48.A N LEU 44.A O TYR 48.A H 2.958 2.229 ASP 50.A N.A ASP 50.A OD1.A ASP 50.A H.A 2.469 1.805 LYS 51.A N TYR 48.A O LYS 51.A H.B 3.470 2.614 LYS 51.A NZ.A ASP 50.A OD2.A LYS 51.A HZ3.A 2.999 2.204 LYS 51.A NZ.B PRO 106.A O LYS 51.A HZ1.B 3.253 2.434 LYS 51.A NZ.B PRO 106.A OXT LYS 51.A HZ1.B 3.264 2.443 VAL 53.A N LEU 21.A O VAL 53.A H 2.834 1.992 ILE 55.A N VAL 23.A O ILE 55.A H 2.930 2.101 LYS 56.A N ILE 3.A O LYS 56.A H 2.920 2.112 VAL 57.A N ASP 25.A O VAL 57.A H 2.910 2.081 VAL 59.A N PHE 27.A O VAL 59.A H 2.932 2.100 ASP 60.A N ASP 58.A OD1 ASP 60.A H 2.961 2.247 GLU 61.A N ASP 58.A O GLU 61.A H.B 2.973 2.325 VAL 62.A N ASP 58.A O VAL 62.A H 2.911 2.168 VAL 65.A N VAL 62.A O VAL 65.A H 3.102 2.476 ALA 66.A N VAL 62.A O ALA 66.A H 3.212 2.385 ALA 67.A N PRO 63.A O ALA 67.A H 2.878 2.044 LYS 68.A N ASP 64.A O LYS 68.A H 3.027 2.219 LYS 68.A NZ.A GLU 12.A OE1.B LYS 68.A HZ1.A 3.475 2.775 LYS 68.A NZ.A GLU 12.A OE2.B LYS 68.A HZ1.A 2.681 1.807 LYS 68.A NZ.B TYR 69.A OH LYS 68.A HZ3.B 3.478 2.696 TYR 69.A N VAL 65.A O TYR 69.A H 3.039 2.208 GLY 70.A N ALA 67.A O GLY 70.A H 3.129 2.305 ILE 71.A N ALA 66.A O ILE 71.A H 3.151 2.303 THR 76.A N PHE 26.A O THR 76.A H 3.072 2.283 THR 76.A OG1 SER 73.A O THR 76.A HG1 2.689 1.961 PHE 77.A N LEU 89.A O PHE 77.A H 2.839 1.998 LYS 78.A N VAL 24.A O LYS 78.A H 2.981 2.219 LYS 78.A NZ GLU 88.A OE1.B LYS 78.A HZ1 2.842 1.960 PHE 79.A N ASP 87.A O PHE 79.A H 2.988 2.179 PHE 80.A N VAL 22.A O PHE 80.A H 2.831 2.012 LYS 81.A N.A LYS 84.A O.A no hydrogen 2.864 N/A LYS 81.A N.A LYS 84.A O.B no hydrogen 2.847 N/A LYS 81.A N.B LYS 84.A O.A no hydrogen 2.868 N/A LYS 81.A N.B LYS 84.A O.B no hydrogen 2.851 N/A LYS 81.A NZ.A HIS 104.A O LYS 81.A HZ2.A 2.639 1.971 LYS 81.A NZ.B ASP 19.A O LYS 81.A HZ3.B 3.017 2.289 LYS 84.A N.A LYS 81.A O.A LYS 84.A H.A 2.942 2.089 LYS 84.A N.A LYS 81.A O.B LYS 84.A H.A 3.114 2.265 LYS 84.A N.B LYS 81.A O.A LYS 84.A H.B 2.944 2.093 LYS 84.A N.B LYS 81.A O.B LYS 84.A H.B 3.116 2.266 LYS 85.A NZ GLU 88.A OE1.B LYS 85.A HZ1 2.422 1.767 VAL 86.A N PHE 79.A O VAL 86.A H 2.750 1.919 GLU 88.A N ASP 87.A OD1 GLU 88.A H.A 2.960 2.255 LEU 89.A N PHE 77.A O LEU 89.A H 2.858 2.057 GLY 91.A N PRO 75.A O GLY 91.A H 2.785 1.959 LYS 96.A N ASN 93.A OD1 LYS 96.A H 2.964 2.127 LEU 97.A N ASN 93.A O LEU 97.A H 3.034 2.231 LYS 98.A N GLN 94.A O LYS 98.A H 3.080 2.225 GLN 99.A N GLU 95.A O GLN 99.A H 3.024 2.179 MET 100.A N LYS 96.A O MET 100.A H 2.969 2.194 ILE 101.A N LEU 97.A O ILE 101.A H 3.091 2.263 LEU 102.A N LYS 98.A O LEU 102.A H 2.944 2.110 LYS 103.A N GLN 99.A O LYS 103.A H 2.876 2.087 HIS 104.A N MET 100.A O HIS 104.A H 3.213 2.434 HIS 104.A NE2 ASP 87.A OD2 HIS 104.A HE2 2.726 1.883 ALA 105.A N ILE 101.A O ALA 105.A H 2.880 2.141