Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 2yp0_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 5.A N TYR 208.A O LEU 5.A H 2.662 1.927 PHE 7.A N LYS 66.A O PHE 7.A H 2.973 2.174 GLY 8.A N THR 206.A O GLY 8.A H 3.204 2.420 TRP 9.A N CYS 63.A O TRP 9.A H 2.818 2.021 PHE 10.A N ILE 204.A O PHE 10.A H 2.835 2.030 LEU 11.A N LEU 61.A O LEU 11.A H 3.040 2.231 THR 12.A N LYS 202.A O THR 12.A H 3.257 2.455 SER 15.A N THR 12.A OG1 SER 15.A H 3.235 2.410 SER 16.A N THR 12.A O SER 16.A H 2.843 2.039 GLU 17.A N LYS 13.A O GLU 17.A H 3.003 2.147 THR 18.A N LYS 14.A O THR 18.A H 3.222 2.452 LEU 19.A N SER 15.A O LEU 19.A H 2.920 2.092 ARG 20.A N SER 16.A O ARG 20.A H 2.636 1.798 LYS 21.A N GLU 17.A O LYS 21.A H 2.938 2.114 ALA 22.A N THR 18.A O ALA 22.A H 3.216 2.446 GLY 23.A N LEU 19.A O GLY 23.A H 2.983 2.216 GLN 24.A N ARG 20.A O GLN 24.A H 3.186 2.357 VAL 25.A N LYS 21.A O VAL 25.A H 3.085 2.229 PHE 26.A N ALA 22.A O PHE 26.A H 3.092 2.316 LEU 27.A N GLY 23.A O LEU 27.A H 2.819 2.017 GLU 28.A N GLN 24.A O GLU 28.A H 2.729 1.925 GLU 29.A N VAL 25.A O GLU 29.A H 3.009 2.239 LEU 30.A N PHE 26.A O LEU 30.A H 2.871 2.039 GLY 31.A N LEU 27.A O GLY 31.A H 3.076 2.227 HIS 33.A N LEU 30.A O HIS 33.A H 2.810 1.971 PHE 36.A N HIS 33.A O PHE 36.A H 3.087 2.489 LYS 37.A N HIS 33.A O LYS 37.A H 3.020 2.204 LYS 37.A NZ GLY 31.A O LYS 37.A HZ1 3.487 2.818 LYS 38.A N LYS 34.A O LYS 38.A H 3.081 2.374 GLU 39.A N PHE 36.A O GLU 39.A H 3.001 2.229 ARG 41.A NH2 GLU 39.A OE2 ARG 41.A HH22 3.099 2.443 HIS 42.A N GLU 39.A O HIS 42.A H 3.233 2.377 PHE 43.A N LEU 40.A O PHE 43.A H 2.893 2.049 ILE 44.A N LEU 40.A O ILE 44.A H 2.892 2.057 SER 51.A N GLU 48.A O SER 51.A H 2.868 2.187 TYR 52.A N GLU 48.A O TYR 52.A H 3.041 2.228 PHE 53.A N LEU 49.A O PHE 53.A H 2.791 1.967 LYS 55.A NZ ALA 148.A O LYS 55.A HZ1 3.149 2.367 LYS 55.A NZ VAL 150.A O LYS 55.A HZ2 2.801 1.953 LEU 61.A N SER 16.A OG LEU 61.A H 2.882 2.095 CYS 63.A N TRP 9.A O CYS 63.A H 2.713 1.896 THR 65.A N PHE 7.A O THR 65.A H 2.970 2.136 LYS 66.A NZ ASP 124.A OD1 LYS 66.A HZ2 3.051 2.267 LYS 66.A NZ ASP 124.A OD2 LYS 66.A HZ2 2.838 2.056 CYS 68.A N LEU 5.A O CYS 68.A H 2.926 2.160 ASP 69.A N LEU 5.A O ASP 69.A H 2.832 2.002 TYR 70.A N PRO 4.A O TYR 70.A H 2.888 2.071 GLY 71.A N CYS 68.A O GLY 71.A H 2.923 2.142 LYS 72.A N ASP 69.A O LYS 72.A H 3.009 2.153 ALA 73.A N CYS 68.A O ALA 73.A H 3.000 2.179 ALA 76.A N ALA 73.A O ALA 76.A H 3.043 2.246 GLU 78.A N GLU 78.A OE1 GLU 78.A H 2.743 1.990 TYR 79.A N GLY 75.A O TYR 79.A H 2.962 2.260 TYR 79.A N ALA 76.A O TYR 79.A H 3.097 2.435 ALA 80.A N ALA 76.A O ALA 80.A H 3.128 2.289 GLN 81.A N GLU 77.A O GLN 81.A H 3.337 2.519 GLN 81.A NE2 GLU 77.A O GLN 81.A HE21 2.928 2.140 GLN 82.A N TYR 79.A O GLN 82.A H 3.228 2.467 LYS 86.A N GLN 82.A O LYS 86.A H 3.392 2.560 ARG 87.A N GLU 83.A O ARG 87.A H 2.803 1.975 SER 88.A N VAL 84.A O SER 88.A H 2.947 2.265 TYR 89.A N VAL 85.A O TYR 89.A H 2.922 2.252 GLY 90.A N PHE 205.A O GLY 90.A H 2.567 1.715 LYS 91.A N SER 88.A O LYS 91.A H 2.757 1.908 PHE 93.A N ALA 203.A O PHE 93.A H 2.765 1.955 LEU 95.A N VAL 201.A O LEU 95.A H 2.885 2.061 ILE 97.A N MET 199.A O ILE 97.A H 2.755 1.986 SER 98.A N GLN 110.A O SER 98.A H 3.172 2.397 LEU 100.A N LEU 193.A O LEU 100.A H 2.899 2.149 PHE 101.A N GLY 108.A O PHE 101.A H 2.961 2.126 VAL 102.A N TRP 191.A O VAL 102.A H 2.839 2.020 THR 103.A N THR 106.A O THR 103.A H 2.886 2.099 THR 103.A OG1 THR 106.A O THR 103.A HG1 3.389 2.650 LYS 105.A N THR 103.A OG1 LYS 105.A H 3.184 2.397 LYS 105.A NZ ASP 158.A OD1 LYS 105.A HZ1 3.116 2.234 THR 106.A N THR 103.A OG1 THR 106.A H 3.081 2.228 ALA 107.A N GLY 145.A O ALA 107.A H 2.764 1.932 GLY 108.A N PHE 101.A O GLY 108.A H 3.042 2.223 ALA 109.A N VAL 142.A O ALA 109.A H 2.708 1.914 GLN 110.A N ALA 99.A O GLN 110.A H 2.804 2.018 VAL 111.A N ALA 140.A O VAL 111.A H 3.009 2.152 VAL 112.A N SER 96.A O VAL 112.A H 2.877 2.034 THR 114.A N GLU 117.A OE1 THR 114.A H 3.089 2.271 GLU 117.A N THR 114.A OG1 GLU 117.A H 3.303 2.466 LEU 118.A N THR 114.A O LEU 118.A H 2.712 1.959 GLN 119.A N ASP 115.A O GLN 119.A H 3.094 2.369 GLN 119.A N GLN 116.A O GLN 119.A H 3.235 2.588 LEU 120.A N GLU 117.A O LEU 120.A H 3.017 2.261 TRP 121.A N LEU 118.A O TRP 121.A H 2.946 2.117 SER 131.A N PRO 128.A O SER 131.A H 2.923 2.075 GLU 132.A N SER 129.A O GLU 132.A H 3.007 2.185 LEU 134.A N SER 131.A O LEU 134.A H 3.250 2.413 SER 138.A N PRO 135.A O SER 138.A H 3.312 2.542 ALA 140.A N GLY 137.A O ALA 140.A H 2.902 2.076 HIS 141.A ND1 ARG 139.A O HIS 141.A HD1 2.724 1.905 VAL 142.A N ALA 109.A O VAL 142.A H 2.783 1.968 LEU 144.A N ALA 107.A O LEU 144.A H 2.835 2.003 GLY 145.A N ALA 107.A O GLY 145.A H 2.974 2.210 CYS 146.A N LYS 55.A O CYS 146.A H 2.916 2.233 ALA 147.A N LYS 105.A O ALA 147.A H 2.770 1.972 ASP 149.A N ASP 149.A OD1 ASP 149.A H 2.666 2.028 VAL 150.A N ALA 147.A O VAL 150.A H 3.072 2.282 GLN 154.A N GLN 151.A O GLN 154.A H 2.975 2.177 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD1 GLN 154.A HE21 2.769 1.919 THR 155.A N PRO 152.A O THR 155.A H 2.780 1.933 THR 155.A OG1 PRO 152.A O THR 155.A HG1 3.002 2.336 GLY 156.A N VAL 153.A O GLY 156.A H 3.118 2.377 ASP 158.A N GLN 154.A O ASP 158.A H 2.779 1.973 LEU 159.A N THR 155.A O LEU 159.A H 2.982 2.226 LEU 160.A N GLY 156.A O LEU 160.A H 3.108 2.253 ASP 161.A N LEU 157.A O ASP 161.A H 2.863 2.018 ILE 162.A N ASP 158.A O ILE 162.A H 3.150 2.333 LEU 163.A N LEU 159.A O LEU 163.A H 2.863 2.071 GLN 164.A N LEU 160.A O GLN 164.A H 3.014 2.290 GLN 164.A N ASP 161.A O GLN 164.A H 3.057 2.445 GLN 164.A NE2 ALA 130.A O GLN 164.A HE21 2.814 1.963 GLN 164.A NE2 GLU 132.A O GLN 164.A HE22 2.641 1.857 GLN 165.A N ASP 161.A O GLN 165.A H 3.177 2.417 GLN 165.A NE2 ASP 161.A O GLN 165.A HE21 3.518 2.849 GLN 165.A NE2 ASP 161.A OD1 GLN 165.A HE21 3.420 2.688 VAL 166.A N ILE 162.A O VAL 166.A H 3.152 2.430 LYS 167.A N GLN 164.A O LYS 167.A H 3.165 2.444 GLY 169.A N VAL 166.A O GLY 169.A H 2.703 1.984 GLU 173.A N SER 170.A O GLU 173.A H 3.282 2.442 ALA 174.A N GLN 171.A O ALA 174.A H 3.346 2.508 VAL 175.A N LEU 183.A O VAL 175.A H 2.751 2.089 LEU 178.A N GLY 181.A O LEU 178.A H 2.771 1.967 ARG 180.A NE GLU 29.A OE1 ARG 180.A HE 3.201 2.554 ARG 180.A NH2 ALA 22.A O ARG 180.A HH22 2.721 2.046 GLY 181.A N LEU 178.A O GLY 181.A H 3.215 2.371 LYS 182.A N SER 194.A O LYS 182.A H 3.193 2.548 LEU 183.A N GLY 176.A O LEU 183.A H 2.815 1.957 TYR 184.A N MET 192.A O TYR 184.A H 2.812 2.004 LEU 186.A N ARG 190.A O LEU 186.A H 2.938 2.121 ARG 190.A N GLY 187.A O ARG 190.A H 3.250 2.436 ARG 190.A NE GLY 187.A O ARG 190.A HE 2.685 1.871 ARG 190.A NH1 ASP 161.A OD2 ARG 190.A HH11 2.898 2.046 ARG 190.A NH2 LEU 186.A O ARG 190.A HH21 2.795 2.234 ARG 190.A NH2 GLY 187.A O ARG 190.A HH21 3.227 2.594 TRP 191.A N VAL 102.A O TRP 191.A H 2.911 2.069 MET 192.A N TYR 184.A O MET 192.A H 2.998 2.187 LEU 193.A N LEU 100.A O LEU 193.A H 2.642 1.796 SER 194.A N LYS 182.A O SER 194.A H 2.989 2.175 LEU 195.A N SER 98.A O LEU 195.A H 3.091 2.293 THR 196.A N ARG 180.A O THR 196.A H 2.866 2.051 MET 199.A N ILE 97.A O MET 199.A H 2.823 2.059 VAL 201.A N LEU 95.A O VAL 201.A H 2.980 2.178 ALA 203.A N PHE 93.A O ALA 203.A H 2.909 2.115 ILE 204.A N PHE 10.A O ILE 204.A H 2.996 2.195 PHE 205.A N LYS 91.A O PHE 205.A H 2.976 2.141 THR 206.A N GLY 8.A O THR 206.A H 3.037 2.220 TYR 208.A N TYR 6.A O TYR 208.A H 3.013 2.161